MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01

Total Repeats: 5517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019699	TGA	2	6	36733	36738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204762
502	NC_019699	ACA	2	6	36783	36788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204762
503	NC_019699	CCA	2	6	36868	36873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204762
504	NC_019699	CAA	2	6	36922	36927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204762
505	NC_019699	GTT	2	6	36951	36956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204762
506	NC_019699	TTG	2	6	37052	37057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204762
507	NC_019699	CGC	2	6	37136	37141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204762
508	NC_019699	CTT	2	6	37219	37224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204762
509	NC_019699	AAT	2	6	37382	37387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204762
510	NC_019699	CTG	2	6	37465	37470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204763
511	NC_019699	GAT	2	6	37479	37484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204763
512	NC_019699	GAT	2	6	37502	37507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204763
513	NC_019699	CTCG	2	8	37530	37537	0 %	25 %	25 %	50 %	428204763
514	NC_019699	ACCATT	2	12	37573	37584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204763
515	NC_019699	AGTC	2	8	37609	37616	25 %	25 %	25 %	25 %	428204763
516	NC_019699	CGA	2	6	37649	37654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204763
517	NC_019699	CTG	2	6	37671	37676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204763
518	NC_019699	AGC	2	6	37681	37686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204763
519	NC_019699	TCC	2	6	37702	37707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204763
520	NC_019699	TGC	2	6	37708	37713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204763
521	NC_019699	ACC	2	6	37722	37727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204763
522	NC_019699	CTG	2	6	37743	37748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204763
523	NC_019699	T	6	6	37764	37769	0 %	100 %	0 %	0 %	428204763
524	NC_019699	CTTG	2	8	37778	37785	0 %	50 %	25 %	25 %	428204763
525	NC_019699	CTG	3	9	37806	37814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204763
526	NC_019699	CTT	2	6	37818	37823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204763
527	NC_019699	CCA	2	6	38004	38009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204763
528	NC_019699	TAC	2	6	38128	38133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204763
529	NC_019699	CCA	2	6	38148	38153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204763
530	NC_019699	TGAC	3	12	38217	38228	25 %	25 %	25 %	25 %	428204763
531	NC_019699	TCA	2	6	38301	38306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204763
532	NC_019699	GTT	2	6	38421	38426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204763
533	NC_019699	GCA	2	6	38444	38449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204763
534	NC_019699	TCGGCT	2	12	38507	38518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204763
535	NC_019699	CGG	2	6	38531	38536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204763
536	NC_019699	CTG	2	6	38691	38696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204763
537	NC_019699	TTG	2	6	38725	38730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204763
538	NC_019699	CGCT	2	8	38779	38786	0 %	25 %	25 %	50 %	428204763
539	NC_019699	CTA	2	6	38811	38816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204763
540	NC_019699	AAC	2	6	38879	38884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204763
541	NC_019699	CTTG	2	8	38925	38932	0 %	50 %	25 %	25 %	428204763
542	NC_019699	GTT	2	6	39053	39058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204763
543	NC_019699	TCC	3	9	39073	39081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204763
544	NC_019699	GCG	2	6	39166	39171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204763
545	NC_019699	TGT	2	6	39528	39533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204764
546	NC_019699	ATA	2	6	39540	39545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204764
547	NC_019699	T	6	6	39581	39586	0 %	100 %	0 %	0 %	428204764
548	NC_019699	ATC	2	6	39630	39635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204764
549	NC_019699	CAT	4	12	39686	39697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204764
550	NC_019699	AGA	2	6	39713	39718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204764
551	NC_019699	CAT	2	6	39725	39730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204764
552	NC_019699	AAT	2	6	39833	39838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204764
553	NC_019699	T	6	6	39851	39856	0 %	100 %	0 %	0 %	428204764
554	NC_019699	CTG	2	6	39878	39883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204764
555	NC_019699	CTT	2	6	39886	39891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204764
556	NC_019699	CAT	2	6	39995	40000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204764
557	NC_019699	CCG	2	6	40002	40007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204764
558	NC_019699	TGC	2	6	40011	40016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204764
559	NC_019699	TGC	2	6	40053	40058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204764
560	NC_019699	GCC	2	6	40067	40072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428204764
561	NC_019699	TGC	2	6	40074	40079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204764
562	NC_019699	ACA	2	6	40976	40981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204765
563	NC_019699	GCT	2	6	40989	40994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204765
564	NC_019699	ACTT	2	8	41027	41034	25 %	50 %	0 %	25 %	428204765
565	NC_019699	TTG	2	6	41044	41049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204765
566	NC_019699	CGCACC	2	12	41075	41086	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428204765
567	NC_019699	TAG	2	6	41104	41109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204765
568	NC_019699	CAA	2	6	41235	41240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204765
569	NC_019699	CAC	2	6	41391	41396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204765
570	NC_019699	ATCG	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	428204765
571	NC_019699	CAA	2	6	41481	41486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204765
572	NC_019699	GAA	2	6	41522	41527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204765
573	NC_019699	TGCT	2	8	41593	41600	0 %	50 %	25 %	25 %	428204765
574	NC_019699	CAC	2	6	41942	41947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204766
575	NC_019699	CGA	2	6	41984	41989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204766
576	NC_019699	TTC	2	6	41990	41995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204766
577	NC_019699	TAC	2	6	42026	42031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204766
578	NC_019699	CG	3	6	42062	42067	0 %	0 %	50 %	50 %	428204766
579	NC_019699	ATG	2	6	42182	42187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204766
580	NC_019699	TTTA	2	8	42218	42225	25 %	75 %	0 %	0 %	428204766
581	NC_019699	TTG	2	6	42285	42290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204766
582	NC_019699	CAT	2	6	42292	42297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204766
583	NC_019699	GCT	2	6	42298	42303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204766
584	NC_019699	ACA	2	6	42433	42438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204766
585	NC_019699	CGAT	2	8	42477	42484	25 %	25 %	25 %	25 %	428204766
586	NC_019699	CAAG	2	8	42553	42560	50 %	0 %	25 %	25 %	428204766
587	NC_019699	ACT	2	6	42638	42643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204766
588	NC_019699	TGGC	2	8	42773	42780	0 %	25 %	50 %	25 %	428204766
589	NC_019699	CGCA	2	8	42843	42850	25 %	0 %	25 %	50 %	428204766
590	NC_019699	GAGC	2	8	42938	42945	25 %	0 %	50 %	25 %	428204766
591	NC_019699	TGA	2	6	43033	43038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204766
592	NC_019699	TCG	2	6	43120	43125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204766
593	NC_019699	CAAC	2	8	43195	43202	50 %	0 %	0 %	50 %	428204766
594	NC_019699	CAG	2	6	43254	43259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204766
595	NC_019699	AGC	2	6	43323	43328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428204766
596	NC_019699	GGT	2	6	43414	43419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204766
597	NC_019699	GAT	2	6	43420	43425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204766
598	NC_019699	GGA	2	6	43462	43467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428204766
599	NC_019699	ATCG	2	8	43475	43482	25 %	25 %	25 %	25 %	428204766
600	NC_019699	CTA	2	6	43483	43488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204766
601	NC_019699	ATG	2	6	43575	43580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204766
602	NC_019699	ATTA	2	8	43660	43667	50 %	50 %	0 %	0 %	428204766
603	NC_019699	TAG	2	6	43669	43674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428204766
604	NC_019699	TGC	2	6	43728	43733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204766
605	NC_019699	GGTG	2	8	43825	43832	0 %	25 %	75 %	0 %	428204766
606	NC_019699	TGT	3	9	43855	43863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428204766
607	NC_019699	TTA	2	6	43880	43885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204766
608	NC_019699	AGA	2	6	43903	43908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204766
609	NC_019699	TTC	2	6	44629	44634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204767
610	NC_019699	ATT	2	6	44680	44685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204767
611	NC_019699	CTTG	2	8	44751	44758	0 %	50 %	25 %	25 %	428204767
612	NC_019699	GGC	2	6	44764	44769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428204767
613	NC_019699	CATA	2	8	44804	44811	50 %	25 %	0 %	25 %	428204767
614	NC_019699	TAC	2	6	44812	44817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428204767
615	NC_019699	TCT	2	6	44895	44900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428204767
616	NC_019699	CTG	3	9	44931	44939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428204767
617	NC_019699	AAT	2	6	44968	44973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428204767
618	NC_019699	CCA	2	6	45020	45025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428204767
619	NC_019699	TCC	2	6	45103	45108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428204767
620	NC_019699	TGG	2	6	45124	45129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428204767
621	NC_019699	AT	3	6	45131	45136	50 %	50 %	0 %	0 %	428204767
622	NC_019699	ATT	2	6	45142	45147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428204767
623	NC_019699	AGA	2	6	45182	45187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428204767
624	NC_019699	CAA	2	6	45213	45218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428204767
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626	NC_019699	T	7	7	45271	45277	0 %	100 %	0 %	0 %	428204767
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