MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 99311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019695	CTGC	2	8	91123	91130	0 %	25 %	25 %	50 %	428205150
1502	NC_019695	TCCA	2	8	91151	91158	25 %	25 %	0 %	50 %	428205150
1503	NC_019695	GAC	2	6	91189	91194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1504	NC_019695	CAG	2	6	91196	91201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1505	NC_019695	AAT	2	6	91205	91210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205150
1506	NC_019695	T	6	6	91249	91254	0 %	100 %	0 %	0 %	428205150
1507	NC_019695	AAATCT	2	12	91272	91283	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428205150
1508	NC_019695	GTTG	2	8	91353	91360	0 %	50 %	50 %	0 %	428205150
1509	NC_019695	GTT	2	6	91364	91369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205150
1510	NC_019695	GTTG	2	8	91374	91381	0 %	50 %	50 %	0 %	428205150
1511	NC_019695	AAT	2	6	91542	91547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205150
1512	NC_019695	GCA	2	6	91569	91574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1513	NC_019695	TCTT	2	8	91592	91599	0 %	75 %	0 %	25 %	428205150
1514	NC_019695	ACC	2	6	91613	91618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205150
1515	NC_019695	CTA	2	6	91642	91647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205150
1516	NC_019695	CTG	2	6	91675	91680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1517	NC_019695	TCTA	2	8	91697	91704	25 %	50 %	0 %	25 %	428205150
1518	NC_019695	ACG	2	6	91776	91781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1519	NC_019695	TTC	2	6	91829	91834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205150
1520	NC_019695	TGC	2	6	91863	91868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1521	NC_019695	GAAA	2	8	91870	91877	75 %	0 %	25 %	0 %	428205150
1522	NC_019695	TAAT	2	8	91879	91886	50 %	50 %	0 %	0 %	428205150
1523	NC_019695	CAA	2	6	91907	91912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205150
1524	NC_019695	ATA	2	6	91986	91991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205150
1525	NC_019695	TAAT	2	8	92050	92057	50 %	50 %	0 %	0 %	428205150
1526	NC_019695	CTG	2	6	92131	92136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1527	NC_019695	TGT	2	6	92142	92147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205150
1528	NC_019695	CAA	2	6	92213	92218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205150
1529	NC_019695	CAA	2	6	92372	92377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205150
1530	NC_019695	GGC	3	9	92437	92445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205150
1531	NC_019695	GTC	2	6	92478	92483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1532	NC_019695	TGC	2	6	92485	92490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205150
1533	NC_019695	AAC	2	6	93133	93138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1534	NC_019695	GCA	2	6	93169	93174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1535	NC_019695	CAA	2	6	93203	93208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1536	NC_019695	GAACAA	2	12	93419	93430	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428205151
1537	NC_019695	TCA	2	6	93550	93555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205151
1538	NC_019695	CGGT	2	8	93568	93575	0 %	25 %	50 %	25 %	428205151
1539	NC_019695	AAG	2	6	93594	93599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205151
1540	NC_019695	CAA	2	6	93719	93724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1541	NC_019695	TCG	2	6	93804	93809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1542	NC_019695	CAA	2	6	93878	93883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1543	NC_019695	TAC	2	6	93927	93932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205151
1544	NC_019695	CTC	2	6	93991	93996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205151
1545	NC_019695	CTG	2	6	94025	94030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1546	NC_019695	GAATT	2	10	94220	94229	40 %	40 %	20 %	0 %	428205151
1547	NC_019695	AGA	2	6	94279	94284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205151
1548	NC_019695	TTAG	2	8	94307	94314	25 %	50 %	25 %	0 %	428205151
1549	NC_019695	ACTCAA	2	12	94336	94347	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428205151
1550	NC_019695	CGA	2	6	94366	94371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1551	NC_019695	CAA	2	6	94374	94379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1552	NC_019695	CAA	2	6	94425	94430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1553	NC_019695	ACA	2	6	94466	94471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1554	NC_019695	TCA	2	6	94540	94545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205151
1555	NC_019695	GCCGTT	2	12	94580	94591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1556	NC_019695	GAACT	2	10	94622	94631	40 %	20 %	20 %	20 %	428205151
1557	NC_019695	CAAT	2	8	94639	94646	50 %	25 %	0 %	25 %	428205151
1558	NC_019695	G	6	6	94753	94758	0 %	0 %	100 %	0 %	428205151
1559	NC_019695	ACT	3	9	94804	94812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205151
1560	NC_019695	TTC	2	6	94813	94818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205151
1561	NC_019695	CGAT	2	8	94824	94831	25 %	25 %	25 %	25 %	428205151
1562	NC_019695	ACA	2	6	94897	94902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1563	NC_019695	TTTG	2	8	94908	94915	0 %	75 %	25 %	0 %	428205151
1564	NC_019695	GAT	2	6	95060	95065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205151
1565	NC_019695	TCA	2	6	95136	95141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205151
1566	NC_019695	TTG	2	6	95309	95314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205151
1567	NC_019695	CAC	2	6	95355	95360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205151
1568	NC_019695	CTGCA	2	10	95361	95370	20 %	20 %	20 %	40 %	428205151
1569	NC_019695	T	6	6	95383	95388	0 %	100 %	0 %	0 %	428205151
1570	NC_019695	GTG	2	6	95442	95447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205151
1571	NC_019695	AC	3	6	95472	95477	50 %	0 %	0 %	50 %	428205151
1572	NC_019695	CGG	2	6	95515	95520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205151
1573	NC_019695	ATT	2	6	95547	95552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205151
1574	NC_019695	TGG	2	6	95683	95688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205151
1575	NC_019695	CGA	2	6	95761	95766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1576	NC_019695	GA	3	6	95923	95928	50 %	0 %	50 %	0 %	428205151
1577	NC_019695	GCG	2	6	96022	96027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205151
1578	NC_019695	CTG	2	6	96063	96068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1579	NC_019695	CGATCG	2	12	96139	96150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1580	NC_019695	TGC	2	6	96172	96177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205151
1581	NC_019695	TCAA	2	8	96235	96242	50 %	25 %	0 %	25 %	428205151
1582	NC_019695	T	6	6	96259	96264	0 %	100 %	0 %	0 %	428205151
1583	NC_019695	AGG	2	6	96271	96276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205151
1584	NC_019695	CAA	2	6	96363	96368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
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1586	NC_019695	GATC	2	8	96449	96456	25 %	25 %	25 %	25 %	428205151
1587	NC_019695	G	6	6	96481	96486	0 %	0 %	100 %	0 %	428205151
1588	NC_019695	AGTT	2	8	96507	96514	25 %	50 %	25 %	0 %	428205151
1589	NC_019695	AAC	2	6	96531	96536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
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1591	NC_019695	TTTA	2	8	96769	96776	25 %	75 %	0 %	0 %	428205151
1592	NC_019695	AAAC	2	8	96848	96855	75 %	0 %	0 %	25 %	428205151
1593	NC_019695	CAAA	2	8	96901	96908	75 %	0 %	0 %	25 %	428205151
1594	NC_019695	AAC	2	6	96929	96934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1595	NC_019695	CAA	2	6	96996	97001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205151
1596	NC_019695	AAG	2	6	97056	97061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205151
1597	NC_019695	TTG	2	6	97157	97162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205151
1598	NC_019695	AGCA	2	8	97212	97219	50 %	0 %	25 %	25 %	428205151
1599	NC_019695	CTG	2	6	97452	97457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205152
1600	NC_019695	T	6	6	97458	97463	0 %	100 %	0 %	0 %	428205152
1601	NC_019695	T	6	6	97479	97484	0 %	100 %	0 %	0 %	428205152
1602	NC_019695	GGTAC	2	10	97566	97575	20 %	20 %	40 %	20 %	428205152
1603	NC_019695	ATT	2	6	97586	97591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205152
1604	NC_019695	TGT	2	6	97724	97729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205152
1605	NC_019695	ACT	2	6	97793	97798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205152
1606	NC_019695	TGA	2	6	97808	97813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205152
1607	NC_019695	TTA	2	6	97833	97838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205152
1608	NC_019695	TTGTG	2	10	97849	97858	0 %	60 %	40 %	0 %	428205152
1609	NC_019695	AGTA	2	8	97914	97921	50 %	25 %	25 %	0 %	428205152
1610	NC_019695	CTA	2	6	98019	98024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205153
1611	NC_019695	CCA	2	6	98039	98044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205153
1612	NC_019695	ACG	2	6	98105	98110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205153
1613	NC_019695	A	6	6	98171	98176	100 %	0 %	0 %	0 %	428205153
1614	NC_019695	TACTC	2	10	98207	98216	20 %	40 %	0 %	40 %	428205153
1615	NC_019695	A	6	6	98257	98262	100 %	0 %	0 %	0 %	428205153
1616	NC_019695	CAGA	2	8	98652	98659	50 %	0 %	25 %	25 %	428205154
1617	NC_019695	T	6	6	98660	98665	0 %	100 %	0 %	0 %	428205154
1618	NC_019695	GGC	2	6	98675	98680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205154
1619	NC_019695	GCT	2	6	98688	98693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205154
1620	NC_019695	CCA	2	6	98745	98750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205154
1621	NC_019695	GCGATC	2	12	98775	98786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428205154
1622	NC_019695	TTGT	2	8	98794	98801	0 %	75 %	25 %	0 %	428205154
1623	NC_019695	CTA	2	6	98842	98847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205154
1624	NC_019695	TTC	2	6	98904	98909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205154
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1626	NC_019695	GCA	2	6	98973	98978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205154
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1995	NC_019695	TCT	2	6	124440	124445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205174
1996	NC_019695	AAG	2	6	124450	124455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205174
1997	NC_019695	GCC	2	6	124464	124469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205174
1998	NC_019695	GCG	2	6	124587	124592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205174
1999	NC_019695	GAC	2	6	124697	124702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205174
2000	NC_019695	GCA	2	6	124768	124773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205174

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