MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 101117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019697	GTT	2	6	236432	236437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384436
4002	NC_019697	TAT	2	6	236486	236491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384436
4003	NC_019697	CAG	2	6	236504	236509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384436
4004	NC_019697	TGA	2	6	236625	236630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384436
4005	NC_019697	GCC	2	6	236650	236655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384436
4006	NC_019697	ATT	2	6	236660	236665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384436
4007	NC_019697	GCT	2	6	236761	236766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384436
4008	NC_019697	CAAT	2	8	236790	236797	50 %	25 %	0 %	25 %	434384436
4009	NC_019697	CGAT	2	8	236895	236902	25 %	25 %	25 %	25 %	434384436
4010	NC_019697	ATA	2	6	236918	236923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384436
4011	NC_019697	CAA	2	6	236980	236985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384436
4012	NC_019697	CGAT	2	8	236987	236994	25 %	25 %	25 %	25 %	434384436
4013	NC_019697	TCGA	2	8	237020	237027	25 %	25 %	25 %	25 %	434384436
4014	NC_019697	CATT	2	8	237045	237052	25 %	50 %	0 %	25 %	434384436
4015	NC_019697	ACC	2	6	237121	237126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384436
4016	NC_019697	CAA	2	6	237142	237147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384436
4017	NC_019697	CTG	2	6	237170	237175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384436
4018	NC_019697	GTTT	2	8	237202	237209	0 %	75 %	25 %	0 %	434384436
4019	NC_019697	TCGA	2	8	237230	237237	25 %	25 %	25 %	25 %	434384436
4020	NC_019697	CGA	2	6	237240	237245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384436
4021	NC_019697	ATTA	2	8	237255	237262	50 %	50 %	0 %	0 %	434384436
4022	NC_019697	ATT	2	6	237280	237285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384436
4023	NC_019697	GTA	2	6	237302	237307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384436
4024	NC_019697	TCG	2	6	237326	237331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384436
4025	NC_019697	CTAC	2	8	237414	237421	25 %	25 %	0 %	50 %	434384436
4026	NC_019697	ATA	2	6	237473	237478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384436
4027	NC_019697	CTA	2	6	237558	237563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384436
4028	NC_019697	AGC	2	6	237567	237572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384436
4029	NC_019697	CAA	2	6	237583	237588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384436
4030	NC_019697	CGC	2	6	237654	237659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384436
4031	NC_019697	TGA	2	6	237671	237676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384436
4032	NC_019697	TAGG	2	8	237681	237688	25 %	25 %	50 %	0 %	434384436
4033	NC_019697	TGC	2	6	237810	237815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384437
4034	NC_019697	AAC	2	6	237862	237867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384437
4035	NC_019697	TTG	2	6	237940	237945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384437
4036	NC_019697	GTG	2	6	237955	237960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384437
4037	NC_019697	CTG	2	6	238303	238308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384438
4038	NC_019697	GTT	2	6	238347	238352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384438
4039	NC_019697	CAA	2	6	238451	238456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384438
4040	NC_019697	CAAGCT	3	18	238467	238484	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434384438
4041	NC_019697	AGC	2	6	238489	238494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384438
4042	NC_019697	TCC	2	6	238546	238551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384438
4043	NC_019697	ACA	2	6	238586	238591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384438
4044	NC_019697	CAG	2	6	238639	238644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384438
4045	NC_019697	CAA	2	6	238647	238652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384438
4046	NC_019697	CAG	2	6	238689	238694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384438
4047	NC_019697	AAC	2	6	238714	238719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384438
4048	NC_019697	CAA	2	6	238739	238744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384438
4049	NC_019697	CTC	2	6	238756	238761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384438
4050	NC_019697	AAT	2	6	238768	238773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384438
4051	NC_019697	GAA	2	6	239106	239111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384439
4052	NC_019697	TGC	2	6	239153	239158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384439
4053	NC_019697	GCGT	2	8	239178	239185	0 %	25 %	50 %	25 %	434384439
4054	NC_019697	TCAT	2	8	239199	239206	25 %	50 %	0 %	25 %	434384439
4055	NC_019697	CA	3	6	239480	239485	50 %	0 %	0 %	50 %	434384440
4056	NC_019697	TCT	2	6	239670	239675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384440
4057	NC_019697	GAT	2	6	239689	239694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384440
4058	NC_019697	ATCG	2	8	239754	239761	25 %	25 %	25 %	25 %	434384440
4059	NC_019697	TGC	2	6	239810	239815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384440
4060	NC_019697	GACT	2	8	239836	239843	25 %	25 %	25 %	25 %	434384440
4061	NC_019697	GCT	2	6	239991	239996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384440
4062	NC_019697	TCA	2	6	240000	240005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384440
4063	NC_019697	GGA	2	6	240022	240027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384440
4064	NC_019697	CG	3	6	240033	240038	0 %	0 %	50 %	50 %	434384440
4065	NC_019697	CGAT	2	8	240387	240394	25 %	25 %	25 %	25 %	434384441
4066	NC_019697	TCAA	2	8	240418	240425	50 %	25 %	0 %	25 %	434384441
4067	NC_019697	CG	3	6	240472	240477	0 %	0 %	50 %	50 %	434384441
4068	NC_019697	AAGA	2	8	240513	240520	75 %	0 %	25 %	0 %	434384441
4069	NC_019697	CGAT	2	8	240613	240620	25 %	25 %	25 %	25 %	434384441
4070	NC_019697	ATC	2	6	240630	240635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384441
4071	NC_019697	TAC	2	6	240636	240641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384441
4072	NC_019697	GCC	2	6	240657	240662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384441
4073	NC_019697	CCA	2	6	240796	240801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384441
4074	NC_019697	AAG	2	6	240823	240828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384441
4075	NC_019697	GTG	2	6	240900	240905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384441
4076	NC_019697	CCG	2	6	240940	240945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384441
4077	NC_019697	TCA	2	6	241057	241062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384441
4078	NC_019697	ACCT	2	8	241086	241093	25 %	25 %	0 %	50 %	434384441
4079	NC_019697	CGC	2	6	241136	241141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384441
4080	NC_019697	GTC	2	6	241143	241148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384441
4081	NC_019697	TGG	2	6	241153	241158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384441
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4083	NC_019697	TAA	2	6	241391	241396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384441
4084	NC_019697	CAA	2	6	241401	241406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384441
4085	NC_019697	GAT	2	6	241424	241429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384441
4086	NC_019697	ATT	2	6	241458	241463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384441
4087	NC_019697	GAA	2	6	241490	241495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384441
4088	NC_019697	ATT	2	6	241546	241551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384441
4089	NC_019697	TTC	3	9	241680	241688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384441
4090	NC_019697	GAT	3	9	241724	241732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384441
4091	NC_019697	CAGA	2	8	241789	241796	50 %	0 %	25 %	25 %	434384441
4092	NC_019697	TTG	2	6	241797	241802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384441
4093	NC_019697	TAAA	2	8	241830	241837	75 %	25 %	0 %	0 %	434384441
4094	NC_019697	TCT	2	6	241970	241975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384442
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4100	NC_019697	GAT	2	6	242260	242265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384442
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4102	NC_019697	TTTA	2	8	242298	242305	25 %	75 %	0 %	0 %	434384442
4103	NC_019697	CT	3	6	242338	242343	0 %	50 %	0 %	50 %	434384442
4104	NC_019697	AAT	2	6	242344	242349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384442
4105	NC_019697	TTG	2	6	242707	242712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384443
4106	NC_019697	GAA	2	6	242832	242837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384443
4107	NC_019697	GAT	3	9	242854	242862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384443
4108	NC_019697	TTC	2	6	242954	242959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384443
4109	NC_019697	CGG	2	6	243002	243007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384443
4110	NC_019697	AGA	2	6	243008	243013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384443
4111	NC_019697	ACAAGT	2	12	243039	243050	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434384443
4112	NC_019697	CTG	2	6	243110	243115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384443
4113	NC_019697	TGGC	2	8	243126	243133	0 %	25 %	50 %	25 %	434384443
4114	NC_019697	AGAA	2	8	243224	243231	75 %	0 %	25 %	0 %	434384444
4115	NC_019697	TTA	2	6	243237	243242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384444
4116	NC_019697	AT	3	6	243253	243258	50 %	50 %	0 %	0 %	434384444
4117	NC_019697	CAAAG	2	10	243269	243278	60 %	0 %	20 %	20 %	434384444
4118	NC_019697	AAC	2	6	243290	243295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384444
4119	NC_019697	AGA	2	6	243319	243324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384444
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4121	NC_019697	TTG	2	6	243342	243347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384444
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4123	NC_019697	AT	3	6	243366	243371	50 %	50 %	0 %	0 %	434384444
4124	NC_019697	ATT	2	6	243463	243468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384444
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4234	NC_019697	CGA	2	6	249930	249935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384450
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4236	NC_019697	T	6	6	250008	250013	0 %	100 %	0 %	0 %	434384450
4237	NC_019697	ATC	2	6	250014	250019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384450
4238	NC_019697	CGA	2	6	250071	250076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384450
4239	NC_019697	GCTG	2	8	250192	250199	0 %	25 %	50 %	25 %	434384450
4240	NC_019697	GTC	2	6	250334	250339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384450
4241	NC_019697	GCG	2	6	250343	250348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384450
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4243	NC_019697	CGC	2	6	250756	250761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384451
4244	NC_019697	TCGA	2	8	250786	250793	25 %	25 %	25 %	25 %	434384451
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4484	NC_019697	ATTA	2	8	263163	263170	50 %	50 %	0 %	0 %	434384459
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