MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Endolissoclinum patella L2 chromosome

Total Repeats: 20392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019566	TGT	2	6	410567	410572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400940
5502	NC_019566	ATG	2	6	410588	410593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400940
5503	NC_019566	TGA	2	6	410628	410633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400940
5504	NC_019566	GTA	2	6	410638	410643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400940
5505	NC_019566	TTA	2	6	410689	410694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400940
5506	NC_019566	TGA	2	6	410715	410720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400940
5507	NC_019566	TGG	2	6	410769	410774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400940
5508	NC_019566	TGC	2	6	410969	410974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400940
5509	NC_019566	GCA	2	6	410981	410986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400940
5510	NC_019566	TGC	2	6	410991	410996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400940
5511	NC_019566	GAAA	2	8	411066	411073	75 %	0 %	25 %	0 %	426400940
5512	NC_019566	AGA	2	6	411102	411107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400940
5513	NC_019566	GAA	2	6	411160	411165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400940
5514	NC_019566	AAG	3	9	411181	411189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426400940
5515	NC_019566	A	7	7	411256	411262	100 %	0 %	0 %	0 %	426400940
5516	NC_019566	GCTTG	2	10	411307	411316	0 %	40 %	40 %	20 %	426400940
5517	NC_019566	TAC	2	6	411411	411416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400940
5518	NC_019566	TTG	2	6	411434	411439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400940
5519	NC_019566	ACA	2	6	411462	411467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400940
5520	NC_019566	TCAC	2	8	411829	411836	25 %	25 %	0 %	50 %	426400941
5521	NC_019566	AATT	2	8	411869	411876	50 %	50 %	0 %	0 %	426400941
5522	NC_019566	TTA	2	6	411889	411894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400941
5523	NC_019566	TAAT	2	8	411973	411980	50 %	50 %	0 %	0 %	426400941
5524	NC_019566	T	6	6	411980	411985	0 %	100 %	0 %	0 %	426400941
5525	NC_019566	TAC	2	6	412033	412038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400942
5526	NC_019566	TAA	2	6	412054	412059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400942
5527	NC_019566	ATT	2	6	412065	412070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400942
5528	NC_019566	TTTA	2	8	412077	412084	25 %	75 %	0 %	0 %	426400942
5529	NC_019566	ACC	2	6	412815	412820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400943
5530	NC_019566	TGC	2	6	412830	412835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5531	NC_019566	AGC	2	6	412839	412844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5532	NC_019566	AGC	2	6	412917	412922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5533	NC_019566	AAC	2	6	412941	412946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400943
5534	NC_019566	AAT	2	6	412959	412964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400943
5535	NC_019566	ACC	2	6	412989	412994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400943
5536	NC_019566	CTA	2	6	413017	413022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5537	NC_019566	CAT	2	6	413060	413065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5538	NC_019566	TCG	2	6	413109	413114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5539	NC_019566	AAT	2	6	413115	413120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400943
5540	NC_019566	ATC	2	6	413139	413144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5541	NC_019566	TCC	2	6	413196	413201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400943
5542	NC_019566	CTT	2	6	413216	413221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400943
5543	NC_019566	GCT	2	6	413227	413232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5544	NC_019566	TCA	2	6	413251	413256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5545	NC_019566	CCA	2	6	413296	413301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400943
5546	NC_019566	GTA	2	6	413374	413379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400943
5547	NC_019566	TAC	2	6	413541	413546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5548	NC_019566	ACG	2	6	413589	413594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5549	NC_019566	CAG	2	6	413618	413623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5550	NC_019566	TAC	2	6	413652	413657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5551	NC_019566	TCT	2	6	413686	413691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400943
5552	NC_019566	GAT	2	6	413694	413699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400943
5553	NC_019566	TAA	2	6	413700	413705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400943
5554	NC_019566	T	7	7	413767	413773	0 %	100 %	0 %	0 %	426400943
5555	NC_019566	CAA	2	6	413873	413878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400943
5556	NC_019566	CTT	2	6	413906	413911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400943
5557	NC_019566	ATC	2	6	413959	413964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5558	NC_019566	TCT	2	6	414032	414037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400943
5559	NC_019566	CGT	2	6	414043	414048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5560	NC_019566	CTA	2	6	414059	414064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5561	NC_019566	GCA	2	6	414118	414123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400943
5562	NC_019566	AGT	3	9	414171	414179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400943
5563	NC_019566	CAT	2	6	414194	414199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400943
5564	NC_019566	TTA	2	6	414400	414405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400943
5565	NC_019566	TTAG	2	8	414523	414530	25 %	50 %	25 %	0 %	426400944
5566	NC_019566	CGA	2	6	414545	414550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400944
5567	NC_019566	CTTT	2	8	414585	414592	0 %	75 %	0 %	25 %	426400944
5568	NC_019566	TCG	2	6	414699	414704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400944
5569	NC_019566	CG	4	8	414703	414710	0 %	0 %	50 %	50 %	426400944
5570	NC_019566	TAA	2	6	414769	414774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400944
5571	NC_019566	GCC	2	6	414776	414781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400944
5572	NC_019566	GAC	2	6	414805	414810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400944
5573	NC_019566	ACC	2	6	414813	414818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400944
5574	NC_019566	TCC	2	6	414854	414859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400944
5575	NC_019566	CT	3	6	415425	415430	0 %	50 %	0 %	50 %	426400945
5576	NC_019566	TGA	2	6	415488	415493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400945
5577	NC_019566	TGCG	2	8	415526	415533	0 %	25 %	50 %	25 %	426400945
5578	NC_019566	CATT	2	8	415585	415592	25 %	50 %	0 %	25 %	426400945
5579	NC_019566	TCC	2	6	415700	415705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400945
5580	NC_019566	TATC	2	8	415726	415733	25 %	50 %	0 %	25 %	426400945
5581	NC_019566	ATC	2	6	415769	415774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400945
5582	NC_019566	TTC	2	6	415934	415939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400945
5583	NC_019566	CT	3	6	415947	415952	0 %	50 %	0 %	50 %	426400945
5584	NC_019566	CCA	2	6	416040	416045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426400945
5585	NC_019566	T	6	6	416116	416121	0 %	100 %	0 %	0 %	426400945
5586	NC_019566	GAT	2	6	416266	416271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400945
5587	NC_019566	TAA	2	6	416519	416524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400946
5588	NC_019566	GCT	2	6	416552	416557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400946
5589	NC_019566	T	6	6	416570	416575	0 %	100 %	0 %	0 %	426400946
5590	NC_019566	ATAA	2	8	416780	416787	75 %	25 %	0 %	0 %	426400946
5591	NC_019566	TAG	2	6	416919	416924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400946
5592	NC_019566	GAAATG	2	12	416960	416971	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	426400946
5593	NC_019566	CTC	2	6	416991	416996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400946
5594	NC_019566	CCG	2	6	417074	417079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400946
5595	NC_019566	TATCG	2	10	417117	417126	20 %	40 %	20 %	20 %	426400946
5596	NC_019566	GAT	2	6	417170	417175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400946
5597	NC_019566	GCC	2	6	417187	417192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426400946
5598	NC_019566	GTT	2	6	417215	417220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400946
5599	NC_019566	TAA	2	6	417226	417231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400946
5600	NC_019566	CTA	2	6	417282	417287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400946
5601	NC_019566	TTTG	2	8	417424	417431	0 %	75 %	25 %	0 %	426400946
5602	NC_019566	AGT	2	6	417432	417437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426400946
5603	NC_019566	GT	3	6	417510	417515	0 %	50 %	50 %	0 %	426400946
5604	NC_019566	TG	3	6	417581	417586	0 %	50 %	50 %	0 %	426400946
5605	NC_019566	TCC	2	6	417619	417624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400946
5606	NC_019566	TGG	2	6	417894	417899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426400946
5607	NC_019566	ACA	2	6	417923	417928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400946
5608	NC_019566	CAG	2	6	417951	417956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400946
5609	NC_019566	GTT	2	6	417957	417962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400946
5610	NC_019566	GTCT	2	8	417975	417982	0 %	50 %	25 %	25 %	426400946
5611	NC_019566	CAT	2	6	418056	418061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400946
5612	NC_019566	TCC	2	6	418120	418125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426400946
5613	NC_019566	TCA	2	6	418175	418180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426400946
5614	NC_019566	AAT	2	6	418185	418190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400946
5615	NC_019566	CTT	2	6	418248	418253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426400946
5616	NC_019566	ATT	2	6	418276	418281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400946
5617	NC_019566	T	7	7	418280	418286	0 %	100 %	0 %	0 %	426400946
5618	NC_019566	ACG	2	6	418309	418314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400946
5619	NC_019566	AGC	2	6	418321	418326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426400946
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5621	NC_019566	GCT	2	6	418373	418378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426400946
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5991	NC_019566	CAA	2	6	441283	441288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426400968
5992	NC_019566	CTTAT	2	10	441400	441409	20 %	60 %	0 %	20 %	426400968
5993	NC_019566	TACT	2	8	441583	441590	25 %	50 %	0 %	25 %	426400968
5994	NC_019566	ACTTT	2	10	441915	441924	20 %	60 %	0 %	20 %	426400969
5995	NC_019566	TAT	2	6	441956	441961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426400969
5996	NC_019566	T	7	7	441961	441967	0 %	100 %	0 %	0 %	426400969
5997	NC_019566	ATTAA	2	10	441977	441986	60 %	40 %	0 %	0 %	426400969
5998	NC_019566	T	6	6	442009	442014	0 %	100 %	0 %	0 %	426400969
5999	NC_019566	GTT	2	6	442628	442633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426400970
6000	NC_019566	ATA	2	6	442654	442659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426400970

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