MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 101117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019697	CACC	2	8	84315	84322	25 %	0 %	0 %	75 %	434384300
1502	NC_019697	GTG	2	6	84358	84363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384300
1503	NC_019697	TCT	2	6	84372	84377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384300
1504	NC_019697	GCG	2	6	84398	84403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384300
1505	NC_019697	AG	3	6	84429	84434	50 %	0 %	50 %	0 %	434384300
1506	NC_019697	ATCG	2	8	84472	84479	25 %	25 %	25 %	25 %	434384300
1507	NC_019697	GTT	2	6	84531	84536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384300
1508	NC_019697	TGG	2	6	84543	84548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384300
1509	NC_019697	TGC	3	9	84598	84606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384300
1510	NC_019697	AATT	2	8	84958	84965	50 %	50 %	0 %	0 %	434384301
1511	NC_019697	TCT	2	6	84981	84986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384301
1512	NC_019697	TTG	2	6	84991	84996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384301
1513	NC_019697	GTTT	2	8	85053	85060	0 %	75 %	25 %	0 %	434384301
1514	NC_019697	GTT	2	6	85243	85248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384301
1515	NC_019697	GATA	2	8	85255	85262	50 %	25 %	25 %	0 %	434384301
1516	NC_019697	TTA	2	6	85308	85313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384301
1517	NC_019697	CTA	2	6	85324	85329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384301
1518	NC_019697	TAA	2	6	85354	85359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384301
1519	NC_019697	GGT	2	6	85368	85373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384301
1520	NC_019697	AGA	2	6	85408	85413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384301
1521	NC_019697	CGAT	2	8	85460	85467	25 %	25 %	25 %	25 %	434384301
1522	NC_019697	CTT	2	6	85532	85537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384301
1523	NC_019697	TCGA	2	8	85978	85985	25 %	25 %	25 %	25 %	434384302
1524	NC_019697	GTT	2	6	85992	85997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384302
1525	NC_019697	GA	3	6	86104	86109	50 %	0 %	50 %	0 %	434384302
1526	NC_019697	TCGC	2	8	86176	86183	0 %	25 %	25 %	50 %	434384302
1527	NC_019697	G	6	6	86241	86246	0 %	0 %	100 %	0 %	434384302
1528	NC_019697	CGAT	2	8	86260	86267	25 %	25 %	25 %	25 %	434384302
1529	NC_019697	GTG	2	6	86301	86306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384302
1530	NC_019697	TAAA	2	8	86362	86369	75 %	25 %	0 %	0 %	434384302
1531	NC_019697	CCG	2	6	86382	86387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384302
1532	NC_019697	ACA	2	6	86404	86409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384302
1533	NC_019697	GAA	2	6	86412	86417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384302
1534	NC_019697	AAG	2	6	86476	86481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384302
1535	NC_019697	GAA	2	6	86571	86576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384302
1536	NC_019697	ACC	2	6	86747	86752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384302
1537	NC_019697	GCC	2	6	86826	86831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384302
1538	NC_019697	ATGTCG	2	12	86884	86895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434384302
1539	NC_019697	AAC	2	6	86905	86910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384302
1540	NC_019697	CGC	2	6	86924	86929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384302
1541	NC_019697	TCGA	2	8	87049	87056	25 %	25 %	25 %	25 %	434384302
1542	NC_019697	AC	3	6	87084	87089	50 %	0 %	0 %	50 %	434384302
1543	NC_019697	CAG	2	6	87168	87173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384302
1544	NC_019697	GTTA	2	8	87176	87183	25 %	50 %	25 %	0 %	434384302
1545	NC_019697	CG	3	6	87226	87231	0 %	0 %	50 %	50 %	434384302
1546	NC_019697	GATG	2	8	87254	87261	25 %	25 %	50 %	0 %	434384302
1547	NC_019697	GAA	2	6	87270	87275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384302
1548	NC_019697	TGA	2	6	87311	87316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384302
1549	NC_019697	TGA	2	6	87322	87327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384302
1550	NC_019697	TAAT	2	8	87403	87410	50 %	50 %	0 %	0 %	434384302
1551	NC_019697	TCGA	2	8	87458	87465	25 %	25 %	25 %	25 %	434384302
1552	NC_019697	GTG	2	6	87474	87479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384302
1553	NC_019697	GAA	2	6	87486	87491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384302
1554	NC_019697	GGT	2	6	87504	87509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384302
1555	NC_019697	TGG	2	6	87550	87555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384302
1556	NC_019697	GTT	2	6	88369	88374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384303
1557	NC_019697	CATT	2	8	88574	88581	25 %	50 %	0 %	25 %	434384303
1558	NC_019697	GGT	2	6	88654	88659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384303
1559	NC_019697	ATT	2	6	88748	88753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384303
1560	NC_019697	CGC	2	6	88759	88764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384303
1561	NC_019697	ATTT	2	8	88862	88869	25 %	75 %	0 %	0 %	434384303
1562	NC_019697	TGC	2	6	88890	88895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384303
1563	NC_019697	TCG	2	6	88918	88923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384303
1564	NC_019697	AGA	4	12	89091	89102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384304
1565	NC_019697	AGA	2	6	89145	89150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384304
1566	NC_019697	CGAT	2	8	89160	89167	25 %	25 %	25 %	25 %	434384304
1567	NC_019697	CAG	2	6	89193	89198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384304
1568	NC_019697	GAT	2	6	89215	89220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384304
1569	NC_019697	ATT	2	6	89287	89292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384304
1570	NC_019697	A	6	6	89318	89323	100 %	0 %	0 %	0 %	434384304
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1573	NC_019697	AAG	2	6	89669	89674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384305
1574	NC_019697	AAAT	2	8	89874	89881	75 %	25 %	0 %	0 %	434384305
1575	NC_019697	GAAA	2	8	90002	90009	75 %	0 %	25 %	0 %	434384306
1576	NC_019697	CTG	2	6	90139	90144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384306
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1580	NC_019697	TCG	2	6	90410	90415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384306
1581	NC_019697	ATT	2	6	90423	90428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384306
1582	NC_019697	GC	3	6	90448	90453	0 %	0 %	50 %	50 %	434384306
1583	NC_019697	TGG	2	6	90461	90466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384306
1584	NC_019697	TCC	2	6	90473	90478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384306
1585	NC_019697	ACT	2	6	90506	90511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384306
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1587	NC_019697	CCTC	2	8	90692	90699	0 %	25 %	0 %	75 %	434384307
1588	NC_019697	GCTC	2	8	90755	90762	0 %	25 %	25 %	50 %	434384307
1589	NC_019697	AGC	2	6	90785	90790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384307
1590	NC_019697	GGTT	2	8	90945	90952	0 %	50 %	50 %	0 %	434384307
1591	NC_019697	TCTAT	2	10	90971	90980	20 %	60 %	0 %	20 %	434384307
1592	NC_019697	ACGCAA	2	12	90989	91000	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434384307
1593	NC_019697	CCA	2	6	91011	91016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384307
1594	NC_019697	CTTC	2	8	91068	91075	0 %	50 %	0 %	50 %	434384307
1595	NC_019697	GCTAGA	2	12	91260	91271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434384307
1596	NC_019697	GACA	2	8	91429	91436	50 %	0 %	25 %	25 %	434384308
1597	NC_019697	GCT	2	6	91483	91488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384308
1598	NC_019697	GCGA	2	8	91517	91524	25 %	0 %	50 %	25 %	434384308
1599	NC_019697	ACA	2	6	91528	91533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384308
1600	NC_019697	ACA	2	6	91588	91593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384308
1601	NC_019697	AGC	2	6	91628	91633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384308
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1604	NC_019697	ACA	3	9	91783	91791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384308
1605	NC_019697	CAC	2	6	91821	91826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384308
1606	NC_019697	TCTA	2	8	91852	91859	25 %	50 %	0 %	25 %	434384308
1607	NC_019697	GGC	2	6	92072	92077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384309
1608	NC_019697	GC	4	8	92076	92083	0 %	0 %	50 %	50 %	434384309
1609	NC_019697	ATC	2	6	92157	92162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384309
1610	NC_019697	TAA	2	6	92275	92280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384309
1611	NC_019697	CCG	2	6	92322	92327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384309
1612	NC_019697	CGA	2	6	92341	92346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384309
1613	NC_019697	AGC	2	6	92367	92372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384309
1614	NC_019697	CGG	2	6	92383	92388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384309
1615	NC_019697	GAT	2	6	92471	92476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384309
1616	NC_019697	T	6	6	92491	92496	0 %	100 %	0 %	0 %	434384309
1617	NC_019697	CAG	2	6	92525	92530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384309
1618	NC_019697	AC	3	6	92551	92556	50 %	0 %	0 %	50 %	434384309
1619	NC_019697	GC	3	6	92560	92565	0 %	0 %	50 %	50 %	434384309
1620	NC_019697	TTG	2	6	92630	92635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384309
1621	NC_019697	ATA	2	6	92661	92666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384309
1622	NC_019697	TGG	2	6	92673	92678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384309
1623	NC_019697	GATCGG	2	12	92683	92694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434384309
1624	NC_019697	GC	3	6	92740	92745	0 %	0 %	50 %	50 %	434384309
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1997	NC_019697	AGA	2	6	114074	114079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384329
1998	NC_019697	TCACC	2	10	114402	114411	20 %	20 %	0 %	60 %	434384330
1999	NC_019697	ACT	2	6	114538	114543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384330
2000	NC_019697	CCG	2	6	114550	114555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384330

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