MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	407681355
2	NC_018676	ATAAA	2	10	5548	5557	80 %	20 %	0 %	0 %	407681357
3	NC_018676	AAAAT	2	10	5816	5825	80 %	20 %	0 %	0 %	407681358
4	NC_018676	TAAAA	2	10	6860	6869	80 %	20 %	0 %	0 %	407681358
5	NC_018676	AACAA	2	10	7907	7916	80 %	0 %	0 %	20 %	407681359
6	NC_018676	CATGC	2	10	8074	8083	20 %	20 %	20 %	40 %	407681359
7	NC_018676	AAATT	2	10	8650	8659	60 %	40 %	0 %	0 %	407681359
8	NC_018676	AATAC	2	10	10275	10284	60 %	20 %	0 %	20 %	407681362
9	NC_018676	GTAAC	2	10	10330	10339	40 %	20 %	20 %	20 %	407681362
10	NC_018676	TAATA	2	10	11103	11112	60 %	40 %	0 %	0 %	407681363
11	NC_018676	ATCTA	2	10	12737	12746	40 %	40 %	0 %	20 %	407681364
12	NC_018676	TTGTT	2	10	14162	14171	0 %	80 %	20 %	0 %	407681365
13	NC_018676	CAAAA	2	10	14836	14845	80 %	0 %	0 %	20 %	407681365
14	NC_018676	TGCAT	2	10	15065	15074	20 %	40 %	20 %	20 %	407681365
15	NC_018676	ATATT	2	10	15590	15599	40 %	60 %	0 %	0 %	407681366
16	NC_018676	TAAAT	2	10	15619	15628	60 %	40 %	0 %	0 %	407681366
17	NC_018676	TCCAT	3	15	15854	15868	20 %	40 %	0 %	40 %	407681366
18	NC_018676	ATTTT	2	10	17526	17535	20 %	80 %	0 %	0 %	407681367
19	NC_018676	CATAT	2	10	17727	17736	40 %	40 %	0 %	20 %	407681368
20	NC_018676	AAACA	2	10	23824	23833	80 %	0 %	0 %	20 %	407681372
21	NC_018676	AACAA	2	10	28310	28319	80 %	0 %	0 %	20 %	407681373
22	NC_018676	AAAAC	2	10	31633	31642	80 %	0 %	0 %	20 %	407681374
23	NC_018676	AATTT	2	10	31655	31664	40 %	60 %	0 %	0 %	407681374
24	NC_018676	TAATA	2	10	31798	31807	60 %	40 %	0 %	0 %	407681374
25	NC_018676	AATTA	2	10	31830	31839	60 %	40 %	0 %	0 %	407681374
26	NC_018676	ATTTA	2	10	34365	34374	40 %	60 %	0 %	0 %	407681376
27	NC_018676	AACAA	2	10	37290	37299	80 %	0 %	0 %	20 %	407681380
28	NC_018676	AATGA	2	10	39490	39499	60 %	20 %	20 %	0 %	407681382
29	NC_018676	GCTTT	2	10	41144	41153	0 %	60 %	20 %	20 %	407681384
30	NC_018676	ATTAT	2	10	44669	44678	40 %	60 %	0 %	0 %	407681387
31	NC_018676	ACAAA	2	10	45017	45026	80 %	0 %	0 %	20 %	407681387
32	NC_018676	GGAAA	2	10	45799	45808	60 %	0 %	40 %	0 %	407681388
33	NC_018676	AATAC	2	10	46290	46299	60 %	20 %	0 %	20 %	407681389
34	NC_018676	TAAAA	2	10	47467	47476	80 %	20 %	0 %	0 %	407681390
35	NC_018676	ATTAC	2	10	48055	48064	40 %	40 %	0 %	20 %	407681391
36	NC_018676	ATTAA	2	10	48326	48335	60 %	40 %	0 %	0 %	407681392
37	NC_018676	AATTA	2	10	49057	49066	60 %	40 %	0 %	0 %	407681392
38	NC_018676	CAAAG	2	10	49423	49432	60 %	0 %	20 %	20 %	407681392
39	NC_018676	AAAAT	2	10	50690	50699	80 %	20 %	0 %	0 %	407681393
40	NC_018676	GTTTT	2	10	51202	51211	0 %	80 %	20 %	0 %	407681393
41	NC_018676	GTGTT	2	10	51284	51293	0 %	60 %	40 %	0 %	407681393
42	NC_018676	AAGAA	2	10	51626	51635	80 %	0 %	20 %	0 %	407681393
43	NC_018676	CTTTA	2	10	52468	52477	20 %	60 %	0 %	20 %	407681394
44	NC_018676	AAGAA	2	10	55660	55669	80 %	0 %	20 %	0 %	407681395
45	NC_018676	AACAA	2	10	56403	56412	80 %	0 %	0 %	20 %	407681395
46	NC_018676	CAAAT	2	10	56478	56487	60 %	20 %	0 %	20 %	407681395
47	NC_018676	AGGTA	2	10	57190	57199	40 %	20 %	40 %	0 %	407681395
48	NC_018676	TTAAA	2	10	58293	58302	60 %	40 %	0 %	0 %	407681396
49	NC_018676	ATATT	2	10	58366	58375	40 %	60 %	0 %	0 %	407681396
50	NC_018676	AATAA	2	10	58808	58817	80 %	20 %	0 %	0 %	407681396
51	NC_018676	ACATT	2	10	59286	59295	40 %	40 %	0 %	20 %	407681397
52	NC_018676	AAACA	2	10	59306	59315	80 %	0 %	0 %	20 %	407681397
53	NC_018676	TTTAA	2	10	61007	61016	40 %	60 %	0 %	0 %	407681398
54	NC_018676	AAGAT	2	10	61440	61449	60 %	20 %	20 %	0 %	407681399
55	NC_018676	AGTTA	2	10	61825	61834	40 %	40 %	20 %	0 %	407681400
56	NC_018676	TAAAA	2	10	62161	62170	80 %	20 %	0 %	0 %	407681400
57	NC_018676	ATAAA	2	10	62241	62250	80 %	20 %	0 %	0 %	407681400
58	NC_018676	GATAT	2	10	62526	62535	40 %	40 %	20 %	0 %	407681400
59	NC_018676	ATAAA	2	10	65285	65294	80 %	20 %	0 %	0 %	407681401
60	NC_018676	ATAAA	2	10	68244	68253	80 %	20 %	0 %	0 %	407681403
61	NC_018676	CAAAA	2	10	68340	68349	80 %	0 %	0 %	20 %	407681403
62	NC_018676	TATAA	2	10	68588	68597	60 %	40 %	0 %	0 %	407681403
63	NC_018676	ATGTG	2	10	68659	68668	20 %	40 %	40 %	0 %	407681403
64	NC_018676	AAAAT	2	10	68900	68909	80 %	20 %	0 %	0 %	407681403
65	NC_018676	AAGAG	2	10	69174	69183	60 %	0 %	40 %	0 %	407681404
66	NC_018676	TAATA	2	10	69447	69456	60 %	40 %	0 %	0 %	407681404
67	NC_018676	TTAAA	2	10	69566	69575	60 %	40 %	0 %	0 %	407681404
68	NC_018676	ATTTT	2	10	70635	70644	20 %	80 %	0 %	0 %	407681405
69	NC_018676	AAAAG	2	10	70756	70765	80 %	0 %	20 %	0 %	407681405
70	NC_018676	ACAAA	2	10	70866	70875	80 %	0 %	0 %	20 %	407681405
71	NC_018676	ATTTA	2	10	70898	70907	40 %	60 %	0 %	0 %	407681405
72	NC_018676	AATAT	2	10	70979	70988	60 %	40 %	0 %	0 %	407681405
73	NC_018676	AAAAG	2	10	72456	72465	80 %	0 %	20 %	0 %	407681407
74	NC_018676	AAACA	2	10	72611	72620	80 %	0 %	0 %	20 %	407681407
75	NC_018676	TTACA	2	10	72639	72648	40 %	40 %	0 %	20 %	407681407
76	NC_018676	TTTTA	2	10	73163	73172	20 %	80 %	0 %	0 %	407681408
77	NC_018676	GTTTT	2	10	73363	73372	0 %	80 %	20 %	0 %	407681408
78	NC_018676	GATTT	2	10	74430	74439	20 %	60 %	20 %	0 %	407681409
79	NC_018676	AAGCA	2	10	76350	76359	60 %	0 %	20 %	20 %	407681410
80	NC_018676	AGTGT	2	10	76542	76551	20 %	40 %	40 %	0 %	407681410
81	NC_018676	ATTTA	2	10	77385	77394	40 %	60 %	0 %	0 %	407681412
82	NC_018676	ATTTG	2	10	79099	79108	20 %	60 %	20 %	0 %	407681415
83	NC_018676	TAAAA	2	10	79258	79267	80 %	20 %	0 %	0 %	407681415
84	NC_018676	TCAAA	2	10	81664	81673	60 %	20 %	0 %	20 %	407681416
85	NC_018676	AATAG	2	10	82876	82885	60 %	20 %	20 %	0 %	407681416
86	NC_018676	ATTAG	2	10	82933	82942	40 %	40 %	20 %	0 %	407681416
87	NC_018676	TAAAT	2	10	83124	83133	60 %	40 %	0 %	0 %	407681416
88	NC_018676	AAAAT	2	10	83508	83517	80 %	20 %	0 %	0 %	407681417
89	NC_018676	GGTGA	2	10	83595	83604	20 %	20 %	60 %	0 %	407681417
90	NC_018676	AAAAT	2	10	84121	84130	80 %	20 %	0 %	0 %	407681417
91	NC_018676	TATAT	2	10	85018	85027	40 %	60 %	0 %	0 %	407681417
92	NC_018676	TGAAA	2	10	89096	89105	60 %	20 %	20 %	0 %	407681420
93	NC_018676	ACAAT	2	10	89186	89195	60 %	20 %	0 %	20 %	407681420
94	NC_018676	AAAAT	2	10	89571	89580	80 %	20 %	0 %	0 %	407681420
95	NC_018676	GTAGA	2	10	91393	91402	40 %	20 %	40 %	0 %	407681421
96	NC_018676	ATTTT	2	10	91694	91703	20 %	80 %	0 %	0 %	407681421
97	NC_018676	TTAAT	2	10	91786	91795	40 %	60 %	0 %	0 %	407681421
98	NC_018676	CAAGG	2	10	92934	92943	40 %	0 %	40 %	20 %	407681424
99	NC_018676	AAAAT	2	10	93285	93294	80 %	20 %	0 %	0 %	407681424
100	NC_018676	CAGAA	2	10	95235	95244	60 %	0 %	20 %	20 %	407681429
101	NC_018676	TAAAA	2	10	95617	95626	80 %	20 %	0 %	0 %	407681429
102	NC_018676	GTAAA	2	10	96868	96877	60 %	20 %	20 %	0 %	407681433
103	NC_018676	TTAAT	2	10	99546	99555	40 %	60 %	0 %	0 %	407681438
104	NC_018676	ATTTT	2	10	101611	101620	20 %	80 %	0 %	0 %	407681442
105	NC_018676	AGGCA	2	10	104392	104401	40 %	0 %	40 %	20 %	407681447
106	NC_018676	AAAAC	2	10	107967	107976	80 %	0 %	0 %	20 %	407681451
107	NC_018676	TTAGG	2	10	109250	109259	20 %	40 %	40 %	0 %	407681453
108	NC_018676	GTTTG	2	10	110443	110452	0 %	60 %	40 %	0 %	407681453
109	NC_018676	ATTTT	2	10	110492	110501	20 %	80 %	0 %	0 %	407681453
110	NC_018676	AAGTA	2	10	112796	112805	60 %	20 %	20 %	0 %	407681454
111	NC_018676	ATCAA	2	10	115144	115153	60 %	20 %	0 %	20 %	407681456
112	NC_018676	TAATC	2	10	115257	115266	40 %	40 %	0 %	20 %	407681456
113	NC_018676	CTAAC	2	10	126108	126117	40 %	20 %	0 %	40 %	407681462
114	NC_018676	CTAAC	2	10	126138	126147	40 %	20 %	0 %	40 %	407681462
115	NC_018676	CTAAC	2	10	126168	126177	40 %	20 %	0 %	40 %	407681462
116	NC_018676	TAAAG	2	10	129437	129446	60 %	20 %	20 %	0 %	407681464
117	NC_018676	GATAT	2	10	130422	130431	40 %	40 %	20 %	0 %	407681464
118	NC_018676	AAAGT	2	10	130759	130768	60 %	20 %	20 %	0 %	407681464
119	NC_018676	ACAGG	2	10	130890	130899	40 %	0 %	40 %	20 %	407681464
120	NC_018676	AAATA	2	10	131701	131710	80 %	20 %	0 %	0 %	407681464
121	NC_018676	TAAGA	2	10	131729	131738	60 %	20 %	20 %	0 %	407681464
122	NC_018676	AGAAA	2	10	132348	132357	80 %	0 %	20 %	0 %	407681465
123	NC_018676	TTGCT	2	10	134434	134443	0 %	60 %	20 %	20 %	407681466
124	NC_018676	ATATT	2	10	136546	136555	40 %	60 %	0 %	0 %	407681469
125	NC_018676	TATAG	2	10	137502	137511	40 %	40 %	20 %	0 %	407681472
126	NC_018676	GTTTT	2	10	139905	139914	0 %	80 %	20 %	0 %	407681473
127	NC_018676	AAAAT	2	10	141977	141986	80 %	20 %	0 %	0 %	407681475
128	NC_018676	AAAAT	2	10	142674	142683	80 %	20 %	0 %	0 %	407681475
129	NC_018676	GTGAT	2	10	142761	142770	20 %	40 %	40 %	0 %	407681475
130	NC_018676	GTTGA	2	10	143317	143326	20 %	40 %	40 %	0 %	407681476
131	NC_018676	TATAT	2	10	144075	144084	40 %	60 %	0 %	0 %	407681477
132	NC_018676	GGAAT	2	10	144549	144558	40 %	20 %	40 %	0 %	407681477
133	NC_018676	TAAAT	2	10	145232	145241	60 %	40 %	0 %	0 %	407681477
134	NC_018676	TGGAA	2	10	145494	145503	40 %	20 %	40 %	0 %	407681477
135	NC_018676	ATTTA	2	10	146089	146098	40 %	60 %	0 %	0 %	407681478
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.