MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 20392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019566	CTT	2	6	36494	36499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400546
502	NC_019566	TCG	2	6	36523	36528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400546
503	NC_019566	TGA	2	6	36532	36537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400546
504	NC_019566	AGG	2	6	36576	36581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400546
505	NC_019566	GA	3	6	36624	36629	50 %	0 %	50 %	0 %	426400546
506	NC_019566	TGATGG	2	12	36634	36645	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	426400546
507	NC_019566	GTT	2	6	36648	36653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400546
508	NC_019566	TGC	2	6	36739	36744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400546
509	NC_019566	A	8	8	36755	36762	100 %	0 %	0 %	0 %	426400546
510	NC_019566	GAA	2	6	36767	36772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400546
511	NC_019566	AT	3	6	36877	36882	50 %	50 %	0 %	0 %	426400546
512	NC_019566	TCGCT	2	10	36898	36907	0 %	40 %	20 %	40 %	426400546
513	NC_019566	GGA	2	6	36910	36915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400546
514	NC_019566	TTG	2	6	36958	36963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400546
515	NC_019566	AAAT	2	8	37039	37046	75 %	25 %	0 %	0 %	426400546
516	NC_019566	GCT	2	6	37073	37078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400546
517	NC_019566	A	8	8	37090	37097	100 %	0 %	0 %	0 %	426400546
518	NC_019566	TCT	2	6	37123	37128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400546
519	NC_019566	GATTA	2	10	37167	37176	40 %	40 %	20 %	0 %	426400546
520	NC_019566	ATG	2	6	37185	37190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400546
521	NC_019566	TTTC	2	8	37219	37226	0 %	75 %	0 %	25 %	426400546
522	NC_019566	ATC	2	6	37949	37954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400547
523	NC_019566	ATT	2	6	37964	37969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400547
524	NC_019566	TAG	2	6	37998	38003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400547
525	NC_019566	TGA	2	6	38008	38013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400547
526	NC_019566	TAA	2	6	38041	38046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400547
527	NC_019566	ACC	2	6	38167	38172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400547
528	NC_019566	TAA	2	6	38179	38184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400547
529	NC_019566	AAT	2	6	38198	38203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400547
530	NC_019566	TTA	2	6	38205	38210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400547
531	NC_019566	AAT	2	6	38278	38283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400547
532	NC_019566	ACTA	2	8	38329	38336	50 %	25 %	0 %	25 %	426400547
533	NC_019566	AAGC	2	8	38373	38380	50 %	0 %	25 %	25 %	426400547
534	NC_019566	CAA	2	6	38444	38449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400547
535	NC_019566	AGA	2	6	38459	38464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400547
536	NC_019566	ATTT	2	8	38501	38508	25 %	75 %	0 %	0 %	426400547
537	NC_019566	AATT	2	8	38548	38555	50 %	50 %	0 %	0 %	426400547
538	NC_019566	CAAA	2	8	38574	38581	75 %	0 %	0 %	25 %	426400547
539	NC_019566	GTGA	2	8	38582	38589	25 %	25 %	50 %	0 %	426400547
540	NC_019566	GAT	2	6	38593	38598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400547
541	NC_019566	TTG	2	6	38673	38678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400547
542	NC_019566	GGCA	2	8	38725	38732	25 %	0 %	50 %	25 %	426400547
543	NC_019566	AGTA	2	8	38756	38763	50 %	25 %	25 %	0 %	426400547
544	NC_019566	GAT	2	6	38855	38860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400547
545	NC_019566	GA	3	6	38881	38886	50 %	0 %	50 %	0 %	426400547
546	NC_019566	T	6	6	38909	38914	0 %	100 %	0 %	0 %	426400547
547	NC_019566	AG	3	6	38926	38931	50 %	0 %	50 %	0 %	426400547
548	NC_019566	T	6	6	38951	38956	0 %	100 %	0 %	0 %	426400547
549	NC_019566	GTGC	2	8	39428	39435	0 %	25 %	50 %	25 %	426400548
550	NC_019566	ATCC	2	8	39476	39483	25 %	25 %	0 %	50 %	426400548
551	NC_019566	CAT	2	6	39549	39554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400548
552	NC_019566	T	6	6	39598	39603	0 %	100 %	0 %	0 %	426400548
553	NC_019566	TAG	2	6	39720	39725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400548
554	NC_019566	GATCG	2	10	39812	39821	20 %	20 %	40 %	20 %	426400548
555	NC_019566	TTA	2	6	39835	39840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400548
556	NC_019566	A	6	6	39955	39960	100 %	0 %	0 %	0 %	426400548
557	NC_019566	CCA	2	6	40012	40017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400548
558	NC_019566	ATGG	2	8	40036	40043	25 %	25 %	50 %	0 %	426400548
559	NC_019566	AGA	2	6	40048	40053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400548
560	NC_019566	ATA	2	6	41028	41033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400549
561	NC_019566	CGA	2	6	41111	41116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400549
562	NC_019566	CCGA	2	8	41257	41264	25 %	0 %	25 %	50 %	426400549
563	NC_019566	CATT	2	8	41306	41313	25 %	50 %	0 %	25 %	426400549
564	NC_019566	TCT	2	6	41314	41319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400549
565	NC_019566	CAA	2	6	41333	41338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400549
566	NC_019566	TCT	2	6	41362	41367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400549
567	NC_019566	T	6	6	41385	41390	0 %	100 %	0 %	0 %	426400549
568	NC_019566	ACTACC	2	12	41406	41417	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	426400549
569	NC_019566	ATT	2	6	41422	41427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400549
570	NC_019566	GGA	2	6	41431	41436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400549
571	NC_019566	A	6	6	41454	41459	100 %	0 %	0 %	0 %	426400549
572	NC_019566	GAT	3	9	41483	41491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400549
573	NC_019566	TCGA	2	8	41494	41501	25 %	25 %	25 %	25 %	426400549
574	NC_019566	TGT	2	6	41572	41577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400549
575	NC_019566	A	6	6	41588	41593	100 %	0 %	0 %	0 %	426400549
576	NC_019566	TGTT	2	8	41597	41604	0 %	75 %	25 %	0 %	426400549
577	NC_019566	GAA	2	6	43009	43014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400550
578	NC_019566	GAG	2	6	43023	43028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426400550
579	NC_019566	ATTTT	2	10	43127	43136	20 %	80 %	0 %	0 %	426400550
580	NC_019566	T	6	6	43133	43138	0 %	100 %	0 %	0 %	426400550
581	NC_019566	GCA	2	6	43151	43156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400550
582	NC_019566	GGT	2	6	43211	43216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400550
583	NC_019566	TGG	2	6	43223	43228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400550
584	NC_019566	A	6	6	43340	43345	100 %	0 %	0 %	0 %	426400550
585	NC_019566	GAT	2	6	43430	43435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400550
586	NC_019566	TAA	2	6	43452	43457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400550
587	NC_019566	ATG	2	6	43505	43510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400551
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589	NC_019566	TTGT	2	8	43545	43552	0 %	75 %	25 %	0 %	426400551
590	NC_019566	TGA	2	6	43603	43608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400551
591	NC_019566	TAC	2	6	43674	43679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400551
592	NC_019566	GTG	2	6	43788	43793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400551
593	NC_019566	TGT	2	6	43795	43800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400551
594	NC_019566	AGAT	2	8	43821	43828	50 %	25 %	25 %	0 %	426400551
595	NC_019566	A	6	6	43842	43847	100 %	0 %	0 %	0 %	426400551
596	NC_019566	AGT	2	6	43853	43858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400551
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598	NC_019566	CGT	2	6	43973	43978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400551
599	NC_019566	CG	3	6	43998	44003	0 %	0 %	50 %	50 %	426400551
600	NC_019566	AGCTA	2	10	44098	44107	40 %	20 %	20 %	20 %	426400551
601	NC_019566	GTA	2	6	44187	44192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400551
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604	NC_019566	CTT	2	6	44247	44252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400551
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609	NC_019566	TAT	2	6	44466	44471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400551
610	NC_019566	CAC	2	6	44493	44498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400551
611	NC_019566	AGA	2	6	44509	44514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400551
612	NC_019566	TGGGT	2	10	44530	44539	0 %	40 %	60 %	0 %	426400551
613	NC_019566	TTTAAT	2	12	44581	44592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400551
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616	NC_019566	ATT	2	6	44660	44665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400551
617	NC_019566	TAG	2	6	44718	44723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400551
618	NC_019566	TGGCA	2	10	44740	44749	20 %	20 %	40 %	20 %	426400551
619	NC_019566	AAC	2	6	44872	44877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400551
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621	NC_019566	TAT	2	6	44977	44982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400551
622	NC_019566	TGTT	2	8	44994	45001	0 %	75 %	25 %	0 %	426400551
623	NC_019566	TTG	2	6	45004	45009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400551
624	NC_019566	CTA	2	6	45027	45032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400551
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626	NC_019566	T	6	6	45118	45123	0 %	100 %	0 %	0 %	426400552
627	NC_019566	CGA	2	6	45416	45421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400552
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