MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 29856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018697	GAA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715265
2	NC_018697	CAA	2	6	55	60	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715265
3	NC_018697	TAA	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715265
4	NC_018697	TGA	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715265
5	NC_018697	CGA	2	6	275	280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715265
6	NC_018697	TAA	2	6	288	293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715265
7	NC_018697	TTC	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715265
8	NC_018697	ATC	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715265
9	NC_018697	ACT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715265
10	NC_018697	AAG	2	6	662	667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715265
11	NC_018697	AGA	2	6	756	761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715265
12	NC_018697	TGA	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715265
13	NC_018697	AAG	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715265
14	NC_018697	TAC	2	6	1078	1083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715265
15	NC_018697	TGG	2	6	1209	1214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715265
16	NC_018697	TTC	2	6	1232	1237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715265
17	NC_018697	TAA	2	6	1513	1518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715266
18	NC_018697	AGA	2	6	1519	1524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715266
19	NC_018697	AGA	2	6	1565	1570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715266
20	NC_018697	TTA	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
21	NC_018697	ATG	2	6	1773	1778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715266
22	NC_018697	TTA	3	9	1785	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
23	NC_018697	TTA	2	6	1898	1903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
24	NC_018697	CAA	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715266
25	NC_018697	TTA	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
26	NC_018697	ATG	2	6	1970	1975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715266
27	NC_018697	TTG	2	6	1980	1985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715266
28	NC_018697	AGC	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715266
29	NC_018697	ACT	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715266
30	NC_018697	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715266
31	NC_018697	GAA	3	9	2405	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715266
32	NC_018697	TGA	2	6	2434	2439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715266
33	NC_018697	AGT	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715266
34	NC_018697	AGA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715266
35	NC_018697	TAT	3	9	2575	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715266
36	NC_018697	ATA	2	6	2672	2677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715267
37	NC_018697	ATT	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715267
38	NC_018697	ATA	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715267
39	NC_018697	TCT	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715267
40	NC_018697	ATT	2	6	2989	2994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715267
41	NC_018697	TGG	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715267
42	NC_018697	AAT	2	6	3149	3154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715267
43	NC_018697	TAA	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715267
44	NC_018697	CAC	2	6	3355	3360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407715267
45	NC_018697	ATT	2	6	3417	3422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715267
46	NC_018697	GCT	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715267
47	NC_018697	GAT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715267
48	NC_018697	GAC	2	6	3604	3609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715267
49	NC_018697	GAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
50	NC_018697	TCA	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715268
51	NC_018697	GAT	2	6	3809	3814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
52	NC_018697	CAT	2	6	3827	3832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715268
53	NC_018697	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
54	NC_018697	ATT	2	6	3902	3907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
55	NC_018697	GCT	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715268
56	NC_018697	TGT	2	6	4081	4086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715268
57	NC_018697	TTA	2	6	4271	4276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
58	NC_018697	AGA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
59	NC_018697	ATT	2	6	4433	4438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
60	NC_018697	ATG	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
61	NC_018697	ACA	2	6	4640	4645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
62	NC_018697	TGA	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
63	NC_018697	TCA	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715268
64	NC_018697	TTG	2	6	4758	4763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715268
65	NC_018697	ATC	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715268
66	NC_018697	AGC	2	6	4846	4851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715268
67	NC_018697	ACG	2	6	4891	4896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715268
68	NC_018697	GAA	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
69	NC_018697	TCG	2	6	5102	5107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715268
70	NC_018697	TAA	2	6	5124	5129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715268
71	NC_018697	TTA	2	6	5243	5248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
72	NC_018697	GAT	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
73	NC_018697	TTA	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
74	NC_018697	ACA	2	6	5426	5431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
75	NC_018697	AGA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
76	NC_018697	ATG	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715268
77	NC_018697	CAA	2	6	5669	5674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
78	NC_018697	AAG	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
79	NC_018697	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715268
80	NC_018697	AAG	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715268
81	NC_018697	CAA	2	6	5903	5908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
82	NC_018697	ACA	2	6	5960	5965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
83	NC_018697	ACA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715268
84	NC_018697	TGC	2	6	6815	6820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715269
85	NC_018697	GAT	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715269
86	NC_018697	AGT	2	6	7047	7052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715269
87	NC_018697	TGA	2	6	7067	7072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715269
88	NC_018697	CTG	2	6	7153	7158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715269
89	NC_018697	GAA	2	6	7164	7169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715269
90	NC_018697	TAC	2	6	7182	7187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715269
91	NC_018697	CTG	2	6	7225	7230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715269
92	NC_018697	TGA	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715269
93	NC_018697	GAG	2	6	7314	7319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407715269
94	NC_018697	GAT	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715269
95	NC_018697	CTT	2	6	7424	7429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715269
96	NC_018697	TTA	2	6	7451	7456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715269
97	NC_018697	GTA	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715269
98	NC_018697	CAT	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715269
99	NC_018697	GCT	2	6	7509	7514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715269
100	NC_018697	TTG	2	6	7540	7545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715269
101	NC_018697	AGC	2	6	7628	7633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715269
102	NC_018697	CAA	2	6	7702	7707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715269
103	NC_018697	TAA	2	6	7929	7934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715269
104	NC_018697	CAT	2	6	7992	7997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715270
105	NC_018697	CAG	2	6	8004	8009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715270
106	NC_018697	AGA	2	6	8041	8046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715270
107	NC_018697	GGT	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715270
108	NC_018697	GTT	3	9	8183	8191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715270
109	NC_018697	ATT	2	6	8212	8217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715270
110	NC_018697	GTT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715270
111	NC_018697	GAA	2	6	8315	8320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715270
112	NC_018697	TCT	2	6	8366	8371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715270
113	NC_018697	CAA	2	6	8405	8410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715270
114	NC_018697	TGA	2	6	8433	8438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715270
115	NC_018697	AAC	2	6	8494	8499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715270
116	NC_018697	GCA	2	6	8540	8545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715270
117	NC_018697	GAA	2	6	8611	8616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715270
118	NC_018697	CAG	2	6	8625	8630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715270
119	NC_018697	GAA	2	6	8632	8637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715270
120	NC_018697	CAG	2	6	8640	8645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715270
121	NC_018697	TGT	2	6	8728	8733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715270
122	NC_018697	GAA	2	6	8753	8758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715270
123	NC_018697	GGC	2	6	8797	8802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407715270
124	NC_018697	ATT	2	6	8990	8995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715270
125	NC_018697	GGT	2	6	9020	9025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715270
126	NC_018697	TCG	2	6	9029	9034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715270
127	NC_018697	ATG	2	6	9035	9040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715270
128	NC_018697	ATC	2	6	9045	9050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715270
129	NC_018697	GAT	2	6	9086	9091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715270
130	NC_018697	TTC	2	6	9450	9455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715271
131	NC_018697	TGA	2	6	9465	9470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715271
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250	NC_018697	AGA	2	6	18334	18339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715282
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