MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 chromosome

Total Repeats: 45806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018719	CGG	2	6	27299	27304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402655
502	NC_018719	GATA	2	8	27342	27349	50 %	25 %	25 %	0 %	408402655
503	NC_018719	AATA	2	8	27350	27357	75 %	25 %	0 %	0 %	408402655
504	NC_018719	GC	3	6	27403	27408	0 %	0 %	50 %	50 %	408402656
505	NC_018719	CAG	2	6	27443	27448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402656
506	NC_018719	GCC	2	6	27451	27456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
507	NC_018719	CTG	2	6	27512	27517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
508	NC_018719	ATA	2	6	27604	27609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402656
509	NC_018719	GGA	2	6	27610	27615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402656
510	NC_018719	GCG	2	6	27721	27726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
511	NC_018719	GGC	2	6	27754	27759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
512	NC_018719	CAAA	2	8	27782	27789	75 %	0 %	0 %	25 %	408402656
513	NC_018719	CTG	2	6	27790	27795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
514	NC_018719	AATG	2	8	27814	27821	50 %	25 %	25 %	0 %	408402656
515	NC_018719	GC	3	6	27854	27859	0 %	0 %	50 %	50 %	408402656
516	NC_018719	GCC	2	6	27928	27933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
517	NC_018719	AGAC	2	8	27965	27972	50 %	0 %	25 %	25 %	408402656
518	NC_018719	CGC	2	6	28001	28006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402656
519	NC_018719	GGA	2	6	28051	28056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402656
520	NC_018719	GTC	2	6	28071	28076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
521	NC_018719	GAT	2	6	28102	28107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402656
522	NC_018719	AG	3	6	28148	28153	50 %	0 %	50 %	0 %	408402656
523	NC_018719	TGC	2	6	28161	28166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402656
524	NC_018719	GAC	2	6	28183	28188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402656
525	NC_018719	CGG	2	6	28203	28208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
526	NC_018719	CAA	3	9	28230	28238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402656
527	NC_018719	TCT	2	6	28270	28275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402656
528	NC_018719	GCG	2	6	28309	28314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
529	NC_018719	ACA	2	6	28325	28330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402656
530	NC_018719	GGC	3	9	28345	28353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402656
531	NC_018719	GAT	2	6	28410	28415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402656
532	NC_018719	ACT	2	6	28429	28434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402657
533	NC_018719	T	6	6	28554	28559	0 %	100 %	0 %	0 %	408402657
534	NC_018719	TGT	2	6	28623	28628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402658
535	NC_018719	TGT	2	6	28632	28637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402658
536	NC_018719	CTT	2	6	28748	28753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402658
537	NC_018719	TCA	2	6	28803	28808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402658
538	NC_018719	TGG	2	6	29009	29014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402659
539	NC_018719	CTGC	2	8	29024	29031	0 %	25 %	25 %	50 %	408402659
540	NC_018719	CTGT	2	8	29034	29041	0 %	50 %	25 %	25 %	408402659
541	NC_018719	TGT	2	6	29137	29142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402659
542	NC_018719	ATG	2	6	29181	29186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402659
543	NC_018719	GCT	2	6	29202	29207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402659
544	NC_018719	ATT	2	6	29298	29303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402660
545	NC_018719	AGA	2	6	29424	29429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402660
546	NC_018719	CA	3	6	29461	29466	50 %	0 %	0 %	50 %	408402660
547	NC_018719	TTTGCA	2	12	29473	29484	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408402660
548	NC_018719	TGT	2	6	29513	29518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402660
549	NC_018719	CCTG	2	8	29529	29536	0 %	25 %	25 %	50 %	408402660
550	NC_018719	CA	3	6	29604	29609	50 %	0 %	0 %	50 %	408402660
551	NC_018719	TTC	2	6	29619	29624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402660
552	NC_018719	ATC	2	6	29658	29663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402661
553	NC_018719	GTT	2	6	29675	29680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402661
554	NC_018719	T	6	6	29684	29689	0 %	100 %	0 %	0 %	408402661
555	NC_018719	TCA	2	6	29841	29846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402661
556	NC_018719	TGC	2	6	30201	30206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402662
557	NC_018719	GA	3	6	30230	30235	50 %	0 %	50 %	0 %	408402662
558	NC_018719	GAA	2	6	30284	30289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402662
559	NC_018719	GAA	2	6	30416	30421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402662
560	NC_018719	GTT	2	6	30440	30445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402662
561	NC_018719	AGC	2	6	30465	30470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402662
562	NC_018719	ACC	3	9	30551	30559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402662
563	NC_018719	G	6	6	30658	30663	0 %	0 %	100 %	0 %	408402662
564	NC_018719	TTA	2	6	30720	30725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402662
565	NC_018719	ACC	2	6	30765	30770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402662
566	NC_018719	AGC	2	6	30771	30776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402662
567	NC_018719	AGC	2	6	30878	30883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402662
568	NC_018719	CTC	2	6	30950	30955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402662
569	NC_018719	CAG	2	6	30976	30981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402662
570	NC_018719	GCC	2	6	30985	30990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402662
571	NC_018719	AGA	2	6	31069	31074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402662
572	NC_018719	GCT	2	6	31104	31109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402662
573	NC_018719	GTC	2	6	31154	31159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402662
574	NC_018719	GATAAT	2	12	31231	31242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	408402662
575	NC_018719	ATC	2	6	31243	31248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402662
576	NC_018719	ATG	2	6	31283	31288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402662
577	NC_018719	CGG	2	6	31315	31320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408402662
578	NC_018719	AGA	2	6	31487	31492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402663
579	NC_018719	GAG	2	6	31542	31547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408402663
580	NC_018719	TG	3	6	31578	31583	0 %	50 %	50 %	0 %	408402663
581	NC_018719	TCAT	2	8	31659	31666	25 %	50 %	0 %	25 %	408402663
582	NC_018719	GTT	2	6	31707	31712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402663
583	NC_018719	CGC	2	6	31751	31756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402663
584	NC_018719	GTC	2	6	31829	31834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402664
585	NC_018719	AGC	2	6	31864	31869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402664
586	NC_018719	GC	3	6	31884	31889	0 %	0 %	50 %	50 %	408402664
587	NC_018719	TGG	2	6	31927	31932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402664
588	NC_018719	GC	3	6	31935	31940	0 %	0 %	50 %	50 %	408402664
589	NC_018719	AATG	2	8	32139	32146	50 %	25 %	25 %	0 %	408402665
590	NC_018719	A	6	6	32147	32152	100 %	0 %	0 %	0 %	408402665
591	NC_018719	AAC	2	6	32239	32244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408402665
592	NC_018719	GCA	2	6	32253	32258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402665
593	NC_018719	GCC	2	6	32293	32298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408402665
594	NC_018719	TAC	2	6	32341	32346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408402665
595	NC_018719	GAC	2	6	32368	32373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408402665
596	NC_018719	TCC	2	6	32472	32477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402665
597	NC_018719	ACTAT	2	10	32761	32770	40 %	40 %	0 %	20 %	408402666
598	NC_018719	CTGA	2	8	32853	32860	25 %	25 %	25 %	25 %	408402666
599	NC_018719	AAT	2	6	32968	32973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408402666
600	NC_018719	TTA	2	6	33136	33141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402667
601	NC_018719	CA	3	6	33193	33198	50 %	0 %	0 %	50 %	408402667
602	NC_018719	TCC	2	6	33204	33209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402667
603	NC_018719	TTG	2	6	33296	33301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408402667
604	NC_018719	ATCATA	2	12	33362	33373	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408402667
605	NC_018719	TCG	2	6	33792	33797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402668
606	NC_018719	CCGGC	2	10	33862	33871	0 %	0 %	40 %	60 %	408402668
607	NC_018719	CTG	2	6	33883	33888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402668
608	NC_018719	CTT	2	6	33895	33900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408402668
609	NC_018719	TCC	2	6	33905	33910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408402668
610	NC_018719	CTTCT	2	10	33970	33979	0 %	60 %	0 %	40 %	408402668
611	NC_018719	CAC	2	6	34096	34101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402669
612	NC_018719	TTTC	2	8	34177	34184	0 %	75 %	0 %	25 %	408402669
613	NC_018719	TGG	2	6	34187	34192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408402669
614	NC_018719	TAT	2	6	34260	34265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408402669
615	NC_018719	AGA	3	9	34304	34312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408402669
616	NC_018719	GTA	2	6	34326	34331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402669
617	NC_018719	TGGC	2	8	34398	34405	0 %	25 %	50 %	25 %	408402670
618	NC_018719	GAT	2	6	34452	34457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402670
619	NC_018719	CGT	2	6	34518	34523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408402670
620	NC_018719	GTCA	2	8	34532	34539	25 %	25 %	25 %	25 %	408402670
621	NC_018719	CAATA	2	10	34544	34553	60 %	20 %	0 %	20 %	408402670
622	NC_018719	AGGG	2	8	34684	34691	25 %	0 %	75 %	0 %	408402670
623	NC_018719	GAT	2	6	34735	34740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408402670
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752	NC_018719	ACC	2	6	42719	42724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408402684
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