MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.02

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019698	GGC	2	6	769	774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389902
2	NC_019698	TGA	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389902
3	NC_019698	ATT	2	6	866	871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389902
4	NC_019698	CCA	2	6	957	962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389902
5	NC_019698	TGA	3	9	1012	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389902
6	NC_019698	TAA	2	6	1201	1206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389903
7	NC_019698	CTC	2	6	1207	1212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389903
8	NC_019698	AGT	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389903
9	NC_019698	CTT	2	6	1350	1355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389903
10	NC_019698	TAG	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389903
11	NC_019698	ATA	2	6	1376	1381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389903
12	NC_019698	TAG	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389903
13	NC_019698	ATC	2	6	1520	1525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389903
14	NC_019698	GCC	2	6	1589	1594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389903
15	NC_019698	ATT	2	6	1702	1707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389903
16	NC_019698	CGG	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389903
17	NC_019698	ACC	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389903
18	NC_019698	GAC	2	6	1887	1892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389903
19	NC_019698	CGC	2	6	1928	1933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389903
20	NC_019698	AAC	2	6	2051	2056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389903
21	NC_019698	TAG	2	6	2131	2136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389903
22	NC_019698	ACA	2	6	2347	2352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389904
23	NC_019698	TGC	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389904
24	NC_019698	ATG	2	6	2636	2641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389904
25	NC_019698	GCT	3	9	2647	2655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389904
26	NC_019698	AAG	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389904
27	NC_019698	AGC	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389904
28	NC_019698	ATC	2	6	2832	2837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389904
29	NC_019698	TGC	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389904
30	NC_019698	TGA	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389904
31	NC_019698	ACC	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389905
32	NC_019698	AAT	2	6	2976	2981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389905
33	NC_019698	GAT	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389905
34	NC_019698	AGC	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389905
35	NC_019698	AGG	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389905
36	NC_019698	TCT	2	6	3522	3527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389906
37	NC_019698	CCG	2	6	3660	3665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389906
38	NC_019698	TGT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389906
39	NC_019698	GAT	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389906
40	NC_019698	CGT	2	6	3714	3719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389906
41	NC_019698	CAG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389906
42	NC_019698	TTG	2	6	3760	3765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389906
43	NC_019698	TGA	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389906
44	NC_019698	CCG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389906
45	NC_019698	GGA	2	6	4069	4074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434389906
46	NC_019698	TGT	2	6	4113	4118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389906
47	NC_019698	TAA	2	6	4133	4138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389906
48	NC_019698	ACA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389907
49	NC_019698	ACA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389907
50	NC_019698	CGC	2	6	4540	4545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389907
51	NC_019698	CGC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389907
52	NC_019698	GAC	2	6	4751	4756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
53	NC_019698	AGC	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
54	NC_019698	GCC	2	6	4898	4903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389907
55	NC_019698	CGA	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
56	NC_019698	CGG	2	6	5007	5012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389907
57	NC_019698	CGC	2	6	5173	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389907
58	NC_019698	GAC	2	6	5205	5210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
59	NC_019698	TGA	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389907
60	NC_019698	GAC	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
61	NC_019698	ACG	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
62	NC_019698	GCG	2	6	5529	5534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389907
63	NC_019698	AGT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389907
64	NC_019698	CGA	2	6	5719	5724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
65	NC_019698	CTG	2	6	5747	5752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389907
66	NC_019698	CGC	2	6	5821	5826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389907
67	NC_019698	CAG	2	6	5979	5984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
68	NC_019698	AGC	2	6	5992	5997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
69	NC_019698	ATC	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389907
70	NC_019698	CAT	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389907
71	NC_019698	GCA	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
72	NC_019698	CGC	2	6	6457	6462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389907
73	NC_019698	CGA	2	6	6493	6498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389907
74	NC_019698	CAT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389907
75	NC_019698	TCA	2	6	6634	6639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389907
76	NC_019698	CAA	2	6	6689	6694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389907
77	NC_019698	ACT	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389907
78	NC_019698	GCC	3	9	6917	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389907
79	NC_019698	GGT	2	6	7308	7313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389907
80	NC_019698	CAC	2	6	7339	7344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389907
81	NC_019698	TAA	2	6	7348	7353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389907
82	NC_019698	ACC	2	6	7833	7838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389908
83	NC_019698	ATT	2	6	7918	7923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389908
84	NC_019698	ATC	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389908
85	NC_019698	GCA	2	6	8093	8098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389908
86	NC_019698	ATC	2	6	8099	8104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389908
87	NC_019698	GCA	2	6	8156	8161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389908
88	NC_019698	CAT	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389908
89	NC_019698	CAG	2	6	8298	8303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389908
90	NC_019698	CTG	2	6	8314	8319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389908
91	NC_019698	TTA	2	6	8375	8380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389908
92	NC_019698	ATC	2	6	8960	8965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389909
93	NC_019698	ATT	2	6	8977	8982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389909
94	NC_019698	CTG	2	6	9016	9021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389909
95	NC_019698	CGG	2	6	9044	9049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389909
96	NC_019698	CAC	2	6	9063	9068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389909
97	NC_019698	TCT	2	6	9077	9082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389909
98	NC_019698	CTA	2	6	9083	9088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389909
99	NC_019698	GAC	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389910
100	NC_019698	AGC	2	6	9142	9147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434389910
101	NC_019698	TCC	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389910
102	NC_019698	TAT	2	6	9293	9298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389910
103	NC_019698	CAT	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389910
104	NC_019698	TAC	2	6	9497	9502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389910
105	NC_019698	TAA	2	6	9515	9520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389910
106	NC_019698	CTC	2	6	9540	9545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389910
107	NC_019698	CCA	3	9	9739	9747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389910
108	NC_019698	CTT	2	6	9831	9836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434389911
109	NC_019698	GCT	2	6	9889	9894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389911
110	NC_019698	TTA	2	6	9961	9966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389911
111	NC_019698	ACT	2	6	10035	10040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389911
112	NC_019698	CAC	2	6	10104	10109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389911
113	NC_019698	GGT	2	6	10135	10140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389911
114	NC_019698	GCG	2	6	10884	10889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434389912
115	NC_019698	CCT	2	6	10935	10940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434389912
116	NC_019698	GAA	2	6	11021	11026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434389912
117	NC_019698	TGG	2	6	11146	11151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389912
118	NC_019698	CCG	2	6	11202	11207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389912
119	NC_019698	TGG	2	6	11521	11526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389913
120	NC_019698	GGT	2	6	11571	11576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389913
121	NC_019698	ATG	2	6	11619	11624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389913
122	NC_019698	GCC	2	6	11778	11783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389913
123	NC_019698	GTC	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389913
124	NC_019698	TCG	2	6	11974	11979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389913
125	NC_019698	CAA	4	12	11994	12005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389913
126	NC_019698	CGC	2	6	12023	12028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389913
127	NC_019698	CAA	2	6	12117	12122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434389913
128	NC_019698	CCA	2	6	12125	12130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434389913
129	NC_019698	TCA	2	6	12202	12207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434389913
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134	NC_019698	CCG	2	6	12388	12393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434389913
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254	NC_019698	AGT	2	6	30681	30686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434389921
255	NC_019698	GGT	2	6	30706	30711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434389922
256	NC_019698	TAA	2	6	30744	30749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434389922
257	NC_019698	TTA	2	6	30765	30770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434389922
258	NC_019698	TCG	2	6	30784	30789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389922
259	NC_019698	GCT	2	6	30901	30906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434389922
260	NC_019698	TTG	2	6	30930	30935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434389922

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.