MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 99311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019695	TTC	2	6	311179	311184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205345
5002	NC_019695	TTA	2	6	311258	311263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205345
5003	NC_019695	CTC	2	6	311350	311355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205345
5004	NC_019695	CAA	2	6	311384	311389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205345
5005	NC_019695	TAG	2	6	311419	311424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205345
5006	NC_019695	AGTTCA	2	12	311426	311437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428205345
5007	NC_019695	ATT	2	6	311516	311521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205345
5008	NC_019695	TTG	2	6	311616	311621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205345
5009	NC_019695	AACT	2	8	311625	311632	50 %	25 %	0 %	25 %	428205345
5010	NC_019695	CAG	2	6	311664	311669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5011	NC_019695	GACG	2	8	311711	311718	25 %	0 %	50 %	25 %	428205345
5012	NC_019695	ACA	2	6	311779	311784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205345
5013	NC_019695	CAA	2	6	311915	311920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205345
5014	NC_019695	AGC	2	6	311941	311946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5015	NC_019695	GCA	2	6	311947	311952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5016	NC_019695	AG	3	6	311976	311981	50 %	0 %	50 %	0 %	428205345
5017	NC_019695	AAC	2	6	312001	312006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205345
5018	NC_019695	ACC	2	6	312142	312147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205345
5019	NC_019695	TAT	2	6	312167	312172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205345
5020	NC_019695	GCAA	2	8	312346	312353	50 %	0 %	25 %	25 %	428205345
5021	NC_019695	CGC	2	6	312356	312361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205345
5022	NC_019695	GCCA	2	8	312490	312497	25 %	0 %	25 %	50 %	428205345
5023	NC_019695	AATT	2	8	312516	312523	50 %	50 %	0 %	0 %	428205345
5024	NC_019695	G	6	6	312568	312573	0 %	0 %	100 %	0 %	428205345
5025	NC_019695	AG	3	6	312576	312581	50 %	0 %	50 %	0 %	428205345
5026	NC_019695	CAAC	2	8	312605	312612	50 %	0 %	0 %	50 %	428205345
5027	NC_019695	CAA	2	6	312616	312621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205345
5028	NC_019695	CAA	2	6	312623	312628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205345
5029	NC_019695	TTAT	2	8	312655	312662	25 %	75 %	0 %	0 %	428205345
5030	NC_019695	AAG	2	6	312672	312677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205345
5031	NC_019695	AT	3	6	312699	312704	50 %	50 %	0 %	0 %	428205345
5032	NC_019695	CCAG	2	8	312775	312782	25 %	0 %	25 %	50 %	428205345
5033	NC_019695	GCGAT	2	10	312915	312924	20 %	20 %	40 %	20 %	428205345
5034	NC_019695	TGG	2	6	312954	312959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205345
5035	NC_019695	ATTG	2	8	312964	312971	25 %	50 %	25 %	0 %	428205345
5036	NC_019695	GCT	2	6	313010	313015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5037	NC_019695	A	6	6	313050	313055	100 %	0 %	0 %	0 %	428205345
5038	NC_019695	TTA	2	6	313163	313168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205345
5039	NC_019695	CGA	2	6	313215	313220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5040	NC_019695	GTC	2	6	313224	313229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5041	NC_019695	A	6	6	313249	313254	100 %	0 %	0 %	0 %	428205345
5042	NC_019695	AGC	2	6	313315	313320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5043	NC_019695	ATGGG	2	10	313462	313471	20 %	20 %	60 %	0 %	428205345
5044	NC_019695	CGG	2	6	313478	313483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205345
5045	NC_019695	CG	3	6	313527	313532	0 %	0 %	50 %	50 %	428205345
5046	NC_019695	T	6	6	313558	313563	0 %	100 %	0 %	0 %	428205345
5047	NC_019695	TTTG	2	8	313591	313598	0 %	75 %	25 %	0 %	428205345
5048	NC_019695	CAG	2	6	313635	313640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5049	NC_019695	TGC	2	6	313654	313659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5050	NC_019695	CAG	2	6	313692	313697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5051	NC_019695	GCC	2	6	313880	313885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205345
5052	NC_019695	GGT	2	6	313991	313996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205345
5053	NC_019695	GC	3	6	314011	314016	0 %	0 %	50 %	50 %	428205345
5054	NC_019695	AGA	2	6	314092	314097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205345
5055	NC_019695	CGT	2	6	314122	314127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5056	NC_019695	GCA	2	6	314186	314191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5057	NC_019695	ATT	2	6	314199	314204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205345
5058	NC_019695	TTAT	2	8	314269	314276	25 %	75 %	0 %	0 %	428205345
5059	NC_019695	GCA	2	6	314302	314307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5060	NC_019695	A	7	7	314307	314313	100 %	0 %	0 %	0 %	428205345
5061	NC_019695	AGC	2	6	314358	314363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205345
5062	NC_019695	GAA	2	6	314438	314443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205345
5063	NC_019695	GATC	2	8	314496	314503	25 %	25 %	25 %	25 %	428205346
5064	NC_019695	TCAA	2	8	314630	314637	50 %	25 %	0 %	25 %	428205346
5065	NC_019695	A	7	7	314756	314762	100 %	0 %	0 %	0 %	428205346
5066	NC_019695	CCT	2	6	314801	314806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205346
5067	NC_019695	ACT	2	6	314831	314836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205346
5068	NC_019695	GTTT	2	8	314840	314847	0 %	75 %	25 %	0 %	428205346
5069	NC_019695	TGT	2	6	314850	314855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205346
5070	NC_019695	GAC	2	6	314904	314909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205346
5071	NC_019695	ATC	2	6	314947	314952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205346
5072	NC_019695	GTCATC	2	12	315049	315060	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428205346
5073	NC_019695	TAGA	2	8	315132	315139	50 %	25 %	25 %	0 %	428205346
5074	NC_019695	CTG	2	6	315162	315167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205346
5075	NC_019695	TGCAC	2	10	315245	315254	20 %	20 %	20 %	40 %	428205346
5076	NC_019695	ATA	2	6	315290	315295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205346
5077	NC_019695	A	6	6	315322	315327	100 %	0 %	0 %	0 %	428205347
5078	NC_019695	TCCA	2	8	315336	315343	25 %	25 %	0 %	50 %	428205347
5079	NC_019695	CGT	2	6	315393	315398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205347
5080	NC_019695	CATGA	2	10	315407	315416	40 %	20 %	20 %	20 %	428205347
5081	NC_019695	AAT	2	6	315476	315481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205347
5082	NC_019695	ACT	2	6	315585	315590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205347
5083	NC_019695	ACT	2	6	315600	315605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205347
5084	NC_019695	AAC	2	6	315651	315656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205347
5085	NC_019695	CTT	3	9	315796	315804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205347
5086	NC_019695	ATAA	2	8	315818	315825	75 %	25 %	0 %	0 %	428205347
5087	NC_019695	GTT	2	6	315850	315855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205347
5088	NC_019695	GTT	2	6	315964	315969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205347
5089	NC_019695	CCG	2	6	315975	315980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205347
5090	NC_019695	ACGTT	2	10	316155	316164	20 %	40 %	20 %	20 %	428205347
5091	NC_019695	AGGC	2	8	316168	316175	25 %	0 %	50 %	25 %	428205347
5092	NC_019695	GAC	2	6	316177	316182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205347
5093	NC_019695	GTT	2	6	316254	316259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205347
5094	NC_019695	CAG	2	6	316280	316285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205347
5095	NC_019695	TGC	2	6	316302	316307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205347
5096	NC_019695	CTT	2	6	316566	316571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205348
5097	NC_019695	CCGAT	2	10	316672	316681	20 %	20 %	20 %	40 %	428205348
5098	NC_019695	TGC	2	6	316683	316688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205348
5099	NC_019695	AAAGCT	2	12	316691	316702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428205348
5100	NC_019695	CGC	2	6	316716	316721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205348
5101	NC_019695	TTCGC	2	10	316752	316761	0 %	40 %	20 %	40 %	428205348
5102	NC_019695	CTT	2	6	316767	316772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205348
5103	NC_019695	CAA	2	6	316783	316788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205348
5104	NC_019695	TCT	2	6	316829	316834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205348
5105	NC_019695	CAC	2	6	317005	317010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205348
5106	NC_019695	TTTCTG	2	12	317100	317111	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428205348
5107	NC_019695	AGC	2	6	317152	317157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205348
5108	NC_019695	GCA	2	6	317166	317171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205348
5109	NC_019695	CAAT	2	8	317175	317182	50 %	25 %	0 %	25 %	428205348
5110	NC_019695	CTA	2	6	317207	317212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205348
5111	NC_019695	GGA	2	6	317213	317218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205348
5112	NC_019695	CCA	2	6	317249	317254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205348
5113	NC_019695	CTTC	2	8	317344	317351	0 %	50 %	0 %	50 %	428205348
5114	NC_019695	TTA	2	6	317357	317362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205348
5115	NC_019695	CTT	2	6	317415	317420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205348
5116	NC_019695	TGA	2	6	317455	317460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205348
5117	NC_019695	TTC	2	6	317476	317481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205348
5118	NC_019695	CTT	2	6	317484	317489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205348
5119	NC_019695	T	6	6	317548	317553	0 %	100 %	0 %	0 %	428205348
5120	NC_019695	TAA	2	6	317563	317568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205348
5121	NC_019695	AAC	2	6	317585	317590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205348
5122	NC_019695	GA	3	6	317617	317622	50 %	0 %	50 %	0 %	428205348
5123	NC_019695	TAC	2	6	317745	317750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205348
5124	NC_019695	TGCC	2	8	317758	317765	0 %	25 %	25 %	50 %	428205348
5125	NC_019695	GC	3	6	317826	317831	0 %	0 %	50 %	50 %	428205348
5126	NC_019695	GTT	2	6	317934	317939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205348
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5129	NC_019695	AAC	2	6	318010	318015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205348
5130	NC_019695	TTA	2	6	318149	318154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205348
5131	NC_019695	ACG	2	6	318176	318181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205348
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5134	NC_019695	TAC	2	6	318255	318260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205348
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5137	NC_019695	GTC	2	6	318355	318360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205348
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5139	NC_019695	GAT	2	6	318400	318405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205348
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5141	NC_019695	TTG	2	6	318511	318516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205348
5142	NC_019695	TTC	2	6	318550	318555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205348
5143	NC_019695	TCAG	2	8	318563	318570	25 %	25 %	25 %	25 %	428205348
5144	NC_019695	GCGAG	2	10	318593	318602	20 %	0 %	60 %	20 %	428205348
5145	NC_019695	TGC	2	6	318619	318624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205348
5146	NC_019695	TGG	2	6	318625	318630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205348
5147	NC_019695	ACCGA	2	10	318641	318650	40 %	0 %	20 %	40 %	428205348
5148	NC_019695	CTA	2	6	318765	318770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205348
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5150	NC_019695	ACGT	2	8	318862	318869	25 %	25 %	25 %	25 %	428205348
5151	NC_019695	GCCC	2	8	318878	318885	0 %	0 %	25 %	75 %	428205348
5152	NC_019695	ATG	2	6	319299	319304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205349
5153	NC_019695	GTG	2	6	319372	319377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205349
5154	NC_019695	AGA	2	6	319406	319411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205349
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5156	NC_019695	GATG	2	8	319454	319461	25 %	25 %	50 %	0 %	428205349
5157	NC_019695	CAG	2	6	319656	319661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205349
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5161	NC_019695	GCG	2	6	320170	320175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205350
5162	NC_019695	GCA	2	6	320198	320203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205350
5163	NC_019695	GCA	2	6	320261	320266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205350
5164	NC_019695	CTG	2	6	320285	320290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205350
5165	NC_019695	CTG	2	6	320339	320344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205350
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5176	NC_019695	AT	3	6	321076	321081	50 %	50 %	0 %	0 %	428205350
5177	NC_019695	AGC	2	6	321174	321179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205350
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5184	NC_019695	ACGGT	2	10	321804	321813	20 %	20 %	40 %	20 %	428205352
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5188	NC_019695	GTT	2	6	322032	322037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205352
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5194	NC_019695	GAG	2	6	322193	322198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205352
5195	NC_019695	GAC	2	6	322226	322231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205352
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5202	NC_019695	AC	3	6	322967	322972	50 %	0 %	0 %	50 %	428205353
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5211	NC_019695	AGC	2	6	323528	323533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205355
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5213	NC_019695	ATC	2	6	323558	323563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205355
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5217	NC_019695	GGGAA	2	10	323907	323916	40 %	0 %	60 %	0 %	428205356
5218	NC_019695	AAACCA	2	12	323973	323984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205356
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5223	NC_019695	AATCC	2	10	324271	324280	40 %	20 %	0 %	40 %	428205356
5224	NC_019695	GTT	2	6	324362	324367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205356
5225	NC_019695	ATA	2	6	324369	324374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205356
5226	NC_019695	ATC	2	6	324398	324403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205356
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5229	NC_019695	CGCCAT	2	12	324614	324625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428205356
5230	NC_019695	A	6	6	324657	324662	100 %	0 %	0 %	0 %	428205356
5231	NC_019695	A	7	7	324674	324680	100 %	0 %	0 %	0 %	428205356
5232	NC_019695	T	6	6	324938	324943	0 %	100 %	0 %	0 %	428205356
5233	NC_019695	CAATT	2	10	325001	325010	40 %	40 %	0 %	20 %	428205356
5234	NC_019695	AAT	2	6	325250	325255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205356
5235	NC_019695	AAT	2	6	325482	325487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205357
5236	NC_019695	GCGATC	2	12	325570	325581	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428205357
5237	NC_019695	TGC	2	6	325611	325616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205357
5238	NC_019695	TGCT	2	8	325625	325632	0 %	50 %	25 %	25 %	428205357
5239	NC_019695	AGCGT	2	10	325655	325664	20 %	20 %	40 %	20 %	428205357
5240	NC_019695	CAA	2	6	325675	325680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205357
5241	NC_019695	ATC	2	6	325836	325841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205358
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5243	NC_019695	AGC	2	6	325956	325961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205358
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5362	NC_019695	ATCAC	2	10	333603	333612	40 %	20 %	0 %	40 %	428205367
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5491	NC_019695	CTG	2	6	343081	343086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205376
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