MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 1491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018719	AGGAG	2	10	792	801	40 %	0 %	60 %	0 %	408402625
2	NC_018719	CCGCG	2	10	1866	1875	0 %	0 %	40 %	60 %	408402626
3	NC_018719	TTTTC	2	10	3053	3062	0 %	80 %	0 %	20 %	408402627
4	NC_018719	CCCGG	2	10	5010	5019	0 %	0 %	40 %	60 %	408402628
5	NC_018719	GCGAT	2	10	6392	6401	20 %	20 %	40 %	20 %	408402631
6	NC_018719	CGGGA	2	10	6487	6496	20 %	0 %	60 %	20 %	408402631
7	NC_018719	GCGCT	2	10	7364	7373	0 %	20 %	40 %	40 %	408402632
8	NC_018719	TGAGA	2	10	8046	8055	40 %	20 %	40 %	0 %	408402634
9	NC_018719	ACTTC	2	10	10369	10378	20 %	40 %	0 %	40 %	408402639
10	NC_018719	CCGTC	2	10	11649	11658	0 %	20 %	20 %	60 %	408402639
11	NC_018719	AGGGA	2	10	14736	14745	40 %	0 %	60 %	0 %	408402642
12	NC_018719	CGACG	2	10	18677	18686	20 %	0 %	40 %	40 %	408402648
13	NC_018719	GAGCA	2	10	19957	19966	40 %	0 %	40 %	20 %	408402649
14	NC_018719	CAAGC	2	10	22299	22308	40 %	0 %	20 %	40 %	408402649
15	NC_018719	TAATA	2	10	22600	22609	60 %	40 %	0 %	0 %	408402649
16	NC_018719	TGCTG	2	10	25157	25166	0 %	40 %	40 %	20 %	408402653
17	NC_018719	TCGCG	2	10	25343	25352	0 %	20 %	40 %	40 %	408402653
18	NC_018719	CCGGC	2	10	26704	26713	0 %	0 %	40 %	60 %	408402655
19	NC_018719	GCGCG	2	10	27196	27205	0 %	0 %	60 %	40 %	408402655
20	NC_018719	ACTAT	2	10	32761	32770	40 %	40 %	0 %	20 %	408402666
21	NC_018719	CCGGC	2	10	33862	33871	0 %	0 %	40 %	60 %	408402668
22	NC_018719	CTTCT	2	10	33970	33979	0 %	60 %	0 %	40 %	408402668
23	NC_018719	CAATA	2	10	34544	34553	60 %	20 %	0 %	20 %	408402670
24	NC_018719	CCAGA	2	10	34927	34936	40 %	0 %	20 %	40 %	408402670
25	NC_018719	ATCCT	2	10	35096	35105	20 %	40 %	0 %	40 %	408402670
26	NC_018719	CTCTT	2	10	40278	40287	0 %	60 %	0 %	40 %	408402678
27	NC_018719	ATAAC	2	10	40759	40768	60 %	20 %	0 %	20 %	408402678
28	NC_018719	CCTTG	2	10	41502	41511	0 %	40 %	20 %	40 %	408402679
29	NC_018719	TATGT	2	10	42052	42061	20 %	60 %	20 %	0 %	408402682
30	NC_018719	GAAAA	2	10	42401	42410	80 %	0 %	20 %	0 %	408402683
31	NC_018719	GACGA	2	10	44958	44967	40 %	0 %	40 %	20 %	408402689
32	NC_018719	GATTC	2	10	47821	47830	20 %	40 %	20 %	20 %	408402694
33	NC_018719	GTGGA	2	10	49246	49255	20 %	20 %	60 %	0 %	408402698
34	NC_018719	AAAAG	2	10	49259	49268	80 %	0 %	20 %	0 %	408402698
35	NC_018719	ACCGG	2	10	51051	51060	20 %	0 %	40 %	40 %	408402700
36	NC_018719	GGACA	2	10	52646	52655	40 %	0 %	40 %	20 %	408402701
37	NC_018719	GGTTT	2	10	57643	57652	0 %	60 %	40 %	0 %	408402705
38	NC_018719	AAAGG	2	10	61453	61462	60 %	0 %	40 %	0 %	408402710
39	NC_018719	CTGTC	2	10	61916	61925	0 %	40 %	20 %	40 %	408402711
40	NC_018719	AGAGG	2	10	64005	64014	40 %	0 %	60 %	0 %	408402713
41	NC_018719	GCTTT	2	10	65771	65780	0 %	60 %	20 %	20 %	408402714
42	NC_018719	CCAAG	2	10	69938	69947	40 %	0 %	20 %	40 %	408402718
43	NC_018719	CACGG	2	10	71144	71153	20 %	0 %	40 %	40 %	408402719
44	NC_018719	AACGG	2	10	71471	71480	40 %	0 %	40 %	20 %	408402719
45	NC_018719	ATATA	2	10	72516	72525	60 %	40 %	0 %	0 %	408402721
46	NC_018719	GCATG	2	10	72607	72616	20 %	20 %	40 %	20 %	408402721
47	NC_018719	CATAT	2	10	73171	73180	40 %	40 %	0 %	20 %	408402722
48	NC_018719	CAATT	2	10	73262	73271	40 %	40 %	0 %	20 %	408402722
49	NC_018719	CATGA	2	10	74023	74032	40 %	20 %	20 %	20 %	408402724
50	NC_018719	GACTG	2	10	75617	75626	20 %	20 %	40 %	20 %	408402726
51	NC_018719	GCCAC	2	10	76498	76507	20 %	0 %	20 %	60 %	408402727
52	NC_018719	AGCCT	2	10	77426	77435	20 %	20 %	20 %	40 %	408402728
53	NC_018719	CTTGC	2	10	77603	77612	0 %	40 %	20 %	40 %	408402729
54	NC_018719	AGCAA	2	10	81662	81671	60 %	0 %	20 %	20 %	408402732
55	NC_018719	AGTCA	2	10	82397	82406	40 %	20 %	20 %	20 %	408402733
56	NC_018719	TACAA	2	10	83536	83545	60 %	20 %	0 %	20 %	408402733
57	NC_018719	AAGAC	2	10	85008	85017	60 %	0 %	20 %	20 %	408402734
58	NC_018719	GGTCT	2	10	89068	89077	0 %	40 %	40 %	20 %	408402739
59	NC_018719	TGCGG	2	10	90899	90908	0 %	20 %	60 %	20 %	408402742
60	NC_018719	AGTAT	2	10	91966	91975	40 %	40 %	20 %	0 %	408402745
61	NC_018719	CAGCG	2	10	92922	92931	20 %	0 %	40 %	40 %	408402747
62	NC_018719	GATGT	2	10	94018	94027	20 %	40 %	40 %	0 %	408402748
63	NC_018719	AGGAG	2	10	96744	96753	40 %	0 %	60 %	0 %	408402750
64	NC_018719	CTGCC	2	10	101380	101389	0 %	20 %	20 %	60 %	408402755
65	NC_018719	CACAA	2	10	101451	101460	60 %	0 %	0 %	40 %	408402755
66	NC_018719	TCTGC	2	10	102162	102171	0 %	40 %	20 %	40 %	408402756
67	NC_018719	TGACC	2	10	103955	103964	20 %	20 %	20 %	40 %	408402758
68	NC_018719	CCCTC	2	10	104254	104263	0 %	20 %	0 %	80 %	408402758
69	NC_018719	GCCTT	2	10	104898	104907	0 %	40 %	20 %	40 %	408402759
70	NC_018719	CATGA	2	10	106523	106532	40 %	20 %	20 %	20 %	408402761
71	NC_018719	CCTGA	2	10	108166	108175	20 %	20 %	20 %	40 %	408402765
72	NC_018719	TGCGT	2	10	109262	109271	0 %	40 %	40 %	20 %	408402766
73	NC_018719	GCAAG	2	10	110461	110470	40 %	0 %	40 %	20 %	408402768
74	NC_018719	AAGCC	2	10	110813	110822	40 %	0 %	20 %	40 %	408402768
75	NC_018719	GCCGG	2	10	111610	111619	0 %	0 %	60 %	40 %	408402769
76	NC_018719	CCTGC	2	10	112556	112565	0 %	20 %	20 %	60 %	408402770
77	NC_018719	GATTA	2	10	113337	113346	40 %	40 %	20 %	0 %	408402771
78	NC_018719	CTGTA	2	10	118130	118139	20 %	40 %	20 %	20 %	408402776
79	NC_018719	CCGGC	2	10	118968	118977	0 %	0 %	40 %	60 %	408402777
80	NC_018719	GAAGG	2	10	119109	119118	40 %	0 %	60 %	0 %	408402778
81	NC_018719	AACCT	2	10	119324	119333	40 %	20 %	0 %	40 %	408402778
82	NC_018719	GCTGG	2	10	120037	120046	0 %	20 %	60 %	20 %	408402778
83	NC_018719	AGGGC	2	10	122103	122112	20 %	0 %	60 %	20 %	408402778
84	NC_018719	TCGAT	2	10	124297	124306	20 %	40 %	20 %	20 %	408402779
85	NC_018719	GTCAA	2	10	124758	124767	40 %	20 %	20 %	20 %	408402779
86	NC_018719	TGCGC	2	10	127974	127983	0 %	20 %	40 %	40 %	408402783
87	NC_018719	CTTTG	2	10	132377	132386	0 %	60 %	20 %	20 %	408402789
88	NC_018719	TGCAA	2	10	133606	133615	40 %	20 %	20 %	20 %	408402791
89	NC_018719	CTGAT	2	10	136741	136750	20 %	40 %	20 %	20 %	408402797
90	NC_018719	TCTTT	2	10	141607	141616	0 %	80 %	0 %	20 %	408402803
91	NC_018719	CTCTT	2	10	142068	142077	0 %	60 %	0 %	40 %	408402804
92	NC_018719	TTGCT	2	10	142331	142340	0 %	60 %	20 %	20 %	408402805
93	NC_018719	TCCTC	2	10	143090	143099	0 %	40 %	0 %	60 %	408402805
94	NC_018719	CGGCA	2	10	147875	147884	20 %	0 %	40 %	40 %	408402811
95	NC_018719	CGGGC	2	10	148148	148157	0 %	0 %	60 %	40 %	408402811
96	NC_018719	TTGTG	2	10	150537	150546	0 %	60 %	40 %	0 %	408402815
97	NC_018719	TCAGA	2	10	151215	151224	40 %	20 %	20 %	20 %	408402815
98	NC_018719	CCTGT	2	10	151653	151662	0 %	40 %	20 %	40 %	408402816
99	NC_018719	AGGCA	2	10	151906	151915	40 %	0 %	40 %	20 %	408402816
100	NC_018719	GCCGG	2	10	152039	152048	0 %	0 %	60 %	40 %	408402816
101	NC_018719	CCGTG	2	10	153166	153175	0 %	20 %	40 %	40 %	408402817
102	NC_018719	GACCT	2	10	158411	158420	20 %	20 %	20 %	40 %	408402824
103	NC_018719	ATACT	2	10	159570	159579	40 %	40 %	0 %	20 %	408402825
104	NC_018719	AGGAG	2	10	163982	163991	40 %	0 %	60 %	0 %	408402830
105	NC_018719	GATCA	2	10	165176	165185	40 %	20 %	20 %	20 %	408402831
106	NC_018719	AAAAG	2	10	168731	168740	80 %	0 %	20 %	0 %	408402834
107	NC_018719	AGTAT	2	10	175047	175056	40 %	40 %	20 %	0 %	408402842
108	NC_018719	TATGC	2	10	176477	176486	20 %	40 %	20 %	20 %	408402844
109	NC_018719	TCCGT	2	10	178520	178529	0 %	40 %	20 %	40 %	408402846
110	NC_018719	TGCAA	2	10	178782	178791	40 %	20 %	20 %	20 %	408402846
111	NC_018719	TTTCA	2	10	183545	183554	20 %	60 %	0 %	20 %	408402852
112	NC_018719	ATTCA	2	10	184059	184068	40 %	40 %	0 %	20 %	408402853
113	NC_018719	AGGGT	2	10	184087	184096	20 %	20 %	60 %	0 %	408402853
114	NC_018719	GAAAA	2	10	184145	184154	80 %	0 %	20 %	0 %	408402853
115	NC_018719	TCTTG	2	10	184512	184521	0 %	60 %	20 %	20 %	408402853
116	NC_018719	AAAGC	2	10	184798	184807	60 %	0 %	20 %	20 %	408402853
117	NC_018719	AAATA	2	10	185019	185028	80 %	20 %	0 %	0 %	408402854
118	NC_018719	GATAT	2	10	185245	185254	40 %	40 %	20 %	0 %	408402855
119	NC_018719	TCTCT	2	10	185310	185319	0 %	60 %	0 %	40 %	408402855
120	NC_018719	CGAGC	2	10	185918	185927	20 %	0 %	40 %	40 %	408402857
121	NC_018719	ACAGA	2	10	189562	189571	60 %	0 %	20 %	20 %	408402866
122	NC_018719	GCAGA	2	10	192167	192176	40 %	0 %	40 %	20 %	408402872
123	NC_018719	CCGCA	2	10	193970	193979	20 %	0 %	20 %	60 %	408402873
124	NC_018719	AAGAA	2	10	194750	194759	80 %	0 %	20 %	0 %	408402875
125	NC_018719	GAACA	2	10	196459	196468	60 %	0 %	20 %	20 %	408402878
126	NC_018719	AAGGT	2	10	199426	199435	40 %	20 %	40 %	0 %	408402883
127	NC_018719	GCCCT	2	10	203391	203400	0 %	20 %	20 %	60 %	408402892
128	NC_018719	ACCGC	2	10	204109	204118	20 %	0 %	20 %	60 %	408402892
129	NC_018719	TTATC	2	10	204253	204262	20 %	60 %	0 %	20 %	408402892
130	NC_018719	ATAGT	2	10	205306	205315	40 %	40 %	20 %	0 %	408402893
131	NC_018719	CCTGC	2	10	206201	206210	0 %	20 %	20 %	60 %	408402893
132	NC_018719	GTCGC	2	10	206552	206561	0 %	20 %	40 %	40 %	408402895
133	NC_018719	GGGAA	2	10	206981	206990	40 %	0 %	60 %	0 %	408402895
134	NC_018719	GGCTC	2	10	207170	207179	0 %	20 %	40 %	40 %	408402895
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142	NC_018719	CCTGA	2	10	222866	222875	20 %	20 %	20 %	40 %	408402912
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156	NC_018719	ATGCT	2	10	253312	253321	20 %	40 %	20 %	20 %	408402955
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164	NC_018719	ATGCT	2	10	271041	271050	20 %	40 %	20 %	20 %	408402986
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169	NC_018719	TTCGT	2	10	290011	290020	0 %	60 %	20 %	20 %	408403006
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259	NC_018719	TAGTA	2	10	449462	449471	40 %	40 %	20 %	0 %	408403214
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261	NC_018719	GAATG	2	10	457867	457876	40 %	20 %	40 %	0 %	408403221
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