MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 45806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018719	CGGC	2	8	147722	147729	0 %	0 %	50 %	50 %	408402811
2502	NC_018719	GGT	2	6	147797	147802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402811
2503	NC_018719	AGA	2	6	147808	147813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402811
2504	NC_018719	GCA	2	6	147849	147854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402811
2505	NC_018719	CGGCA	2	10	147875	147884	20 %	0 %	40 %	40 %	408402811
2506	NC_018719	TCC	2	6	147889	147894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402811
2507	NC_018719	CGGGC	2	10	148148	148157	0 %	0 %	60 %	40 %	408402811
2508	NC_018719	TACC	2	8	148169	148176	25 %	25 %	0 %	50 %	408402811
2509	NC_018719	CTC	2	6	148227	148232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402811
2510	NC_018719	AAT	2	6	148334	148339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402811
2511	NC_018719	CGAC	2	8	148372	148379	25 %	0 %	25 %	50 %	408402811
2512	NC_018719	CAG	2	6	148522	148527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402811
2513	NC_018719	ATC	2	6	148532	148537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402811
2514	NC_018719	GAT	2	6	148547	148552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402811
2515	NC_018719	GTA	2	6	148557	148562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402811
2516	NC_018719	TAG	2	6	148563	148568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402811
2517	NC_018719	TGC	2	6	148616	148621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402812
2518	NC_018719	CAC	2	6	148623	148628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402812
2519	NC_018719	AAT	2	6	148633	148638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402812
2520	NC_018719	GCAA	2	8	148661	148668	50 %	0 %	25 %	25 %	408402812
2521	NC_018719	GAAC	2	8	148694	148701	50 %	0 %	25 %	25 %	408402812
2522	NC_018719	GAGTTT	2	12	148702	148713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	408402812
2523	NC_018719	ACA	2	6	148721	148726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402812
2524	NC_018719	CCA	2	6	148731	148736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402812
2525	NC_018719	GGC	2	6	148864	148869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402812
2526	NC_018719	TGC	2	6	148914	148919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402812
2527	NC_018719	AAG	2	6	148939	148944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402812
2528	NC_018719	ACG	2	6	149057	149062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402812
2529	NC_018719	GCG	2	6	149088	149093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402813
2530	NC_018719	GCG	2	6	149138	149143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402813
2531	NC_018719	AGC	2	6	149193	149198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402813
2532	NC_018719	GCT	2	6	149211	149216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402813
2533	NC_018719	CG	3	6	149255	149260	0 %	0 %	50 %	50 %	408402813
2534	NC_018719	CCG	2	6	149288	149293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402813
2535	NC_018719	GCA	2	6	149299	149304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402813
2536	NC_018719	CCT	2	6	149314	149319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402813
2537	NC_018719	T	7	7	149431	149437	0 %	100 %	0 %	0 %	408402813
2538	NC_018719	CTT	2	6	149655	149660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402813
2539	NC_018719	AGG	2	6	149667	149672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402813
2540	NC_018719	TGCC	2	8	149686	149693	0 %	25 %	25 %	50 %	408402813
2541	NC_018719	T	6	6	149718	149723	0 %	100 %	0 %	0 %	408402813
2542	NC_018719	GGT	2	6	149776	149781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402813
2543	NC_018719	CGT	3	9	149809	149817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402813
2544	NC_018719	TCAA	2	8	149830	149837	50 %	25 %	0 %	25 %	408402813
2545	NC_018719	CTT	2	6	149927	149932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402814
2546	NC_018719	TCA	2	6	150012	150017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402814
2547	NC_018719	GACC	2	8	150026	150033	25 %	0 %	25 %	50 %	408402814
2548	NC_018719	CAT	2	6	150043	150048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402814
2549	NC_018719	TCA	2	6	150073	150078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402814
2550	NC_018719	CTT	2	6	150089	150094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402814
2551	NC_018719	GAA	2	6	150152	150157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402814
2552	NC_018719	GC	3	6	150238	150243	0 %	0 %	50 %	50 %	408402814
2553	NC_018719	GCC	2	6	150273	150278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402814
2554	NC_018719	GTCTGG	2	12	150338	150349	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408402814
2555	NC_018719	GA	3	6	150395	150400	50 %	0 %	50 %	0 %	408402814
2556	NC_018719	TTGTG	2	10	150537	150546	0 %	60 %	40 %	0 %	408402815
2557	NC_018719	GAGC	2	8	150565	150572	25 %	0 %	50 %	25 %	408402815
2558	NC_018719	CTT	2	6	150628	150633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402815
2559	NC_018719	CGC	2	6	150658	150663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402815
2560	NC_018719	GCC	3	9	150931	150939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402815
2561	NC_018719	ATT	2	6	150944	150949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402815
2562	NC_018719	GC	3	6	150981	150986	0 %	0 %	50 %	50 %	408402815
2563	NC_018719	CGA	2	6	151015	151020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402815
2564	NC_018719	CAT	2	6	151027	151032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402815
2565	NC_018719	CTGC	2	8	151074	151081	0 %	25 %	25 %	50 %	408402815
2566	NC_018719	GC	3	6	151101	151106	0 %	0 %	50 %	50 %	408402815
2567	NC_018719	TGCA	2	8	151168	151175	25 %	25 %	25 %	25 %	408402815
2568	NC_018719	TCAGA	2	10	151215	151224	40 %	20 %	20 %	20 %	408402815
2569	NC_018719	CGT	2	6	151311	151316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402815
2570	NC_018719	CT	3	6	151354	151359	0 %	50 %	0 %	50 %	408402815
2571	NC_018719	GCC	2	6	151411	151416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402815
2572	NC_018719	ATC	2	6	151451	151456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402815
2573	NC_018719	TGG	2	6	151491	151496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402815
2574	NC_018719	CTG	2	6	151537	151542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402815
2575	NC_018719	GCA	2	6	151554	151559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402815
2576	NC_018719	CGC	2	6	151594	151599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402815
2577	NC_018719	TTG	2	6	151629	151634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402815
2578	NC_018719	ATC	2	6	151638	151643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402816
2579	NC_018719	CCTGT	2	10	151653	151662	0 %	40 %	20 %	40 %	408402816
2580	NC_018719	CGG	2	6	151666	151671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402816
2581	NC_018719	AAAC	2	8	151681	151688	75 %	0 %	0 %	25 %	408402816
2582	NC_018719	AAT	2	6	151838	151843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402816
2583	NC_018719	CAG	2	6	151846	151851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402816
2584	NC_018719	AGGCA	2	10	151906	151915	40 %	0 %	40 %	20 %	408402816
2585	NC_018719	TAGA	2	8	151935	151942	50 %	25 %	25 %	0 %	408402816
2586	NC_018719	TC	3	6	151963	151968	0 %	50 %	0 %	50 %	408402816
2587	NC_018719	CCA	2	6	151996	152001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402816
2588	NC_018719	GCCGG	2	10	152039	152048	0 %	0 %	60 %	40 %	408402816
2589	NC_018719	GTC	2	6	152060	152065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402816
2590	NC_018719	TCG	2	6	152196	152201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402816
2591	NC_018719	CGG	2	6	152287	152292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402816
2592	NC_018719	GCA	2	6	152328	152333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402816
2593	NC_018719	ACC	2	6	152340	152345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402816
2594	NC_018719	TGC	2	6	152383	152388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402816
2595	NC_018719	CTA	2	6	152410	152415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402816
2596	NC_018719	GTC	2	6	152429	152434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402816
2597	NC_018719	CGC	2	6	152446	152451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402817
2598	NC_018719	ACC	2	6	152586	152591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402817
2599	NC_018719	GCA	2	6	152653	152658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402817
2600	NC_018719	GTT	2	6	152726	152731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402817
2601	NC_018719	GTCG	2	8	152769	152776	0 %	25 %	50 %	25 %	408402817
2602	NC_018719	T	6	6	152976	152981	0 %	100 %	0 %	0 %	408402817
2603	NC_018719	TAG	2	6	153024	153029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402817
2604	NC_018719	TGC	2	6	153034	153039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402817
2605	NC_018719	TGC	2	6	153062	153067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402817
2606	NC_018719	TCT	2	6	153090	153095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402817
2607	NC_018719	CCA	2	6	153106	153111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402817
2608	NC_018719	CCGTG	2	10	153166	153175	0 %	20 %	40 %	40 %	408402817
2609	NC_018719	AT	3	6	153218	153223	50 %	50 %	0 %	0 %	408402817
2610	NC_018719	CCA	2	6	153271	153276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402817
2611	NC_018719	GCA	2	6	153422	153427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402817
2612	NC_018719	GC	3	6	153428	153433	0 %	0 %	50 %	50 %	408402817
2613	NC_018719	AGCG	2	8	153435	153442	25 %	0 %	50 %	25 %	408402817
2614	NC_018719	ACC	2	6	153522	153527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402817
2615	NC_018719	GGCA	2	8	153574	153581	25 %	0 %	50 %	25 %	408402817
2616	NC_018719	TTG	2	6	153606	153611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402817
2617	NC_018719	CTA	2	6	153673	153678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402817
2618	NC_018719	GCC	2	6	153690	153695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402817
2619	NC_018719	CTG	2	6	153774	153779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402818
2620	NC_018719	AT	3	6	153930	153935	50 %	50 %	0 %	0 %	408402818
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2622	NC_018719	AGGA	2	8	154026	154033	50 %	0 %	50 %	0 %	408402818
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2744	NC_018719	TCA	2	6	160046	160051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402826
2745	NC_018719	CG	3	6	160054	160059	0 %	0 %	50 %	50 %	408402826
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2750	NC_018719	TAC	2	6	160282	160287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402826
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2752	NC_018719	CAT	2	6	160314	160319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402826
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2857	NC_018719	GA	3	6	166470	166475	50 %	0 %	50 %	0 %	408402832
2858	NC_018719	GCTG	2	8	166485	166492	0 %	25 %	50 %	25 %	408402832
2859	NC_018719	TGC	2	6	166574	166579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402832
2860	NC_018719	AG	4	8	166643	166650	50 %	0 %	50 %	0 %	408402832
2861	NC_018719	ATGACA	2	12	166670	166681	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408402832
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2864	NC_018719	AGG	2	6	166977	166982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402832
2865	NC_018719	GGC	2	6	167200	167205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402832
2866	NC_018719	CAA	2	6	167226	167231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402832
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2870	NC_018719	CGAT	2	8	167517	167524	25 %	25 %	25 %	25 %	408402833
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2983	NC_018719	CGC	2	6	175031	175036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402842
2984	NC_018719	AGTAT	2	10	175047	175056	40 %	40 %	20 %	0 %	408402842
2985	NC_018719	GACG	2	8	175227	175234	25 %	0 %	50 %	25 %	408402843
2986	NC_018719	ATT	2	6	175237	175242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402843
2987	NC_018719	ACT	2	6	175270	175275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402843
2988	NC_018719	AAGG	2	8	175298	175305	50 %	0 %	50 %	0 %	408402843
2989	NC_018719	TGCC	2	8	175314	175321	0 %	25 %	25 %	50 %	408402843
2990	NC_018719	ATG	2	6	175357	175362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402843
2991	NC_018719	ATT	2	6	175416	175421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402843
2992	NC_018719	T	6	6	175512	175517	0 %	100 %	0 %	0 %	408402843
2993	NC_018719	TGA	2	6	175593	175598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402843
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2995	NC_018719	TCCA	2	8	175669	175676	25 %	25 %	0 %	50 %	408402843
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2998	NC_018719	CTG	2	6	175951	175956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402844
2999	NC_018719	CTGC	2	8	175969	175976	0 %	25 %	25 %	50 %	408402844
3000	NC_018719	TCC	2	6	175992	175997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402844

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