MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019682	CTG	2	6	99908	99913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715450
1502	NC_019682	TAA	2	6	99917	99922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715450
1503	NC_019682	CCT	2	6	100027	100032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715450
1504	NC_019682	ATCA	2	8	100053	100060	50 %	25 %	0 %	25 %	427715450
1505	NC_019682	AAC	2	6	100089	100094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715450
1506	NC_019682	CTT	3	9	100115	100123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715450
1507	NC_019682	CAG	2	6	100124	100129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715450
1508	NC_019682	GAG	2	6	100190	100195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715450
1509	NC_019682	ACT	2	6	100212	100217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715450
1510	NC_019682	GTT	2	6	100256	100261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715450
1511	NC_019682	CTT	2	6	100298	100303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715450
1512	NC_019682	TTC	2	6	100338	100343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715450
1513	NC_019682	CTT	2	6	100349	100354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715450
1514	NC_019682	CTT	2	6	100464	100469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715450
1515	NC_019682	CTC	2	6	100562	100567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715450
1516	NC_019682	CAGA	2	8	100568	100575	50 %	0 %	25 %	25 %	427715450
1517	NC_019682	T	7	7	100625	100631	0 %	100 %	0 %	0 %	427715450
1518	NC_019682	CAG	2	6	100655	100660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715450
1519	NC_019682	TTG	2	6	100701	100706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715450
1520	NC_019682	GTT	2	6	100733	100738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715450
1521	NC_019682	CAAT	2	8	100759	100766	50 %	25 %	0 %	25 %	427715450
1522	NC_019682	TAT	2	6	100820	100825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715450
1523	NC_019682	CT	4	8	100839	100846	0 %	50 %	0 %	50 %	427715450
1524	NC_019682	AGAAA	2	10	100887	100896	80 %	0 %	20 %	0 %	427715450
1525	NC_019682	TTC	2	6	100929	100934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715450
1526	NC_019682	AT	4	8	100953	100960	50 %	50 %	0 %	0 %	427715450
1527	NC_019682	CTTC	2	8	100966	100973	0 %	50 %	0 %	50 %	427715450
1528	NC_019682	CTC	2	6	101006	101011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715450
1529	NC_019682	ACAG	2	8	101023	101030	50 %	0 %	25 %	25 %	427715450
1530	NC_019682	AAT	2	6	101049	101054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715450
1531	NC_019682	CAG	2	6	101138	101143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715450
1532	NC_019682	TTG	2	6	101145	101150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715450
1533	NC_019682	TA	3	6	101175	101180	50 %	50 %	0 %	0 %	427715450
1534	NC_019682	T	6	6	101204	101209	0 %	100 %	0 %	0 %	427715450
1535	NC_019682	GTA	2	6	101248	101253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715450
1536	NC_019682	GAT	2	6	101288	101293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715450
1537	NC_019682	T	6	6	101339	101344	0 %	100 %	0 %	0 %	427715450
1538	NC_019682	TCT	2	6	101353	101358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715450
1539	NC_019682	GTA	2	6	101408	101413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715450
1540	NC_019682	CAA	2	6	101448	101453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715450
1541	NC_019682	AGT	2	6	101479	101484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715450
1542	NC_019682	AAAAT	2	10	101507	101516	80 %	20 %	0 %	0 %	427715450
1543	NC_019682	AC	3	6	102031	102036	50 %	0 %	0 %	50 %	427715451
1544	NC_019682	CAC	2	6	102394	102399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715452
1545	NC_019682	TAGG	2	8	102405	102412	25 %	25 %	50 %	0 %	427715452
1546	NC_019682	TCT	2	6	102559	102564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715453
1547	NC_019682	CTG	2	6	102594	102599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715453
1548	NC_019682	GGT	2	6	102754	102759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715453
1549	NC_019682	TTCACT	2	12	102799	102810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	427715453
1550	NC_019682	CGC	2	6	102948	102953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715453
1551	NC_019682	ACT	2	6	102955	102960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715453
1552	NC_019682	CGC	2	6	102982	102987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715453
1553	NC_019682	TCC	2	6	103012	103017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715453
1554	NC_019682	TAT	2	6	103082	103087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715453
1555	NC_019682	TGT	2	6	103105	103110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715453
1556	NC_019682	TCT	2	6	103225	103230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715453
1557	NC_019682	GC	3	6	103304	103309	0 %	0 %	50 %	50 %	427715454
1558	NC_019682	TAA	2	6	103340	103345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715454
1559	NC_019682	TGC	2	6	103440	103445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715454
1560	NC_019682	T	6	6	103489	103494	0 %	100 %	0 %	0 %	427715454
1561	NC_019682	CTTT	2	8	103630	103637	0 %	75 %	0 %	25 %	427715454
1562	NC_019682	A	7	7	103647	103653	100 %	0 %	0 %	0 %	427715454
1563	NC_019682	CTT	2	6	103675	103680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715454
1564	NC_019682	GTT	2	6	103859	103864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715454
1565	NC_019682	TAA	2	6	103954	103959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715455
1566	NC_019682	CAA	2	6	103962	103967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715455
1567	NC_019682	T	6	6	103993	103998	0 %	100 %	0 %	0 %	427715455
1568	NC_019682	GT	3	6	104002	104007	0 %	50 %	50 %	0 %	427715455
1569	NC_019682	CAG	2	6	104072	104077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715455
1570	NC_019682	ACC	2	6	104257	104262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715455
1571	NC_019682	AAG	2	6	104279	104284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715455
1572	NC_019682	GATT	2	8	104452	104459	25 %	50 %	25 %	0 %	427715455
1573	NC_019682	GTGG	2	8	104481	104488	0 %	25 %	75 %	0 %	427715455
1574	NC_019682	TAA	2	6	104538	104543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715455
1575	NC_019682	TTAACT	2	12	104759	104770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	427715456
1576	NC_019682	TCC	2	6	104850	104855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715456
1577	NC_019682	TCAAC	2	10	104860	104869	40 %	20 %	0 %	40 %	427715456
1578	NC_019682	ACC	2	6	105073	105078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715456
1579	NC_019682	AACT	2	8	105079	105086	50 %	25 %	0 %	25 %	427715456
1580	NC_019682	TAT	2	6	105121	105126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715456
1581	NC_019682	T	6	6	105128	105133	0 %	100 %	0 %	0 %	427715456
1582	NC_019682	TTG	3	9	105139	105147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715456
1583	NC_019682	AAATCA	2	12	105177	105188	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	427715456
1584	NC_019682	TA	3	6	105202	105207	50 %	50 %	0 %	0 %	427715456
1585	NC_019682	ACC	2	6	105283	105288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715456
1586	NC_019682	TGA	2	6	105399	105404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715456
1587	NC_019682	ATT	2	6	105410	105415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715456
1588	NC_019682	ATT	2	6	105479	105484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715456
1589	NC_019682	T	6	6	105589	105594	0 %	100 %	0 %	0 %	427715456
1590	NC_019682	TGA	2	6	105604	105609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715456
1591	NC_019682	ATA	2	6	105665	105670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715456
1592	NC_019682	AAAG	2	8	105671	105678	75 %	0 %	25 %	0 %	427715456
1593	NC_019682	TGA	2	6	105702	105707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715456
1594	NC_019682	CTC	2	6	105719	105724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715456
1595	NC_019682	TAA	2	6	105737	105742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715456
1596	NC_019682	T	6	6	105764	105769	0 %	100 %	0 %	0 %	427715456
1597	NC_019682	CATTC	2	10	105796	105805	20 %	40 %	0 %	40 %	427715456
1598	NC_019682	CCG	2	6	105853	105858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715456
1599	NC_019682	CCTTTG	2	12	106000	106011	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427715456
1600	NC_019682	GTA	2	6	106048	106053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715456
1601	NC_019682	A	6	6	106912	106917	100 %	0 %	0 %	0 %	427715457
1602	NC_019682	CCA	2	6	106940	106945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715457
1603	NC_019682	CAA	2	6	106956	106961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715457
1604	NC_019682	GAA	2	6	107004	107009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715457
1605	NC_019682	GCT	2	6	107124	107129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715457
1606	NC_019682	TG	3	6	107175	107180	0 %	50 %	50 %	0 %	427715457
1607	NC_019682	TCT	2	6	107235	107240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715457
1608	NC_019682	TGG	2	6	107267	107272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715457
1609	NC_019682	GAT	2	6	107327	107332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715457
1610	NC_019682	CAC	2	6	107342	107347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715457
1611	NC_019682	TGA	2	6	107369	107374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715457
1612	NC_019682	TCA	2	6	107386	107391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715457
1613	NC_019682	TTG	2	6	107458	107463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715457
1614	NC_019682	ACA	2	6	107485	107490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715457
1615	NC_019682	TGA	2	6	107491	107496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715457
1616	NC_019682	TTCT	2	8	107503	107510	0 %	75 %	0 %	25 %	427715457
1617	NC_019682	CAG	2	6	107518	107523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715457
1618	NC_019682	AAG	2	6	107526	107531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715457
1619	NC_019682	CCA	2	6	107536	107541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715457
1620	NC_019682	CAA	2	6	107588	107593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715457
1621	NC_019682	CTT	2	6	107614	107619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715457
1622	NC_019682	ACA	2	6	107650	107655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715457
1623	NC_019682	GGT	2	6	107703	107708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715457
1624	NC_019682	GCA	2	6	107724	107729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715457
1625	NC_019682	CAAC	2	8	107814	107821	50 %	0 %	0 %	50 %	427715457
1626	NC_019682	TGA	2	6	107855	107860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715457
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1628	NC_019682	TGAC	2	8	107944	107951	25 %	25 %	25 %	25 %	427715457
1629	NC_019682	TA	3	6	108007	108012	50 %	50 %	0 %	0 %	427715457
1630	NC_019682	CTG	2	6	108177	108182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715457
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1725	NC_019682	GTT	2	6	113226	113231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715464
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1733	NC_019682	GAT	2	6	113507	113512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715465
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1741	NC_019682	CCA	2	6	114081	114086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715465
1742	NC_019682	TGA	2	6	114214	114219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715466
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1867	NC_019682	CAA	2	6	122629	122634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715481
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1872	NC_019682	TCAA	2	8	122967	122974	50 %	25 %	0 %	25 %	427715481
1873	NC_019682	AG	3	6	123018	123023	50 %	0 %	50 %	0 %	427715481
1874	NC_019682	TCCAG	2	10	123041	123050	20 %	20 %	20 %	40 %	427715481
1875	NC_019682	GAA	2	6	123092	123097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715481
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1988	NC_019682	TTG	2	6	131384	131389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715491
1989	NC_019682	GATAT	2	10	131476	131485	40 %	40 %	20 %	0 %	427715491
1990	NC_019682	CAG	2	6	131516	131521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715491
1991	NC_019682	ATC	2	6	131588	131593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715491
1992	NC_019682	TGA	2	6	131597	131602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715491
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2000	NC_019682	ATA	2	6	131975	131980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715491

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