MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019682	ATC	2	6	30951	30956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715377
502	NC_019682	TCT	2	6	31340	31345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715378
503	NC_019682	CTT	2	6	31473	31478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715378
504	NC_019682	AAG	2	6	31493	31498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715378
505	NC_019682	CTAATG	2	12	31529	31540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427715378
506	NC_019682	GCG	2	6	31573	31578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715378
507	NC_019682	AGC	2	6	31604	31609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715378
508	NC_019682	TTG	2	6	31626	31631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715378
509	NC_019682	CCA	2	6	31682	31687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715378
510	NC_019682	TTGGT	2	10	31697	31706	0 %	60 %	40 %	0 %	427715378
511	NC_019682	AGGTA	2	10	31774	31783	40 %	20 %	40 %	0 %	427715378
512	NC_019682	AGGTA	2	10	31796	31805	40 %	20 %	40 %	0 %	427715378
513	NC_019682	GGGA	2	8	31907	31914	25 %	0 %	75 %	0 %	427715378
514	NC_019682	TAAA	2	8	31942	31949	75 %	25 %	0 %	0 %	427715378
515	NC_019682	A	6	6	31947	31952	100 %	0 %	0 %	0 %	427715378
516	NC_019682	C	6	6	31955	31960	0 %	0 %	0 %	100 %	427715378
517	NC_019682	GTA	2	6	31991	31996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715378
518	NC_019682	GCA	2	6	32042	32047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715378
519	NC_019682	AGCC	2	8	32108	32115	25 %	0 %	25 %	50 %	427715378
520	NC_019682	TAA	2	6	32149	32154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715378
521	NC_019682	TAAAT	2	10	32308	32317	60 %	40 %	0 %	0 %	427715379
522	NC_019682	GCT	2	6	32339	32344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
523	NC_019682	TTA	2	6	32365	32370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715379
524	NC_019682	ATA	2	6	32416	32421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715379
525	NC_019682	GCTG	2	8	32484	32491	0 %	25 %	50 %	25 %	427715379
526	NC_019682	GCT	2	6	32535	32540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
527	NC_019682	ATC	2	6	32582	32587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715379
528	NC_019682	GAT	2	6	32605	32610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715379
529	NC_019682	ATG	2	6	32646	32651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715379
530	NC_019682	CTG	2	6	32687	32692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
531	NC_019682	GCT	2	6	32754	32759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
532	NC_019682	T	6	6	32842	32847	0 %	100 %	0 %	0 %	427715379
533	NC_019682	GCT	2	6	32928	32933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
534	NC_019682	TGTGCT	2	12	32979	32990	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427715379
535	NC_019682	AAT	2	6	33002	33007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715379
536	NC_019682	AAT	2	6	33077	33082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715379
537	NC_019682	GCT	3	9	33111	33119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
538	NC_019682	TGC	2	6	33332	33337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715379
539	NC_019682	TAAAA	2	10	33362	33371	80 %	20 %	0 %	0 %	427715379
540	NC_019682	TTGC	2	8	33397	33404	0 %	50 %	25 %	25 %	427715379
541	NC_019682	TTGAAT	2	12	33410	33421	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	427715379
542	NC_019682	TGT	2	6	33429	33434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715379
543	NC_019682	ATT	2	6	34084	34089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715380
544	NC_019682	AAC	3	9	34128	34136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715380
545	NC_019682	CTG	2	6	34209	34214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715380
546	NC_019682	TGA	2	6	34308	34313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715380
547	NC_019682	ATC	2	6	34314	34319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715380
548	NC_019682	GCC	2	6	34329	34334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715380
549	NC_019682	GTT	2	6	34336	34341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715380
550	NC_019682	GCT	2	6	34430	34435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715380
551	NC_019682	CTTA	2	8	34467	34474	25 %	50 %	0 %	25 %	427715380
552	NC_019682	ATTG	2	8	34483	34490	25 %	50 %	25 %	0 %	427715380
553	NC_019682	ACT	2	6	34655	34660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715380
554	NC_019682	ACG	2	6	34677	34682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715380
555	NC_019682	AGC	2	6	34688	34693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715380
556	NC_019682	AAG	2	6	34722	34727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715380
557	NC_019682	AAC	2	6	34852	34857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715380
558	NC_019682	CAAA	2	8	34858	34865	75 %	0 %	0 %	25 %	427715380
559	NC_019682	ATT	2	6	34880	34885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715380
560	NC_019682	CT	3	6	34907	34912	0 %	50 %	0 %	50 %	427715380
561	NC_019682	GAT	2	6	34946	34951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715380
562	NC_019682	CAA	2	6	35000	35005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715380
563	NC_019682	AGA	2	6	35020	35025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715380
564	NC_019682	GCT	2	6	35027	35032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715380
565	NC_019682	CCG	2	6	35035	35040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715380
566	NC_019682	GTT	2	6	35168	35173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715380
567	NC_019682	CTTT	2	8	35265	35272	0 %	75 %	0 %	25 %	427715380
568	NC_019682	AGC	2	6	35311	35316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715380
569	NC_019682	AAT	2	6	35324	35329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715380
570	NC_019682	TCA	2	6	35348	35353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715380
571	NC_019682	A	6	6	35371	35376	100 %	0 %	0 %	0 %	427715380
572	NC_019682	AT	3	6	35397	35402	50 %	50 %	0 %	0 %	427715380
573	NC_019682	TAG	2	6	35440	35445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715380
574	NC_019682	CCT	2	6	35707	35712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715381
575	NC_019682	GGC	2	6	36159	36164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715382
576	NC_019682	AGT	2	6	36167	36172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715382
577	NC_019682	G	6	6	36186	36191	0 %	0 %	100 %	0 %	427715382
578	NC_019682	GCT	2	6	36272	36277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715382
579	NC_019682	TG	3	6	36278	36283	0 %	50 %	50 %	0 %	427715382
580	NC_019682	ACA	2	6	36317	36322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715382
581	NC_019682	CTG	2	6	36353	36358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715382
582	NC_019682	GTA	2	6	36383	36388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715382
583	NC_019682	A	6	6	36409	36414	100 %	0 %	0 %	0 %	427715382
584	NC_019682	GGC	2	6	36415	36420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715382
585	NC_019682	TTG	2	6	36452	36457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715382
586	NC_019682	ATT	2	6	36509	36514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715382
587	NC_019682	GT	3	6	36546	36551	0 %	50 %	50 %	0 %	427715382
588	NC_019682	T	6	6	36569	36574	0 %	100 %	0 %	0 %	427715382
589	NC_019682	TTG	2	6	36662	36667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715382
590	NC_019682	A	6	6	36734	36739	100 %	0 %	0 %	0 %	427715382
591	NC_019682	GTG	2	6	36798	36803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715382
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593	NC_019682	TGG	2	6	36857	36862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715382
594	NC_019682	CCT	2	6	36875	36880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715382
595	NC_019682	TGC	2	6	36933	36938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715382
596	NC_019682	TTG	2	6	36951	36956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715382
597	NC_019682	TAA	2	6	37009	37014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715382
598	NC_019682	GAT	2	6	37048	37053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715382
599	NC_019682	ATT	2	6	37067	37072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715382
600	NC_019682	CT	3	6	37113	37118	0 %	50 %	0 %	50 %	427715382
601	NC_019682	GCG	2	6	37252	37257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715382
602	NC_019682	GGTA	2	8	37315	37322	25 %	25 %	50 %	0 %	427715382
603	NC_019682	TGG	2	6	37379	37384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715382
604	NC_019682	AATT	2	8	37444	37451	50 %	50 %	0 %	0 %	427715382
605	NC_019682	CCAA	2	8	37455	37462	50 %	0 %	0 %	50 %	427715382
606	NC_019682	CTG	2	6	37467	37472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715382
607	NC_019682	TAG	2	6	37583	37588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715383
608	NC_019682	TCG	2	6	37627	37632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715383
609	NC_019682	TAA	2	6	37662	37667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715383
610	NC_019682	ATC	2	6	37698	37703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715383
611	NC_019682	AGT	3	9	37752	37760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715383
612	NC_019682	TAA	2	6	38108	38113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715384
613	NC_019682	CGT	2	6	38150	38155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715384
614	NC_019682	TCT	2	6	38162	38167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715384
615	NC_019682	GTA	2	6	38307	38312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715384
616	NC_019682	GCG	2	6	38326	38331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715384
617	NC_019682	TTAA	2	8	38384	38391	50 %	50 %	0 %	0 %	427715384
618	NC_019682	ACTTC	2	10	38457	38466	20 %	40 %	0 %	40 %	427715384
619	NC_019682	TAA	2	6	38541	38546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715384
620	NC_019682	GTCT	2	8	39171	39178	0 %	50 %	25 %	25 %	427715385
621	NC_019682	ATG	2	6	39225	39230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715385
622	NC_019682	ATC	2	6	39261	39266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715385
623	NC_019682	CCG	2	6	39322	39327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715385
624	NC_019682	CAA	2	6	39335	39340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715385
625	NC_019682	TTA	2	6	39353	39358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715385
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1000	NC_019682	AGT	2	6	63531	63536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715413

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