MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 3780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019699	CAA	2	6	312	317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204731
2	NC_019699	CAG	2	6	415	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204731
3	NC_019699	TGC	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
4	NC_019699	CAG	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204731
5	NC_019699	CCA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204731
6	NC_019699	TCA	2	6	668	673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204731
7	NC_019699	ACA	2	6	911	916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204731
8	NC_019699	ATT	2	6	931	936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204731
9	NC_019699	TGC	2	6	963	968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
10	NC_019699	TGC	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
11	NC_019699	TGG	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204731
12	NC_019699	CAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204731
13	NC_019699	CAG	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204731
14	NC_019699	AAC	2	6	1225	1230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204731
15	NC_019699	TAG	2	6	1274	1279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204731
16	NC_019699	CTG	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
17	NC_019699	CAG	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204731
18	NC_019699	TAG	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204731
19	NC_019699	CTG	2	6	1469	1474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204731
20	NC_019699	CAA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204732
21	NC_019699	TTG	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204732
22	NC_019699	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204732
23	NC_019699	ACC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204732
24	NC_019699	CCA	2	6	1789	1794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204732
25	NC_019699	CAA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204732
26	NC_019699	TTA	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204732
27	NC_019699	AAC	2	6	1998	2003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204732
28	NC_019699	CAT	2	6	2045	2050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204732
29	NC_019699	CTT	2	6	2069	2074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204732
30	NC_019699	GCA	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204733
31	NC_019699	GTC	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204733
32	NC_019699	ACA	2	6	2574	2579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204733
33	NC_019699	GCC	2	6	2791	2796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204733
34	NC_019699	CGC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204733
35	NC_019699	GGA	2	6	2863	2868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204733
36	NC_019699	TGC	3	9	2886	2894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204733
37	NC_019699	AAG	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204733
38	NC_019699	GCT	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204733
39	NC_019699	GGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204734
40	NC_019699	TTC	2	6	3448	3453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204734
41	NC_019699	AGC	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204734
42	NC_019699	TGC	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204734
43	NC_019699	AAT	2	6	3773	3778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204734
44	NC_019699	GTA	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204735
45	NC_019699	CAC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204735
46	NC_019699	ATT	2	6	4075	4080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204735
47	NC_019699	GAA	2	6	4188	4193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204735
48	NC_019699	GCG	2	6	4264	4269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204735
49	NC_019699	CAA	2	6	4382	4387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204735
50	NC_019699	AGC	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204735
51	NC_019699	TGG	2	6	4447	4452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204735
52	NC_019699	TCC	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204735
53	NC_019699	CAA	2	6	4794	4799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204735
54	NC_019699	AGC	2	6	5131	5136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204736
55	NC_019699	ATG	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204736
56	NC_019699	AAC	2	6	5206	5211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204736
57	NC_019699	TGG	2	6	5343	5348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204736
58	NC_019699	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204736
59	NC_019699	CTA	2	6	5385	5390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204736
60	NC_019699	TTA	2	6	5554	5559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204737
61	NC_019699	TAA	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204737
62	NC_019699	AGT	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204737
63	NC_019699	CCG	2	6	6384	6389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204738
64	NC_019699	AGC	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204738
65	NC_019699	CAA	2	6	6560	6565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204738
66	NC_019699	ATC	2	6	6641	6646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204739
67	NC_019699	CTG	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204739
68	NC_019699	TAG	4	12	6846	6857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204739
69	NC_019699	CAA	2	6	6925	6930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204739
70	NC_019699	GGA	2	6	7096	7101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204739
71	NC_019699	TAG	3	9	7194	7202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204739
72	NC_019699	CTT	2	6	7242	7247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204739
73	NC_019699	GCC	2	6	7259	7264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204739
74	NC_019699	GAA	2	6	7271	7276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204739
75	NC_019699	CCA	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204739
76	NC_019699	TAG	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204739
77	NC_019699	TTC	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204740
78	NC_019699	AGC	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204740
79	NC_019699	ATG	2	6	8012	8017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204740
80	NC_019699	GTA	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204740
81	NC_019699	TGG	2	6	8396	8401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204740
82	NC_019699	TCT	2	6	8429	8434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204740
83	NC_019699	CTC	2	6	8439	8444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204740
84	NC_019699	CAG	2	6	8538	8543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204740
85	NC_019699	AGA	2	6	8582	8587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204740
86	NC_019699	CAG	2	6	8772	8777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204740
87	NC_019699	CTA	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204740
88	NC_019699	CAT	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204740
89	NC_019699	TTA	2	6	8825	8830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204740
90	NC_019699	AGC	2	6	8833	8838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204740
91	NC_019699	TGC	2	6	9202	9207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204741
92	NC_019699	GGT	2	6	9212	9217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204741
93	NC_019699	TTC	2	6	9307	9312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204741
94	NC_019699	GCC	2	6	9447	9452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204741
95	NC_019699	TGT	2	6	9529	9534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204741
96	NC_019699	CTG	2	6	9538	9543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204741
97	NC_019699	CAA	2	6	9546	9551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204741
98	NC_019699	TCA	2	6	9795	9800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204741
99	NC_019699	GTA	2	6	10204	10209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204742
100	NC_019699	AGC	2	6	10325	10330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204742
101	NC_019699	GAA	2	6	10333	10338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204742
102	NC_019699	CAA	2	6	10372	10377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204742
103	NC_019699	GCT	2	6	10387	10392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204742
104	NC_019699	AGT	2	6	10417	10422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204742
105	NC_019699	ATG	2	6	10592	10597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204742
106	NC_019699	GAT	2	6	10609	10614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204742
107	NC_019699	AAG	2	6	10629	10634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204742
108	NC_019699	TAG	2	6	10821	10826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204743
109	NC_019699	AAT	2	6	10855	10860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204743
110	NC_019699	AGA	2	6	10942	10947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204743
111	NC_019699	ATT	2	6	10958	10963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204743
112	NC_019699	ACA	2	6	10996	11001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204743
113	NC_019699	TGC	2	6	11038	11043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204743
114	NC_019699	CCA	2	6	11129	11134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204743
115	NC_019699	CGT	2	6	11219	11224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204743
116	NC_019699	ACG	2	6	11283	11288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204744
117	NC_019699	GCT	2	6	11331	11336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204744
118	NC_019699	GCT	2	6	11376	11381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204744
119	NC_019699	TTG	2	6	11471	11476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204744
120	NC_019699	TAA	2	6	11588	11593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204744
121	NC_019699	ATA	2	6	11655	11660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204744
122	NC_019699	ACG	2	6	11726	11731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204744
123	NC_019699	GCA	2	6	11820	11825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204744
124	NC_019699	CAT	2	6	11915	11920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204744
125	NC_019699	AAT	2	6	12138	12143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204744
126	NC_019699	TAC	2	6	12149	12154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204744
127	NC_019699	CCA	2	6	12368	12373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204744
128	NC_019699	CTA	2	6	12397	12402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204744
129	NC_019699	TAT	2	6	12458	12463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204744
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159	NC_019699	ATT	2	6	14897	14902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204746
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239	NC_019699	CAA	2	6	24058	24063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204756
240	NC_019699	TTC	2	6	24124	24129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204756
241	NC_019699	TAA	2	6	24141	24146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204756
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243	NC_019699	CGC	2	6	24188	24193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204756
244	NC_019699	CGT	2	6	24229	24234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204756
245	NC_019699	CTG	2	6	24369	24374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204756
246	NC_019699	CCA	2	6	24450	24455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204756
247	NC_019699	TGA	2	6	24593	24598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204756
248	NC_019699	GTA	2	6	24721	24726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204756
249	NC_019699	GCT	2	6	24789	24794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204756
250	NC_019699	AAT	2	6	24904	24909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204756
251	NC_019699	TTG	2	6	25009	25014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204756
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498	NC_019699	TCG	2	6	50721	50726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204771
499	NC_019699	TGC	2	6	50768	50773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204771
500	NC_019699	ACT	2	6	50909	50914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204771

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