MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 45806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018719	GCC	2	6	176022	176027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402844
3002	NC_018719	CTGC	2	8	176043	176050	0 %	25 %	25 %	50 %	408402844
3003	NC_018719	TGA	2	6	176137	176142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402844
3004	NC_018719	ATC	2	6	176160	176165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402844
3005	NC_018719	TCA	2	6	176250	176255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402844
3006	NC_018719	TGC	2	6	176369	176374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402844
3007	NC_018719	CTG	2	6	176438	176443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402844
3008	NC_018719	TC	3	6	176450	176455	0 %	50 %	0 %	50 %	408402844
3009	NC_018719	ATGGCT	2	12	176465	176476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408402844
3010	NC_018719	TATGC	2	10	176477	176486	20 %	40 %	20 %	20 %	408402844
3011	NC_018719	CT	3	6	176553	176558	0 %	50 %	0 %	50 %	408402844
3012	NC_018719	AG	3	6	176573	176578	50 %	0 %	50 %	0 %	408402844
3013	NC_018719	GC	3	6	176652	176657	0 %	0 %	50 %	50 %	408402844
3014	NC_018719	ACC	2	6	176742	176747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402844
3015	NC_018719	TCA	2	6	177025	177030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402845
3016	NC_018719	GCG	2	6	177102	177107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402845
3017	NC_018719	CCA	2	6	177138	177143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402845
3018	NC_018719	CT	3	6	177164	177169	0 %	50 %	0 %	50 %	408402845
3019	NC_018719	GCC	2	6	177206	177211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402845
3020	NC_018719	GCTT	2	8	177321	177328	0 %	50 %	25 %	25 %	408402845
3021	NC_018719	CGCCGG	2	12	177529	177540	0 %	0 %	50 %	50 %	408402845
3022	NC_018719	CGG	2	6	177562	177567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402845
3023	NC_018719	ACCG	2	8	177607	177614	25 %	0 %	25 %	50 %	408402845
3024	NC_018719	CAAG	2	8	177616	177623	50 %	0 %	25 %	25 %	408402845
3025	NC_018719	CAG	2	6	177710	177715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402845
3026	NC_018719	GGAA	2	8	177735	177742	50 %	0 %	50 %	0 %	408402845
3027	NC_018719	GCCTTC	2	12	177773	177784	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408402845
3028	NC_018719	AGC	2	6	178014	178019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3029	NC_018719	GCA	2	6	178075	178080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3030	NC_018719	GCT	2	6	178083	178088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3031	NC_018719	CGT	2	6	178144	178149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3032	NC_018719	TCA	2	6	178173	178178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402846
3033	NC_018719	ACT	2	6	178247	178252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402846
3034	NC_018719	GCA	2	6	178275	178280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3035	NC_018719	TTC	2	6	178348	178353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402846
3036	NC_018719	TTCC	2	8	178411	178418	0 %	50 %	0 %	50 %	408402846
3037	NC_018719	TTC	2	6	178466	178471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402846
3038	NC_018719	TCCGT	2	10	178520	178529	0 %	40 %	20 %	40 %	408402846
3039	NC_018719	GAC	2	6	178591	178596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3040	NC_018719	CGA	2	6	178665	178670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3041	NC_018719	AGT	2	6	178672	178677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402846
3042	NC_018719	TGTT	2	8	178691	178698	0 %	75 %	25 %	0 %	408402846
3043	NC_018719	TCC	2	6	178719	178724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402846
3044	NC_018719	CCA	2	6	178765	178770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402846
3045	NC_018719	TGCAA	2	10	178782	178791	40 %	20 %	20 %	20 %	408402846
3046	NC_018719	TGT	2	6	178800	178805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402846
3047	NC_018719	GCT	2	6	178830	178835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3048	NC_018719	TGC	2	6	178914	178919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402846
3049	NC_018719	CCAT	2	8	178938	178945	25 %	25 %	0 %	50 %	408402846
3050	NC_018719	TCT	2	6	179174	179179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402847
3051	NC_018719	GCC	2	6	179233	179238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402847
3052	NC_018719	TCT	2	6	179239	179244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402847
3053	NC_018719	TAC	2	6	179298	179303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402847
3054	NC_018719	GCG	2	6	179305	179310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402847
3055	NC_018719	TAT	2	6	179445	179450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402847
3056	NC_018719	TC	3	6	179577	179582	0 %	50 %	0 %	50 %	408402847
3057	NC_018719	TCCCCC	2	12	179592	179603	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	408402847
3058	NC_018719	TTG	2	6	179624	179629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402847
3059	NC_018719	GCC	2	6	179671	179676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402847
3060	NC_018719	CT	3	6	179697	179702	0 %	50 %	0 %	50 %	408402847
3061	NC_018719	AG	3	6	179801	179806	50 %	0 %	50 %	0 %	408402847
3062	NC_018719	CAA	2	6	179832	179837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402847
3063	NC_018719	CTT	2	6	179906	179911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402847
3064	NC_018719	TC	3	6	179983	179988	0 %	50 %	0 %	50 %	408402847
3065	NC_018719	TTA	2	6	180038	180043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402847
3066	NC_018719	TGG	2	6	180063	180068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402847
3067	NC_018719	GCA	2	6	180098	180103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402847
3068	NC_018719	CAA	2	6	180158	180163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402847
3069	NC_018719	GCT	2	6	180178	180183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402847
3070	NC_018719	GAAT	2	8	180226	180233	50 %	25 %	25 %	0 %	408402847
3071	NC_018719	TCT	2	6	180303	180308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402847
3072	NC_018719	CCAT	2	8	180379	180386	25 %	25 %	0 %	50 %	408402847
3073	NC_018719	ACA	2	6	180392	180397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402847
3074	NC_018719	ACT	2	6	180406	180411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402847
3075	NC_018719	CTT	2	6	180434	180439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402847
3076	NC_018719	CT	3	6	180440	180445	0 %	50 %	0 %	50 %	408402847
3077	NC_018719	TCG	2	6	180466	180471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402847
3078	NC_018719	ATGG	2	8	180481	180488	25 %	25 %	50 %	0 %	408402847
3079	NC_018719	GC	3	6	180525	180530	0 %	0 %	50 %	50 %	408402847
3080	NC_018719	TAA	2	6	180578	180583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402847
3081	NC_018719	AGCA	2	8	180615	180622	50 %	0 %	25 %	25 %	408402847
3082	NC_018719	CAG	2	6	180651	180656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402847
3083	NC_018719	CTTG	2	8	180831	180838	0 %	50 %	25 %	25 %	408402847
3084	NC_018719	CGGG	2	8	180857	180864	0 %	0 %	75 %	25 %	408402847
3085	NC_018719	ACT	2	6	180874	180879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402847
3086	NC_018719	GCC	2	6	180894	180899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402847
3087	NC_018719	AT	3	6	180961	180966	50 %	50 %	0 %	0 %	408402847
3088	NC_018719	GGC	2	6	180979	180984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402847
3089	NC_018719	CTTT	2	8	181034	181041	0 %	75 %	0 %	25 %	408402847
3090	NC_018719	ATT	2	6	181074	181079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402847
3091	NC_018719	TCA	2	6	181082	181087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402847
3092	NC_018719	T	6	6	181108	181113	0 %	100 %	0 %	0 %	408402847
3093	NC_018719	GCT	2	6	181189	181194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402847
3094	NC_018719	AATC	2	8	181220	181227	50 %	25 %	0 %	25 %	408402847
3095	NC_018719	AGG	2	6	181429	181434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402848
3096	NC_018719	TCT	2	6	181459	181464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402848
3097	NC_018719	CTA	2	6	181599	181604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402848
3098	NC_018719	AGT	2	6	182157	182162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402849
3099	NC_018719	TCA	2	6	182197	182202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402849
3100	NC_018719	TGCG	2	8	182204	182211	0 %	25 %	50 %	25 %	408402849
3101	NC_018719	GAA	2	6	182248	182253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402849
3102	NC_018719	ATT	2	6	182333	182338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402849
3103	NC_018719	GAAA	2	8	182347	182354	75 %	0 %	25 %	0 %	408402849
3104	NC_018719	CTG	2	6	182381	182386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402849
3105	NC_018719	ACC	2	6	182417	182422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402849
3106	NC_018719	TTC	2	6	182457	182462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402849
3107	NC_018719	AG	3	6	182500	182505	50 %	0 %	50 %	0 %	408402849
3108	NC_018719	GCT	2	6	182556	182561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402849
3109	NC_018719	CTT	2	6	182813	182818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402850
3110	NC_018719	TGC	2	6	182877	182882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402850
3111	NC_018719	ATC	2	6	182926	182931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402850
3112	NC_018719	CT	3	6	183002	183007	0 %	50 %	0 %	50 %	408402850
3113	NC_018719	TA	3	6	183219	183224	50 %	50 %	0 %	0 %	408402851
3114	NC_018719	ATC	2	6	183264	183269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402851
3115	NC_018719	TAT	2	6	183270	183275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402851
3116	NC_018719	GGC	2	6	183450	183455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402852
3117	NC_018719	GCA	2	6	183469	183474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402852
3118	NC_018719	TTTCA	2	10	183545	183554	20 %	60 %	0 %	20 %	408402852
3119	NC_018719	TGCT	2	8	183596	183603	0 %	50 %	25 %	25 %	408402852
3120	NC_018719	CAG	2	6	183958	183963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402853
3121	NC_018719	ATC	2	6	184017	184022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402853
3122	NC_018719	ATTCA	2	10	184059	184068	40 %	40 %	0 %	20 %	408402853
3123	NC_018719	AGGGT	2	10	184087	184096	20 %	20 %	60 %	0 %	408402853
3124	NC_018719	GAAAA	2	10	184145	184154	80 %	0 %	20 %	0 %	408402853
3125	NC_018719	AATG	2	8	184188	184195	50 %	25 %	25 %	0 %	408402853
3126	NC_018719	ATGC	2	8	184264	184271	25 %	25 %	25 %	25 %	408402853
3127	NC_018719	CTAT	2	8	184338	184345	25 %	50 %	0 %	25 %	408402853
3128	NC_018719	GCT	2	6	184405	184410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402853
3129	NC_018719	AG	3	6	184426	184431	50 %	0 %	50 %	0 %	408402853
3130	NC_018719	TCTTG	2	10	184512	184521	0 %	60 %	20 %	20 %	408402853
3131	NC_018719	AAAGC	2	10	184798	184807	60 %	0 %	20 %	20 %	408402853
3132	NC_018719	GAT	2	6	184853	184858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402854
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3135	NC_018719	AAATA	2	10	185019	185028	80 %	20 %	0 %	0 %	408402854
3136	NC_018719	CAA	2	6	185038	185043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402854
3137	NC_018719	GATAT	2	10	185245	185254	40 %	40 %	20 %	0 %	408402855
3138	NC_018719	TCTCT	2	10	185310	185319	0 %	60 %	0 %	40 %	408402855
3139	NC_018719	CCT	2	6	185470	185475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402856
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3141	NC_018719	GATA	2	8	185724	185731	50 %	25 %	25 %	0 %	408402857
3142	NC_018719	AT	3	6	185872	185877	50 %	50 %	0 %	0 %	408402857
3143	NC_018719	CGAGC	2	10	185918	185927	20 %	0 %	40 %	40 %	408402857
3144	NC_018719	AGC	2	6	185992	185997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402857
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3146	NC_018719	CCT	2	6	186355	186360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402858
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3149	NC_018719	TCTT	2	8	186784	186791	0 %	75 %	0 %	25 %	408402859
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3152	NC_018719	T	6	6	186877	186882	0 %	100 %	0 %	0 %	408402859
3153	NC_018719	TCCT	2	8	187024	187031	0 %	50 %	0 %	50 %	408402860
3154	NC_018719	TCTA	2	8	187075	187082	25 %	50 %	0 %	25 %	408402860
3155	NC_018719	AAT	2	6	187094	187099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402860
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3157	NC_018719	GTT	2	6	187240	187245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402860
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3159	NC_018719	TTC	2	6	187360	187365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402860
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3161	NC_018719	TC	3	6	187734	187739	0 %	50 %	0 %	50 %	408402861
3162	NC_018719	TAT	2	6	187773	187778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402861
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3182	NC_018719	TCC	2	6	189098	189103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402865
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3231	NC_018719	A	6	6	192176	192181	100 %	0 %	0 %	0 %	408402872
3232	NC_018719	GTC	2	6	192237	192242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402872
3233	NC_018719	ACT	2	6	192313	192318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402872
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3237	NC_018719	TAG	2	6	192520	192525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402872
3238	NC_018719	CGA	2	6	192548	192553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402872
3239	NC_018719	ACG	2	6	192580	192585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402872
3240	NC_018719	CGC	2	6	192640	192645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402872
3241	NC_018719	CCG	2	6	192648	192653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402872
3242	NC_018719	CA	3	6	192678	192683	50 %	0 %	0 %	50 %	408402872
3243	NC_018719	AGA	2	6	192710	192715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402872
3244	NC_018719	GGCA	2	8	192833	192840	25 %	0 %	50 %	25 %	408402872
3245	NC_018719	TG	3	6	192843	192848	0 %	50 %	50 %	0 %	408402872
3246	NC_018719	TCG	2	6	192871	192876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402872
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3249	NC_018719	GCGA	2	8	193106	193113	25 %	0 %	50 %	25 %	408402872
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3277	NC_018719	CGA	2	6	194873	194878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402875
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3353	NC_018719	GGC	2	6	199955	199960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402884
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3359	NC_018719	GAAA	2	8	200438	200445	75 %	0 %	25 %	0 %	408402885
3360	NC_018719	GCT	2	6	200469	200474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402885
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3362	NC_018719	GAC	2	6	200599	200604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402885
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3367	NC_018719	CCG	2	6	200714	200719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402885
3368	NC_018719	GTA	3	9	200758	200766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402885
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3481	NC_018719	AGCC	2	8	206521	206528	25 %	0 %	25 %	50 %	408402895
3482	NC_018719	GTCGC	2	10	206552	206561	0 %	20 %	40 %	40 %	408402895
3483	NC_018719	CAT	2	6	206587	206592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402895
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3486	NC_018719	CCA	2	6	206703	206708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402895
3487	NC_018719	TGC	2	6	206733	206738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402895
3488	NC_018719	CGA	2	6	206740	206745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402895
3489	NC_018719	GC	3	6	206754	206759	0 %	0 %	50 %	50 %	408402895
3490	NC_018719	GCC	2	6	206791	206796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402895
3491	NC_018719	CCG	2	6	206799	206804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402895
3492	NC_018719	GTC	2	6	206875	206880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402895
3493	NC_018719	TCA	2	6	206892	206897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402895
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3495	NC_018719	CCT	2	6	206940	206945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402895
3496	NC_018719	GGGAA	2	10	206981	206990	40 %	0 %	60 %	0 %	408402895
3497	NC_018719	GTC	2	6	207028	207033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402895
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3499	NC_018719	CGT	2	6	207096	207101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402895
3500	NC_018719	CG	3	6	207115	207120	0 %	0 %	50 %	50 %	408402895

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