MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_019682	ACT	2	6	870189	870194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716139
13502	NC_019682	AGA	2	6	870209	870214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716139
13503	NC_019682	ATCG	2	8	870217	870224	25 %	25 %	25 %	25 %	427716139
13504	NC_019682	AGC	2	6	870282	870287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716139
13505	NC_019682	TGC	2	6	870363	870368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716139
13506	NC_019682	AGTTT	2	10	870753	870762	20 %	60 %	20 %	0 %	427716140
13507	NC_019682	GA	3	6	870793	870798	50 %	0 %	50 %	0 %	427716140
13508	NC_019682	CTT	2	6	870838	870843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716140
13509	NC_019682	ATC	2	6	870908	870913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716140
13510	NC_019682	TGC	2	6	871066	871071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716140
13511	NC_019682	GCT	2	6	871119	871124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716140
13512	NC_019682	AAT	2	6	871334	871339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716141
13513	NC_019682	AAAACT	2	12	871419	871430	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	427716141
13514	NC_019682	GTA	2	6	871459	871464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716141
13515	NC_019682	GCA	2	6	871470	871475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716141
13516	NC_019682	GCT	2	6	871483	871488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716141
13517	NC_019682	ATA	2	6	871498	871503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716141
13518	NC_019682	TGGC	2	8	871506	871513	0 %	25 %	50 %	25 %	427716141
13519	NC_019682	TGC	2	6	871542	871547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716141
13520	NC_019682	T	6	6	871561	871566	0 %	100 %	0 %	0 %	427716141
13521	NC_019682	TAAC	2	8	871615	871622	50 %	25 %	0 %	25 %	427716141
13522	NC_019682	TTAA	2	8	871635	871642	50 %	50 %	0 %	0 %	427716141
13523	NC_019682	TAGC	2	8	871743	871750	25 %	25 %	25 %	25 %	427716141
13524	NC_019682	CCT	2	6	871761	871766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716141
13525	NC_019682	CTA	2	6	871777	871782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716141
13526	NC_019682	TGA	2	6	871851	871856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716141
13527	NC_019682	TAA	2	6	871886	871891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716141
13528	NC_019682	TAT	2	6	871931	871936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716141
13529	NC_019682	ACT	2	6	871949	871954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716141
13530	NC_019682	AAT	2	6	872013	872018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716141
13531	NC_019682	TTC	2	6	872035	872040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716141
13532	NC_019682	GGT	2	6	872435	872440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716142
13533	NC_019682	GA	4	8	872449	872456	50 %	0 %	50 %	0 %	427716142
13534	NC_019682	ACA	3	9	872522	872530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716142
13535	NC_019682	GAA	2	6	872564	872569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716142
13536	NC_019682	CCA	2	6	872577	872582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716142
13537	NC_019682	TTC	2	6	872614	872619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716142
13538	NC_019682	GTA	2	6	872639	872644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716142
13539	NC_019682	TCT	2	6	872651	872656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716142
13540	NC_019682	TCG	2	6	872696	872701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716142
13541	NC_019682	GAT	2	6	872743	872748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716142
13542	NC_019682	TGGAC	2	10	872820	872829	20 %	20 %	40 %	20 %	427716142
13543	NC_019682	A	7	7	872839	872845	100 %	0 %	0 %	0 %	427716142
13544	NC_019682	A	6	6	873371	873376	100 %	0 %	0 %	0 %	427716143
13545	NC_019682	GAC	2	6	873424	873429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716143
13546	NC_019682	GAA	2	6	873435	873440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716143
13547	NC_019682	AAG	2	6	873445	873450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716143
13548	NC_019682	CAA	2	6	873455	873460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427716143
13549	NC_019682	ACC	2	6	873463	873468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716143
13550	NC_019682	GAA	2	6	873476	873481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716143
13551	NC_019682	AGC	2	6	873490	873495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716143
13552	NC_019682	GCGG	2	8	874071	874078	0 %	0 %	75 %	25 %	427716144
13553	NC_019682	AAG	2	6	874080	874085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716144
13554	NC_019682	TTC	2	6	874086	874091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716144
13555	NC_019682	CCA	2	6	874114	874119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716144
13556	NC_019682	CTA	2	6	874136	874141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716144
13557	NC_019682	GTT	2	6	874193	874198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716144
13558	NC_019682	TCC	2	6	874204	874209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427716144
13559	NC_019682	GAG	2	6	874224	874229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716144
13560	NC_019682	CTG	2	6	874235	874240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716144
13561	NC_019682	TAC	2	6	874254	874259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716144
13562	NC_019682	CGA	2	6	874265	874270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716144
13563	NC_019682	CGGAA	2	10	874285	874294	40 %	0 %	40 %	20 %	427716144
13564	NC_019682	AAT	2	6	874310	874315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716144
13565	NC_019682	TCT	2	6	874342	874347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716144
13566	NC_019682	CTT	2	6	874388	874393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716144
13567	NC_019682	CTT	2	6	874454	874459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716144
13568	NC_019682	TCT	2	6	874462	874467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716144
13569	NC_019682	TGT	2	6	874478	874483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716144
13570	NC_019682	ATG	2	6	874594	874599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716144
13571	NC_019682	ATCT	2	8	874616	874623	25 %	50 %	0 %	25 %	427716144
13572	NC_019682	TTC	2	6	874644	874649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716144
13573	NC_019682	TGA	2	6	874650	874655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716144
13574	NC_019682	CTT	2	6	874667	874672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716144
13575	NC_019682	AGC	2	6	874707	874712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716144
13576	NC_019682	GTT	2	6	874822	874827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716144
13577	NC_019682	CAC	2	6	874838	874843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716144
13578	NC_019682	T	7	7	874996	875002	0 %	100 %	0 %	0 %	427716144
13579	NC_019682	TTG	2	6	875052	875057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427716144
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13582	NC_019682	ACCAA	2	10	875603	875612	60 %	0 %	0 %	40 %	427716145
13583	NC_019682	AAT	2	6	875674	875679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716145
13584	NC_019682	CAG	2	6	875704	875709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716145
13585	NC_019682	AG	3	6	875708	875713	50 %	0 %	50 %	0 %	427716145
13586	NC_019682	AGT	2	6	875760	875765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716145
13587	NC_019682	TGTT	2	8	875769	875776	0 %	75 %	25 %	0 %	427716145
13588	NC_019682	CTG	2	6	875938	875943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716146
13589	NC_019682	TAC	2	6	875966	875971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716146
13590	NC_019682	CCA	2	6	876021	876026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716146
13591	NC_019682	TGG	2	6	876049	876054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716146
13592	NC_019682	CTA	2	6	876121	876126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427716146
13593	NC_019682	CAG	2	6	876167	876172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427716146
13594	NC_019682	GCT	2	6	876243	876248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716146
13595	NC_019682	GTA	2	6	876356	876361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716146
13596	NC_019682	CTG	2	6	876400	876405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716146
13597	NC_019682	CAC	2	6	876425	876430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427716146
13598	NC_019682	TGG	2	6	876531	876536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716146
13599	NC_019682	TGAG	2	8	876580	876587	25 %	25 %	50 %	0 %	427716146
13600	NC_019682	GCC	2	6	876868	876873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427716147
13601	NC_019682	GCT	2	6	876969	876974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716147
13602	NC_019682	CGT	2	6	877005	877010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716147
13603	NC_019682	TGC	2	6	877021	877026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716147
13604	NC_019682	GAG	2	6	877134	877139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427716147
13605	NC_019682	CAAT	2	8	877185	877192	50 %	25 %	0 %	25 %	427716147
13606	NC_019682	TGTA	2	8	877230	877237	25 %	50 %	25 %	0 %	427716147
13607	NC_019682	TG	3	6	877298	877303	0 %	50 %	50 %	0 %	427716147
13608	NC_019682	TTA	2	6	877322	877327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716147
13609	NC_019682	TTA	2	6	877413	877418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427716147
13610	NC_019682	TTGCT	2	10	877423	877432	0 %	60 %	20 %	20 %	427716147
13611	NC_019682	ATA	2	6	877480	877485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427716147
13612	NC_019682	GTG	2	6	877503	877508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427716147
13613	NC_019682	GTAT	2	8	877534	877541	25 %	50 %	25 %	0 %	427716147
13614	NC_019682	TTTA	2	8	877654	877661	25 %	75 %	0 %	0 %	427716147
13615	NC_019682	GAA	2	6	877666	877671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427716147
13616	NC_019682	TA	3	6	877849	877854	50 %	50 %	0 %	0 %	427716147
13617	NC_019682	AGT	2	6	877887	877892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716147
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13978	NC_019682	T	6	6	901591	901596	0 %	100 %	0 %	0 %	427716169
13979	NC_019682	TGA	2	6	901608	901613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427716169
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13981	NC_019682	TTGT	2	8	901781	901788	0 %	75 %	25 %	0 %	427716169
13982	NC_019682	CTG	2	6	901839	901844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427716169
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13990	NC_019682	CTT	2	6	902296	902301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427716169
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