MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 67449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019695	CTT	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205074
2	NC_019695	TAC	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205074
3	NC_019695	CAA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205074
4	NC_019695	GCC	2	6	437	442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205074
5	NC_019695	GTC	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
6	NC_019695	TGC	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
7	NC_019695	GGC	2	6	567	572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205074
8	NC_019695	TGC	2	6	734	739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
9	NC_019695	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205074
10	NC_019695	GAT	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
11	NC_019695	AAG	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205074
12	NC_019695	GCC	2	6	938	943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205074
13	NC_019695	GCT	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
14	NC_019695	TGA	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
15	NC_019695	GTC	2	6	1191	1196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
16	NC_019695	ATG	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
17	NC_019695	GAA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205074
18	NC_019695	ACC	2	6	1350	1355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205074
19	NC_019695	CTT	2	6	1691	1696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205075
20	NC_019695	GCA	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205075
21	NC_019695	TAC	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205075
22	NC_019695	CCG	2	6	1903	1908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205075
23	NC_019695	CAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205075
24	NC_019695	CGA	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205075
25	NC_019695	ACG	2	6	2142	2147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
26	NC_019695	GGC	2	6	2224	2229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205076
27	NC_019695	AAC	2	6	2427	2432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205076
28	NC_019695	AGC	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
29	NC_019695	GAG	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205076
30	NC_019695	GTT	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
31	NC_019695	ATC	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205076
32	NC_019695	TGT	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
33	NC_019695	GAA	2	6	2707	2712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205076
34	NC_019695	ATT	2	6	2717	2722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205076
35	NC_019695	CGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205076
36	NC_019695	TAC	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205076
37	NC_019695	CTT	2	6	2952	2957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205076
38	NC_019695	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
39	NC_019695	TAG	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
40	NC_019695	GAT	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
41	NC_019695	CGA	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
42	NC_019695	CTT	2	6	3435	3440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205076
43	NC_019695	GTC	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205076
44	NC_019695	GTA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
45	NC_019695	AGA	2	6	3504	3509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205076
46	NC_019695	GAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205076
47	NC_019695	TTG	2	6	3574	3579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
48	NC_019695	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205076
49	NC_019695	CTG	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205076
50	NC_019695	CAC	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205078
51	NC_019695	GAT	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205078
52	NC_019695	GGT	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205078
53	NC_019695	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205078
54	NC_019695	GGT	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205078
55	NC_019695	AGC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205078
56	NC_019695	AAG	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205078
57	NC_019695	AGA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205078
58	NC_019695	CCG	2	6	5645	5650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205078
59	NC_019695	CCT	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205079
60	NC_019695	CCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205079
61	NC_019695	CAG	2	6	6256	6261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205079
62	NC_019695	TGT	2	6	6324	6329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205079
63	NC_019695	GTT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205079
64	NC_019695	CGG	2	6	6406	6411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205079
65	NC_019695	TCC	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205079
66	NC_019695	TGC	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205079
67	NC_019695	TGC	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205079
68	NC_019695	GCA	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205080
69	NC_019695	ATG	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
70	NC_019695	TAG	2	6	7422	7427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
71	NC_019695	GAA	2	6	7430	7435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
72	NC_019695	TAG	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
73	NC_019695	TTG	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205080
74	NC_019695	GCT	2	6	7706	7711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205080
75	NC_019695	CAC	2	6	7746	7751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205080
76	NC_019695	CAG	4	12	7800	7811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205080
77	NC_019695	GAC	2	6	7841	7846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205080
78	NC_019695	ACC	2	6	7881	7886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205080
79	NC_019695	GAA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
80	NC_019695	CAA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205080
81	NC_019695	GAA	2	6	8114	8119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
82	NC_019695	AAG	2	6	8136	8141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
83	NC_019695	AAG	2	6	8154	8159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
84	NC_019695	ATC	2	6	8181	8186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205080
85	NC_019695	GAA	2	6	8201	8206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
86	NC_019695	CCG	2	6	8212	8217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205080
87	NC_019695	TGA	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
88	NC_019695	TGG	2	6	8568	8573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205081
89	NC_019695	TCG	2	6	8604	8609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205081
90	NC_019695	CAG	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205081
91	NC_019695	TCT	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205081
92	NC_019695	GAA	2	6	8795	8800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205081
93	NC_019695	ATG	2	6	8861	8866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205081
94	NC_019695	CTA	2	6	8889	8894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205081
95	NC_019695	ACC	2	6	8926	8931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205081
96	NC_019695	AGA	2	6	9010	9015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205081
97	NC_019695	ATT	2	6	9017	9022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205081
98	NC_019695	AGT	3	9	9040	9048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205081
99	NC_019695	TAT	2	6	9306	9311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205081
100	NC_019695	AAG	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205081
101	NC_019695	CGG	2	6	9643	9648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205082
102	NC_019695	GAA	2	6	9887	9892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205082
103	NC_019695	GCA	2	6	9896	9901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205082
104	NC_019695	AAG	2	6	9909	9914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205082
105	NC_019695	GTT	2	6	10052	10057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205082
106	NC_019695	GTT	2	6	10096	10101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205082
107	NC_019695	TTG	2	6	10260	10265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205082
108	NC_019695	TAG	2	6	10287	10292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205082
109	NC_019695	TGA	2	6	10306	10311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205082
110	NC_019695	ACT	2	6	10509	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205082
111	NC_019695	GAA	2	6	10655	10660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205082
112	NC_019695	GCG	2	6	10699	10704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205082
113	NC_019695	CCA	3	9	10715	10723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205082
114	NC_019695	GCA	2	6	10745	10750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205082
115	NC_019695	GCG	2	6	11065	11070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205083
116	NC_019695	TAG	2	6	11196	11201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205083
117	NC_019695	GGT	2	6	11234	11239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205083
118	NC_019695	GCT	2	6	11351	11356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205083
119	NC_019695	GCA	2	6	11374	11379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205083
120	NC_019695	GTT	2	6	11399	11404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205083
121	NC_019695	GCG	2	6	11425	11430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205083
122	NC_019695	TCT	2	6	11527	11532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205083
123	NC_019695	GCT	2	6	11548	11553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205083
124	NC_019695	TTC	2	6	11622	11627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205083
125	NC_019695	CAA	2	6	11699	11704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205083
126	NC_019695	ATT	2	6	11747	11752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205083
127	NC_019695	CGC	2	6	11815	11820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205083
128	NC_019695	ACA	2	6	11924	11929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205083
129	NC_019695	TAG	2	6	11973	11978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205083
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254	NC_019695	CAA	2	6	22680	22685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205090
255	NC_019695	ATC	2	6	22708	22713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205090
256	NC_019695	TGA	2	6	22724	22729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205090
257	NC_019695	AGA	2	6	22934	22939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205090
258	NC_019695	GCA	3	9	22961	22969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205090
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377	NC_019695	AGC	2	6	32799	32804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205097
378	NC_019695	CAT	2	6	32970	32975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205097
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