MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs chromosome

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018677	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	407681636
2	NC_018677	ATAAA	2	10	5597	5606	80 %	20 %	0 %	0 %	407681638
3	NC_018677	AAAAT	2	10	5865	5874	80 %	20 %	0 %	0 %	407681639
4	NC_018677	TAAAA	2	10	6909	6918	80 %	20 %	0 %	0 %	407681639
5	NC_018677	AACAA	2	10	7956	7965	80 %	0 %	0 %	20 %	407681640
6	NC_018677	CATGC	2	10	8123	8132	20 %	20 %	20 %	40 %	407681640
7	NC_018677	AAATT	2	10	8699	8708	60 %	40 %	0 %	0 %	407681640
8	NC_018677	AATAC	2	10	10324	10333	60 %	20 %	0 %	20 %	407681643
9	NC_018677	GTAAC	2	10	10379	10388	40 %	20 %	20 %	20 %	407681643
10	NC_018677	TAATA	2	10	11152	11161	60 %	40 %	0 %	0 %	407681644
11	NC_018677	ATCTA	2	10	12786	12795	40 %	40 %	0 %	20 %	407681645
12	NC_018677	TTGTT	2	10	14211	14220	0 %	80 %	20 %	0 %	407681646
13	NC_018677	CAAAA	2	10	14885	14894	80 %	0 %	0 %	20 %	407681646
14	NC_018677	TGCAT	2	10	15114	15123	20 %	40 %	20 %	20 %	407681646
15	NC_018677	ATATT	2	10	15639	15648	40 %	60 %	0 %	0 %	407681647
16	NC_018677	TAAAT	2	10	15668	15677	60 %	40 %	0 %	0 %	407681647
17	NC_018677	TCCAT	3	15	15903	15917	20 %	40 %	0 %	40 %	407681647
18	NC_018677	CATAT	2	10	17771	17780	40 %	40 %	0 %	20 %	407681649
19	NC_018677	AAACA	2	10	23874	23883	80 %	0 %	0 %	20 %	407681653
20	NC_018677	AACAA	2	10	28372	28381	80 %	0 %	0 %	20 %	407681654
21	NC_018677	AAAAC	2	10	31728	31737	80 %	0 %	0 %	20 %	407681655
22	NC_018677	AATTT	2	10	31750	31759	40 %	60 %	0 %	0 %	407681655
23	NC_018677	TAATA	2	10	31893	31902	60 %	40 %	0 %	0 %	407681655
24	NC_018677	AATTA	2	10	31925	31934	60 %	40 %	0 %	0 %	407681655
25	NC_018677	ATTTA	2	10	34523	34532	40 %	60 %	0 %	0 %	407681657
26	NC_018677	AACAA	2	10	37448	37457	80 %	0 %	0 %	20 %	407681661
27	NC_018677	AATGA	2	10	39648	39657	60 %	20 %	20 %	0 %	407681663
28	NC_018677	GCTTT	2	10	41302	41311	0 %	60 %	20 %	20 %	407681665
29	NC_018677	ATTAT	2	10	45085	45094	40 %	60 %	0 %	0 %	407681669
30	NC_018677	ACAAA	2	10	45433	45442	80 %	0 %	0 %	20 %	407681669
31	NC_018677	GGAAA	2	10	46215	46224	60 %	0 %	40 %	0 %	407681670
32	NC_018677	AATAC	2	10	46706	46715	60 %	20 %	0 %	20 %	407681671
33	NC_018677	TAAAA	2	10	47883	47892	80 %	20 %	0 %	0 %	407681672
34	NC_018677	ATTAC	2	10	48471	48480	40 %	40 %	0 %	20 %	407681673
35	NC_018677	ATTAA	2	10	48742	48751	60 %	40 %	0 %	0 %	407681674
36	NC_018677	AATTA	2	10	49473	49482	60 %	40 %	0 %	0 %	407681674
37	NC_018677	CAAAG	2	10	49839	49848	60 %	0 %	20 %	20 %	407681674
38	NC_018677	AAAAT	2	10	51106	51115	80 %	20 %	0 %	0 %	407681675
39	NC_018677	GTTTT	2	10	51618	51627	0 %	80 %	20 %	0 %	407681675
40	NC_018677	GTGTT	2	10	51700	51709	0 %	60 %	40 %	0 %	407681675
41	NC_018677	AAGAA	2	10	52042	52051	80 %	0 %	20 %	0 %	407681675
42	NC_018677	CTTTA	2	10	52884	52893	20 %	60 %	0 %	20 %	407681676
43	NC_018677	AAGAA	2	10	56060	56069	80 %	0 %	20 %	0 %	407681677
44	NC_018677	AACAA	2	10	56803	56812	80 %	0 %	0 %	20 %	407681677
45	NC_018677	CAAAT	2	10	56878	56887	60 %	20 %	0 %	20 %	407681677
46	NC_018677	AGGTA	2	10	57590	57599	40 %	20 %	40 %	0 %	407681677
47	NC_018677	TTAAA	2	10	58693	58702	60 %	40 %	0 %	0 %	407681678
48	NC_018677	ATATT	2	10	58766	58775	40 %	60 %	0 %	0 %	407681678
49	NC_018677	AATAA	2	10	59208	59217	80 %	20 %	0 %	0 %	407681678
50	NC_018677	ACATT	2	10	59686	59695	40 %	40 %	0 %	20 %	407681679
51	NC_018677	AAACA	2	10	59706	59715	80 %	0 %	0 %	20 %	407681679
52	NC_018677	TTTAA	2	10	61402	61411	40 %	60 %	0 %	0 %	407681680
53	NC_018677	ATTAA	2	10	61453	61462	60 %	40 %	0 %	0 %	407681680
54	NC_018677	AAGAT	2	10	61835	61844	60 %	20 %	20 %	0 %	407681681
55	NC_018677	AGTTA	2	10	62220	62229	40 %	40 %	20 %	0 %	407681682
56	NC_018677	TAAAA	2	10	62556	62565	80 %	20 %	0 %	0 %	407681682
57	NC_018677	ATAAA	2	10	62636	62645	80 %	20 %	0 %	0 %	407681682
58	NC_018677	GATAT	2	10	62921	62930	40 %	40 %	20 %	0 %	407681682
59	NC_018677	AAAGC	2	10	62946	62955	60 %	0 %	20 %	20 %	407681682
60	NC_018677	ATAAA	2	10	65685	65694	80 %	20 %	0 %	0 %	407681683
61	NC_018677	ATAAA	2	10	68661	68670	80 %	20 %	0 %	0 %	407681685
62	NC_018677	CAAAA	2	10	68757	68766	80 %	0 %	0 %	20 %	407681685
63	NC_018677	TATAA	2	10	69005	69014	60 %	40 %	0 %	0 %	407681685
64	NC_018677	ATGTG	2	10	69076	69085	20 %	40 %	40 %	0 %	407681685
65	NC_018677	AAAAT	2	10	69317	69326	80 %	20 %	0 %	0 %	407681685
66	NC_018677	AAGAG	2	10	69591	69600	60 %	0 %	40 %	0 %	407681686
67	NC_018677	TAATA	2	10	69864	69873	60 %	40 %	0 %	0 %	407681686
68	NC_018677	TTAAA	2	10	69983	69992	60 %	40 %	0 %	0 %	407681686
69	NC_018677	ATTTT	2	10	71052	71061	20 %	80 %	0 %	0 %	407681687
70	NC_018677	AAAAG	2	10	71173	71182	80 %	0 %	20 %	0 %	407681687
71	NC_018677	ACAAA	2	10	71283	71292	80 %	0 %	0 %	20 %	407681687
72	NC_018677	ATTTA	2	10	71315	71324	40 %	60 %	0 %	0 %	407681687
73	NC_018677	AATAT	2	10	71396	71405	60 %	40 %	0 %	0 %	407681687
74	NC_018677	AAAAG	2	10	72873	72882	80 %	0 %	20 %	0 %	407681689
75	NC_018677	AAACA	2	10	73028	73037	80 %	0 %	0 %	20 %	407681689
76	NC_018677	TTACA	2	10	73056	73065	40 %	40 %	0 %	20 %	407681689
77	NC_018677	TTTTA	2	10	73580	73589	20 %	80 %	0 %	0 %	407681690
78	NC_018677	GTTTT	2	10	73780	73789	0 %	80 %	20 %	0 %	407681690
79	NC_018677	GATTT	2	10	74847	74856	20 %	60 %	20 %	0 %	407681691
80	NC_018677	AAGCA	2	10	76439	76448	60 %	0 %	20 %	20 %	407681692
81	NC_018677	AGTGT	2	10	76631	76640	20 %	40 %	40 %	0 %	407681692
82	NC_018677	ATTTA	2	10	77474	77483	40 %	60 %	0 %	0 %	407681694
83	NC_018677	ATTTG	2	10	79188	79197	20 %	60 %	20 %	0 %	407681697
84	NC_018677	TAAAA	2	10	79347	79356	80 %	20 %	0 %	0 %	407681697
85	NC_018677	TCAAA	2	10	81753	81762	60 %	20 %	0 %	20 %	407681698
86	NC_018677	AATAG	2	10	82965	82974	60 %	20 %	20 %	0 %	407681698
87	NC_018677	ATTAG	2	10	83022	83031	40 %	40 %	20 %	0 %	407681698
88	NC_018677	TAAAT	2	10	83213	83222	60 %	40 %	0 %	0 %	407681698
89	NC_018677	AAAAT	2	10	83597	83606	80 %	20 %	0 %	0 %	407681699
90	NC_018677	GGTGA	2	10	83684	83693	20 %	20 %	60 %	0 %	407681699
91	NC_018677	AAAAT	2	10	84210	84219	80 %	20 %	0 %	0 %	407681699
92	NC_018677	TATAT	2	10	85107	85116	40 %	60 %	0 %	0 %	407681699
93	NC_018677	TGAAA	2	10	89185	89194	60 %	20 %	20 %	0 %	407681702
94	NC_018677	ACAAT	2	10	89275	89284	60 %	20 %	0 %	20 %	407681702
95	NC_018677	AAAAT	2	10	89660	89669	80 %	20 %	0 %	0 %	407681702
96	NC_018677	GTAGA	2	10	91482	91491	40 %	20 %	40 %	0 %	407681703
97	NC_018677	ATTTT	2	10	91783	91792	20 %	80 %	0 %	0 %	407681703
98	NC_018677	TTAAT	2	10	91875	91884	40 %	60 %	0 %	0 %	407681703
99	NC_018677	CAAGG	2	10	93022	93031	40 %	0 %	40 %	20 %	407681706
100	NC_018677	AAAAT	2	10	93373	93382	80 %	20 %	0 %	0 %	407681706
101	NC_018677	CAGAA	2	10	95323	95332	60 %	0 %	20 %	20 %	407681711
102	NC_018677	TAAAA	2	10	95705	95714	80 %	20 %	0 %	0 %	407681711
103	NC_018677	GTAAA	2	10	96956	96965	60 %	20 %	20 %	0 %	407681715
104	NC_018677	TTAAT	2	10	99634	99643	40 %	60 %	0 %	0 %	407681720
105	NC_018677	AGGCA	2	10	104480	104489	40 %	0 %	40 %	20 %	407681729
106	NC_018677	AAAAC	2	10	108055	108064	80 %	0 %	0 %	20 %	407681733
107	NC_018677	GTTAT	2	10	112298	112307	20 %	60 %	20 %	0 %	407681735
108	NC_018677	AAGTA	2	10	112889	112898	60 %	20 %	20 %	0 %	407681736
109	NC_018677	ATCAA	2	10	115237	115246	60 %	20 %	0 %	20 %	407681738
110	NC_018677	TAATC	2	10	115350	115359	40 %	40 %	0 %	20 %	407681738
111	NC_018677	CTAAC	2	10	126246	126255	40 %	20 %	0 %	40 %	407681743
112	NC_018677	TAAAG	2	10	129635	129644	60 %	20 %	20 %	0 %	407681745
113	NC_018677	GATAT	2	10	130620	130629	40 %	40 %	20 %	0 %	407681745
114	NC_018677	AAAGT	2	10	130957	130966	60 %	20 %	20 %	0 %	407681745
115	NC_018677	ACAGG	2	10	131088	131097	40 %	0 %	40 %	20 %	407681745
116	NC_018677	AAATA	2	10	131899	131908	80 %	20 %	0 %	0 %	407681745
117	NC_018677	TAAGA	2	10	131927	131936	60 %	20 %	20 %	0 %	407681745
118	NC_018677	AGAAA	2	10	132552	132561	80 %	0 %	20 %	0 %	407681746
119	NC_018677	TTGCT	2	10	134638	134647	0 %	60 %	20 %	20 %	407681747
120	NC_018677	GTTTT	2	10	135304	135313	0 %	80 %	20 %	0 %	407681748
121	NC_018677	ATATT	2	10	136681	136690	40 %	60 %	0 %	0 %	407681750
122	NC_018677	TATAG	2	10	137636	137645	40 %	40 %	20 %	0 %	407681753
123	NC_018677	GTTTT	2	10	140039	140048	0 %	80 %	20 %	0 %	407681754
124	NC_018677	AAAAT	2	10	142097	142106	80 %	20 %	0 %	0 %	407681756
125	NC_018677	AAAAT	2	10	142794	142803	80 %	20 %	0 %	0 %	407681756
126	NC_018677	GTGAT	2	10	142881	142890	20 %	40 %	40 %	0 %	407681756
127	NC_018677	GTTGA	2	10	143437	143446	20 %	40 %	40 %	0 %	407681757
128	NC_018677	TATAT	2	10	144195	144204	40 %	60 %	0 %	0 %	407681758
129	NC_018677	GGAAT	2	10	144669	144678	40 %	20 %	40 %	0 %	407681758
130	NC_018677	TAAAT	2	10	145352	145361	60 %	40 %	0 %	0 %	407681758
131	NC_018677	TGGAA	2	10	145614	145623	40 %	20 %	40 %	0 %	407681758
132	NC_018677	ATTTA	2	10	146209	146218	40 %	60 %	0 %	0 %	407681759
133	NC_018677	TTTTA	2	10	147505	147514	20 %	80 %	0 %	0 %	407681761
134	NC_018677	AAAAT	2	10	149211	149220	80 %	20 %	0 %	0 %	407681764
135	NC_018677	CAAAA	2	10	150024	150033	80 %	0 %	0 %	20 %	407681765
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.