MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 20392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019566	CAC	2	6	221652	221657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400736
3002	NC_019566	TGC	2	6	221678	221683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3003	NC_019566	TAA	2	6	221787	221792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400736
3004	NC_019566	GCA	2	6	221827	221832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3005	NC_019566	CAA	2	6	221909	221914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400736
3006	NC_019566	GTAT	2	8	221975	221982	25 %	50 %	25 %	0 %	426400736
3007	NC_019566	CCA	2	6	221998	222003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400736
3008	NC_019566	GAAAA	2	10	222018	222027	80 %	0 %	20 %	0 %	426400736
3009	NC_019566	CAC	2	6	222083	222088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400736
3010	NC_019566	GTTT	2	8	222091	222098	0 %	75 %	25 %	0 %	426400736
3011	NC_019566	T	6	6	222096	222101	0 %	100 %	0 %	0 %	426400736
3012	NC_019566	GC	3	6	222158	222163	0 %	0 %	50 %	50 %	426400736
3013	NC_019566	ACG	2	6	222189	222194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3014	NC_019566	TAA	2	6	222239	222244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400736
3015	NC_019566	AAG	2	6	222281	222286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400736
3016	NC_019566	TCT	2	6	222323	222328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400736
3017	NC_019566	AGT	2	6	222435	222440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400736
3018	NC_019566	CTA	2	6	222464	222469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400736
3019	NC_019566	CTT	2	6	222485	222490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400736
3020	NC_019566	ATT	2	6	222504	222509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400736
3021	NC_019566	AGC	2	6	222520	222525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3022	NC_019566	CGAC	2	8	222529	222536	25 %	0 %	25 %	50 %	426400736
3023	NC_019566	GTT	2	6	222580	222585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400736
3024	NC_019566	AATA	2	8	222596	222603	75 %	25 %	0 %	0 %	426400736
3025	NC_019566	CAA	2	6	222623	222628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400736
3026	NC_019566	GCA	2	6	222658	222663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3027	NC_019566	TTC	2	6	222669	222674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400736
3028	NC_019566	TAT	2	6	222690	222695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400736
3029	NC_019566	GGTA	2	8	222751	222758	25 %	25 %	50 %	0 %	426400736
3030	NC_019566	AGC	2	6	222775	222780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3031	NC_019566	ATGC	2	8	222856	222863	25 %	25 %	25 %	25 %	426400736
3032	NC_019566	CGT	2	6	222917	222922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3033	NC_019566	ATC	2	6	222943	222948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400736
3034	NC_019566	CAG	2	6	222962	222967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3035	NC_019566	CCAG	2	8	223028	223035	25 %	0 %	25 %	50 %	426400736
3036	NC_019566	CAA	2	6	223061	223066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400736
3037	NC_019566	CGA	2	6	223070	223075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3038	NC_019566	ATT	2	6	223108	223113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400736
3039	NC_019566	AAG	2	6	223156	223161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400736
3040	NC_019566	ATCCA	2	10	223432	223441	40 %	20 %	0 %	40 %	426400736
3041	NC_019566	GTA	2	6	223491	223496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400736
3042	NC_019566	GTC	3	9	223510	223518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400736
3043	NC_019566	TG	3	6	223535	223540	0 %	50 %	50 %	0 %	426400736
3044	NC_019566	ATG	2	6	223543	223548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400736
3045	NC_019566	TTA	2	6	223693	223698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400737
3046	NC_019566	T	6	6	223728	223733	0 %	100 %	0 %	0 %	426400737
3047	NC_019566	T	6	6	223796	223801	0 %	100 %	0 %	0 %	426400737
3048	NC_019566	GCA	2	6	223816	223821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400737
3049	NC_019566	TTAA	2	8	223822	223829	50 %	50 %	0 %	0 %	426400737
3050	NC_019566	CCAC	2	8	223894	223901	25 %	0 %	0 %	75 %	426400737
3051	NC_019566	ACG	2	6	223902	223907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400737
3052	NC_019566	GAAC	2	8	223909	223916	50 %	0 %	25 %	25 %	426400737
3053	NC_019566	CAT	2	6	223946	223951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400737
3054	NC_019566	AAC	2	6	224051	224056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400737
3055	NC_019566	AT	3	6	224102	224107	50 %	50 %	0 %	0 %	426400737
3056	NC_019566	GCGAC	2	10	224127	224136	20 %	0 %	40 %	40 %	426400737
3057	NC_019566	ACG	2	6	224182	224187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400738
3058	NC_019566	GAC	2	6	224190	224195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400738
3059	NC_019566	AAT	2	6	224230	224235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400738
3060	NC_019566	CCG	2	6	224270	224275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400738
3061	NC_019566	AACG	2	8	224355	224362	50 %	0 %	25 %	25 %	426400738
3062	NC_019566	T	6	6	224393	224398	0 %	100 %	0 %	0 %	426400738
3063	NC_019566	AC	3	6	224412	224417	50 %	0 %	0 %	50 %	426400738
3064	NC_019566	TGCAG	2	10	224450	224459	20 %	20 %	40 %	20 %	426400738
3065	NC_019566	TTA	2	6	224465	224470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400738
3066	NC_019566	TTC	2	6	224900	224905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400739
3067	NC_019566	CAG	2	6	225002	225007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400739
3068	NC_019566	AGT	2	6	225024	225029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400739
3069	NC_019566	GAAGC	2	10	225068	225077	40 %	0 %	40 %	20 %	426400739
3070	NC_019566	CTT	2	6	225150	225155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400739
3071	NC_019566	TCA	2	6	225160	225165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
3072	NC_019566	AAAGT	2	10	225185	225194	60 %	20 %	20 %	0 %	426400739
3073	NC_019566	CTT	2	6	225293	225298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400739
3074	NC_019566	TAA	2	6	225308	225313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400739
3075	NC_019566	CTT	2	6	225410	225415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400739
3076	NC_019566	TTC	2	6	225468	225473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400739
3077	NC_019566	ACC	2	6	225603	225608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400739
3078	NC_019566	TAA	2	6	225923	225928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400739
3079	NC_019566	CAA	3	9	225974	225982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400739
3080	NC_019566	CAA	2	6	225992	225997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400739
3081	NC_019566	TAC	2	6	226083	226088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
3082	NC_019566	AAC	2	6	226110	226115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400739
3083	NC_019566	ATT	2	6	226122	226127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400739
3084	NC_019566	CAC	2	6	226175	226180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400739
3085	NC_019566	AGC	2	6	226185	226190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400739
3086	NC_019566	ACC	2	6	226191	226196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400739
3087	NC_019566	CGAT	2	8	226238	226245	25 %	25 %	25 %	25 %	426400739
3088	NC_019566	AGC	2	6	226248	226253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400739
3089	NC_019566	TTC	2	6	226395	226400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400739
3090	NC_019566	T	6	6	226428	226433	0 %	100 %	0 %	0 %	426400739
3091	NC_019566	TTCA	2	8	226467	226474	25 %	50 %	0 %	25 %	426400739
3092	NC_019566	GTA	2	6	226477	226482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400739
3093	NC_019566	CAAT	2	8	226567	226574	50 %	25 %	0 %	25 %	426400739
3094	NC_019566	ACAAT	2	10	226582	226591	60 %	20 %	0 %	20 %	426400739
3095	NC_019566	ACG	2	6	226611	226616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400739
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3098	NC_019566	CAT	2	6	226833	226838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
3099	NC_019566	TCT	2	6	226870	226875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400739
3100	NC_019566	CAT	2	6	226887	226892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
3101	NC_019566	ACT	2	6	226933	226938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
3102	NC_019566	TGC	2	6	226981	226986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400739
3103	NC_019566	AAATG	2	10	227063	227072	60 %	20 %	20 %	0 %	426400739
3104	NC_019566	ATA	2	6	227166	227171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400739
3105	NC_019566	T	6	6	227184	227189	0 %	100 %	0 %	0 %	426400739
3106	NC_019566	TCA	2	6	227191	227196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
3107	NC_019566	TTG	2	6	227292	227297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400739
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3109	NC_019566	ATA	2	6	227454	227459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400739
3110	NC_019566	TGT	2	6	227506	227511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400739
3111	NC_019566	CAT	2	6	227519	227524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
3112	NC_019566	CAA	2	6	227647	227652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400739
3113	NC_019566	AGGT	2	8	227689	227696	25 %	25 %	50 %	0 %	426400739
3114	NC_019566	AATA	2	8	227827	227834	75 %	25 %	0 %	0 %	426400739
3115	NC_019566	AAC	2	6	227844	227849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400739
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3117	NC_019566	ACT	2	6	227904	227909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
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3119	NC_019566	CAAA	2	8	228052	228059	75 %	0 %	0 %	25 %	426400739
3120	NC_019566	GCA	2	6	228076	228081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400739
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3122	NC_019566	ATTA	2	8	228152	228159	50 %	50 %	0 %	0 %	426400739
3123	NC_019566	CCA	2	6	228201	228206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400739
3124	NC_019566	ATC	2	6	228261	228266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400739
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3126	NC_019566	T	6	6	228326	228331	0 %	100 %	0 %	0 %	426400739
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3132	NC_019566	CT	3	6	228567	228572	0 %	50 %	0 %	50 %	426400739
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3139	NC_019566	T	6	6	228857	228862	0 %	100 %	0 %	0 %	426400739
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3164	NC_019566	AT	3	6	230534	230539	50 %	50 %	0 %	0 %	426400740
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3231	NC_019566	T	7	7	233782	233788	0 %	100 %	0 %	0 %	426400741
3232	NC_019566	GC	3	6	233807	233812	0 %	0 %	50 %	50 %	426400741
3233	NC_019566	AGC	2	6	233844	233849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400741
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3237	NC_019566	TA	3	6	233976	233981	50 %	50 %	0 %	0 %	426400741
3238	NC_019566	TCTTAA	2	12	234023	234034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	426400742
3239	NC_019566	GAA	2	6	234123	234128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400742
3240	NC_019566	AGAA	2	8	234172	234179	75 %	0 %	25 %	0 %	426400742
3241	NC_019566	CCA	2	6	234221	234226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400742
3242	NC_019566	CAA	2	6	234261	234266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400742
3243	NC_019566	AAG	2	6	234306	234311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400742
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3367	NC_019566	AT	3	6	241996	242001	50 %	50 %	0 %	0 %	426400751
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3401	NC_019566	A	7	7	244388	244394	100 %	0 %	0 %	0 %	426400755
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3481	NC_019566	CAT	2	6	250124	250129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400762
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