MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanobium gracile PCC 6307 chromosome

Total Repeats: 86268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019675	CTG	2	6	19305	19310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701360
502	NC_019675	CCG	2	6	19332	19337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701360
503	NC_019675	CTC	2	6	19342	19347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701360
504	NC_019675	TCGGCC	2	12	19470	19481	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	427701360
505	NC_019675	GCG	2	6	19486	19491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701360
506	NC_019675	GCG	2	6	19497	19502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701360
507	NC_019675	GCC	2	6	19535	19540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701360
508	NC_019675	GGC	2	6	19564	19569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701360
509	NC_019675	CCG	2	6	19629	19634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701360
510	NC_019675	CCGG	2	8	19657	19664	0 %	0 %	50 %	50 %	427701360
511	NC_019675	TGG	2	6	19674	19679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701360
512	NC_019675	CGC	2	6	19700	19705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701360
513	NC_019675	GAG	2	6	19754	19759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701360
514	NC_019675	GCA	2	6	19761	19766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701360
515	NC_019675	CCG	3	9	19786	19794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701360
516	NC_019675	CAC	2	6	19918	19923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701361
517	NC_019675	CCG	2	6	20021	20026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701361
518	NC_019675	CTT	2	6	20039	20044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427701361
519	NC_019675	TGG	3	9	20047	20055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701361
520	NC_019675	CGG	2	6	20086	20091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701361
521	NC_019675	TGA	2	6	20098	20103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701361
522	NC_019675	CTG	2	6	20202	20207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
523	NC_019675	TGG	2	6	20239	20244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701361
524	NC_019675	GCC	2	6	20286	20291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701361
525	NC_019675	GCT	2	6	20309	20314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
526	NC_019675	GCGGGT	2	12	20318	20329	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	427701361
527	NC_019675	ACT	2	6	20335	20340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427701361
528	NC_019675	ACC	2	6	20358	20363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701361
529	NC_019675	GGA	2	6	20375	20380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701361
530	NC_019675	CTG	2	6	20388	20393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
531	NC_019675	TGC	2	6	20398	20403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
532	NC_019675	CTC	2	6	20414	20419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701361
533	NC_019675	GAG	2	6	20424	20429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701361
534	NC_019675	GCT	2	6	20432	20437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
535	NC_019675	GGA	2	6	20465	20470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701361
536	NC_019675	GCC	2	6	20522	20527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701361
537	NC_019675	GCG	2	6	20528	20533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701361
538	NC_019675	TGC	2	6	20572	20577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
539	NC_019675	GCA	2	6	20615	20620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701361
540	NC_019675	GCC	4	12	20685	20696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701361
541	NC_019675	CCG	2	6	20713	20718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701361
542	NC_019675	TGG	2	6	20746	20751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701361
543	NC_019675	GCGCC	2	10	20759	20768	0 %	0 %	40 %	60 %	427701361
544	NC_019675	CTGG	2	8	20790	20797	0 %	25 %	50 %	25 %	427701361
545	NC_019675	CTG	2	6	20811	20816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
546	NC_019675	TGG	2	6	20878	20883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701361
547	NC_019675	GGC	2	6	20918	20923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701361
548	NC_019675	CTG	2	6	20934	20939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
549	NC_019675	C	6	6	20940	20945	0 %	0 %	0 %	100 %	427701361
550	NC_019675	GCC	2	6	21000	21005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701361
551	NC_019675	CCA	2	6	21067	21072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701361
552	NC_019675	TCGA	2	8	21078	21085	25 %	25 %	25 %	25 %	427701361
553	NC_019675	GCCC	2	8	21144	21151	0 %	0 %	25 %	75 %	427701361
554	NC_019675	GCG	2	6	21155	21160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701361
555	NC_019675	TGC	2	6	21169	21174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701361
556	NC_019675	C	8	8	21222	21229	0 %	0 %	0 %	100 %	427701362
557	NC_019675	C	6	6	21287	21292	0 %	0 %	0 %	100 %	427701362
558	NC_019675	CTG	2	6	21313	21318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701362
559	NC_019675	GAT	2	6	21324	21329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701362
560	NC_019675	GCG	2	6	21333	21338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701362
561	NC_019675	C	6	6	21349	21354	0 %	0 %	0 %	100 %	427701362
562	NC_019675	CCAGG	2	10	21372	21381	20 %	0 %	40 %	40 %	427701362
563	NC_019675	CCG	2	6	21398	21403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701362
564	NC_019675	CTG	2	6	21457	21462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701362
565	NC_019675	CCG	2	6	21479	21484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701362
566	NC_019675	AAG	2	6	21571	21576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701362
567	NC_019675	GC	3	6	21650	21655	0 %	0 %	50 %	50 %	427701362
568	NC_019675	CCGTCC	2	12	21661	21672	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	427701362
569	NC_019675	CTG	2	6	21709	21714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701362
570	NC_019675	CTG	2	6	21724	21729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701362
571	NC_019675	GAC	2	6	21745	21750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701362
572	NC_019675	GCT	2	6	21768	21773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701362
573	NC_019675	GGT	2	6	21798	21803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701362
574	NC_019675	GCCCG	2	10	21817	21826	0 %	0 %	40 %	60 %	427701362
575	NC_019675	GCTG	2	8	21899	21906	0 %	25 %	50 %	25 %	427701362
576	NC_019675	CAG	2	6	21922	21927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701362
577	NC_019675	GTG	2	6	21928	21933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701362
578	NC_019675	GATCGG	2	12	21945	21956	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427701362
579	NC_019675	CCG	2	6	21962	21967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701362
580	NC_019675	GCCG	2	8	22008	22015	0 %	0 %	50 %	50 %	427701362
581	NC_019675	GGA	2	6	22020	22025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701362
582	NC_019675	CGAG	2	8	22040	22047	25 %	0 %	50 %	25 %	427701362
583	NC_019675	CGGT	2	8	22081	22088	0 %	25 %	50 %	25 %	427701362
584	NC_019675	ACCT	2	8	22096	22103	25 %	25 %	0 %	50 %	427701362
585	NC_019675	CCAC	2	8	22136	22143	25 %	0 %	0 %	75 %	427701362
586	NC_019675	CGC	3	9	22149	22157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701362
587	NC_019675	GGT	2	6	22188	22193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701362
588	NC_019675	GCC	4	12	22237	22248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701362
589	NC_019675	CGA	2	6	22275	22280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701362
590	NC_019675	GTG	2	6	22288	22293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701362
591	NC_019675	GGC	2	6	22311	22316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701362
592	NC_019675	C	6	6	22394	22399	0 %	0 %	0 %	100 %	427701362
593	NC_019675	C	6	6	22430	22435	0 %	0 %	0 %	100 %	427701362
594	NC_019675	TGA	2	6	22487	22492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701362
595	NC_019675	GGA	2	6	22500	22505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701362
596	NC_019675	TCG	2	6	22541	22546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701362
597	NC_019675	CGG	3	9	22580	22588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701362
598	NC_019675	GCCA	2	8	22632	22639	25 %	0 %	25 %	50 %	427701362
599	NC_019675	CGTC	2	8	22649	22656	0 %	25 %	25 %	50 %	427701362
600	NC_019675	CCA	2	6	22658	22663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701362
601	NC_019675	CAC	3	9	22680	22688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701362
602	NC_019675	GCC	2	6	22696	22701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701362
603	NC_019675	CCG	2	6	22730	22735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701362
604	NC_019675	ACC	2	6	23017	23022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701363
605	NC_019675	GAG	2	6	23107	23112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701363
606	NC_019675	GGC	2	6	23143	23148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701363
607	NC_019675	CCA	2	6	23159	23164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701363
608	NC_019675	GCC	2	6	23182	23187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701363
609	NC_019675	TGC	2	6	23210	23215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701363
610	NC_019675	AAG	2	6	23260	23265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701363
611	NC_019675	TCC	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701363
612	NC_019675	GCG	2	6	23402	23407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701363
613	NC_019675	GCT	2	6	23433	23438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701363
614	NC_019675	CAC	2	6	23446	23451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701363
615	NC_019675	GTG	2	6	23470	23475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701363
616	NC_019675	GCG	2	6	23504	23509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701363
617	NC_019675	C	6	6	23519	23524	0 %	0 %	0 %	100 %	427701363
618	NC_019675	ACT	2	6	23537	23542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427701363
619	NC_019675	TCGAT	2	10	23567	23576	20 %	40 %	20 %	20 %	427701363
620	NC_019675	GCCAAG	2	12	23611	23622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701363
621	NC_019675	CGG	2	6	23640	23645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701363
622	NC_019675	CGA	2	6	23673	23678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701363
623	NC_019675	AAG	2	6	23761	23766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701363
624	NC_019675	AGG	2	6	23813	23818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701363
625	NC_019675	CTG	2	6	23902	23907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701363
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627	NC_019675	CCA	2	6	23972	23977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701364
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