MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 5517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019699	GGT	2	6	108694	108699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204830
1502	NC_019699	GAA	2	6	108706	108711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204830
1503	NC_019699	GAA	2	6	108727	108732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204830
1504	NC_019699	CTC	2	6	108768	108773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204830
1505	NC_019699	TGG	2	6	108784	108789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204830
1506	NC_019699	TGGG	2	8	108803	108810	0 %	25 %	75 %	0 %	428204830
1507	NC_019699	CTGG	2	8	108817	108824	0 %	25 %	50 %	25 %	428204830
1508	NC_019699	TGGG	2	8	108832	108839	0 %	25 %	75 %	0 %	428204830
1509	NC_019699	CGT	2	6	108856	108861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204830
1510	NC_019699	CAAAT	2	10	108930	108939	60 %	20 %	0 %	20 %	428204830
1511	NC_019699	AAGC	2	8	108977	108984	50 %	0 %	25 %	25 %	428204830
1512	NC_019699	GTC	2	6	109059	109064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1513	NC_019699	ATT	2	6	109074	109079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204831
1514	NC_019699	TG	3	6	109085	109090	0 %	50 %	50 %	0 %	428204831
1515	NC_019699	TGC	2	6	109102	109107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1516	NC_019699	CCG	2	6	109143	109148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204831
1517	NC_019699	AGA	2	6	109187	109192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204831
1518	NC_019699	CGTT	2	8	109256	109263	0 %	50 %	25 %	25 %	428204831
1519	NC_019699	CAG	2	6	109356	109361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1520	NC_019699	CTG	2	6	109450	109455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1521	NC_019699	TAC	2	6	109457	109462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204831
1522	NC_019699	GAT	2	6	109466	109471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1523	NC_019699	CTG	2	6	109512	109517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1524	NC_019699	GCG	2	6	109552	109557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204831
1525	NC_019699	GATC	2	8	109676	109683	25 %	25 %	25 %	25 %	428204831
1526	NC_019699	ATCG	2	8	109724	109731	25 %	25 %	25 %	25 %	428204831
1527	NC_019699	GAA	2	6	109739	109744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204831
1528	NC_019699	TGC	2	6	109777	109782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1529	NC_019699	A	7	7	109847	109853	100 %	0 %	0 %	0 %	428204831
1530	NC_019699	TTC	2	6	109858	109863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204831
1531	NC_019699	AGC	2	6	109876	109881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1532	NC_019699	GAA	2	6	109929	109934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204831
1533	NC_019699	TAC	2	6	109967	109972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204831
1534	NC_019699	AG	3	6	109985	109990	50 %	0 %	50 %	0 %	428204831
1535	NC_019699	GTC	2	6	110055	110060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1536	NC_019699	TGA	2	6	110074	110079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1537	NC_019699	GGT	2	6	110090	110095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204831
1538	NC_019699	GCCCT	2	10	110109	110118	0 %	20 %	20 %	60 %	428204831
1539	NC_019699	TC	3	6	110121	110126	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
1540	NC_019699	GGGAT	2	10	110158	110167	20 %	20 %	60 %	0 %	428204831
1541	NC_019699	G	6	6	110184	110189	0 %	0 %	100 %	0 %	428204831
1542	NC_019699	TGG	2	6	110191	110196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204831
1543	NC_019699	AGT	2	6	110210	110215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1544	NC_019699	CAA	2	6	110268	110273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204831
1545	NC_019699	AGT	2	6	110300	110305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1546	NC_019699	ATT	2	6	110355	110360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204831
1547	NC_019699	TCT	2	6	110380	110385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204831
1548	NC_019699	CTG	2	6	110436	110441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1549	NC_019699	ATT	2	6	110445	110450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204831
1550	NC_019699	GGT	2	6	110459	110464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204831
1551	NC_019699	GAA	3	9	110523	110531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204831
1552	NC_019699	GCT	2	6	110573	110578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1553	NC_019699	TGG	3	9	110698	110706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204831
1554	NC_019699	GAC	2	6	110781	110786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1555	NC_019699	CG	3	6	110820	110825	0 %	0 %	50 %	50 %	428204831
1556	NC_019699	GCT	2	6	110955	110960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1557	NC_019699	TGA	2	6	110990	110995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1558	NC_019699	TC	3	6	110999	111004	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
1559	NC_019699	AAC	2	6	111052	111057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204831
1560	NC_019699	GGA	2	6	111069	111074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204831
1561	NC_019699	TGA	2	6	111088	111093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1562	NC_019699	GTC	2	6	111108	111113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1563	NC_019699	GCT	2	6	111177	111182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1564	NC_019699	TC	3	6	111247	111252	0 %	50 %	0 %	50 %	428204831
1565	NC_019699	CAG	3	9	111264	111272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1566	NC_019699	CGA	2	6	111309	111314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1567	NC_019699	GCA	2	6	111381	111386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1568	NC_019699	TCT	2	6	111453	111458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204831
1569	NC_019699	ACC	2	6	111530	111535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204831
1570	NC_019699	GC	3	6	111578	111583	0 %	0 %	50 %	50 %	428204831
1571	NC_019699	CA	3	6	111584	111589	50 %	0 %	0 %	50 %	428204831
1572	NC_019699	GGTT	2	8	111650	111657	0 %	50 %	50 %	0 %	428204831
1573	NC_019699	TGA	2	6	111673	111678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1574	NC_019699	GAT	2	6	111701	111706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1575	NC_019699	GT	3	6	111712	111717	0 %	50 %	50 %	0 %	428204831
1576	NC_019699	TGG	2	6	111760	111765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204831
1577	NC_019699	TCA	2	6	111769	111774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204831
1578	NC_019699	TGT	2	6	111805	111810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204831
1579	NC_019699	ACC	2	6	111826	111831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204831
1580	NC_019699	ACG	2	6	111856	111861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1581	NC_019699	TGC	2	6	111931	111936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1582	NC_019699	AGT	2	6	111986	111991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204831
1583	NC_019699	GGT	2	6	111999	112004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204831
1584	NC_019699	GCT	2	6	112028	112033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1585	NC_019699	GCT	2	6	112095	112100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204831
1586	NC_019699	CCG	2	6	112327	112332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204832
1587	NC_019699	AATCCG	2	12	112348	112359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428204832
1588	NC_019699	GCA	2	6	112419	112424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1589	NC_019699	GCT	2	6	112495	112500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1590	NC_019699	GCAG	2	8	112512	112519	25 %	0 %	50 %	25 %	428204832
1591	NC_019699	AG	3	6	112573	112578	50 %	0 %	50 %	0 %	428204832
1592	NC_019699	GAC	2	6	112585	112590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1593	NC_019699	TCT	2	6	112612	112617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204832
1594	NC_019699	CTG	2	6	112667	112672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1595	NC_019699	AGA	2	6	112675	112680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204832
1596	NC_019699	TCGA	2	8	112718	112725	25 %	25 %	25 %	25 %	428204832
1597	NC_019699	GAGC	2	8	112743	112750	25 %	0 %	50 %	25 %	428204832
1598	NC_019699	CTA	2	6	112776	112781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204832
1599	NC_019699	CGA	2	6	112797	112802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1600	NC_019699	GCT	3	9	112822	112830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1601	NC_019699	GAA	2	6	112870	112875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204832
1602	NC_019699	CGTG	2	8	112902	112909	0 %	25 %	50 %	25 %	428204832
1603	NC_019699	CGT	2	6	112975	112980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1604	NC_019699	TTG	2	6	112993	112998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204832
1605	NC_019699	TGC	2	6	113025	113030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1606	NC_019699	GCAG	2	8	113047	113054	25 %	0 %	50 %	25 %	428204832
1607	NC_019699	CAA	2	6	113113	113118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204832
1608	NC_019699	CAG	2	6	113143	113148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1609	NC_019699	GCA	2	6	113254	113259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1610	NC_019699	GCT	2	6	113296	113301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1611	NC_019699	AGG	2	6	113318	113323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204832
1612	NC_019699	GCA	2	6	113423	113428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1613	NC_019699	TGCAA	2	10	113445	113454	40 %	20 %	20 %	20 %	428204832
1614	NC_019699	GAG	2	6	113498	113503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204832
1615	NC_019699	TGC	2	6	113526	113531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204832
1616	NC_019699	GGA	2	6	113829	113834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204833
1617	NC_019699	GTT	2	6	113887	113892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204833
1618	NC_019699	CGG	2	6	114007	114012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204833
1619	NC_019699	CTGCGG	2	12	114013	114024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428204833
1620	NC_019699	AAT	2	6	114025	114030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204833
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1742	NC_019699	TAT	2	6	121693	121698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204839
1743	NC_019699	TCA	2	6	121725	121730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204839
1744	NC_019699	CGAT	2	8	121786	121793	25 %	25 %	25 %	25 %	428204839
1745	NC_019699	TAAA	2	8	121862	121869	75 %	25 %	0 %	0 %	428204839
1746	NC_019699	TCTA	2	8	122027	122034	25 %	50 %	0 %	25 %	428204840
1747	NC_019699	T	6	6	122044	122049	0 %	100 %	0 %	0 %	428204840
1748	NC_019699	TAT	2	6	122082	122087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204840
1749	NC_019699	TG	3	6	122109	122114	0 %	50 %	50 %	0 %	428204840
1750	NC_019699	TTC	2	6	122181	122186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204840
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1752	NC_019699	AGT	2	6	122226	122231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204840
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1754	NC_019699	CACT	2	8	122246	122253	25 %	25 %	0 %	50 %	428204840
1755	NC_019699	ACT	2	6	122284	122289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204840
1756	NC_019699	AAAT	2	8	122299	122306	75 %	25 %	0 %	0 %	428204840
1757	NC_019699	TTCG	2	8	122339	122346	0 %	50 %	25 %	25 %	428204840
1758	NC_019699	CCT	2	6	122350	122355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204840
1759	NC_019699	GATG	2	8	122473	122480	25 %	25 %	50 %	0 %	428204840
1760	NC_019699	ACT	2	6	122587	122592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204840
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1762	NC_019699	ATT	2	6	122644	122649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204840
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1765	NC_019699	ACG	2	6	122785	122790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204840
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1770	NC_019699	TAAA	2	8	122928	122935	75 %	25 %	0 %	0 %	428204840
1771	NC_019699	T	7	7	122968	122974	0 %	100 %	0 %	0 %	428204840
1772	NC_019699	T	6	6	123023	123028	0 %	100 %	0 %	0 %	428204840
1773	NC_019699	TGC	2	6	123723	123728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204841
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1775	NC_019699	ATA	2	6	123824	123829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204841
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1780	NC_019699	TG	3	6	124185	124190	0 %	50 %	50 %	0 %	428204841
1781	NC_019699	TAG	2	6	124194	124199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204841
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1840	NC_019699	A	6	6	128105	128110	100 %	0 %	0 %	0 %	428204844
1841	NC_019699	GGA	2	6	128187	128192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204844
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1845	NC_019699	TTGC	2	8	128409	128416	0 %	50 %	25 %	25 %	428204844
1846	NC_019699	AGTT	2	8	128448	128455	25 %	50 %	25 %	0 %	428204844
1847	NC_019699	CAT	2	6	128557	128562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204845
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1855	NC_019699	TCTG	2	8	128753	128760	0 %	50 %	25 %	25 %	428204845
1856	NC_019699	GA	4	8	128767	128774	50 %	0 %	50 %	0 %	428204845
1857	NC_019699	ATG	2	6	128783	128788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204845
1858	NC_019699	CTG	2	6	129001	129006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204846
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1986	NC_019699	GAA	2	6	139258	139263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204856
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1988	NC_019699	CTG	2	6	139528	139533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204856
1989	NC_019699	CCAA	2	8	139618	139625	50 %	0 %	0 %	50 %	428204856
1990	NC_019699	AGC	2	6	139644	139649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204856
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1997	NC_019699	CTG	2	6	141071	141076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204858
1998	NC_019699	AAAAC	2	10	141083	141092	80 %	0 %	0 %	20 %	428204858
1999	NC_019699	GCA	2	6	141163	141168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204858
2000	NC_019699	AGA	2	6	141187	141192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204858

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