MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	GATT	2	8	537	544	25 %	50 %	25 %	0 %	428204731
2	NC_019699	CTTA	2	8	1172	1179	25 %	50 %	0 %	25 %	428204731
3	NC_019699	AGTT	2	8	1355	1362	25 %	50 %	25 %	0 %	428204731
4	NC_019699	TTGC	2	8	1632	1639	0 %	50 %	25 %	25 %	428204732
5	NC_019699	AAGC	2	8	2359	2366	50 %	0 %	25 %	25 %	428204733
6	NC_019699	GTCC	2	8	2701	2708	0 %	25 %	25 %	50 %	428204733
7	NC_019699	AAGA	2	8	2729	2736	75 %	0 %	25 %	0 %	428204733
8	NC_019699	CAAT	2	8	3116	3123	50 %	25 %	0 %	25 %	428204733
9	NC_019699	ATTG	2	8	3755	3762	25 %	50 %	25 %	0 %	428204734
10	NC_019699	AGCA	2	8	3819	3826	50 %	0 %	25 %	25 %	428204734
11	NC_019699	ATTG	2	8	4800	4807	25 %	50 %	25 %	0 %	428204735
12	NC_019699	TGCG	2	8	4840	4847	0 %	25 %	50 %	25 %	428204735
13	NC_019699	AGCT	2	8	5123	5130	25 %	25 %	25 %	25 %	428204736
14	NC_019699	TCGA	2	8	5239	5246	25 %	25 %	25 %	25 %	428204736
15	NC_019699	TAGT	2	8	5442	5449	25 %	50 %	25 %	0 %	428204736
16	NC_019699	GTAG	2	8	5592	5599	25 %	25 %	50 %	0 %	428204737
17	NC_019699	GCGT	2	8	6425	6432	0 %	25 %	50 %	25 %	428204738
18	NC_019699	CCAA	2	8	7178	7185	50 %	0 %	0 %	50 %	428204739
19	NC_019699	CGAT	2	8	7977	7984	25 %	25 %	25 %	25 %	428204740
20	NC_019699	TCGC	2	8	8082	8089	0 %	25 %	25 %	50 %	428204740
21	NC_019699	CTTA	2	8	8226	8233	25 %	50 %	0 %	25 %	428204740
22	NC_019699	AATC	2	8	9163	9170	50 %	25 %	0 %	25 %	428204741
23	NC_019699	CACC	2	8	9184	9191	25 %	0 %	0 %	75 %	428204741
24	NC_019699	CTGA	2	8	9225	9232	25 %	25 %	25 %	25 %	428204741
25	NC_019699	ATTG	2	8	9623	9630	25 %	50 %	25 %	0 %	428204741
26	NC_019699	ATTA	2	8	9763	9770	50 %	50 %	0 %	0 %	428204741
27	NC_019699	TTAT	2	8	10833	10840	25 %	75 %	0 %	0 %	428204743
28	NC_019699	TTTG	2	8	11842	11849	0 %	75 %	25 %	0 %	428204744
29	NC_019699	AGTT	2	8	11855	11862	25 %	50 %	25 %	0 %	428204744
30	NC_019699	TAAC	2	8	12349	12356	50 %	25 %	0 %	25 %	428204744
31	NC_019699	AAAG	2	8	12944	12951	75 %	0 %	25 %	0 %	428204745
32	NC_019699	TTTC	2	8	12981	12988	0 %	75 %	0 %	25 %	428204745
33	NC_019699	ACGA	2	8	13196	13203	50 %	0 %	25 %	25 %	428204745
34	NC_019699	GTTA	2	8	13233	13240	25 %	50 %	25 %	0 %	428204745
35	NC_019699	CACC	2	8	13444	13451	25 %	0 %	0 %	75 %	428204745
36	NC_019699	CGAA	2	8	13578	13585	50 %	0 %	25 %	25 %	428204745
37	NC_019699	TTTG	2	8	14275	14282	0 %	75 %	25 %	0 %	428204746
38	NC_019699	TGAC	2	8	14709	14716	25 %	25 %	25 %	25 %	428204746
39	NC_019699	TGTC	2	8	15001	15008	0 %	50 %	25 %	25 %	428204746
40	NC_019699	ACTT	2	8	16266	16273	25 %	50 %	0 %	25 %	428204748
41	NC_019699	TCCG	2	8	16531	16538	0 %	25 %	25 %	50 %	428204748
42	NC_019699	GCTG	2	8	16570	16577	0 %	25 %	50 %	25 %	428204748
43	NC_019699	CTTC	2	8	17012	17019	0 %	50 %	0 %	50 %	428204749
44	NC_019699	TAGC	2	8	17123	17130	25 %	25 %	25 %	25 %	428204749
45	NC_019699	GAAT	2	8	17836	17843	50 %	25 %	25 %	0 %	428204750
46	NC_019699	TGTT	2	8	18718	18725	0 %	75 %	25 %	0 %	428204751
47	NC_019699	ACTG	2	8	19456	19463	25 %	25 %	25 %	25 %	428204752
48	NC_019699	CAAA	2	8	19664	19671	75 %	0 %	0 %	25 %	428204752
49	NC_019699	GTTT	2	8	21011	21018	0 %	75 %	25 %	0 %	428204753
50	NC_019699	TGTA	2	8	21252	21259	25 %	50 %	25 %	0 %	428204753
51	NC_019699	TGCT	2	8	21470	21477	0 %	50 %	25 %	25 %	428204753
52	NC_019699	GATC	2	8	21498	21505	25 %	25 %	25 %	25 %	428204753
53	NC_019699	CCTG	2	8	21575	21582	0 %	25 %	25 %	50 %	428204753
54	NC_019699	ACAA	2	8	22480	22487	75 %	0 %	0 %	25 %	428204754
55	NC_019699	AACG	2	8	22842	22849	50 %	0 %	25 %	25 %	428204754
56	NC_019699	TCGT	2	8	23350	23357	0 %	50 %	25 %	25 %	428204755
57	NC_019699	TAAA	2	8	24018	24025	75 %	25 %	0 %	0 %	428204756
58	NC_019699	GCCA	2	8	24428	24435	25 %	0 %	25 %	50 %	428204756
59	NC_019699	GTTA	2	8	24499	24506	25 %	50 %	25 %	0 %	428204756
60	NC_019699	TCGT	2	8	30392	30399	0 %	50 %	25 %	25 %	428204759
61	NC_019699	GTTT	2	8	30738	30745	0 %	75 %	25 %	0 %	428204759
62	NC_019699	TCCA	2	8	31012	31019	25 %	25 %	0 %	50 %	428204760
63	NC_019699	CAGT	2	8	33279	33286	25 %	25 %	25 %	25 %	428204761
64	NC_019699	AAAC	2	8	33433	33440	75 %	0 %	0 %	25 %	428204761
65	NC_019699	GAGG	2	8	34652	34659	25 %	0 %	75 %	0 %	428204762
66	NC_019699	CATC	2	8	35419	35426	25 %	25 %	0 %	50 %	428204762
67	NC_019699	AAAG	2	8	36261	36268	75 %	0 %	25 %	0 %	428204762
68	NC_019699	AAAC	2	8	36309	36316	75 %	0 %	0 %	25 %	428204762
69	NC_019699	TGTT	2	8	36534	36541	0 %	75 %	25 %	0 %	428204762
70	NC_019699	AATT	2	8	36710	36717	50 %	50 %	0 %	0 %	428204762
71	NC_019699	CTCG	2	8	37530	37537	0 %	25 %	25 %	50 %	428204763
72	NC_019699	AGTC	2	8	37609	37616	25 %	25 %	25 %	25 %	428204763
73	NC_019699	CTTG	2	8	37778	37785	0 %	50 %	25 %	25 %	428204763
74	NC_019699	TGAC	3	12	38217	38228	25 %	25 %	25 %	25 %	428204763
75	NC_019699	CGCT	2	8	38779	38786	0 %	25 %	25 %	50 %	428204763
76	NC_019699	CTTG	2	8	38925	38932	0 %	50 %	25 %	25 %	428204763
77	NC_019699	ACTT	2	8	41027	41034	25 %	50 %	0 %	25 %	428204765
78	NC_019699	ATCG	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	428204765
79	NC_019699	TGCT	2	8	41593	41600	0 %	50 %	25 %	25 %	428204765
80	NC_019699	TTTA	2	8	42218	42225	25 %	75 %	0 %	0 %	428204766
81	NC_019699	CGAT	2	8	42477	42484	25 %	25 %	25 %	25 %	428204766
82	NC_019699	CAAG	2	8	42553	42560	50 %	0 %	25 %	25 %	428204766
83	NC_019699	TGGC	2	8	42773	42780	0 %	25 %	50 %	25 %	428204766
84	NC_019699	CGCA	2	8	42843	42850	25 %	0 %	25 %	50 %	428204766
85	NC_019699	GAGC	2	8	42938	42945	25 %	0 %	50 %	25 %	428204766
86	NC_019699	CAAC	2	8	43195	43202	50 %	0 %	0 %	50 %	428204766
87	NC_019699	ATCG	2	8	43475	43482	25 %	25 %	25 %	25 %	428204766
88	NC_019699	ATTA	2	8	43660	43667	50 %	50 %	0 %	0 %	428204766
89	NC_019699	GGTG	2	8	43825	43832	0 %	25 %	75 %	0 %	428204766
90	NC_019699	CTTG	2	8	44751	44758	0 %	50 %	25 %	25 %	428204767
91	NC_019699	CATA	2	8	44804	44811	50 %	25 %	0 %	25 %	428204767
92	NC_019699	TCGA	2	8	45848	45855	25 %	25 %	25 %	25 %	428204768
93	NC_019699	CAGA	2	8	45860	45867	50 %	0 %	25 %	25 %	428204768
94	NC_019699	GCTG	2	8	46624	46631	0 %	25 %	50 %	25 %	428204768
95	NC_019699	TGGC	2	8	46926	46933	0 %	25 %	50 %	25 %	428204769
96	NC_019699	CTAT	2	8	47665	47672	25 %	50 %	0 %	25 %	428204769
97	NC_019699	GCAG	2	8	48492	48499	25 %	0 %	50 %	25 %	428204769
98	NC_019699	GATG	2	8	49107	49114	25 %	25 %	50 %	0 %	428204770
99	NC_019699	CTTG	2	8	49260	49267	0 %	50 %	25 %	25 %	428204770
100	NC_019699	TGCT	2	8	49414	49421	0 %	50 %	25 %	25 %	428204770
101	NC_019699	ATCC	2	8	49924	49931	25 %	25 %	0 %	50 %	428204770
102	NC_019699	TGCG	2	8	50143	50150	0 %	25 %	50 %	25 %	428204770
103	NC_019699	TGCC	2	8	50487	50494	0 %	25 %	25 %	50 %	428204771
104	NC_019699	GTTT	2	8	50735	50742	0 %	75 %	25 %	0 %	428204771
105	NC_019699	TCTT	2	8	51324	51331	0 %	75 %	0 %	25 %	428204772
106	NC_019699	GCCT	2	8	51779	51786	0 %	25 %	25 %	50 %	428204772
107	NC_019699	CCAT	2	8	52394	52401	25 %	25 %	0 %	50 %	428204772
108	NC_019699	TATC	2	8	52751	52758	25 %	50 %	0 %	25 %	428204773
109	NC_019699	CATA	2	8	52802	52809	50 %	25 %	0 %	25 %	428204773
110	NC_019699	CTTG	2	8	52897	52904	0 %	50 %	25 %	25 %	428204773
111	NC_019699	GTTT	2	8	53068	53075	0 %	75 %	25 %	0 %	428204774
112	NC_019699	AATC	2	8	53496	53503	50 %	25 %	0 %	25 %	428204774
113	NC_019699	ATCG	2	8	53747	53754	25 %	25 %	25 %	25 %	428204775
114	NC_019699	TGCT	2	8	53769	53776	0 %	50 %	25 %	25 %	428204775
115	NC_019699	CCTT	2	8	53997	54004	0 %	50 %	0 %	50 %	428204775
116	NC_019699	TTTC	2	8	54108	54115	0 %	75 %	0 %	25 %	428204775
117	NC_019699	GGCT	2	8	54878	54885	0 %	25 %	50 %	25 %	428204776
118	NC_019699	TCAC	2	8	55280	55287	25 %	25 %	0 %	50 %	428204776
119	NC_019699	CTAA	2	8	55466	55473	50 %	25 %	0 %	25 %	428204777
120	NC_019699	GCTT	2	8	55555	55562	0 %	50 %	25 %	25 %	428204777
121	NC_019699	TGCT	2	8	56113	56120	0 %	50 %	25 %	25 %	428204778
122	NC_019699	AGAC	2	8	57442	57449	50 %	0 %	25 %	25 %	428204781
123	NC_019699	TGCC	2	8	57628	57635	0 %	25 %	25 %	50 %	428204781
124	NC_019699	CTTA	2	8	57814	57821	25 %	50 %	0 %	25 %	428204781
125	NC_019699	CTGG	2	8	57847	57854	0 %	25 %	50 %	25 %	428204781
126	NC_019699	TGGT	2	8	58501	58508	0 %	50 %	50 %	0 %	428204781
127	NC_019699	ATGA	2	8	58863	58870	50 %	25 %	25 %	0 %	428204781
128	NC_019699	CGAT	2	8	58948	58955	25 %	25 %	25 %	25 %	428204781
129	NC_019699	GGTT	2	8	59442	59449	0 %	50 %	50 %	0 %	428204781
130	NC_019699	CAGT	2	8	59829	59836	25 %	25 %	25 %	25 %	428204782
131	NC_019699	AACA	2	8	60563	60570	75 %	0 %	0 %	25 %	428204783
132	NC_019699	AATT	2	8	60572	60579	50 %	50 %	0 %	0 %	428204783
133	NC_019699	ACTT	2	8	61918	61925	25 %	50 %	0 %	25 %	428204784
134	NC_019699	TAAT	2	8	63212	63219	50 %	50 %	0 %	0 %	428204785
135	NC_019699	CGAT	2	8	63277	63284	25 %	25 %	25 %	25 %	428204785
136	NC_019699	TGAG	2	8	63867	63874	25 %	25 %	50 %	0 %	428204786
137	NC_019699	ATCG	2	8	65014	65021	25 %	25 %	25 %	25 %	428204788
138	NC_019699	AGGT	2	8	65066	65073	25 %	25 %	50 %	0 %	428204788
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