MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 2995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019697	TTTTA	2	10	2806	2815	20 %	80 %	0 %	0 %	434384227
2	NC_019697	TGGCG	2	10	3320	3329	0 %	20 %	60 %	20 %	434384228
3	NC_019697	AGGCG	2	10	3683	3692	20 %	0 %	60 %	20 %	434384228
4	NC_019697	CCAAC	2	10	4518	4527	40 %	0 %	0 %	60 %	434384229
5	NC_019697	CTTGC	2	10	5466	5475	0 %	40 %	20 %	40 %	434384230
6	NC_019697	CGATT	2	10	5699	5708	20 %	40 %	20 %	20 %	434384230
7	NC_019697	TGCTC	2	10	6078	6087	0 %	40 %	20 %	40 %	434384231
8	NC_019697	ATTTC	2	10	7034	7043	20 %	60 %	0 %	20 %	434384232
9	NC_019697	TTTGA	2	10	12122	12131	20 %	60 %	20 %	0 %	434384239
10	NC_019697	TCAGT	2	10	12468	12477	20 %	40 %	20 %	20 %	434384239
11	NC_019697	GATCG	2	10	14157	14166	20 %	20 %	40 %	20 %	434384240
12	NC_019697	ACGAT	2	10	14281	14290	40 %	20 %	20 %	20 %	434384240
13	NC_019697	GCAGC	2	10	14553	14562	20 %	0 %	40 %	40 %	434384240
14	NC_019697	TCGGA	2	10	16236	16245	20 %	20 %	40 %	20 %	434384240
15	NC_019697	AGCCG	2	10	16538	16547	20 %	0 %	40 %	40 %	434384240
16	NC_019697	TCCCA	2	10	21685	21694	20 %	20 %	0 %	60 %	434384243
17	NC_019697	CATCG	2	10	24898	24907	20 %	20 %	20 %	40 %	434384247
18	NC_019697	AGTCA	2	10	27018	27027	40 %	20 %	20 %	20 %	434384248
19	NC_019697	GATCG	2	10	27498	27507	20 %	20 %	40 %	20 %	434384248
20	NC_019697	TGACT	2	10	29883	29892	20 %	40 %	20 %	20 %	434384250
21	NC_019697	AGTAA	2	10	31467	31476	60 %	20 %	20 %	0 %	434384250
22	NC_019697	GAATA	2	10	36454	36463	60 %	20 %	20 %	0 %	434384256
23	NC_019697	TTAAC	2	10	40963	40972	40 %	40 %	0 %	20 %	434384261
24	NC_019697	TTGGC	2	10	44061	44070	0 %	40 %	40 %	20 %	434384264
25	NC_019697	TTGGA	2	10	45686	45695	20 %	40 %	40 %	0 %	434384265
26	NC_019697	GCGAT	2	10	45770	45779	20 %	20 %	40 %	20 %	434384265
27	NC_019697	TTATC	2	10	49159	49168	20 %	60 %	0 %	20 %	434384268
28	NC_019697	AATTT	2	10	49427	49436	40 %	60 %	0 %	0 %	434384268
29	NC_019697	ACCGC	2	10	49763	49772	20 %	0 %	20 %	60 %	434384269
30	NC_019697	TGGAA	2	10	51916	51925	40 %	20 %	40 %	0 %	434384270
31	NC_019697	AAGAA	2	10	55523	55532	80 %	0 %	20 %	0 %	434384271
32	NC_019697	GATCG	2	10	57651	57660	20 %	20 %	40 %	20 %	434384273
33	NC_019697	CGATG	2	10	57848	57857	20 %	20 %	40 %	20 %	434384273
34	NC_019697	CGATC	2	10	57899	57908	20 %	20 %	20 %	40 %	434384273
35	NC_019697	AGCCT	2	10	58374	58383	20 %	20 %	20 %	40 %	434384274
36	NC_019697	TTGAG	2	10	58555	58564	20 %	40 %	40 %	0 %	434384274
37	NC_019697	GATCG	2	10	60989	60998	20 %	20 %	40 %	20 %	434384276
38	NC_019697	AGTTG	2	10	65960	65969	20 %	40 %	40 %	0 %	434384281
39	NC_019697	GGGAT	2	10	66875	66884	20 %	20 %	60 %	0 %	434384281
40	NC_019697	CGCCA	2	10	67969	67978	20 %	0 %	20 %	60 %	434384283
41	NC_019697	CGATC	2	10	69114	69123	20 %	20 %	20 %	40 %	434384284
42	NC_019697	CCGCA	2	10	69155	69164	20 %	0 %	20 %	60 %	434384284
43	NC_019697	TATCG	2	10	69447	69456	20 %	40 %	20 %	20 %	434384284
44	NC_019697	CAGCA	2	10	70499	70508	40 %	0 %	20 %	40 %	434384285
45	NC_019697	ATCTT	2	10	71313	71322	20 %	60 %	0 %	20 %	434384286
46	NC_019697	AACTC	2	10	79406	79415	40 %	20 %	0 %	40 %	434384294
47	NC_019697	CAATA	2	10	80268	80277	60 %	20 %	0 %	20 %	434384295
48	NC_019697	AGCTA	2	10	82919	82928	40 %	20 %	20 %	20 %	434384298
49	NC_019697	TCTAT	2	10	90971	90980	20 %	60 %	0 %	20 %	434384307
50	NC_019697	TGGCT	2	10	93481	93490	0 %	40 %	40 %	20 %	434384310
51	NC_019697	CTTGA	2	10	94183	94192	20 %	40 %	20 %	20 %	434384311
52	NC_019697	ATTAT	2	10	96558	96567	40 %	60 %	0 %	0 %	434384313
53	NC_019697	ATTAA	2	10	101082	101091	60 %	40 %	0 %	0 %	434384316
54	NC_019697	TGCTT	2	10	101688	101697	0 %	60 %	20 %	20 %	434384316
55	NC_019697	CAAAC	2	10	102466	102475	60 %	0 %	0 %	40 %	434384318
56	NC_019697	AGGCT	2	10	104662	104671	20 %	20 %	40 %	20 %	434384319
57	NC_019697	TTGCC	2	10	105052	105061	0 %	40 %	20 %	40 %	434384320
58	NC_019697	AGTTT	2	10	107979	107988	20 %	60 %	20 %	0 %	434384323
59	NC_019697	CGATC	2	10	111353	111362	20 %	20 %	20 %	40 %	434384326
60	NC_019697	TCGAC	2	10	112200	112209	20 %	20 %	20 %	40 %	434384327
61	NC_019697	AACTA	2	10	112805	112814	60 %	20 %	0 %	20 %	434384329
62	NC_019697	TCACC	2	10	114402	114411	20 %	20 %	0 %	60 %	434384330
63	NC_019697	ATCGC	2	10	116333	116342	20 %	20 %	20 %	40 %	434384332
64	NC_019697	ATGCC	2	10	116375	116384	20 %	20 %	20 %	40 %	434384332
65	NC_019697	CGATC	2	10	116793	116802	20 %	20 %	20 %	40 %	434384333
66	NC_019697	CGATC	2	10	118569	118578	20 %	20 %	20 %	40 %	434384334
67	NC_019697	CGATC	2	10	120350	120359	20 %	20 %	20 %	40 %	434384336
68	NC_019697	CGATC	2	10	120941	120950	20 %	20 %	20 %	40 %	434384336
69	NC_019697	AGTTT	2	10	122355	122364	20 %	60 %	20 %	0 %	434384339
70	NC_019697	TCCAC	2	10	126349	126358	20 %	20 %	0 %	60 %	434384343
71	NC_019697	CATTC	2	10	127759	127768	20 %	40 %	0 %	40 %	434384346
72	NC_019697	AGCCA	2	10	128459	128468	40 %	0 %	20 %	40 %	434384346
73	NC_019697	ATTGG	2	10	131253	131262	20 %	40 %	40 %	0 %	434384350
74	NC_019697	AACCA	2	10	132964	132973	60 %	0 %	0 %	40 %	434384351
75	NC_019697	GCATC	2	10	132975	132984	20 %	20 %	20 %	40 %	434384351
76	NC_019697	TGCGC	2	10	134457	134466	0 %	20 %	40 %	40 %	434384352
77	NC_019697	TATTT	2	10	137738	137747	20 %	80 %	0 %	0 %	434384353
78	NC_019697	CTCAT	2	10	144137	144146	20 %	40 %	0 %	40 %	434384359
79	NC_019697	GTTTG	2	10	145908	145917	0 %	60 %	40 %	0 %	434384360
80	NC_019697	AGCAA	2	10	147223	147232	60 %	0 %	20 %	20 %	434384361
81	NC_019697	CGGGA	2	10	150358	150367	20 %	0 %	60 %	20 %	434384363
82	NC_019697	ATGCA	2	10	153110	153119	40 %	20 %	20 %	20 %	434384365
83	NC_019697	AGAAA	2	10	154293	154302	80 %	0 %	20 %	0 %	434384365
84	NC_019697	CATGC	2	10	155290	155299	20 %	20 %	20 %	40 %	434384365
85	NC_019697	TTCGG	2	10	158279	158288	0 %	40 %	40 %	20 %	434384367
86	NC_019697	TCCCA	2	10	161103	161112	20 %	20 %	0 %	60 %	434384370
87	NC_019697	GCGGT	2	10	161428	161437	0 %	20 %	60 %	20 %	434384370
88	NC_019697	TTTGC	2	10	165043	165052	0 %	60 %	20 %	20 %	434384375
89	NC_019697	ATCAA	2	10	175095	175104	60 %	20 %	0 %	20 %	434384383
90	NC_019697	CGCCT	2	10	175457	175466	0 %	20 %	20 %	60 %	434384383
91	NC_019697	GGATC	2	10	177016	177025	20 %	20 %	40 %	20 %	434384385
92	NC_019697	ATTAT	2	10	181130	181139	40 %	60 %	0 %	0 %	434384389
93	NC_019697	AGGGG	2	10	183465	183474	20 %	0 %	80 %	0 %	434384391
94	NC_019697	ATCGC	2	10	184495	184504	20 %	20 %	20 %	40 %	434384392
95	NC_019697	GTGCT	2	10	190894	190903	0 %	40 %	40 %	20 %	434384396
96	NC_019697	AAACC	2	10	196972	196981	60 %	0 %	0 %	40 %	434384404
97	NC_019697	AAATT	2	10	197053	197062	60 %	40 %	0 %	0 %	434384404
98	NC_019697	CGGTT	2	10	198615	198624	0 %	40 %	40 %	20 %	434384405
99	NC_019697	TAAAT	2	10	199772	199781	60 %	40 %	0 %	0 %	434384406
100	NC_019697	CGTAG	2	10	200398	200407	20 %	20 %	40 %	20 %	434384406
101	NC_019697	CAATC	2	10	203572	203581	40 %	20 %	0 %	40 %	434384408
102	NC_019697	TCATA	2	10	204185	204194	40 %	40 %	0 %	20 %	434384408
103	NC_019697	AACTA	2	10	205208	205217	60 %	20 %	0 %	20 %	434384409
104	NC_019697	AAGAT	2	10	207138	207147	60 %	20 %	20 %	0 %	434384410
105	NC_019697	TCGTT	2	10	210752	210761	0 %	60 %	20 %	20 %	434384414
106	NC_019697	TAAAT	2	10	211144	211153	60 %	40 %	0 %	0 %	434384414
107	NC_019697	CCATA	2	10	211461	211470	40 %	20 %	0 %	40 %	434384414
108	NC_019697	CGCTC	2	10	213303	213312	0 %	20 %	20 %	60 %	434384415
109	NC_019697	GCCAT	2	10	213487	213496	20 %	20 %	20 %	40 %	434384415
110	NC_019697	AGATT	2	10	213730	213739	40 %	40 %	20 %	0 %	434384415
111	NC_019697	GTAAC	2	10	216531	216540	40 %	20 %	20 %	20 %	434384417
112	NC_019697	TGGCT	2	10	217156	217165	0 %	40 %	40 %	20 %	434384417
113	NC_019697	TAACT	2	10	219890	219899	40 %	40 %	0 %	20 %	434384418
114	NC_019697	TTAAC	2	10	220333	220342	40 %	40 %	0 %	20 %	434384418
115	NC_019697	ATTCA	2	10	220392	220401	40 %	40 %	0 %	20 %	434384418
116	NC_019697	CGTGA	2	10	220518	220527	20 %	20 %	40 %	20 %	434384418
117	NC_019697	CTGGT	2	10	228483	228492	0 %	40 %	40 %	20 %	434384429
118	NC_019697	TGAAT	2	10	231900	231909	40 %	40 %	20 %	0 %	434384432
119	NC_019697	CAAAG	2	10	243269	243278	60 %	0 %	20 %	20 %	434384444
120	NC_019697	AAACT	2	10	246903	246912	60 %	20 %	0 %	20 %	434384447
121	NC_019697	GGATT	2	10	247107	247116	20 %	40 %	40 %	0 %	434384447
122	NC_019697	TTGGG	2	10	249576	249585	0 %	40 %	60 %	0 %	434384449
123	NC_019697	GGATC	2	10	252446	252455	20 %	20 %	40 %	20 %	434384454
124	NC_019697	ACTCC	2	10	252623	252632	20 %	20 %	0 %	60 %	434384455
125	NC_019697	TTGGC	2	10	255682	255691	0 %	40 %	40 %	20 %	434384456
126	NC_019697	TTGCC	2	10	256795	256804	0 %	40 %	20 %	40 %	434384456
127	NC_019697	GGGAA	2	10	261544	261553	40 %	0 %	60 %	0 %	434384458
128	NC_019697	CAAAA	2	10	265054	265063	80 %	0 %	0 %	20 %	434384462
129	NC_019697	AGAGG	2	10	267110	267119	40 %	0 %	60 %	0 %	434384462
130	NC_019697	CGATT	2	10	280578	280587	20 %	40 %	20 %	20 %	434384471
131	NC_019697	GCCAT	2	10	281156	281165	20 %	20 %	20 %	40 %	434384471
132	NC_019697	ATCGG	2	10	281543	281552	20 %	20 %	40 %	20 %	434384471
133	NC_019697	ATCGG	2	10	281984	281993	20 %	20 %	40 %	20 %	434384471
134	NC_019697	CGAAC	2	10	284002	284011	40 %	0 %	20 %	40 %	434384473
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