MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs chromosome

Total Repeats: 3660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018677	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681636
2	NC_018677	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681636
3	NC_018677	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681636
4	NC_018677	ATG	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681636
5	NC_018677	CAG	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681636
6	NC_018677	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681636
7	NC_018677	TAA	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681636
8	NC_018677	CTA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681636
9	NC_018677	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681636
10	NC_018677	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681636
11	NC_018677	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681636
12	NC_018677	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681636
13	NC_018677	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681636
14	NC_018677	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681636
15	NC_018677	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681636
16	NC_018677	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681636
17	NC_018677	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681636
18	NC_018677	ACT	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681636
19	NC_018677	GAT	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681636
20	NC_018677	ATA	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681636
21	NC_018677	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681636
22	NC_018677	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681636
23	NC_018677	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681636
24	NC_018677	GGT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681636
25	NC_018677	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681636
26	NC_018677	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681636
27	NC_018677	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681636
28	NC_018677	CTC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681636
29	NC_018677	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681636
30	NC_018677	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681636
31	NC_018677	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681636
32	NC_018677	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681636
33	NC_018677	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681636
34	NC_018677	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681636
35	NC_018677	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681636
36	NC_018677	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681636
37	NC_018677	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681636
38	NC_018677	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681636
39	NC_018677	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681636
40	NC_018677	TGT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681636
41	NC_018677	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681636
42	NC_018677	TAA	3	9	1908	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681636
43	NC_018677	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681637
44	NC_018677	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681637
45	NC_018677	CTG	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681637
46	NC_018677	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681637
47	NC_018677	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681637
48	NC_018677	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681637
49	NC_018677	CAA	4	12	2247	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681637
50	NC_018677	ACA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681637
51	NC_018677	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681637
52	NC_018677	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681637
53	NC_018677	GTA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681637
54	NC_018677	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681637
55	NC_018677	TTA	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
56	NC_018677	ATA	2	6	4460	4465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
57	NC_018677	GTT	2	6	4492	4497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681638
58	NC_018677	ATT	2	6	4527	4532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
59	NC_018677	ATA	3	9	4538	4546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
60	NC_018677	CTG	2	6	4642	4647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681638
61	NC_018677	AAC	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681638
62	NC_018677	ATT	2	6	4745	4750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
63	NC_018677	GTT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681638
64	NC_018677	TAA	2	6	4799	4804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
65	NC_018677	ATT	2	6	4857	4862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
66	NC_018677	ATT	2	6	4919	4924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
67	NC_018677	ATT	2	6	4985	4990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
68	NC_018677	TAT	2	6	5180	5185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
69	NC_018677	AGT	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681638
70	NC_018677	ATC	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681638
71	NC_018677	ATA	2	6	5219	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
72	NC_018677	ATA	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
73	NC_018677	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
74	NC_018677	AGA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681638
75	NC_018677	TTA	2	6	5371	5376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
76	NC_018677	TAA	2	6	5444	5449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
77	NC_018677	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
78	NC_018677	CTT	2	6	5488	5493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681638
79	NC_018677	AAT	2	6	5572	5577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
80	NC_018677	ATT	2	6	5586	5591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
81	NC_018677	ATA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
82	NC_018677	TAA	2	6	5642	5647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
83	NC_018677	TAT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
84	NC_018677	TTA	2	6	5659	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
85	NC_018677	TAA	2	6	5701	5706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681638
86	NC_018677	ATT	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681638
87	NC_018677	TAA	2	6	5771	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
88	NC_018677	ATT	2	6	5831	5836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681639
89	NC_018677	TAA	2	6	5853	5858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
90	NC_018677	ATA	2	6	5944	5949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
91	NC_018677	TAA	2	6	6043	6048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
92	NC_018677	TCC	2	6	6151	6156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681639
93	NC_018677	TTA	4	12	6204	6215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681639
94	NC_018677	ATA	2	6	6379	6384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
95	NC_018677	ATA	2	6	6392	6397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
96	NC_018677	TAA	2	6	6463	6468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
97	NC_018677	GCT	2	6	6476	6481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681639
98	NC_018677	TAA	2	6	6610	6615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
99	NC_018677	TTA	2	6	6717	6722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681639
100	NC_018677	ATT	2	6	6827	6832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681639
101	NC_018677	AAT	2	6	6880	6885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
102	NC_018677	CAA	2	6	6901	6906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681639
103	NC_018677	TTA	2	6	6932	6937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681639
104	NC_018677	TAC	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681639
105	NC_018677	TAA	2	6	6985	6990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681639
106	NC_018677	ACC	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407681639
107	NC_018677	AAC	2	6	7155	7160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681639
108	NC_018677	TAA	2	6	7260	7265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
109	NC_018677	CAA	2	6	7280	7285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681640
110	NC_018677	TAT	2	6	7370	7375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681640
111	NC_018677	TTA	2	6	7376	7381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681640
112	NC_018677	AAC	2	6	7506	7511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681640
113	NC_018677	TAA	2	6	7528	7533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
114	NC_018677	AGC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681640
115	NC_018677	ATT	2	6	7585	7590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681640
116	NC_018677	GAA	2	6	7591	7596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681640
117	NC_018677	ACA	2	6	7605	7610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681640
118	NC_018677	TAT	2	6	7625	7630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681640
119	NC_018677	TAA	2	6	7692	7697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
120	NC_018677	TTA	2	6	7747	7752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681640
121	NC_018677	TAA	2	6	7760	7765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
122	NC_018677	TTA	2	6	7768	7773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681640
123	NC_018677	CTA	2	6	7844	7849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681640
124	NC_018677	TTG	2	6	7858	7863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681640
125	NC_018677	TAA	2	6	7919	7924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
126	NC_018677	ACC	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407681640
127	NC_018677	ATA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
128	NC_018677	ATT	2	6	8050	8055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681640
129	NC_018677	ATC	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681640
130	NC_018677	TAA	3	9	8232	8240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
131	NC_018677	TGC	2	6	8343	8348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681640
132	NC_018677	TAT	2	6	8483	8488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681640
133	NC_018677	TAA	2	6	8490	8495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681640
134	NC_018677	GTT	2	6	8513	8518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681640
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