MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 101117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_019697	ATC	2	6	56344	56349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384272
1003	NC_019697	GAC	2	6	56358	56363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384272
1004	NC_019697	CAT	2	6	56369	56374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384272
1005	NC_019697	GGA	2	6	56492	56497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384272
1006	NC_019697	GCTTCT	2	12	56530	56541	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	434384272
1007	NC_019697	GA	3	6	56657	56662	50 %	0 %	50 %	0 %	434384272
1008	NC_019697	TACT	2	8	56698	56705	25 %	50 %	0 %	25 %	434384272
1009	NC_019697	GCT	2	6	56707	56712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384272
1010	NC_019697	GTG	2	6	56787	56792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384272
1011	NC_019697	GACT	2	8	56848	56855	25 %	25 %	25 %	25 %	434384272
1012	NC_019697	TG	3	6	56857	56862	0 %	50 %	50 %	0 %	434384272
1013	NC_019697	CTC	2	6	56906	56911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384272
1014	NC_019697	CAC	2	6	56912	56917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384272
1015	NC_019697	ATTA	2	8	56920	56927	50 %	50 %	0 %	0 %	434384272
1016	NC_019697	GGT	2	6	57453	57458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384273
1017	NC_019697	TTC	2	6	57464	57469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384273
1018	NC_019697	CT	3	6	57516	57521	0 %	50 %	0 %	50 %	434384273
1019	NC_019697	CAA	2	6	57531	57536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384273
1020	NC_019697	TGC	2	6	57578	57583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384273
1021	NC_019697	GATCG	2	10	57651	57660	20 %	20 %	40 %	20 %	434384273
1022	NC_019697	CGCA	2	8	57722	57729	25 %	0 %	25 %	50 %	434384273
1023	NC_019697	T	7	7	57736	57742	0 %	100 %	0 %	0 %	434384273
1024	NC_019697	ATT	2	6	57811	57816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384273
1025	NC_019697	CGATG	2	10	57848	57857	20 %	20 %	40 %	20 %	434384273
1026	NC_019697	CAAG	2	8	57881	57888	50 %	0 %	25 %	25 %	434384273
1027	NC_019697	CGATC	2	10	57899	57908	20 %	20 %	20 %	40 %	434384273
1028	NC_019697	A	7	7	57936	57942	100 %	0 %	0 %	0 %	434384273
1029	NC_019697	CGAT	2	8	57962	57969	25 %	25 %	25 %	25 %	434384273
1030	NC_019697	AGC	2	6	58055	58060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384273
1031	NC_019697	AGCCT	2	10	58374	58383	20 %	20 %	20 %	40 %	434384274
1032	NC_019697	CGAT	2	8	58408	58415	25 %	25 %	25 %	25 %	434384274
1033	NC_019697	ATC	2	6	58530	58535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384274
1034	NC_019697	TTGAG	2	10	58555	58564	20 %	40 %	40 %	0 %	434384274
1035	NC_019697	GATT	2	8	58580	58587	25 %	50 %	25 %	0 %	434384274
1036	NC_019697	AATT	2	8	58626	58633	50 %	50 %	0 %	0 %	434384274
1037	NC_019697	ATC	2	6	58666	58671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384274
1038	NC_019697	CAG	2	6	58703	58708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384274
1039	NC_019697	TCA	2	6	58720	58725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384274
1040	NC_019697	CAA	2	6	58796	58801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384274
1041	NC_019697	AGTA	2	8	58857	58864	50 %	25 %	25 %	0 %	434384274
1042	NC_019697	CAG	2	6	58962	58967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384274
1043	NC_019697	ATC	2	6	59017	59022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384274
1044	NC_019697	TTG	2	6	59038	59043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384274
1045	NC_019697	GTT	2	6	59075	59080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384274
1046	NC_019697	TGG	2	6	59198	59203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384274
1047	NC_019697	ATCG	2	8	59204	59211	25 %	25 %	25 %	25 %	434384274
1048	NC_019697	CG	3	6	59239	59244	0 %	0 %	50 %	50 %	434384274
1049	NC_019697	CGAT	2	8	59300	59307	25 %	25 %	25 %	25 %	434384274
1050	NC_019697	CG	3	6	59427	59432	0 %	0 %	50 %	50 %	434384274
1051	NC_019697	AG	3	6	59460	59465	50 %	0 %	50 %	0 %	434384274
1052	NC_019697	ATCG	2	8	59495	59502	25 %	25 %	25 %	25 %	434384274
1053	NC_019697	GCC	2	6	59548	59553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384274
1054	NC_019697	TCT	2	6	59574	59579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384274
1055	NC_019697	A	6	6	59610	59615	100 %	0 %	0 %	0 %	434384274
1056	NC_019697	ATCG	2	8	59619	59626	25 %	25 %	25 %	25 %	434384274
1057	NC_019697	CAAT	2	8	59627	59634	50 %	25 %	0 %	25 %	434384274
1058	NC_019697	ACC	2	6	59670	59675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384274
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1060	NC_019697	GCC	2	6	60005	60010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384275
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1062	NC_019697	T	6	6	60239	60244	0 %	100 %	0 %	0 %	434384275
1063	NC_019697	GCC	2	6	60263	60268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384275
1064	NC_019697	T	6	6	60271	60276	0 %	100 %	0 %	0 %	434384275
1065	NC_019697	TTG	2	6	60289	60294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384275
1066	NC_019697	TCG	2	6	60311	60316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384275
1067	NC_019697	T	6	6	60328	60333	0 %	100 %	0 %	0 %	434384275
1068	NC_019697	AGCG	2	8	60340	60347	25 %	0 %	50 %	25 %	434384275
1069	NC_019697	TTTC	2	8	60348	60355	0 %	75 %	0 %	25 %	434384275
1070	NC_019697	TCG	2	6	60356	60361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384275
1071	NC_019697	GTTG	2	8	60393	60400	0 %	50 %	50 %	0 %	434384275
1072	NC_019697	TAT	2	6	60408	60413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384275
1073	NC_019697	CGA	2	6	60474	60479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384275
1074	NC_019697	CAC	2	6	60480	60485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384275
1075	NC_019697	CTG	2	6	60495	60500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384275
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1081	NC_019697	AT	3	6	60712	60717	50 %	50 %	0 %	0 %	434384276
1082	NC_019697	ATT	2	6	60760	60765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384276
1083	NC_019697	TTAT	2	8	60770	60777	25 %	75 %	0 %	0 %	434384276
1084	NC_019697	TCTGTG	2	12	60810	60821	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434384276
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1086	NC_019697	ACC	2	6	60859	60864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384276
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1089	NC_019697	GTTG	2	8	60981	60988	0 %	50 %	50 %	0 %	434384276
1090	NC_019697	GATCG	2	10	60989	60998	20 %	20 %	40 %	20 %	434384276
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1093	NC_019697	TCGG	2	8	61640	61647	0 %	25 %	50 %	25 %	434384277
1094	NC_019697	TA	3	6	61658	61663	50 %	50 %	0 %	0 %	434384277
1095	NC_019697	AAG	2	6	61736	61741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384277
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1098	NC_019697	GC	3	6	61821	61826	0 %	0 %	50 %	50 %	434384277
1099	NC_019697	TGA	2	6	61920	61925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384277
1100	NC_019697	A	6	6	62009	62014	100 %	0 %	0 %	0 %	434384277
1101	NC_019697	TGG	2	6	62082	62087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384277
1102	NC_019697	TCAA	2	8	62114	62121	50 %	25 %	0 %	25 %	434384277
1103	NC_019697	GAT	2	6	62157	62162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384277
1104	NC_019697	TGC	2	6	62181	62186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384277
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1106	NC_019697	GAC	2	6	62320	62325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384277
1107	NC_019697	ATT	2	6	62329	62334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384277
1108	NC_019697	GCT	2	6	62335	62340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384277
1109	NC_019697	GGT	2	6	62345	62350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384277
1110	NC_019697	TCT	2	6	62369	62374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384277
1111	NC_019697	TGGC	2	8	62399	62406	0 %	25 %	50 %	25 %	434384277
1112	NC_019697	TCAAAG	2	12	62411	62422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434384277
1113	NC_019697	GTA	2	6	62446	62451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384277
1114	NC_019697	GCC	2	6	62530	62535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384277
1115	NC_019697	GCC	3	9	62551	62559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384277
1116	NC_019697	TCGA	2	8	62821	62828	25 %	25 %	25 %	25 %	434384278
1117	NC_019697	TTA	2	6	62830	62835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384278
1118	NC_019697	ATT	2	6	62875	62880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384278
1119	NC_019697	GGT	2	6	62893	62898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384278
1120	NC_019697	TC	3	6	62916	62921	0 %	50 %	0 %	50 %	434384278
1121	NC_019697	A	6	6	62932	62937	100 %	0 %	0 %	0 %	434384278
1122	NC_019697	GGC	2	6	62952	62957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384278
1123	NC_019697	TGG	2	6	62967	62972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384278
1124	NC_019697	ATCG	2	8	62994	63001	25 %	25 %	25 %	25 %	434384278
1125	NC_019697	TGAC	2	8	63017	63024	25 %	25 %	25 %	25 %	434384278
1126	NC_019697	TAG	2	6	63047	63052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384278
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1128	NC_019697	CGG	2	6	63140	63145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384278
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1248	NC_019697	CTT	2	6	70961	70966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384286
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1252	NC_019697	TAG	2	6	71002	71007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384286
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