MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 109341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019682	TGA	2	6	295965	295970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715631
4502	NC_019682	GAA	2	6	296174	296179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715632
4503	NC_019682	CCCT	2	8	296280	296287	0 %	25 %	0 %	75 %	427715632
4504	NC_019682	AAT	2	6	296659	296664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715633
4505	NC_019682	GATT	2	8	296688	296695	25 %	50 %	25 %	0 %	427715633
4506	NC_019682	TAT	2	6	296708	296713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715633
4507	NC_019682	ATT	2	6	296722	296727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715633
4508	NC_019682	TTC	2	6	296735	296740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715633
4509	NC_019682	TGG	2	6	296841	296846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715633
4510	NC_019682	ATG	3	9	296924	296932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715633
4511	NC_019682	T	6	6	297030	297035	0 %	100 %	0 %	0 %	427715633
4512	NC_019682	ACA	2	6	297240	297245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715633
4513	NC_019682	ATG	2	6	297246	297251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715633
4514	NC_019682	AAG	2	6	297523	297528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715634
4515	NC_019682	CAA	2	6	297738	297743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715634
4516	NC_019682	CTA	2	6	297771	297776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715634
4517	NC_019682	ACTC	2	8	297836	297843	25 %	25 %	0 %	50 %	427715635
4518	NC_019682	CAT	2	6	297924	297929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715635
4519	NC_019682	GTTG	2	8	297938	297945	0 %	50 %	50 %	0 %	427715635
4520	NC_019682	GTAA	2	8	297951	297958	50 %	25 %	25 %	0 %	427715635
4521	NC_019682	CCATC	2	10	297991	298000	20 %	20 %	0 %	60 %	427715635
4522	NC_019682	CCA	2	6	298115	298120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715635
4523	NC_019682	CCA	2	6	298181	298186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715635
4524	NC_019682	GAC	2	6	298234	298239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715635
4525	NC_019682	TTC	2	6	298363	298368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715635
4526	NC_019682	AGA	2	6	298760	298765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715636
4527	NC_019682	ACC	2	6	298780	298785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715636
4528	NC_019682	TGC	2	6	298818	298823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715636
4529	NC_019682	TG	3	6	298986	298991	0 %	50 %	50 %	0 %	427715636
4530	NC_019682	TATC	2	8	299044	299051	25 %	50 %	0 %	25 %	427715636
4531	NC_019682	CAA	2	6	299067	299072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715636
4532	NC_019682	ACA	2	6	299096	299101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715636
4533	NC_019682	CAAA	2	8	299126	299133	75 %	0 %	0 %	25 %	427715636
4534	NC_019682	CGT	2	6	299137	299142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715636
4535	NC_019682	GTT	2	6	299163	299168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715636
4536	NC_019682	GT	3	6	299198	299203	0 %	50 %	50 %	0 %	427715636
4537	NC_019682	TTA	2	6	299293	299298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715636
4538	NC_019682	A	7	7	299472	299478	100 %	0 %	0 %	0 %	427715637
4539	NC_019682	TTGA	2	8	299583	299590	25 %	50 %	25 %	0 %	427715637
4540	NC_019682	TGG	2	6	299719	299724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715637
4541	NC_019682	TAA	2	6	299752	299757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715637
4542	NC_019682	A	6	6	299863	299868	100 %	0 %	0 %	0 %	427715637
4543	NC_019682	ACGGTG	2	12	299871	299882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427715637
4544	NC_019682	GCTG	2	8	299903	299910	0 %	25 %	50 %	25 %	427715637
4545	NC_019682	CAA	2	6	300027	300032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715637
4546	NC_019682	CAGT	2	8	300038	300045	25 %	25 %	25 %	25 %	427715637
4547	NC_019682	TAG	2	6	300154	300159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715637
4548	NC_019682	TGA	2	6	300214	300219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715637
4549	NC_019682	G	6	6	300227	300232	0 %	0 %	100 %	0 %	427715637
4550	NC_019682	GCC	2	6	300265	300270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715637
4551	NC_019682	GA	3	6	300271	300276	50 %	0 %	50 %	0 %	427715637
4552	NC_019682	GTC	2	6	300311	300316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715637
4553	NC_019682	GCA	2	6	300384	300389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715637
4554	NC_019682	TA	3	6	300415	300420	50 %	50 %	0 %	0 %	427715637
4555	NC_019682	CCATAG	2	12	300464	300475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427715637
4556	NC_019682	CAT	2	6	300798	300803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715638
4557	NC_019682	AGTT	2	8	300875	300882	25 %	50 %	25 %	0 %	427715638
4558	NC_019682	GTCCT	2	10	300958	300967	0 %	40 %	20 %	40 %	427715638
4559	NC_019682	ATT	2	6	301012	301017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715638
4560	NC_019682	GT	3	6	301103	301108	0 %	50 %	50 %	0 %	427715638
4561	NC_019682	CAT	2	6	301184	301189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715638
4562	NC_019682	TA	4	8	301190	301197	50 %	50 %	0 %	0 %	427715638
4563	NC_019682	GAT	2	6	301198	301203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715638
4564	NC_019682	GCG	2	6	301324	301329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715638
4565	NC_019682	A	6	6	301345	301350	100 %	0 %	0 %	0 %	427715638
4566	NC_019682	TCCA	2	8	301367	301374	25 %	25 %	0 %	50 %	427715638
4567	NC_019682	CTGCGA	2	12	301431	301442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427715638
4568	NC_019682	ACA	2	6	301453	301458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715638
4569	NC_019682	AGA	2	6	301470	301475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715638
4570	NC_019682	TTC	2	6	301545	301550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715638
4571	NC_019682	TA	3	6	301568	301573	50 %	50 %	0 %	0 %	427715638
4572	NC_019682	TG	3	6	301597	301602	0 %	50 %	50 %	0 %	427715638
4573	NC_019682	TCA	2	6	301709	301714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715638
4574	NC_019682	GAA	2	6	301741	301746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715638
4575	NC_019682	CGC	3	9	301750	301758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715638
4576	NC_019682	GAA	2	6	301786	301791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715638
4577	NC_019682	ATT	2	6	301817	301822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715638
4578	NC_019682	CTG	2	6	301859	301864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715638
4579	NC_019682	TCA	2	6	301917	301922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715638
4580	NC_019682	GGC	2	6	301930	301935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715638
4581	NC_019682	CCG	2	6	301998	302003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715638
4582	NC_019682	AGA	2	6	302028	302033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715638
4583	NC_019682	CCG	2	6	302096	302101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715638
4584	NC_019682	ATG	2	6	302315	302320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715638
4585	NC_019682	GCC	2	6	302397	302402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715638
4586	NC_019682	TAATT	2	10	302489	302498	40 %	60 %	0 %	0 %	427715639
4587	NC_019682	GCTA	2	8	302528	302535	25 %	25 %	25 %	25 %	427715639
4588	NC_019682	CCA	2	6	302547	302552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715639
4589	NC_019682	CGA	2	6	302560	302565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715639
4590	NC_019682	TTTG	2	8	302602	302609	0 %	75 %	25 %	0 %	427715639
4591	NC_019682	C	6	6	302739	302744	0 %	0 %	0 %	100 %	427715639
4592	NC_019682	TGG	2	6	302819	302824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715639
4593	NC_019682	AAT	2	6	302954	302959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715639
4594	NC_019682	TCT	2	6	302979	302984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715639
4595	NC_019682	ATT	2	6	303032	303037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715639
4596	NC_019682	TGCT	2	8	303040	303047	0 %	50 %	25 %	25 %	427715639
4597	NC_019682	GCA	2	6	303067	303072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715639
4598	NC_019682	GCCCA	2	10	303078	303087	20 %	0 %	20 %	60 %	427715639
4599	NC_019682	TGA	2	6	303262	303267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715639
4600	NC_019682	GCT	2	6	303378	303383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715639
4601	NC_019682	CAT	2	6	303395	303400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715639
4602	NC_019682	TTC	2	6	303569	303574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715639
4603	NC_019682	A	6	6	303686	303691	100 %	0 %	0 %	0 %	427715639
4604	NC_019682	TTG	2	6	303848	303853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715639
4605	NC_019682	TTA	2	6	303873	303878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715639
4606	NC_019682	TTC	2	6	303989	303994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715639
4607	NC_019682	TGCT	2	8	303995	304002	0 %	50 %	25 %	25 %	427715639
4608	NC_019682	T	7	7	304002	304008	0 %	100 %	0 %	0 %	427715639
4609	NC_019682	GC	3	6	304058	304063	0 %	0 %	50 %	50 %	427715639
4610	NC_019682	AAG	2	6	304087	304092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715639
4611	NC_019682	TTAA	2	8	304110	304117	50 %	50 %	0 %	0 %	427715639
4612	NC_019682	TCA	2	6	304149	304154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715639
4613	NC_019682	GTT	2	6	304207	304212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715639
4614	NC_019682	GCA	2	6	304245	304250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715639
4615	NC_019682	TGT	2	6	304433	304438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715639
4616	NC_019682	AAT	2	6	304453	304458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715639
4617	NC_019682	ACAGCT	2	12	304485	304496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427715639
4618	NC_019682	AGC	2	6	304535	304540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715639
4619	NC_019682	GCTT	2	8	304545	304552	0 %	50 %	25 %	25 %	427715639
4620	NC_019682	T	6	6	304551	304556	0 %	100 %	0 %	0 %	427715639
4621	NC_019682	TAA	2	6	304604	304609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715639
4622	NC_019682	TTC	3	9	304661	304669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715639
4623	NC_019682	AGA	2	6	304701	304706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715639
4624	NC_019682	ATC	2	6	304739	304744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715639
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4626	NC_019682	AAT	2	6	304818	304823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715640
4627	NC_019682	AGA	2	6	304927	304932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715640
4628	NC_019682	AT	3	6	304955	304960	50 %	50 %	0 %	0 %	427715640
4629	NC_019682	AAT	2	6	305035	305040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715640
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4639	NC_019682	TTC	2	6	305627	305632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715641
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4643	NC_019682	TCAA	2	8	305826	305833	50 %	25 %	0 %	25 %	427715641
4644	NC_019682	TGC	2	6	305917	305922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715641
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4648	NC_019682	TTTC	2	8	306052	306059	0 %	75 %	0 %	25 %	427715641
4649	NC_019682	TCCC	2	8	306133	306140	0 %	25 %	0 %	75 %	427715641
4650	NC_019682	CGAA	2	8	306164	306171	50 %	0 %	25 %	25 %	427715641
4651	NC_019682	A	6	6	306283	306288	100 %	0 %	0 %	0 %	427715641
4652	NC_019682	TGTAGA	2	12	306297	306308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715641
4653	NC_019682	TGT	2	6	306327	306332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715641
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4655	NC_019682	T	7	7	306456	306462	0 %	100 %	0 %	0 %	427715641
4656	NC_019682	AT	3	6	306469	306474	50 %	50 %	0 %	0 %	427715641
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4660	NC_019682	TAAT	2	8	306810	306817	50 %	50 %	0 %	0 %	427715641
4661	NC_019682	GGA	2	6	306867	306872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715641
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4723	NC_019682	TTG	2	6	311647	311652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715647
4724	NC_019682	AATT	2	8	311751	311758	50 %	50 %	0 %	0 %	427715647
4725	NC_019682	GCT	2	6	311804	311809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715647
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4728	NC_019682	GA	3	6	311996	312001	50 %	0 %	50 %	0 %	427715647
4729	NC_019682	ACCAA	2	10	312040	312049	60 %	0 %	0 %	40 %	427715647
4730	NC_019682	TGA	2	6	312072	312077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715647
4731	NC_019682	ATCA	2	8	312175	312182	50 %	25 %	0 %	25 %	427715647
4732	NC_019682	GCC	2	6	312245	312250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715647
4733	NC_019682	TGCAT	2	10	312264	312273	20 %	40 %	20 %	20 %	427715647
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4735	NC_019682	TAA	2	6	312478	312483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715647
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4738	NC_019682	CTT	2	6	312741	312746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715647
4739	NC_019682	CGG	2	6	312768	312773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715647
4740	NC_019682	CCT	2	6	312783	312788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715647
4741	NC_019682	ATAA	2	8	312845	312852	75 %	25 %	0 %	0 %	427715647
4742	NC_019682	CAG	2	6	312973	312978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715647
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4989	NC_019682	ATA	2	6	329735	329740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715662
4990	NC_019682	CTG	2	6	330155	330160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715663
4991	NC_019682	CA	3	6	330200	330205	50 %	0 %	0 %	50 %	427715663
4992	NC_019682	TAG	2	6	330232	330237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715663
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