MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 99311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019695	CCAT	2	8	278138	278145	25 %	25 %	0 %	50 %	428205310
4502	NC_019695	CTAAGC	2	12	278157	278168	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428205310
4503	NC_019695	GATC	2	8	278188	278195	25 %	25 %	25 %	25 %	428205310
4504	NC_019695	TTA	2	6	278234	278239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205310
4505	NC_019695	TTA	2	6	278303	278308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205310
4506	NC_019695	AAT	2	6	278359	278364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205310
4507	NC_019695	CGA	3	9	278405	278413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205310
4508	NC_019695	GTT	2	6	278418	278423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205310
4509	NC_019695	T	8	8	278438	278445	0 %	100 %	0 %	0 %	428205310
4510	NC_019695	CGT	2	6	278669	278674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205311
4511	NC_019695	ACT	2	6	278685	278690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205311
4512	NC_019695	T	6	6	278862	278867	0 %	100 %	0 %	0 %	428205311
4513	NC_019695	CT	3	6	278925	278930	0 %	50 %	0 %	50 %	428205311
4514	NC_019695	CCT	2	6	278961	278966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205311
4515	NC_019695	TCG	2	6	279024	279029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205311
4516	NC_019695	TAA	2	6	279126	279131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205311
4517	NC_019695	GCG	3	9	279248	279256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205311
4518	NC_019695	GAT	2	6	279611	279616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205311
4519	NC_019695	GTA	2	6	279617	279622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205311
4520	NC_019695	CAT	2	6	279644	279649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205311
4521	NC_019695	CCATAC	2	12	279832	279843	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428205311
4522	NC_019695	GAC	2	6	279845	279850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205311
4523	NC_019695	GT	3	6	279870	279875	0 %	50 %	50 %	0 %	428205311
4524	NC_019695	TGGA	2	8	279876	279883	25 %	25 %	50 %	0 %	428205311
4525	NC_019695	TGT	2	6	279907	279912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205311
4526	NC_019695	GCT	3	9	279951	279959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205311
4527	NC_019695	T	6	6	280038	280043	0 %	100 %	0 %	0 %	428205311
4528	NC_019695	A	6	6	280386	280391	100 %	0 %	0 %	0 %	428205312
4529	NC_019695	CTAC	2	8	280479	280486	25 %	25 %	0 %	50 %	428205312
4530	NC_019695	TA	3	6	280516	280521	50 %	50 %	0 %	0 %	428205312
4531	NC_019695	TAC	2	6	280538	280543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205312
4532	NC_019695	ATT	2	6	280581	280586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205312
4533	NC_019695	GAA	2	6	280889	280894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205313
4534	NC_019695	CTA	2	6	280930	280935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205313
4535	NC_019695	TTG	2	6	280937	280942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205313
4536	NC_019695	AAATCT	2	12	281070	281081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428205313
4537	NC_019695	TTA	2	6	281142	281147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205313
4538	NC_019695	TAA	2	6	281186	281191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
4539	NC_019695	TTC	2	6	281270	281275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205313
4540	NC_019695	TGAA	2	8	281298	281305	50 %	25 %	25 %	0 %	428205313
4541	NC_019695	TAA	2	6	281359	281364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
4542	NC_019695	TAA	2	6	281384	281389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
4543	NC_019695	GCC	2	6	281415	281420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205313
4544	NC_019695	GGA	2	6	281471	281476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205313
4545	NC_019695	GTAG	2	8	281481	281488	25 %	25 %	50 %	0 %	428205313
4546	NC_019695	CAC	2	6	281632	281637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205313
4547	NC_019695	AGC	2	6	281726	281731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205313
4548	NC_019695	TGG	2	6	281742	281747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205313
4549	NC_019695	TTG	2	6	281753	281758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205313
4550	NC_019695	TGC	2	6	281784	281789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205313
4551	NC_019695	TAA	2	6	281797	281802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
4552	NC_019695	TCT	2	6	281835	281840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205313
4553	NC_019695	TCGT	2	8	281942	281949	0 %	50 %	25 %	25 %	428205313
4554	NC_019695	AAT	2	6	281960	281965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
4555	NC_019695	TAA	2	6	281998	282003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
4556	NC_019695	GTA	2	6	282010	282015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205313
4557	NC_019695	TGG	2	6	282063	282068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205313
4558	NC_019695	GTA	2	6	282081	282086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205313
4559	NC_019695	CAG	2	6	282136	282141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205313
4560	NC_019695	TAA	2	6	282173	282178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
4561	NC_019695	TTG	2	6	282209	282214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205313
4562	NC_019695	TTTGC	2	10	282243	282252	0 %	60 %	20 %	20 %	428205313
4563	NC_019695	TCGACA	2	12	282264	282275	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428205313
4564	NC_019695	GCAA	2	8	282286	282293	50 %	0 %	25 %	25 %	428205313
4565	NC_019695	ATT	2	6	282375	282380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205313
4566	NC_019695	TAA	2	6	282422	282427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205313
4567	NC_019695	ACCA	2	8	282432	282439	50 %	0 %	0 %	50 %	428205313
4568	NC_019695	CA	3	6	282438	282443	50 %	0 %	0 %	50 %	428205313
4569	NC_019695	GAC	2	6	282550	282555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205313
4570	NC_019695	ACAAAC	2	12	282573	282584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205313
4571	NC_019695	CAG	2	6	282652	282657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205313
4572	NC_019695	GGT	2	6	282696	282701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205313
4573	NC_019695	GTT	2	6	282727	282732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205313
4574	NC_019695	TGA	2	6	282748	282753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205313
4575	NC_019695	GGC	2	6	282763	282768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205313
4576	NC_019695	TTC	2	6	282881	282886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205313
4577	NC_019695	GCG	2	6	283060	283065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205314
4578	NC_019695	TTTA	2	8	283158	283165	25 %	75 %	0 %	0 %	428205314
4579	NC_019695	TC	3	6	283180	283185	0 %	50 %	0 %	50 %	428205314
4580	NC_019695	CCAAG	2	10	283188	283197	40 %	0 %	20 %	40 %	428205314
4581	NC_019695	GTGTC	2	10	283237	283246	0 %	40 %	40 %	20 %	428205314
4582	NC_019695	GGT	2	6	283265	283270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205314
4583	NC_019695	ATTTG	2	10	283312	283321	20 %	60 %	20 %	0 %	428205314
4584	NC_019695	GCA	2	6	283381	283386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205314
4585	NC_019695	TAA	2	6	283502	283507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205314
4586	NC_019695	AAC	2	6	283581	283586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205314
4587	NC_019695	GGC	3	9	283623	283631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205314
4588	NC_019695	T	6	6	283659	283664	0 %	100 %	0 %	0 %	428205314
4589	NC_019695	AGC	2	6	283704	283709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205314
4590	NC_019695	AG	3	6	283721	283726	50 %	0 %	50 %	0 %	428205314
4591	NC_019695	GTT	2	6	283731	283736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205314
4592	NC_019695	TAA	2	6	283775	283780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205314
4593	NC_019695	CTG	2	6	283782	283787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205314
4594	NC_019695	CAA	2	6	283881	283886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205314
4595	NC_019695	CACG	2	8	283918	283925	25 %	0 %	25 %	50 %	428205314
4596	NC_019695	T	6	6	283933	283938	0 %	100 %	0 %	0 %	428205314
4597	NC_019695	GTTG	2	8	284027	284034	0 %	50 %	50 %	0 %	428205314
4598	NC_019695	AC	3	6	284051	284056	50 %	0 %	0 %	50 %	428205314
4599	NC_019695	GAT	2	6	284058	284063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205314
4600	NC_019695	GTAG	2	8	284092	284099	25 %	25 %	50 %	0 %	428205314
4601	NC_019695	GTA	2	6	284127	284132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205314
4602	NC_019695	GCT	2	6	284161	284166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205314
4603	NC_019695	AGT	2	6	284203	284208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205314
4604	NC_019695	CGA	2	6	284240	284245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205314
4605	NC_019695	TCT	2	6	284257	284262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205314
4606	NC_019695	TTC	2	6	284313	284318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205314
4607	NC_019695	CTA	2	6	284342	284347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205314
4608	NC_019695	TGTC	2	8	284377	284384	0 %	50 %	25 %	25 %	428205314
4609	NC_019695	TTTC	2	8	284413	284420	0 %	75 %	0 %	25 %	428205314
4610	NC_019695	ATCG	2	8	284431	284438	25 %	25 %	25 %	25 %	428205314
4611	NC_019695	AGT	2	6	284450	284455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205314
4612	NC_019695	TGGT	2	8	285377	285384	0 %	50 %	50 %	0 %	428205316
4613	NC_019695	CGA	2	6	285467	285472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205316
4614	NC_019695	GCAG	2	8	285506	285513	25 %	0 %	50 %	25 %	428205316
4615	NC_019695	ATT	3	9	285536	285544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205317
4616	NC_019695	ACA	2	6	285551	285556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205317
4617	NC_019695	GT	3	6	285592	285597	0 %	50 %	50 %	0 %	428205317
4618	NC_019695	AGC	2	6	285727	285732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205317
4619	NC_019695	GAA	2	6	286184	286189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205318
4620	NC_019695	GGA	2	6	286245	286250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205318
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4622	NC_019695	AAC	2	6	286334	286339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205318
4623	NC_019695	CTG	2	6	286414	286419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205318
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4731	NC_019695	CCAA	2	8	295237	295244	50 %	0 %	0 %	50 %	428205326
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4884	NC_019695	TGG	2	6	304883	304888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205338
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4894	NC_019695	GAA	2	6	305628	305633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205339
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4952	NC_019695	TGCCT	2	10	308720	308729	0 %	40 %	20 %	40 %	428205344
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4986	NC_019695	TACCGA	2	12	310456	310467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428205345
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4988	NC_019695	TGC	2	6	310536	310541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205345
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