MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cycloclasticus sp. P1 chromosome

Total Repeats: 45148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018697	TTC	2	6	287201	287206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715541
5502	NC_018697	CGG	2	6	287230	287235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407715541
5503	NC_018697	TTA	2	6	287301	287306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715541
5504	NC_018697	TAA	2	6	287347	287352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715541
5505	NC_018697	AGA	2	6	287408	287413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715541
5506	NC_018697	TAGCT	2	10	287438	287447	20 %	40 %	20 %	20 %	407715541
5507	NC_018697	TGT	2	6	287462	287467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715541
5508	NC_018697	TCT	2	6	287560	287565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715541
5509	NC_018697	TCC	2	6	287631	287636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407715541
5510	NC_018697	AAT	2	6	287649	287654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715541
5511	NC_018697	TAA	2	6	287743	287748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715541
5512	NC_018697	TGA	2	6	287751	287756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715541
5513	NC_018697	GAGG	2	8	287785	287792	25 %	0 %	75 %	0 %	407715541
5514	NC_018697	AT	3	6	287818	287823	50 %	50 %	0 %	0 %	407715541
5515	NC_018697	AGA	2	6	287861	287866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715541
5516	NC_018697	TGCT	2	8	287889	287896	0 %	50 %	25 %	25 %	407715541
5517	NC_018697	TTA	2	6	287934	287939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715541
5518	NC_018697	TAGC	2	8	287947	287954	25 %	25 %	25 %	25 %	407715541
5519	NC_018697	AAT	2	6	287978	287983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715541
5520	NC_018697	CAT	2	6	287992	287997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715541
5521	NC_018697	ATT	2	6	288090	288095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715542
5522	NC_018697	T	6	6	288094	288099	0 %	100 %	0 %	0 %	407715542
5523	NC_018697	CGA	3	9	288181	288189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407715542
5524	NC_018697	T	6	6	288251	288256	0 %	100 %	0 %	0 %	407715542
5525	NC_018697	TGT	2	6	288373	288378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715542
5526	NC_018697	CCA	2	6	288486	288491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407715542
5527	NC_018697	TCA	2	6	288561	288566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715542
5528	NC_018697	TAA	2	6	288575	288580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715542
5529	NC_018697	TGA	2	6	288586	288591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715542
5530	NC_018697	AAC	2	6	288659	288664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715542
5531	NC_018697	CAT	2	6	288674	288679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715542
5532	NC_018697	ATGC	2	8	288689	288696	25 %	25 %	25 %	25 %	407715542
5533	NC_018697	AAT	2	6	288725	288730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715542
5534	NC_018697	ATG	2	6	288743	288748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715542
5535	NC_018697	T	6	6	288755	288760	0 %	100 %	0 %	0 %	407715542
5536	NC_018697	TTC	2	6	288791	288796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715542
5537	NC_018697	A	6	6	288876	288881	100 %	0 %	0 %	0 %	407715542
5538	NC_018697	GTT	2	6	288917	288922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715542
5539	NC_018697	T	7	7	288921	288927	0 %	100 %	0 %	0 %	407715542
5540	NC_018697	TTG	2	6	288947	288952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715542
5541	NC_018697	TCA	2	6	288963	288968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715542
5542	NC_018697	TGG	2	6	289033	289038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715542
5543	NC_018697	GGT	2	6	289060	289065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715542
5544	NC_018697	TGC	2	6	289165	289170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715542
5545	NC_018697	CAT	2	6	289199	289204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715542
5546	NC_018697	GT	3	6	289347	289352	0 %	50 %	50 %	0 %	407715543
5547	NC_018697	GTT	2	6	289365	289370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715543
5548	NC_018697	GTT	2	6	289386	289391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715543
5549	NC_018697	T	6	6	289427	289432	0 %	100 %	0 %	0 %	407715543
5550	NC_018697	AATCGT	2	12	289441	289452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407715543
5551	NC_018697	CAA	2	6	289464	289469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715543
5552	NC_018697	CAC	2	6	289513	289518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407715543
5553	NC_018697	CCA	2	6	289532	289537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407715543
5554	NC_018697	TC	3	6	289616	289621	0 %	50 %	0 %	50 %	407715543
5555	NC_018697	GCC	2	6	289630	289635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407715543
5556	NC_018697	CCTT	2	8	289670	289677	0 %	50 %	0 %	50 %	407715543
5557	NC_018697	TCT	2	6	289709	289714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715543
5558	NC_018697	CTT	2	6	289755	289760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715543
5559	NC_018697	TCTT	2	8	289826	289833	0 %	75 %	0 %	25 %	407715543
5560	NC_018697	GAAT	2	8	289850	289857	50 %	25 %	25 %	0 %	407715543
5561	NC_018697	ATC	2	6	289867	289872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715543
5562	NC_018697	CCA	2	6	289985	289990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407715543
5563	NC_018697	TTTAA	2	10	290078	290087	40 %	60 %	0 %	0 %	407715543
5564	NC_018697	GAA	2	6	290124	290129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407715543
5565	NC_018697	T	6	6	290263	290268	0 %	100 %	0 %	0 %	407715543
5566	NC_018697	GCT	2	6	290285	290290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715543
5567	NC_018697	TCG	2	6	290414	290419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407715543
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5569	NC_018697	GTT	2	6	290484	290489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715543
5570	NC_018697	CCG	2	6	290513	290518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407715543
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5573	NC_018697	AATCG	2	10	290638	290647	40 %	20 %	20 %	20 %	407715543
5574	NC_018697	ATGGTG	2	12	290714	290725	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407715543
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5582	NC_018697	AACT	2	8	291028	291035	50 %	25 %	0 %	25 %	407715544
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5588	NC_018697	TTG	2	6	291329	291334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715544
5589	NC_018697	TAA	2	6	291419	291424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715544
5590	NC_018697	CG	3	6	291445	291450	0 %	0 %	50 %	50 %	407715544
5591	NC_018697	GGTC	2	8	291483	291490	0 %	25 %	50 %	25 %	407715544
5592	NC_018697	ATA	2	6	291534	291539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715544
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5594	NC_018697	T	7	7	291649	291655	0 %	100 %	0 %	0 %	407715544
5595	NC_018697	TAAG	2	8	291672	291679	50 %	25 %	25 %	0 %	407715544
5596	NC_018697	ATT	2	6	291690	291695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407715544
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5599	NC_018697	ATAA	2	8	291824	291831	75 %	25 %	0 %	0 %	407715545
5600	NC_018697	CTT	3	9	291909	291917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407715545
5601	NC_018697	ACA	2	6	291944	291949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407715545
5602	NC_018697	GGC	2	6	291964	291969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407715545
5603	NC_018697	ACCG	2	8	292039	292046	25 %	0 %	25 %	50 %	407715545
5604	NC_018697	GGCA	2	8	292047	292054	25 %	0 %	50 %	25 %	407715545
5605	NC_018697	AT	3	6	292091	292096	50 %	50 %	0 %	0 %	407715545
5606	NC_018697	CA	3	6	292130	292135	50 %	0 %	0 %	50 %	407715545
5607	NC_018697	TTGC	2	8	292244	292251	0 %	50 %	25 %	25 %	407715545
5608	NC_018697	GTT	2	6	292273	292278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715545
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5612	NC_018697	ATC	2	6	292451	292456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407715545
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5614	NC_018697	T	8	8	292506	292513	0 %	100 %	0 %	0 %	407715545
5615	NC_018697	GC	3	6	292523	292528	0 %	0 %	50 %	50 %	407715545
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5620	NC_018697	AAT	2	6	292632	292637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407715546
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5989	NC_018697	TTG	2	6	310406	310411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407715561
5990	NC_018697	CAACT	2	10	310446	310455	40 %	20 %	0 %	40 %	407715561
5991	NC_018697	A	6	6	310539	310544	100 %	0 %	0 %	0 %	407715561
5992	NC_018697	GTCT	2	8	310568	310575	0 %	50 %	25 %	25 %	407715561
5993	NC_018697	GGT	2	6	310624	310629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407715561
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5999	NC_018697	ATG	2	6	310978	310983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407715561
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