MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni PT14 chromosome

Total Repeats: 980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018709	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407941474
2	NC_018709	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407941474
3	NC_018709	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407941475
4	NC_018709	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407941475
5	NC_018709	ATGCTA	2	12	9431	9442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407941479
6	NC_018709	ATTTAA	2	12	10235	10246	50 %	50 %	0 %	0 %	407941479
7	NC_018709	ATGGGT	2	12	17170	17181	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407941484
8	NC_018709	TTCATT	2	12	18322	18333	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407941486
9	NC_018709	AAGAAA	2	12	19535	19546	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407941487
10	NC_018709	AAGATA	2	12	20454	20465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407941488
11	NC_018709	AGCAAA	2	12	21237	21248	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407941488
12	NC_018709	TTTTCT	2	12	21744	21755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407941489
13	NC_018709	TTTTAT	2	12	26538	26549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407941493
14	NC_018709	TTATGC	2	12	27600	27611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407941494
15	NC_018709	CTTTAA	2	12	29847	29858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407941495
16	NC_018709	CTATTT	2	12	29967	29978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407941495
17	NC_018709	ATGTGT	2	12	30661	30672	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407941496
18	NC_018709	ATGGAT	2	12	34528	34539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407941499
19	NC_018709	GAAATT	2	12	34737	34748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407941499
20	NC_018709	AACAAA	2	12	44013	44024	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407941501
21	NC_018709	AAATTT	2	12	49087	49098	50 %	50 %	0 %	0 %	407941503
22	NC_018709	GAAAGA	2	12	51008	51019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407941504
23	NC_018709	TTTTTA	2	12	51787	51798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407941504
24	NC_018709	ATGAAA	2	12	54896	54907	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407941507
25	NC_018709	TAAGCT	2	12	55428	55439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407941507
26	NC_018709	AGTTTT	2	12	57610	57621	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407941509
27	NC_018709	TTCTTT	2	12	57826	57837	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407941510
28	NC_018709	CCAATG	2	12	61652	61663	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407941512
29	NC_018709	CAAAAT	2	12	61768	61779	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407941512
30	NC_018709	TTCATC	2	12	62702	62713	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407941513
31	NC_018709	TAATTT	2	12	64496	64507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941515
32	NC_018709	ATTTTA	2	12	64748	64759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941515
33	NC_018709	AAATAT	2	12	65105	65116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941515
34	NC_018709	GTTGGA	2	12	66045	66056	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407941515
35	NC_018709	GTTTTT	2	12	66190	66201	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407941515
36	NC_018709	TACAGC	2	12	68218	68229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407941518
37	NC_018709	CTTTTA	2	12	68372	68383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407941519
38	NC_018709	TAGCTT	2	12	74838	74849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407941529
39	NC_018709	TTCATT	2	12	77197	77208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407941532
40	NC_018709	CATCTT	2	12	78943	78954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407941533
41	NC_018709	TTTAAA	2	12	81362	81373	50 %	50 %	0 %	0 %	407941536
42	NC_018709	CTAGCT	2	12	81794	81805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407941537
43	NC_018709	GAATGA	2	12	82048	82059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407941537
44	NC_018709	GATGCT	2	12	83210	83221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407941538
45	NC_018709	TAAATT	2	12	84924	84935	50 %	50 %	0 %	0 %	407941541
46	NC_018709	TTTTTG	2	12	91787	91798	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407941548
47	NC_018709	GAATTT	2	12	92107	92118	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407941549
48	NC_018709	AACTCA	2	12	92622	92633	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407941549
49	NC_018709	ATTTAT	2	12	94183	94194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941550
50	NC_018709	CTTTAA	2	12	94402	94413	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407941550
51	NC_018709	ATATTT	2	12	95162	95173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407941552
52	NC_018709	GTAACT	2	12	97571	97582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407941554
53	NC_018709	CAGGAA	2	12	98277	98288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407941555
54	NC_018709	TTGTGT	2	12	98863	98874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407941555
55	NC_018709	ATAAAA	2	12	100688	100699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407941556
56	NC_018709	TTAATG	2	12	102905	102916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407941559
57	NC_018709	GCAAGC	2	12	102985	102996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407941559
58	NC_018709	AACTTA	2	12	105723	105734	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407941563
59	NC_018709	GAACTT	2	12	107969	107980	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407941565
60	NC_018709	TTAGAA	2	12	108020	108031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407941565
61	NC_018709	TGGCTG	2	12	108858	108869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407941567
62	NC_018709	AAAAAT	2	12	110323	110334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407941568
63	NC_018709	GGTTTG	2	12	116029	116040	0 %	50 %	50 %	0 %	407941575
64	NC_018709	AAAGAA	2	12	116308	116319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407941576
65	NC_018709	AAAATA	2	12	117840	117851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407941578
66	NC_018709	ATTTTG	2	12	119377	119388	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407941580
67	NC_018709	GAAAAA	2	12	120284	120295	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407941581
68	NC_018709	GTTGTG	2	12	121131	121142	0 %	50 %	50 %	0 %	407941582
69	NC_018709	GGACAT	2	12	121172	121183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407941582
70	NC_018709	TTTGAT	2	12	122757	122768	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407941584
71	NC_018709	TTCTTT	2	12	131899	131910	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407941596
72	NC_018709	GGGCTT	2	12	132578	132589	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407941597
73	NC_018709	AAAGAT	2	12	135650	135661	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407941599
74	NC_018709	TTGTTA	2	12	137738	137749	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407941603
75	NC_018709	AAAGAA	2	12	137877	137888	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407941603
76	NC_018709	GAAAAA	2	12	140572	140583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407941605
77	NC_018709	AGATGA	2	12	140836	140847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407941606
78	NC_018709	CTATAC	2	12	144327	144338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941608
79	NC_018709	TAAGGA	2	12	148696	148707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407941612
80	NC_018709	TTTTAC	2	12	150711	150722	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407941613
81	NC_018709	CTGCTC	2	12	152587	152598	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407941616
82	NC_018709	ATTTTC	2	12	153509	153520	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407941617
83	NC_018709	AAAACT	2	12	156548	156559	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407941620
84	NC_018709	ATAAAA	2	12	156616	156627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407941620
85	NC_018709	TTTTGC	2	12	157172	157183	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407941621
86	NC_018709	AGCTAT	2	12	158227	158238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407941623
87	NC_018709	GGCTAA	2	12	158626	158637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407941623
88	NC_018709	TCAAAT	2	12	160252	160263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407941626
89	NC_018709	AAATAA	2	12	163021	163032	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407941631
90	NC_018709	ATTTTC	2	12	165090	165101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407941633
91	NC_018709	AGCTTT	2	12	165786	165797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407941634
92	NC_018709	GGCTGT	2	12	166427	166438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407941635
93	NC_018709	TATAAA	2	12	167836	167847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941636
94	NC_018709	AAAAGC	2	12	169340	169351	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407941637
95	NC_018709	AACAAG	2	12	170132	170143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407941638
96	NC_018709	TAAAAA	2	12	173047	173058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407941641
97	NC_018709	TGGAAA	2	12	173108	173119	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407941641
98	NC_018709	TATTTT	2	12	175851	175862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407941643
99	NC_018709	TTAAAT	2	12	175875	175886	50 %	50 %	0 %	0 %	407941643
100	NC_018709	CTTTCT	2	12	175962	175973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407941643
101	NC_018709	ATTCTA	2	12	177963	177974	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407941646
102	NC_018709	GCTATT	2	12	178190	178201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407941646
103	NC_018709	TTGCAG	2	12	179537	179548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407941647
104	NC_018709	TGACTT	2	12	182226	182237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407941650
105	NC_018709	AAAACC	2	12	183330	183341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407941652
106	NC_018709	CAAGGA	2	12	185700	185711	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407941654
107	NC_018709	AATGAA	2	12	190103	190114	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407941659
108	NC_018709	AAGTGC	2	12	191308	191319	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407941659
109	NC_018709	CCTAAT	2	12	191327	191338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407941659
110	NC_018709	CTTACT	2	12	192927	192938	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407941661
111	NC_018709	AATTAA	2	12	194305	194316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941662
112	NC_018709	AAATTC	2	12	195019	195030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407941663
113	NC_018709	AAAGAA	2	12	203846	203857	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407941671
114	NC_018709	TTTGAA	2	12	208915	208926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407941675
115	NC_018709	TGAACT	2	12	209258	209269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407941676
116	NC_018709	TTTGAT	2	12	210054	210065	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407941676
117	NC_018709	TAAAAT	2	12	211276	211287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407941678
118	NC_018709	GAAATA	2	12	213413	213424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407941681
119	NC_018709	TGATTT	2	12	214190	214201	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407941682
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350	NC_018709	GTTTAA	2	12	625401	625412	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407942097
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462	NC_018709	ATTTAA	3	18	818193	818210	50 %	50 %	0 %	0 %	407942279
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