MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 45806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018719	CT	3	6	234440	234445	0 %	50 %	0 %	50 %	408402927
4002	NC_018719	GCG	2	6	234497	234502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402927
4003	NC_018719	GCA	2	6	234650	234655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402928
4004	NC_018719	TGTC	2	8	234738	234745	0 %	50 %	25 %	25 %	408402928
4005	NC_018719	T	6	6	234853	234858	0 %	100 %	0 %	0 %	408402929
4006	NC_018719	GTAC	2	8	234877	234884	25 %	25 %	25 %	25 %	408402929
4007	NC_018719	CAG	2	6	234908	234913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402929
4008	NC_018719	TAT	2	6	234965	234970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402929
4009	NC_018719	CTTGT	2	10	234972	234981	0 %	60 %	20 %	20 %	408402929
4010	NC_018719	TTC	2	6	235013	235018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402929
4011	NC_018719	GTA	2	6	235079	235084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402929
4012	NC_018719	AGC	2	6	235091	235096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402929
4013	NC_018719	A	6	6	235133	235138	100 %	0 %	0 %	0 %	408402929
4014	NC_018719	GTT	2	6	235214	235219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402929
4015	NC_018719	TCT	2	6	235241	235246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402929
4016	NC_018719	CTA	2	6	235781	235786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402930
4017	NC_018719	CT	3	6	235799	235804	0 %	50 %	0 %	50 %	408402930
4018	NC_018719	TGA	2	6	235870	235875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402930
4019	NC_018719	TGGT	2	8	235881	235888	0 %	50 %	50 %	0 %	408402930
4020	NC_018719	CGT	2	6	235924	235929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402930
4021	NC_018719	GCG	2	6	235983	235988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402930
4022	NC_018719	TGT	2	6	236074	236079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402930
4023	NC_018719	CCT	2	6	236143	236148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402930
4024	NC_018719	ACGTCG	2	12	236169	236180	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408402930
4025	NC_018719	GTG	2	6	236246	236251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402930
4026	NC_018719	CA	3	6	236305	236310	50 %	0 %	0 %	50 %	408402930
4027	NC_018719	GC	3	6	236326	236331	0 %	0 %	50 %	50 %	408402930
4028	NC_018719	GGC	2	6	236349	236354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402930
4029	NC_018719	GTA	2	6	236402	236407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402930
4030	NC_018719	GAT	2	6	236428	236433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402930
4031	NC_018719	GCT	2	6	236470	236475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402930
4032	NC_018719	CCT	2	6	236618	236623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402930
4033	NC_018719	AC	3	6	236637	236642	50 %	0 %	0 %	50 %	408402930
4034	NC_018719	TTC	2	6	236715	236720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402930
4035	NC_018719	GTCT	2	8	236770	236777	0 %	50 %	25 %	25 %	408402930
4036	NC_018719	GGC	2	6	236786	236791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402930
4037	NC_018719	CTG	2	6	236801	236806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402930
4038	NC_018719	CAAGCC	2	12	236812	236823	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408402930
4039	NC_018719	GAA	2	6	237711	237716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402931
4040	NC_018719	GCC	2	6	237797	237802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402931
4041	NC_018719	ATG	2	6	237905	237910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402932
4042	NC_018719	A	6	6	237946	237951	100 %	0 %	0 %	0 %	408402932
4043	NC_018719	AAT	2	6	238041	238046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402932
4044	NC_018719	A	6	6	238090	238095	100 %	0 %	0 %	0 %	408402932
4045	NC_018719	AAG	2	6	238136	238141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402932
4046	NC_018719	TGG	2	6	238149	238154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402932
4047	NC_018719	TAT	2	6	238229	238234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402933
4048	NC_018719	AAC	2	6	238271	238276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402933
4049	NC_018719	GATA	2	8	238297	238304	50 %	25 %	25 %	0 %	408402933
4050	NC_018719	TTG	2	6	238335	238340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402933
4051	NC_018719	CAG	3	9	238392	238400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402933
4052	NC_018719	GCT	2	6	238510	238515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402933
4053	NC_018719	ATT	2	6	238536	238541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402933
4054	NC_018719	AATC	2	8	238614	238621	50 %	25 %	0 %	25 %	408402934
4055	NC_018719	GCAAA	2	10	238701	238710	60 %	0 %	20 %	20 %	408402934
4056	NC_018719	GCA	2	6	238721	238726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402934
4057	NC_018719	AAT	2	6	238752	238757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402934
4058	NC_018719	TAC	2	6	239026	239031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402934
4059	NC_018719	CTA	2	6	239170	239175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402935
4060	NC_018719	GA	4	8	239214	239221	50 %	0 %	50 %	0 %	408402935
4061	NC_018719	CAAACG	2	12	239292	239303	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408402935
4062	NC_018719	AGG	2	6	239316	239321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402935
4063	NC_018719	CCG	2	6	239510	239515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402936
4064	NC_018719	GCC	2	6	239516	239521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402936
4065	NC_018719	ACA	2	6	239576	239581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402936
4066	NC_018719	GC	3	6	239593	239598	0 %	0 %	50 %	50 %	408402936
4067	NC_018719	AAG	2	6	239612	239617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
4068	NC_018719	AAG	2	6	239621	239626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
4069	NC_018719	GGCG	2	8	239636	239643	0 %	0 %	75 %	25 %	408402936
4070	NC_018719	CGG	2	6	239677	239682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402936
4071	NC_018719	TGA	2	6	239692	239697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402936
4072	NC_018719	CACG	2	8	239745	239752	25 %	0 %	25 %	50 %	408402936
4073	NC_018719	AAGG	2	8	239822	239829	50 %	0 %	50 %	0 %	408402936
4074	NC_018719	AGA	2	6	239862	239867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
4075	NC_018719	CGG	2	6	239874	239879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402936
4076	NC_018719	GAA	3	9	239915	239923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
4077	NC_018719	ATCT	2	8	240029	240036	25 %	50 %	0 %	25 %	408402936
4078	NC_018719	AAC	2	6	240079	240084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402936
4079	NC_018719	CAAT	2	8	240149	240156	50 %	25 %	0 %	25 %	408402936
4080	NC_018719	GAA	2	6	240275	240280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
4081	NC_018719	TGGCTT	2	12	240513	240524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	408402936
4082	NC_018719	CGA	2	6	240601	240606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402936
4083	NC_018719	CAT	2	6	240619	240624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402936
4084	NC_018719	AGC	2	6	240643	240648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402936
4085	NC_018719	AGA	2	6	240668	240673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402936
4086	NC_018719	AT	3	6	240865	240870	50 %	50 %	0 %	0 %	408402936
4087	NC_018719	GCG	2	6	240903	240908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402936
4088	NC_018719	GGAGC	2	10	240922	240931	20 %	0 %	60 %	20 %	408402936
4089	NC_018719	TATGAT	2	12	240935	240946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408402936
4090	NC_018719	TCG	2	6	241177	241182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402937
4091	NC_018719	CTA	2	6	241194	241199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402937
4092	NC_018719	A	8	8	241283	241290	100 %	0 %	0 %	0 %	408402937
4093	NC_018719	CTA	3	9	241495	241503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402937
4094	NC_018719	CAA	2	6	241516	241521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402937
4095	NC_018719	A	6	6	241536	241541	100 %	0 %	0 %	0 %	408402937
4096	NC_018719	GAA	2	6	241641	241646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402937
4097	NC_018719	ACA	2	6	241707	241712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402937
4098	NC_018719	ATTGTG	2	12	241741	241752	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408402937
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4100	NC_018719	AGAA	2	8	241901	241908	75 %	0 %	25 %	0 %	408402938
4101	NC_018719	CAT	2	6	241921	241926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402938
4102	NC_018719	CGG	2	6	241984	241989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402938
4103	NC_018719	GCG	2	6	242042	242047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402938
4104	NC_018719	TAC	2	6	242060	242065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402938
4105	NC_018719	GAA	2	6	242084	242089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402938
4106	NC_018719	GAT	2	6	242173	242178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402938
4107	NC_018719	AAT	2	6	242230	242235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402938
4108	NC_018719	AGG	2	6	242252	242257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402938
4109	NC_018719	ACA	2	6	242357	242362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402939
4110	NC_018719	CAAGGG	2	12	242379	242390	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408402939
4111	NC_018719	AGG	2	6	242437	242442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402939
4112	NC_018719	ACAA	2	8	242471	242478	75 %	0 %	0 %	25 %	408402939
4113	NC_018719	GAA	2	6	242499	242504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402939
4114	NC_018719	CGC	2	6	242574	242579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402939
4115	NC_018719	AGG	2	6	242609	242614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402939
4116	NC_018719	AAG	2	6	242939	242944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402940
4117	NC_018719	AGG	2	6	243009	243014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402940
4118	NC_018719	GCTT	2	8	243019	243026	0 %	50 %	25 %	25 %	408402940
4119	NC_018719	TGCAA	2	10	243661	243670	40 %	20 %	20 %	20 %	408402941
4120	NC_018719	A	6	6	243684	243689	100 %	0 %	0 %	0 %	408402941
4121	NC_018719	AGT	2	6	243761	243766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402941
4122	NC_018719	CAA	2	6	243846	243851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402942
4123	NC_018719	GAT	2	6	243859	243864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402942
4124	NC_018719	ACA	2	6	243865	243870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402942
4125	NC_018719	TCTA	2	8	243887	243894	25 %	50 %	0 %	25 %	408402942
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4128	NC_018719	A	6	6	243958	243963	100 %	0 %	0 %	0 %	408402942
4129	NC_018719	ACT	2	6	243983	243988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402942
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4131	NC_018719	AAAT	2	8	244119	244126	75 %	25 %	0 %	0 %	408402942
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4163	NC_018719	ATT	2	6	246153	246158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402944
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4226	NC_018719	ACA	2	6	250736	250741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402952
4227	NC_018719	TGT	2	6	250758	250763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402952
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4234	NC_018719	CAAT	2	8	251656	251663	50 %	25 %	0 %	25 %	408402954
4235	NC_018719	GAC	2	6	251673	251678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402954
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4239	NC_018719	CA	3	6	252025	252030	50 %	0 %	0 %	50 %	408402954
4240	NC_018719	CAT	2	6	252149	252154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402954
4241	NC_018719	TTG	2	6	252216	252221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402954
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4243	NC_018719	CAT	2	6	252290	252295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402954
4244	NC_018719	AAT	2	6	252710	252715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402955
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4246	NC_018719	TGT	2	6	252749	252754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402955
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4262	NC_018719	ATGCT	2	10	253312	253321	20 %	40 %	20 %	20 %	408402955
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4273	NC_018719	GGA	2	6	254321	254326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402957
4274	NC_018719	TGCA	2	8	254349	254356	25 %	25 %	25 %	25 %	408402957
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4358	NC_018719	GCG	2	6	259966	259971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402966
4359	NC_018719	GGAGC	2	10	259985	259994	20 %	0 %	60 %	20 %	408402966
4360	NC_018719	TATGAT	2	12	259998	260009	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	408402966
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