MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_019682	GGA	2	6	132090	132095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715492
2003	NC_019682	ATG	2	6	132188	132193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715492
2004	NC_019682	TCC	2	6	132270	132275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715492
2005	NC_019682	AATTT	2	10	132320	132329	40 %	60 %	0 %	0 %	427715492
2006	NC_019682	TGA	2	6	132330	132335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715492
2007	NC_019682	GCT	2	6	132382	132387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715492
2008	NC_019682	TGC	2	6	132390	132395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715492
2009	NC_019682	TAT	2	6	132492	132497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715492
2010	NC_019682	CGT	2	6	132589	132594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715492
2011	NC_019682	GAT	2	6	132694	132699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715492
2012	NC_019682	GTT	2	6	132793	132798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715492
2013	NC_019682	A	6	6	132820	132825	100 %	0 %	0 %	0 %	427715492
2014	NC_019682	TAGT	2	8	132887	132894	25 %	50 %	25 %	0 %	427715492
2015	NC_019682	GTT	2	6	132909	132914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715492
2016	NC_019682	TGT	2	6	132938	132943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715492
2017	NC_019682	CGC	2	6	133043	133048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715492
2018	NC_019682	CAT	2	6	133051	133056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715492
2019	NC_019682	ATG	2	6	133133	133138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715492
2020	NC_019682	ATT	2	6	133169	133174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715492
2021	NC_019682	GA	3	6	133190	133195	50 %	0 %	50 %	0 %	427715492
2022	NC_019682	GAT	2	6	133210	133215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715492
2023	NC_019682	GGT	2	6	133218	133223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715492
2024	NC_019682	CGC	2	6	133255	133260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715492
2025	NC_019682	ACC	2	6	133293	133298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715492
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2028	NC_019682	A	6	6	133344	133349	100 %	0 %	0 %	0 %	427715492
2029	NC_019682	GCG	2	6	133414	133419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715492
2030	NC_019682	ATTT	2	8	133460	133467	25 %	75 %	0 %	0 %	427715492
2031	NC_019682	TC	3	6	133512	133517	0 %	50 %	0 %	50 %	427715492
2032	NC_019682	CAT	2	6	133576	133581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715492
2033	NC_019682	CTCAA	2	10	133624	133633	40 %	20 %	0 %	40 %	427715492
2034	NC_019682	GGTTA	2	10	133661	133670	20 %	40 %	40 %	0 %	427715492
2035	NC_019682	AGG	2	6	133764	133769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715492
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2037	NC_019682	AATT	2	8	133811	133818	50 %	50 %	0 %	0 %	427715492
2038	NC_019682	GAA	2	6	133999	134004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715492
2039	NC_019682	TAG	2	6	134045	134050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715492
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2041	NC_019682	GAA	2	6	134074	134079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715492
2042	NC_019682	TATT	2	8	134118	134125	25 %	75 %	0 %	0 %	427715492
2043	NC_019682	GCA	3	9	134169	134177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715492
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2046	NC_019682	GTC	2	6	134246	134251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715492
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2054	NC_019682	AAC	2	6	134597	134602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715493
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2062	NC_019682	GAA	2	6	134943	134948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715494
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2122	NC_019682	TTG	2	6	138091	138096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715498
2123	NC_019682	GTT	2	6	138138	138143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715498
2124	NC_019682	TTTTG	2	10	138189	138198	0 %	80 %	20 %	0 %	427715498
2125	NC_019682	A	6	6	138209	138214	100 %	0 %	0 %	0 %	427715498
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2242	NC_019682	CGA	2	6	146150	146155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715508
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2244	NC_019682	TTA	2	6	146199	146204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715508
2245	NC_019682	TCC	2	6	146214	146219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715508
2246	NC_019682	TG	3	6	146230	146235	0 %	50 %	50 %	0 %	427715508
2247	NC_019682	TGA	2	6	146284	146289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715508
2248	NC_019682	CCTT	2	8	146295	146302	0 %	50 %	0 %	50 %	427715508
2249	NC_019682	GAA	2	6	146812	146817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715509
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2259	NC_019682	CAT	2	6	147316	147321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715509
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2352	NC_019682	CCA	2	6	153985	153990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715515
2353	NC_019682	AAATA	2	10	153994	154003	80 %	20 %	0 %	0 %	427715515
2354	NC_019682	TGG	2	6	154119	154124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715515
2355	NC_019682	ACTG	2	8	154221	154228	25 %	25 %	25 %	25 %	427715516
2356	NC_019682	TGC	2	6	154235	154240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715516
2357	NC_019682	CAGC	2	8	154355	154362	25 %	0 %	25 %	50 %	427715516
2358	NC_019682	CTG	2	6	154372	154377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715516
2359	NC_019682	AC	3	6	154436	154441	50 %	0 %	0 %	50 %	427715516
2360	NC_019682	TGG	2	6	154462	154467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715516
2361	NC_019682	AGTTG	2	10	154564	154573	20 %	40 %	40 %	0 %	427715516
2362	NC_019682	AGT	2	6	154607	154612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715516
2363	NC_019682	T	6	6	154682	154687	0 %	100 %	0 %	0 %	427715516
2364	NC_019682	GCCAAT	2	12	154709	154720	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427715516
2365	NC_019682	ATC	2	6	154748	154753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715516
2366	NC_019682	AGC	2	6	154760	154765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715516
2367	NC_019682	CCA	2	6	154800	154805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715516
2368	NC_019682	CAATCA	2	12	154873	154884	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	427715516
2369	NC_019682	A	6	6	154903	154908	100 %	0 %	0 %	0 %	427715516
2370	NC_019682	CGCCAT	2	12	154939	154950	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	427715516
2371	NC_019682	TTAA	2	8	154974	154981	50 %	50 %	0 %	0 %	427715516
2372	NC_019682	ACC	2	6	155004	155009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715516
2373	NC_019682	GCGATG	2	12	155019	155030	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427715516
2374	NC_019682	GTA	2	6	155089	155094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715516
2375	NC_019682	CTG	2	6	155125	155130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715516
2376	NC_019682	CATA	2	8	155180	155187	50 %	25 %	0 %	25 %	427715516
2377	NC_019682	TTC	2	6	155855	155860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715517
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2379	NC_019682	CTT	2	6	155887	155892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715517
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2381	NC_019682	TGA	2	6	157033	157038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715518
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2385	NC_019682	TTA	2	6	157511	157516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715519
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2391	NC_019682	GAA	2	6	158009	158014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715519
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2397	NC_019682	GCA	2	6	158303	158308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715519
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2441	NC_019682	CAGC	2	8	165711	165718	25 %	0 %	25 %	50 %	427715522
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2450	NC_019682	GTGG	2	8	166031	166038	0 %	25 %	75 %	0 %	427715522
2451	NC_019682	CAG	2	6	166040	166045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715522
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2470	NC_019682	AAGG	2	8	167014	167021	50 %	0 %	50 %	0 %	427715522
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2474	NC_019682	TTAA	2	8	167125	167132	50 %	50 %	0 %	0 %	427715522
2475	NC_019682	CAAT	2	8	167306	167313	50 %	25 %	0 %	25 %	427715523
2476	NC_019682	C	6	6	167391	167396	0 %	0 %	0 %	100 %	427715523
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2480	NC_019682	A	6	6	167563	167568	100 %	0 %	0 %	0 %	427715523
2481	NC_019682	TAA	2	6	167694	167699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715523
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2483	NC_019682	GTTTA	2	10	167834	167843	20 %	60 %	20 %	0 %	427715523
2484	NC_019682	CGG	2	6	167883	167888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715523
2485	NC_019682	ATT	2	6	167946	167951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715523
2486	NC_019682	GT	3	6	168143	168148	0 %	50 %	50 %	0 %	427715523
2487	NC_019682	AAAC	2	8	168168	168175	75 %	0 %	0 %	25 %	427715523
2488	NC_019682	GAA	2	6	168190	168195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715523
2489	NC_019682	AAG	2	6	168209	168214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715523
2490	NC_019682	A	6	6	168287	168292	100 %	0 %	0 %	0 %	427715524
2491	NC_019682	GAA	2	6	168347	168352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715524
2492	NC_019682	TCCT	2	8	168402	168409	0 %	50 %	0 %	50 %	427715524
2493	NC_019682	GAT	2	6	168461	168466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715524
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2496	NC_019682	ATC	2	6	168530	168535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715524
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2499	NC_019682	A	7	7	168740	168746	100 %	0 %	0 %	0 %	427715524
2500	NC_019682	CAA	2	6	168778	168783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715524

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