MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 20392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019566	TTA	2	6	251152	251157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400762
3502	NC_019566	TAC	2	6	251240	251245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400762
3503	NC_019566	T	7	7	251251	251257	0 %	100 %	0 %	0 %	426400762
3504	NC_019566	ATT	2	6	251284	251289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400762
3505	NC_019566	TAA	2	6	251294	251299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400762
3506	NC_019566	TAAT	2	8	251384	251391	50 %	50 %	0 %	0 %	426400762
3507	NC_019566	TTA	2	6	251440	251445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400762
3508	NC_019566	TAA	2	6	251490	251495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400762
3509	NC_019566	ATT	2	6	251503	251508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400762
3510	NC_019566	TCG	2	6	251538	251543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400762
3511	NC_019566	CAAAT	2	10	251574	251583	60 %	20 %	0 %	20 %	426400762
3512	NC_019566	CTT	2	6	251606	251611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400762
3513	NC_019566	TGG	2	6	251661	251666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400762
3514	NC_019566	TCAGCG	2	12	251689	251700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	426400762
3515	NC_019566	CGAT	2	8	251711	251718	25 %	25 %	25 %	25 %	426400762
3516	NC_019566	TACAA	2	10	251864	251873	60 %	20 %	0 %	20 %	426400763
3517	NC_019566	GGC	2	6	251874	251879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426400763
3518	NC_019566	CT	3	6	251909	251914	0 %	50 %	0 %	50 %	426400763
3519	NC_019566	AG	3	6	251924	251929	50 %	0 %	50 %	0 %	426400763
3520	NC_019566	GT	3	6	252093	252098	0 %	50 %	50 %	0 %	426400763
3521	NC_019566	TGA	2	6	252099	252104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400763
3522	NC_019566	A	6	6	252104	252109	100 %	0 %	0 %	0 %	426400763
3523	NC_019566	ATG	2	6	252112	252117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400763
3524	NC_019566	CTTGG	2	10	252178	252187	0 %	40 %	40 %	20 %	426400763
3525	NC_019566	TGG	2	6	252212	252217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400763
3526	NC_019566	A	11	11	253095	253105	100 %	0 %	0 %	0 %	426400764
3527	NC_019566	ATG	2	6	253145	253150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400764
3528	NC_019566	ATTTT	2	10	253153	253162	20 %	80 %	0 %	0 %	426400764
3529	NC_019566	TA	3	6	253177	253182	50 %	50 %	0 %	0 %	426400764
3530	NC_019566	A	7	7	253217	253223	100 %	0 %	0 %	0 %	426400764
3531	NC_019566	TTTAGG	2	12	253298	253309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	426400765
3532	NC_019566	TTTAAT	2	12	253320	253331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400765
3533	NC_019566	TTA	2	6	253350	253355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400765
3534	NC_019566	AAT	2	6	253387	253392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400765
3535	NC_019566	ATT	2	6	253397	253402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400765
3536	NC_019566	GTC	2	6	253435	253440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400765
3537	NC_019566	AT	3	6	253444	253449	50 %	50 %	0 %	0 %	426400765
3538	NC_019566	ATA	2	6	253533	253538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400766
3539	NC_019566	CTT	2	6	253562	253567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400766
3540	NC_019566	AAT	2	6	253570	253575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400766
3541	NC_019566	TTA	2	6	253583	253588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400766
3542	NC_019566	TAA	2	6	253593	253598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400766
3543	NC_019566	TGT	2	6	253711	253716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400767
3544	NC_019566	T	6	6	253806	253811	0 %	100 %	0 %	0 %	426400767
3545	NC_019566	TTAAG	2	10	253815	253824	40 %	40 %	20 %	0 %	426400767
3546	NC_019566	ATGA	2	8	254305	254312	50 %	25 %	25 %	0 %	426400768
3547	NC_019566	AAAG	2	8	254356	254363	75 %	0 %	25 %	0 %	426400768
3548	NC_019566	GATG	2	8	254388	254395	25 %	25 %	50 %	0 %	426400768
3549	NC_019566	TAA	2	6	254430	254435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400768
3550	NC_019566	TGA	2	6	254441	254446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400768
3551	NC_019566	TGGA	2	8	254452	254459	25 %	25 %	50 %	0 %	426400768
3552	NC_019566	TAC	2	6	254503	254508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400768
3553	NC_019566	AAG	2	6	254521	254526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400768
3554	NC_019566	AGC	2	6	254545	254550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400768
3555	NC_019566	GTT	2	6	254674	254679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400768
3556	NC_019566	TAC	2	6	254724	254729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400768
3557	NC_019566	TAAG	2	8	255809	255816	50 %	25 %	25 %	0 %	426400769
3558	NC_019566	TA	3	6	255888	255893	50 %	50 %	0 %	0 %	426400769
3559	NC_019566	AAAT	2	8	255918	255925	75 %	25 %	0 %	0 %	426400769
3560	NC_019566	TA	3	6	255927	255932	50 %	50 %	0 %	0 %	426400769
3561	NC_019566	CGG	2	6	256623	256628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426400770
3562	NC_019566	GAC	2	6	256648	256653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400770
3563	NC_019566	ATCT	2	8	256746	256753	25 %	50 %	0 %	25 %	426400770
3564	NC_019566	ATT	2	6	256766	256771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400770
3565	NC_019566	GAT	2	6	256982	256987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400770
3566	NC_019566	A	6	6	257096	257101	100 %	0 %	0 %	0 %	426400770
3567	NC_019566	TAC	2	6	257131	257136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400770
3568	NC_019566	GCA	2	6	257189	257194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400770
3569	NC_019566	AT	3	6	257256	257261	50 %	50 %	0 %	0 %	426400770
3570	NC_019566	ACA	2	6	257291	257296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400770
3571	NC_019566	A	7	7	257392	257398	100 %	0 %	0 %	0 %	426400770
3572	NC_019566	ATC	2	6	257508	257513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400770
3573	NC_019566	AGGTA	2	10	257533	257542	40 %	20 %	40 %	0 %	426400770
3574	NC_019566	TAC	2	6	257548	257553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400770
3575	NC_019566	TGT	2	6	257569	257574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400770
3576	NC_019566	ATA	2	6	257655	257660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400770
3577	NC_019566	ATC	2	6	257682	257687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400770
3578	NC_019566	AAT	2	6	257988	257993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400771
3579	NC_019566	ATT	2	6	257994	257999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400771
3580	NC_019566	TAT	2	6	258009	258014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400771
3581	NC_019566	ATTT	2	8	258024	258031	25 %	75 %	0 %	0 %	426400771
3582	NC_019566	CTA	2	6	258058	258063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400771
3583	NC_019566	ATG	2	6	258077	258082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400771
3584	NC_019566	TAAA	2	8	258236	258243	75 %	25 %	0 %	0 %	426400772
3585	NC_019566	CA	3	6	258260	258265	50 %	0 %	0 %	50 %	426400772
3586	NC_019566	ATA	2	6	258292	258297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400772
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3588	NC_019566	A	6	6	258490	258495	100 %	0 %	0 %	0 %	426400773
3589	NC_019566	ATT	2	6	258518	258523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400773
3590	NC_019566	GTA	2	6	258614	258619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400773
3591	NC_019566	CTA	2	6	258639	258644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400773
3592	NC_019566	GCTC	2	8	258779	258786	0 %	25 %	25 %	50 %	426400773
3593	NC_019566	GAA	2	6	258808	258813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400773
3594	NC_019566	AGC	2	6	258844	258849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400773
3595	NC_019566	CT	3	6	258922	258927	0 %	50 %	0 %	50 %	426400773
3596	NC_019566	ATT	2	6	258983	258988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400773
3597	NC_019566	GTG	2	6	259017	259022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400773
3598	NC_019566	TTGA	2	8	259097	259104	25 %	50 %	25 %	0 %	426400773
3599	NC_019566	GGT	2	6	259141	259146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400773
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3601	NC_019566	GCT	2	6	259451	259456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400773
3602	NC_019566	ATT	2	6	259499	259504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400773
3603	NC_019566	TGT	2	6	259543	259548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400773
3604	NC_019566	GTT	2	6	259631	259636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400773
3605	NC_019566	TTG	2	6	259855	259860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400773
3606	NC_019566	TGC	2	6	259900	259905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400773
3607	NC_019566	GCT	2	6	259943	259948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400773
3608	NC_019566	A	6	6	259956	259961	100 %	0 %	0 %	0 %	426400773
3609	NC_019566	AAT	2	6	260156	260161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400773
3610	NC_019566	GTT	2	6	260175	260180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400773
3611	NC_019566	ATT	3	9	260189	260197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400773
3612	NC_019566	TGG	2	6	260200	260205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400773
3613	NC_019566	ATAGG	2	10	260214	260223	40 %	20 %	40 %	0 %	426400773
3614	NC_019566	TGC	2	6	260246	260251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400773
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3616	NC_019566	CGG	2	6	260370	260375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426400773
3617	NC_019566	TGT	2	6	260431	260436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400773
3618	NC_019566	TGG	2	6	260443	260448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400773
3619	NC_019566	GATT	2	8	260521	260528	25 %	50 %	25 %	0 %	426400773
3620	NC_019566	GATCGT	2	12	260537	260548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	426400773
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3991	NC_019566	TCTGGT	2	12	288513	288524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	426400802
3992	NC_019566	TAC	2	6	288556	288561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400802
3993	NC_019566	TTGAT	2	10	288595	288604	20 %	60 %	20 %	0 %	426400802
3994	NC_019566	GA	4	8	288773	288780	50 %	0 %	50 %	0 %	426400802
3995	NC_019566	ACT	2	6	288951	288956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400802
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