MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 99311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019695	GTTC	2	8	155504	155511	0 %	50 %	25 %	25 %	428205196
2502	NC_019695	AAG	2	6	155518	155523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205196
2503	NC_019695	TGC	2	6	155650	155655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205196
2504	NC_019695	ACA	2	6	155708	155713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205196
2505	NC_019695	CGG	2	6	155733	155738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205196
2506	NC_019695	GAA	2	6	155760	155765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205196
2507	NC_019695	TTAGAT	2	12	155775	155786	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428205196
2508	NC_019695	ACA	2	6	155816	155821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205196
2509	NC_019695	CAG	2	6	155904	155909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205196
2510	NC_019695	AAGA	2	8	155920	155927	75 %	0 %	25 %	0 %	428205196
2511	NC_019695	GCA	2	6	155951	155956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205196
2512	NC_019695	TGC	2	6	155981	155986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205196
2513	NC_019695	GAA	2	6	156015	156020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205196
2514	NC_019695	TGGA	2	8	156046	156053	25 %	25 %	50 %	0 %	428205196
2515	NC_019695	ACC	2	6	156107	156112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205196
2516	NC_019695	AGC	2	6	156116	156121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205196
2517	NC_019695	A	7	7	156160	156166	100 %	0 %	0 %	0 %	428205196
2518	NC_019695	AGC	2	6	156331	156336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205197
2519	NC_019695	TGC	2	6	156392	156397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205197
2520	NC_019695	GCG	2	6	156451	156456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205197
2521	NC_019695	GAG	2	6	156487	156492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205197
2522	NC_019695	TGCG	2	8	156498	156505	0 %	25 %	50 %	25 %	428205197
2523	NC_019695	CCTCTG	2	12	156591	156602	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428205197
2524	NC_019695	GCT	2	6	156689	156694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205197
2525	NC_019695	CAA	2	6	156787	156792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205197
2526	NC_019695	GCTG	2	8	157036	157043	0 %	25 %	50 %	25 %	428205197
2527	NC_019695	TG	3	6	157042	157047	0 %	50 %	50 %	0 %	428205197
2528	NC_019695	CGC	2	6	157087	157092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205197
2529	NC_019695	GCT	2	6	157121	157126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205197
2530	NC_019695	GCT	2	6	157140	157145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205197
2531	NC_019695	GGCG	2	8	157389	157396	0 %	0 %	75 %	25 %	428205197
2532	NC_019695	A	7	7	157452	157458	100 %	0 %	0 %	0 %	428205198
2533	NC_019695	CGA	2	6	157553	157558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
2534	NC_019695	GCA	2	6	157595	157600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
2535	NC_019695	TGT	2	6	157743	157748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205198
2536	NC_019695	GA	3	6	157779	157784	50 %	0 %	50 %	0 %	428205198
2537	NC_019695	GAG	2	6	157838	157843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205198
2538	NC_019695	CCCG	2	8	157861	157868	0 %	0 %	25 %	75 %	428205198
2539	NC_019695	CAG	2	6	157908	157913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
2540	NC_019695	GCA	2	6	157961	157966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
2541	NC_019695	CTG	2	6	157968	157973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205198
2542	NC_019695	GA	3	6	157974	157979	50 %	0 %	50 %	0 %	428205198
2543	NC_019695	CCA	2	6	158072	158077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205198
2544	NC_019695	AGC	2	6	158122	158127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
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2547	NC_019695	AGC	2	6	158236	158241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205198
2548	NC_019695	ACGGCT	2	12	158281	158292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428205198
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2551	NC_019695	TCT	2	6	158726	158731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205199
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2553	NC_019695	GCT	2	6	158769	158774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
2554	NC_019695	GAA	2	6	158811	158816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205199
2555	NC_019695	TTG	2	6	158820	158825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205199
2556	NC_019695	A	6	6	158880	158885	100 %	0 %	0 %	0 %	428205199
2557	NC_019695	CTGT	2	8	158918	158925	0 %	50 %	25 %	25 %	428205199
2558	NC_019695	GAA	2	6	159000	159005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205199
2559	NC_019695	TCCA	2	8	159015	159022	25 %	25 %	0 %	50 %	428205199
2560	NC_019695	TTTGG	2	10	159171	159180	0 %	60 %	40 %	0 %	428205199
2561	NC_019695	AAAG	2	8	159193	159200	75 %	0 %	25 %	0 %	428205199
2562	NC_019695	CCAT	2	8	159262	159269	25 %	25 %	0 %	50 %	428205199
2563	NC_019695	GATTG	2	10	159356	159365	20 %	40 %	40 %	0 %	428205199
2564	NC_019695	CAT	2	6	159417	159422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205199
2565	NC_019695	GGC	2	6	159440	159445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205199
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2567	NC_019695	TAG	2	6	159548	159553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205199
2568	NC_019695	GCA	3	9	159619	159627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205199
2569	NC_019695	GTG	2	6	159700	159705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205199
2570	NC_019695	CTG	2	6	159710	159715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
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2574	NC_019695	TGC	2	6	159930	159935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
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2578	NC_019695	TGC	2	6	160180	160185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
2579	NC_019695	CTG	2	6	160188	160193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205199
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2583	NC_019695	CAGG	2	8	160253	160260	25 %	0 %	50 %	25 %	428205199
2584	NC_019695	GGA	2	6	160283	160288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205199
2585	NC_019695	TAA	2	6	160320	160325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205199
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2587	NC_019695	GAAGG	2	10	160349	160358	40 %	0 %	60 %	0 %	428205199
2588	NC_019695	TTG	2	6	160741	160746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205200
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2591	NC_019695	ATA	2	6	160886	160891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205200
2592	NC_019695	TTC	2	6	160924	160929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205200
2593	NC_019695	TGC	2	6	161027	161032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205200
2594	NC_019695	AG	4	8	161041	161048	50 %	0 %	50 %	0 %	428205200
2595	NC_019695	TTTG	2	8	161058	161065	0 %	75 %	25 %	0 %	428205200
2596	NC_019695	AGC	2	6	161092	161097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205200
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2598	NC_019695	A	6	6	161442	161447	100 %	0 %	0 %	0 %	428205200
2599	NC_019695	AGAT	2	8	161449	161456	50 %	25 %	25 %	0 %	428205200
2600	NC_019695	TAAA	2	8	161601	161608	75 %	25 %	0 %	0 %	428205201
2601	NC_019695	ATG	3	9	161647	161655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205201
2602	NC_019695	CAG	3	9	161657	161665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205201
2603	NC_019695	AAG	2	6	161767	161772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205201
2604	NC_019695	ATG	4	12	161977	161988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205201
2605	NC_019695	ATAA	2	8	162090	162097	75 %	25 %	0 %	0 %	428205201
2606	NC_019695	TGGA	2	8	162098	162105	25 %	25 %	50 %	0 %	428205201
2607	NC_019695	TTC	2	6	162168	162173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205201
2608	NC_019695	GGAAA	2	10	162202	162211	60 %	0 %	40 %	0 %	428205201
2609	NC_019695	GAC	2	6	162222	162227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205201
2610	NC_019695	TAC	2	6	162239	162244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205201
2611	NC_019695	GCA	3	9	162268	162276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205201
2612	NC_019695	GAG	2	6	162286	162291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205201
2613	NC_019695	TCCG	2	8	162317	162324	0 %	25 %	25 %	50 %	428205201
2614	NC_019695	CGT	2	6	162456	162461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205201
2615	NC_019695	GCG	2	6	162524	162529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205202
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2617	NC_019695	CTG	2	6	162619	162624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205202
2618	NC_019695	CGG	2	6	162712	162717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205202
2619	NC_019695	CG	3	6	162746	162751	0 %	0 %	50 %	50 %	428205202
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2621	NC_019695	TGG	2	6	162829	162834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205202
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2988	NC_019695	AAGC	2	8	187248	187255	50 %	0 %	25 %	25 %	428205223
2989	NC_019695	TGA	2	6	187292	187297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205223
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