MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 3189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019682	GTGAT	2	10	955	964	20 %	40 %	40 %	0 %	427715355
2	NC_019682	AACCG	2	10	4066	4075	40 %	0 %	20 %	40 %	427715357
3	NC_019682	CCAGT	2	10	4974	4983	20 %	20 %	20 %	40 %	427715357
4	NC_019682	ATGAA	2	10	9169	9178	60 %	20 %	20 %	0 %	427715361
5	NC_019682	ACATC	2	10	10891	10900	40 %	20 %	0 %	40 %	427715363
6	NC_019682	AACCC	2	10	12925	12934	40 %	0 %	0 %	60 %	427715366
7	NC_019682	TAAAT	2	10	21055	21064	60 %	40 %	0 %	0 %	427715370
8	NC_019682	TGGAA	2	10	24678	24687	40 %	20 %	40 %	0 %	427715373
9	NC_019682	CTTAT	2	10	25902	25911	20 %	60 %	0 %	20 %	427715374
10	NC_019682	AAAAC	2	10	28332	28341	80 %	0 %	0 %	20 %	427715375
11	NC_019682	CCCAA	2	10	30344	30353	40 %	0 %	0 %	60 %	427715377
12	NC_019682	TTGGT	2	10	31697	31706	0 %	60 %	40 %	0 %	427715378
13	NC_019682	AGGTA	2	10	31774	31783	40 %	20 %	40 %	0 %	427715378
14	NC_019682	AGGTA	2	10	31796	31805	40 %	20 %	40 %	0 %	427715378
15	NC_019682	TAAAT	2	10	32308	32317	60 %	40 %	0 %	0 %	427715379
16	NC_019682	TAAAA	2	10	33362	33371	80 %	20 %	0 %	0 %	427715379
17	NC_019682	ACTTC	2	10	38457	38466	20 %	40 %	0 %	40 %	427715384
18	NC_019682	ATCAA	2	10	40130	40139	60 %	20 %	0 %	20 %	427715386
19	NC_019682	GACCA	2	10	40665	40674	40 %	0 %	20 %	40 %	427715387
20	NC_019682	AATGA	2	10	43587	43596	60 %	20 %	20 %	0 %	427715389
21	NC_019682	TAACT	2	10	45675	45684	40 %	40 %	0 %	20 %	427715391
22	NC_019682	AAAAG	2	10	47480	47489	80 %	0 %	20 %	0 %	427715393
23	NC_019682	CTGTG	2	10	47494	47503	0 %	40 %	40 %	20 %	427715393
24	NC_019682	GCCAC	3	15	51511	51525	20 %	0 %	20 %	60 %	427715398
25	NC_019682	AATCA	2	10	52204	52213	60 %	20 %	0 %	20 %	427715400
26	NC_019682	TTTGA	2	10	55377	55386	20 %	60 %	20 %	0 %	427715401
27	NC_019682	ATTTA	2	10	55726	55735	40 %	60 %	0 %	0 %	427715402
28	NC_019682	CCACC	2	10	55806	55815	20 %	0 %	0 %	80 %	427715402
29	NC_019682	TTTGG	2	10	58771	58780	0 %	60 %	40 %	0 %	427715405
30	NC_019682	AATTT	2	10	58835	58844	40 %	60 %	0 %	0 %	427715405
31	NC_019682	TGACA	2	10	60584	60593	40 %	20 %	20 %	20 %	427715408
32	NC_019682	TAATT	2	10	61066	61075	40 %	60 %	0 %	0 %	427715409
33	NC_019682	CAATT	2	10	65626	65635	40 %	40 %	0 %	20 %	427715416
34	NC_019682	ACTCA	2	10	66424	66433	40 %	20 %	0 %	40 %	427715416
35	NC_019682	TTAAT	2	10	68476	68485	40 %	60 %	0 %	0 %	427715419
36	NC_019682	TCCAA	2	10	69491	69500	40 %	20 %	0 %	40 %	427715422
37	NC_019682	AGAGA	2	10	71969	71978	60 %	0 %	40 %	0 %	427715426
38	NC_019682	CATTA	2	10	79407	79416	40 %	40 %	0 %	20 %	427715432
39	NC_019682	CAAGA	2	10	86097	86106	60 %	0 %	20 %	20 %	427715438
40	NC_019682	TTATT	2	10	86199	86208	20 %	80 %	0 %	0 %	427715438
41	NC_019682	ACCTT	2	10	86675	86684	20 %	40 %	0 %	40 %	427715438
42	NC_019682	CGTCT	2	10	87468	87477	0 %	40 %	20 %	40 %	427715439
43	NC_019682	TGATT	2	10	95863	95872	20 %	60 %	20 %	0 %	427715446
44	NC_019682	TGTCT	2	10	97455	97464	0 %	60 %	20 %	20 %	427715448
45	NC_019682	CATTA	2	10	98856	98865	40 %	40 %	0 %	20 %	427715449
46	NC_019682	AGAAA	2	10	100887	100896	80 %	0 %	20 %	0 %	427715450
47	NC_019682	AAAAT	2	10	101507	101516	80 %	20 %	0 %	0 %	427715450
48	NC_019682	TCAAC	2	10	104860	104869	40 %	20 %	0 %	40 %	427715456
49	NC_019682	CATTC	2	10	105796	105805	20 %	40 %	0 %	40 %	427715456
50	NC_019682	AAGAG	2	10	109006	109015	60 %	0 %	40 %	0 %	427715459
51	NC_019682	TACAC	2	10	109585	109594	40 %	20 %	0 %	40 %	427715459
52	NC_019682	TCACC	2	10	112275	112284	20 %	20 %	0 %	60 %	427715462
53	NC_019682	GCTTT	2	10	115141	115150	0 %	60 %	20 %	20 %	427715467
54	NC_019682	TTTAT	2	10	122955	122964	20 %	80 %	0 %	0 %	427715481
55	NC_019682	TCCAG	2	10	123041	123050	20 %	20 %	20 %	40 %	427715481
56	NC_019682	AGAAA	2	10	123864	123873	80 %	0 %	20 %	0 %	427715483
57	NC_019682	GTTTT	2	10	124170	124179	0 %	80 %	20 %	0 %	427715484
58	NC_019682	TTGCG	2	10	125761	125770	0 %	40 %	40 %	20 %	427715485
59	NC_019682	ATAGA	2	10	126401	126410	60 %	20 %	20 %	0 %	427715486
60	NC_019682	GATAT	2	10	131476	131485	40 %	40 %	20 %	0 %	427715491
61	NC_019682	TGTAG	2	10	131638	131647	20 %	40 %	40 %	0 %	427715491
62	NC_019682	AATTT	2	10	132320	132329	40 %	60 %	0 %	0 %	427715492
63	NC_019682	CTCAA	2	10	133624	133633	40 %	20 %	0 %	40 %	427715492
64	NC_019682	GGTTA	2	10	133661	133670	20 %	40 %	40 %	0 %	427715492
65	NC_019682	AAATT	2	10	135697	135706	60 %	40 %	0 %	0 %	427715494
66	NC_019682	ATTTT	2	10	136498	136507	20 %	80 %	0 %	0 %	427715496
67	NC_019682	TTTTG	2	10	138189	138198	0 %	80 %	20 %	0 %	427715498
68	NC_019682	GTTCT	2	10	139892	139901	0 %	60 %	20 %	20 %	427715500
69	NC_019682	CATCC	2	10	141568	141577	20 %	20 %	0 %	60 %	427715502
70	NC_019682	ATCAA	2	10	143942	143951	60 %	20 %	0 %	20 %	427715506
71	NC_019682	TCAAC	2	10	145460	145469	40 %	20 %	0 %	40 %	427715508
72	NC_019682	ATTTT	2	10	150376	150385	20 %	80 %	0 %	0 %	427715512
73	NC_019682	AAATA	2	10	153994	154003	80 %	20 %	0 %	0 %	427715515
74	NC_019682	AGTTG	2	10	154564	154573	20 %	40 %	40 %	0 %	427715516
75	NC_019682	AGAAA	2	10	165891	165900	80 %	0 %	20 %	0 %	427715522
76	NC_019682	GTTTA	2	10	167834	167843	20 %	60 %	20 %	0 %	427715523
77	NC_019682	GAAAA	2	10	168816	168825	80 %	0 %	20 %	0 %	427715524
78	NC_019682	AGTTT	2	10	169645	169654	20 %	60 %	20 %	0 %	427715525
79	NC_019682	CAAAA	2	10	172307	172316	80 %	0 %	0 %	20 %	427715527
80	NC_019682	GTAGC	2	10	173590	173599	20 %	20 %	40 %	20 %	427715529
81	NC_019682	CATCT	2	10	173937	173946	20 %	40 %	0 %	40 %	427715529
82	NC_019682	CGTAC	2	10	174262	174271	20 %	20 %	20 %	40 %	427715529
83	NC_019682	TACTG	2	10	176155	176164	20 %	40 %	20 %	20 %	427715531
84	NC_019682	GTAAT	2	10	176944	176953	40 %	40 %	20 %	0 %	427715533
85	NC_019682	TCAAA	2	10	180692	180701	60 %	20 %	0 %	20 %	427715536
86	NC_019682	TTTTA	2	10	181776	181785	20 %	80 %	0 %	0 %	427715537
87	NC_019682	GTCTG	2	10	184463	184472	0 %	40 %	40 %	20 %	427715541
88	NC_019682	TCAAA	2	10	187187	187196	60 %	20 %	0 %	20 %	427715545
89	NC_019682	AAATC	2	10	187666	187675	60 %	20 %	0 %	20 %	427715545
90	NC_019682	AGTTG	2	10	189485	189494	20 %	40 %	40 %	0 %	427715546
91	NC_019682	TTCTG	2	10	196069	196078	0 %	60 %	20 %	20 %	427715553
92	NC_019682	ATCGC	2	10	203619	203628	20 %	20 %	20 %	40 %	427715562
93	NC_019682	CAACT	2	10	206437	206446	40 %	20 %	0 %	40 %	427715565
94	NC_019682	CGAGG	2	10	207994	208003	20 %	0 %	60 %	20 %	427715567
95	NC_019682	CAAAC	2	10	211299	211308	60 %	0 %	0 %	40 %	427715569
96	NC_019682	CTTGA	2	10	215235	215244	20 %	40 %	20 %	20 %	427715573
97	NC_019682	GAAAT	2	10	215657	215666	60 %	20 %	20 %	0 %	427715573
98	NC_019682	ATTTT	2	10	216022	216031	20 %	80 %	0 %	0 %	427715573
99	NC_019682	TCCTT	2	10	217498	217507	0 %	60 %	0 %	40 %	427715574
100	NC_019682	GATTT	2	10	226610	226619	20 %	60 %	20 %	0 %	427715578
101	NC_019682	TGCAA	2	10	231865	231874	40 %	20 %	20 %	20 %	427715583
102	NC_019682	GTAAT	2	10	232653	232662	40 %	40 %	20 %	0 %	427715583
103	NC_019682	TGGCG	2	10	235955	235964	0 %	20 %	60 %	20 %	427715589
104	NC_019682	AGGGA	2	10	236109	236118	40 %	0 %	60 %	0 %	427715589
105	NC_019682	GGAAG	2	10	238867	238876	40 %	0 %	60 %	0 %	427715590
106	NC_019682	TCAAC	2	10	239365	239374	40 %	20 %	0 %	40 %	427715590
107	NC_019682	TCAAC	2	10	240193	240202	40 %	20 %	0 %	40 %	427715590
108	NC_019682	AAGTG	2	10	240211	240220	40 %	20 %	40 %	0 %	427715590
109	NC_019682	TCAAC	2	10	240745	240754	40 %	20 %	0 %	40 %	427715590
110	NC_019682	TCAAC	2	10	241021	241030	40 %	20 %	0 %	40 %	427715590
111	NC_019682	TAACT	2	10	241714	241723	40 %	40 %	0 %	20 %	427715590
112	NC_019682	GCGTC	2	10	244189	244198	0 %	20 %	40 %	40 %	427715590
113	NC_019682	AACGC	2	10	246303	246312	40 %	0 %	20 %	40 %	427715591
114	NC_019682	AATTC	2	10	247767	247776	40 %	40 %	0 %	20 %	427715592
115	NC_019682	AATTC	2	10	248137	248146	40 %	40 %	0 %	20 %	427715593
116	NC_019682	AAGGC	2	10	248560	248569	40 %	0 %	40 %	20 %	427715594
117	NC_019682	GGCGA	2	10	249412	249421	20 %	0 %	60 %	20 %	427715595
118	NC_019682	TGACC	2	10	249656	249665	20 %	20 %	20 %	40 %	427715595
119	NC_019682	GTGGG	2	10	251882	251891	0 %	20 %	80 %	0 %	427715596
120	NC_019682	CATGT	2	10	263683	263692	20 %	40 %	20 %	20 %	427715606
121	NC_019682	ACTAA	2	10	266266	266275	60 %	20 %	0 %	20 %	427715607
122	NC_019682	GGACA	2	10	267434	267443	40 %	0 %	40 %	20 %	427715608
123	NC_019682	GGCAA	2	10	271101	271110	40 %	0 %	40 %	20 %	427715609
124	NC_019682	TCACT	2	10	271426	271435	20 %	40 %	0 %	40 %	427715609
125	NC_019682	TAAAC	2	10	273973	273982	60 %	20 %	0 %	20 %	427715614
126	NC_019682	TTTAA	2	10	274387	274396	40 %	60 %	0 %	0 %	427715614
127	NC_019682	CGCAG	2	10	276330	276339	20 %	0 %	40 %	40 %	427715615
128	NC_019682	TCTGC	2	10	283712	283721	0 %	40 %	20 %	40 %	427715620
129	NC_019682	CAATC	2	10	286585	286594	40 %	20 %	0 %	40 %	427715623
130	NC_019682	GCGCT	2	10	290461	290470	0 %	20 %	40 %	40 %	427715626
131	NC_019682	ATATC	2	10	291027	291036	40 %	40 %	0 %	20 %	427715626
132	NC_019682	CCAAG	2	10	292322	292331	40 %	0 %	20 %	40 %	427715627
133	NC_019682	CCTAC	2	10	292743	292752	20 %	20 %	0 %	60 %	427715628
134	NC_019682	CCATC	2	10	297991	298000	20 %	20 %	0 %	60 %	427715635
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262	NC_019682	AGATG	2	10	559222	559231	40 %	20 %	40 %	0 %	427715863
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