MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_019682	CA	3	6	330616	330621	50 %	0 %	0 %	50 %	427715663
5003	NC_019682	ATT	2	6	330654	330659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715663
5004	NC_019682	CGT	2	6	330660	330665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715663
5005	NC_019682	TA	3	6	330817	330822	50 %	50 %	0 %	0 %	427715663
5006	NC_019682	CAA	2	6	330924	330929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715663
5007	NC_019682	TGC	2	6	330967	330972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715663
5008	NC_019682	AAG	2	6	330973	330978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715663
5009	NC_019682	CAG	4	12	331000	331011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715663
5010	NC_019682	CCA	3	9	331029	331037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715663
5011	NC_019682	CCA	2	6	331041	331046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715663
5012	NC_019682	CCA	2	6	331050	331055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715663
5013	NC_019682	CCA	4	12	331059	331070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715663
5014	NC_019682	AAT	2	6	331080	331085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715663
5015	NC_019682	TTTG	2	8	331109	331116	0 %	75 %	25 %	0 %	427715663
5016	NC_019682	TTTTG	2	10	331129	331138	0 %	80 %	20 %	0 %	427715663
5017	NC_019682	CAC	2	6	331168	331173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715663
5018	NC_019682	TCGGT	2	10	331290	331299	0 %	40 %	40 %	20 %	427715663
5019	NC_019682	GGAGGT	2	12	331344	331355	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	427715663
5020	NC_019682	ACA	2	6	331357	331362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715663
5021	NC_019682	GGAAA	2	10	331392	331401	60 %	0 %	40 %	0 %	427715663
5022	NC_019682	TTA	2	6	331421	331426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715663
5023	NC_019682	GAT	2	6	331803	331808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715663
5024	NC_019682	GGAAA	2	10	332022	332031	60 %	0 %	40 %	0 %	427715663
5025	NC_019682	ACG	2	6	332167	332172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715663
5026	NC_019682	CTT	3	9	332641	332649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715664
5027	NC_019682	TGG	2	6	332739	332744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715664
5028	NC_019682	TCA	2	6	332831	332836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715664
5029	NC_019682	ATTTA	2	10	332864	332873	40 %	60 %	0 %	0 %	427715664
5030	NC_019682	TGA	2	6	332907	332912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715665
5031	NC_019682	GCT	3	9	332919	332927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715665
5032	NC_019682	CT	3	6	333021	333026	0 %	50 %	0 %	50 %	427715665
5033	NC_019682	CAA	3	9	333692	333700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715666
5034	NC_019682	A	7	7	333699	333705	100 %	0 %	0 %	0 %	427715666
5035	NC_019682	TCAGT	2	10	333706	333715	20 %	40 %	20 %	20 %	427715666
5036	NC_019682	GAAA	2	8	333731	333738	75 %	0 %	25 %	0 %	427715666
5037	NC_019682	TTA	2	6	333764	333769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715666
5038	NC_019682	ATG	2	6	333822	333827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715666
5039	NC_019682	TAC	2	6	333834	333839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715666
5040	NC_019682	TTA	2	6	333874	333879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715666
5041	NC_019682	TGTTT	2	10	333937	333946	0 %	80 %	20 %	0 %	427715666
5042	NC_019682	GAA	2	6	333950	333955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715666
5043	NC_019682	TTA	2	6	333986	333991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715666
5044	NC_019682	AGG	2	6	333997	334002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715666
5045	NC_019682	TTA	2	6	334009	334014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715666
5046	NC_019682	AAGA	2	8	334034	334041	75 %	0 %	25 %	0 %	427715666
5047	NC_019682	CCTA	2	8	334073	334080	25 %	25 %	0 %	50 %	427715666
5048	NC_019682	ATC	2	6	334158	334163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715666
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5051	NC_019682	A	6	6	334371	334376	100 %	0 %	0 %	0 %	427715666
5052	NC_019682	ATC	2	6	334469	334474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715666
5053	NC_019682	TTG	2	6	334650	334655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715667
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5055	NC_019682	ATTT	2	8	334866	334873	25 %	75 %	0 %	0 %	427715667
5056	NC_019682	ATT	2	6	334895	334900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715667
5057	NC_019682	T	7	7	334899	334905	0 %	100 %	0 %	0 %	427715667
5058	NC_019682	TGT	2	6	334923	334928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715667
5059	NC_019682	TGA	3	9	334974	334982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715667
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5061	NC_019682	CAA	2	6	335079	335084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715667
5062	NC_019682	TGA	2	6	335109	335114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715667
5063	NC_019682	TGG	2	6	335116	335121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715667
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5065	NC_019682	GTA	2	6	335225	335230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715667
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5068	NC_019682	TAC	2	6	335326	335331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715667
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5103	NC_019682	AAG	2	6	337841	337846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715669
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5107	NC_019682	CCAA	2	8	338036	338043	50 %	0 %	0 %	50 %	427715669
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5155	NC_019682	T	7	7	341569	341575	0 %	100 %	0 %	0 %	427715673
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5241	NC_019682	TTTC	2	8	345118	345125	0 %	75 %	0 %	25 %	427715674
5242	NC_019682	GGAA	2	8	345127	345134	50 %	0 %	50 %	0 %	427715674
5243	NC_019682	TAATT	2	10	345173	345182	40 %	60 %	0 %	0 %	427715674
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5488	NC_019682	AGA	2	6	359066	359071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715689
5489	NC_019682	TC	3	6	359075	359080	0 %	50 %	0 %	50 %	427715689
5490	NC_019682	TGGAAC	2	12	359086	359097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427715689
5491	NC_019682	GT	3	6	359129	359134	0 %	50 %	50 %	0 %	427715689
5492	NC_019682	TGTCG	2	10	359190	359199	0 %	40 %	40 %	20 %	427715689
5493	NC_019682	AGA	2	6	359237	359242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715689
5494	NC_019682	CTG	2	6	359264	359269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715689
5495	NC_019682	ATC	2	6	359313	359318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715689
5496	NC_019682	CAA	2	6	359324	359329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715689
5497	NC_019682	AGCC	2	8	359506	359513	25 %	0 %	25 %	50 %	427715690
5498	NC_019682	ATT	2	6	359536	359541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715690
5499	NC_019682	AAT	2	6	359545	359550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715690
5500	NC_019682	TAC	2	6	359625	359630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715690

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