MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 5517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019699	CG	3	6	213336	213341	0 %	0 %	50 %	50 %	428204922
3002	NC_019699	CGA	2	6	213528	213533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204922
3003	NC_019699	AAC	2	6	213572	213577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204922
3004	NC_019699	CTTT	2	8	213594	213601	0 %	75 %	0 %	25 %	428204922
3005	NC_019699	GAA	2	6	213661	213666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204922
3006	NC_019699	TGC	2	6	213752	213757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204922
3007	NC_019699	A	6	6	213998	214003	100 %	0 %	0 %	0 %	428204922
3008	NC_019699	AGC	2	6	214029	214034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204922
3009	NC_019699	GAT	2	6	214099	214104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204922
3010	NC_019699	TGG	2	6	214118	214123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204922
3011	NC_019699	TGA	2	6	214131	214136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204922
3012	NC_019699	GGC	2	6	214140	214145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204922
3013	NC_019699	GAG	2	6	214284	214289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204922
3014	NC_019699	ACA	3	9	214396	214404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204922
3015	NC_019699	ACC	2	6	214454	214459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204922
3016	NC_019699	GGT	2	6	214473	214478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204922
3017	NC_019699	ACT	3	9	214483	214491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204922
3018	NC_019699	TAC	2	6	214518	214523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204922
3019	NC_019699	TCA	2	6	214528	214533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204922
3020	NC_019699	A	6	6	214550	214555	100 %	0 %	0 %	0 %	428204922
3021	NC_019699	GCA	2	6	214560	214565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204922
3022	NC_019699	CAC	2	6	214571	214576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204922
3023	NC_019699	CGAGT	2	10	214631	214640	20 %	20 %	40 %	20 %	428204922
3024	NC_019699	GCT	2	6	214669	214674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204922
3025	NC_019699	CAA	2	6	214690	214695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204922
3026	NC_019699	CCG	2	6	214818	214823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204922
3027	NC_019699	GA	3	6	214888	214893	50 %	0 %	50 %	0 %	428204922
3028	NC_019699	TAC	2	6	214932	214937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204922
3029	NC_019699	CGCTCG	2	12	214991	215002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428204922
3030	NC_019699	GACA	2	8	215155	215162	50 %	0 %	25 %	25 %	428204923
3031	NC_019699	AGC	2	6	215190	215195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204923
3032	NC_019699	GGAACG	2	12	215209	215220	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428204923
3033	NC_019699	TCGA	2	8	215241	215248	25 %	25 %	25 %	25 %	428204923
3034	NC_019699	GAA	2	6	215324	215329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204923
3035	NC_019699	AGA	2	6	215425	215430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204923
3036	NC_019699	A	6	6	215451	215456	100 %	0 %	0 %	0 %	428204923
3037	NC_019699	GAAA	2	8	215596	215603	75 %	0 %	25 %	0 %	428204923
3038	NC_019699	ATT	2	6	215608	215613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204923
3039	NC_019699	CCAG	2	8	215615	215622	25 %	0 %	25 %	50 %	428204923
3040	NC_019699	ATG	2	6	215745	215750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204923
3041	NC_019699	CTA	2	6	215817	215822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204923
3042	NC_019699	TTA	2	6	215875	215880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204923
3043	NC_019699	TGAC	2	8	215913	215920	25 %	25 %	25 %	25 %	428204923
3044	NC_019699	TTG	2	6	215942	215947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204923
3045	NC_019699	CAGC	2	8	216561	216568	25 %	0 %	25 %	50 %	428204924
3046	NC_019699	AGT	2	6	216593	216598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204924
3047	NC_019699	CTC	2	6	216627	216632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204924
3048	NC_019699	AGC	2	6	216727	216732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204924
3049	NC_019699	AGAT	2	8	216742	216749	50 %	25 %	25 %	0 %	428204924
3050	NC_019699	GT	3	6	216778	216783	0 %	50 %	50 %	0 %	428204924
3051	NC_019699	GCA	2	6	216941	216946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204924
3052	NC_019699	AGG	2	6	216981	216986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204924
3053	NC_019699	TCG	2	6	217048	217053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204924
3054	NC_019699	GA	3	6	217170	217175	50 %	0 %	50 %	0 %	428204925
3055	NC_019699	GCC	2	6	217194	217199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204925
3056	NC_019699	AAT	2	6	217204	217209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204925
3057	NC_019699	TCT	2	6	217270	217275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204925
3058	NC_019699	CTG	2	6	217358	217363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204925
3059	NC_019699	TTG	2	6	217396	217401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204925
3060	NC_019699	A	6	6	217430	217435	100 %	0 %	0 %	0 %	428204925
3061	NC_019699	GTTCTG	2	12	217502	217513	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428204925
3062	NC_019699	TTA	2	6	217516	217521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204925
3063	NC_019699	TC	3	6	217643	217648	0 %	50 %	0 %	50 %	428204925
3064	NC_019699	TCT	2	6	217708	217713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204925
3065	NC_019699	AGT	2	6	217728	217733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204925
3066	NC_019699	ACA	2	6	217866	217871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204926
3067	NC_019699	GTG	2	6	217975	217980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204926
3068	NC_019699	ACA	2	6	217981	217986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204926
3069	NC_019699	ATA	2	6	218023	218028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204926
3070	NC_019699	TGTC	2	8	218063	218070	0 %	50 %	25 %	25 %	428204926
3071	NC_019699	CA	3	6	218072	218077	50 %	0 %	0 %	50 %	428204926
3072	NC_019699	AGC	2	6	218160	218165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204926
3073	NC_019699	A	7	7	218169	218175	100 %	0 %	0 %	0 %	428204926
3074	NC_019699	ACT	2	6	218226	218231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204926
3075	NC_019699	AAT	2	6	218269	218274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204926
3076	NC_019699	CAG	2	6	218294	218299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204926
3077	NC_019699	GA	3	6	218327	218332	50 %	0 %	50 %	0 %	428204926
3078	NC_019699	GAAA	2	8	218362	218369	75 %	0 %	25 %	0 %	428204926
3079	NC_019699	TCC	2	6	218445	218450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204926
3080	NC_019699	CAC	2	6	218498	218503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204926
3081	NC_019699	AGT	2	6	218691	218696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204926
3082	NC_019699	TGC	2	6	218707	218712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204926
3083	NC_019699	AGCC	2	8	218721	218728	25 %	0 %	25 %	50 %	428204926
3084	NC_019699	GCC	2	6	218789	218794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204926
3085	NC_019699	GAC	2	6	218807	218812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204926
3086	NC_019699	ATGA	2	8	218847	218854	50 %	25 %	25 %	0 %	428204926
3087	NC_019699	CGT	2	6	218901	218906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204926
3088	NC_019699	TGC	2	6	218909	218914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204926
3089	NC_019699	CTT	2	6	218957	218962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204926
3090	NC_019699	T	6	6	218961	218966	0 %	100 %	0 %	0 %	428204926
3091	NC_019699	ATG	2	6	218971	218976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204926
3092	NC_019699	GCG	2	6	218988	218993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204926
3093	NC_019699	CAG	2	6	218999	219004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204926
3094	NC_019699	CTAGAA	2	12	219074	219085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428204926
3095	NC_019699	TTG	2	6	219098	219103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204926
3096	NC_019699	GAA	2	6	219793	219798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204927
3097	NC_019699	AC	3	6	219799	219804	50 %	0 %	0 %	50 %	428204927
3098	NC_019699	CAG	2	6	219830	219835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204927
3099	NC_019699	GAA	2	6	219862	219867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204927
3100	NC_019699	GCTT	2	8	219871	219878	0 %	50 %	25 %	25 %	428204927
3101	NC_019699	A	8	8	219944	219951	100 %	0 %	0 %	0 %	428204927
3102	NC_019699	TTG	2	6	220134	220139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204928
3103	NC_019699	AAG	2	6	220216	220221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204928
3104	NC_019699	TGC	2	6	220283	220288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204928
3105	NC_019699	AAC	2	6	220291	220296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204928
3106	NC_019699	AGGA	2	8	220338	220345	50 %	0 %	50 %	0 %	428204928
3107	NC_019699	AG	4	8	220424	220431	50 %	0 %	50 %	0 %	428204928
3108	NC_019699	GCC	2	6	220476	220481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204928
3109	NC_019699	GA	3	6	220571	220576	50 %	0 %	50 %	0 %	428204928
3110	NC_019699	CAG	2	6	220580	220585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204928
3111	NC_019699	CAA	2	6	220909	220914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204929
3112	NC_019699	TTG	2	6	220923	220928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204929
3113	NC_019699	GCT	2	6	221004	221009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204929
3114	NC_019699	TTC	2	6	221073	221078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204929
3115	NC_019699	TAT	2	6	221101	221106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204929
3116	NC_019699	A	6	6	221115	221120	100 %	0 %	0 %	0 %	428204929
3117	NC_019699	TTG	2	6	221181	221186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204929
3118	NC_019699	ACAG	2	8	221227	221234	50 %	0 %	25 %	25 %	428204929
3119	NC_019699	ATC	2	6	221263	221268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204929
3120	NC_019699	TTA	2	6	221270	221275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204929
3121	NC_019699	CAGT	2	8	221436	221443	25 %	25 %	25 %	25 %	428204929
3122	NC_019699	AAAT	2	8	221449	221456	75 %	25 %	0 %	0 %	428204929
3123	NC_019699	ATA	2	6	221504	221509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204929
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3242	NC_019699	CTG	2	6	230192	230197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204941
3243	NC_019699	TA	3	6	230199	230204	50 %	50 %	0 %	0 %	428204941
3244	NC_019699	TTG	2	6	230208	230213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204941
3245	NC_019699	AAAT	2	8	230232	230239	75 %	25 %	0 %	0 %	428204941
3246	NC_019699	TTC	2	6	230304	230309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204941
3247	NC_019699	CTC	2	6	230354	230359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204941
3248	NC_019699	TAC	2	6	230378	230383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204941
3249	NC_019699	GCT	2	6	230392	230397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204941
3250	NC_019699	CGAT	2	8	230404	230411	25 %	25 %	25 %	25 %	428204941
3251	NC_019699	TCT	2	6	230477	230482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204941
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3255	NC_019699	GTT	2	6	230975	230980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204942
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3259	NC_019699	TAC	2	6	231276	231281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204942
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3262	NC_019699	GA	3	6	231346	231351	50 %	0 %	50 %	0 %	428204942
3263	NC_019699	CGGA	2	8	231426	231433	25 %	0 %	50 %	25 %	428204942
3264	NC_019699	CCG	2	6	231496	231501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204942
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3269	NC_019699	ATTA	2	8	232491	232498	50 %	50 %	0 %	0 %	428204944
3270	NC_019699	CAAC	2	8	232513	232520	50 %	0 %	0 %	50 %	428204944
3271	NC_019699	GA	3	6	232612	232617	50 %	0 %	50 %	0 %	428204944
3272	NC_019699	TAGAA	2	10	232635	232644	60 %	20 %	20 %	0 %	428204944
3273	NC_019699	GAAGC	2	10	232651	232660	40 %	0 %	40 %	20 %	428204944
3274	NC_019699	GGA	2	6	232665	232670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204944
3275	NC_019699	T	6	6	232693	232698	0 %	100 %	0 %	0 %	428204944
3276	NC_019699	CTG	2	6	232745	232750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204944
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3291	NC_019699	TTG	2	6	234408	234413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204947
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3340	NC_019699	TGACCC	2	12	239322	239333	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428204951
3341	NC_019699	TTGT	2	8	239362	239369	0 %	75 %	25 %	0 %	428204951
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3344	NC_019699	CAAC	2	8	239425	239432	50 %	0 %	0 %	50 %	428204951
3345	NC_019699	TTG	2	6	239521	239526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204951
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3348	NC_019699	GTT	2	6	239819	239824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204952
3349	NC_019699	GATC	2	8	239828	239835	25 %	25 %	25 %	25 %	428204952
3350	NC_019699	AAT	2	6	239844	239849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204952
3351	NC_019699	GTA	2	6	239963	239968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204952
3352	NC_019699	GCT	2	6	239987	239992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204952
3353	NC_019699	AAC	2	6	240321	240326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204953
3354	NC_019699	ATG	2	6	240363	240368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204953
3355	NC_019699	A	7	7	240370	240376	100 %	0 %	0 %	0 %	428204953
3356	NC_019699	GTG	2	6	240454	240459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204953
3357	NC_019699	AAG	2	6	240510	240515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204953
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3360	NC_019699	GAT	2	6	240608	240613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204953
3361	NC_019699	TTG	2	6	240736	240741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204953
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3363	NC_019699	CAG	2	6	240864	240869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204953
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3486	NC_019699	G	6	6	247626	247631	0 %	0 %	100 %	0 %	428204958
3487	NC_019699	CTG	2	6	247639	247644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204958
3488	NC_019699	ATT	2	6	247646	247651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204958
3489	NC_019699	TGGC	2	8	247721	247728	0 %	25 %	50 %	25 %	428204958
3490	NC_019699	TTC	2	6	247733	247738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204958
3491	NC_019699	CAT	2	6	247768	247773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204958
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3494	NC_019699	TCT	2	6	247831	247836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204958
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