MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 3716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
2	NC_018676	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
3	NC_018676	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
4	NC_018676	ATG	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
5	NC_018676	CAG	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
6	NC_018676	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681355
7	NC_018676	TAA	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
8	NC_018676	CTA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
9	NC_018676	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681355
10	NC_018676	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
11	NC_018676	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681355
12	NC_018676	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
13	NC_018676	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
14	NC_018676	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
15	NC_018676	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681355
16	NC_018676	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681355
17	NC_018676	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
18	NC_018676	ACT	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
19	NC_018676	GAT	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
20	NC_018676	ATA	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
21	NC_018676	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
22	NC_018676	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
23	NC_018676	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681355
24	NC_018676	GGT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
25	NC_018676	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
26	NC_018676	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
27	NC_018676	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
28	NC_018676	CTC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681355
29	NC_018676	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
30	NC_018676	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
31	NC_018676	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
32	NC_018676	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
33	NC_018676	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
34	NC_018676	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
35	NC_018676	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
36	NC_018676	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
37	NC_018676	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
38	NC_018676	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
39	NC_018676	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681355
40	NC_018676	TGT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681355
41	NC_018676	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
42	NC_018676	TAA	3	9	1908	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
43	NC_018676	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681356
44	NC_018676	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
45	NC_018676	CTG	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681356
46	NC_018676	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681356
47	NC_018676	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
48	NC_018676	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
49	NC_018676	CAA	4	12	2247	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681356
50	NC_018676	ACA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681356
51	NC_018676	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681356
52	NC_018676	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681356
53	NC_018676	GTA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681356
54	NC_018676	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681356
55	NC_018676	TTA	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
56	NC_018676	ATA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
57	NC_018676	GTT	2	6	4443	4448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681357
58	NC_018676	ATT	2	6	4478	4483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
59	NC_018676	ATA	3	9	4489	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
60	NC_018676	CTG	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681357
61	NC_018676	AAC	2	6	4622	4627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681357
62	NC_018676	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
63	NC_018676	GTT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681357
64	NC_018676	TAA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
65	NC_018676	ATT	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
66	NC_018676	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
67	NC_018676	ATT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
68	NC_018676	TAT	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
69	NC_018676	AGT	2	6	5146	5151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681357
70	NC_018676	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681357
71	NC_018676	ATA	2	6	5170	5175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
72	NC_018676	ATA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
73	NC_018676	ATA	2	6	5208	5213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
74	NC_018676	AGA	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681357
75	NC_018676	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
76	NC_018676	TAA	2	6	5395	5400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
77	NC_018676	ATT	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
78	NC_018676	CTT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681357
79	NC_018676	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
80	NC_018676	ATT	2	6	5537	5542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
81	NC_018676	ATA	2	6	5580	5585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
82	NC_018676	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
83	NC_018676	TAT	2	6	5602	5607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
84	NC_018676	TTA	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
85	NC_018676	TAA	2	6	5652	5657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681357
86	NC_018676	ATT	2	6	5663	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681357
87	NC_018676	TAA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
88	NC_018676	ATT	2	6	5782	5787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
89	NC_018676	TAA	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
90	NC_018676	ATA	2	6	5895	5900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
91	NC_018676	TAA	2	6	5994	5999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
92	NC_018676	TCC	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681358
93	NC_018676	TTA	4	12	6155	6166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
94	NC_018676	ATA	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
95	NC_018676	ATA	2	6	6343	6348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
96	NC_018676	TAA	2	6	6414	6419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
97	NC_018676	GCT	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681358
98	NC_018676	TAA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
99	NC_018676	TTA	2	6	6668	6673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
100	NC_018676	ATT	2	6	6778	6783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
101	NC_018676	AAT	2	6	6831	6836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
102	NC_018676	CAA	2	6	6852	6857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681358
103	NC_018676	TTA	2	6	6883	6888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681358
104	NC_018676	TAC	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681358
105	NC_018676	TAA	2	6	6936	6941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681358
106	NC_018676	ACC	2	6	7021	7026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407681358
107	NC_018676	AAC	2	6	7106	7111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681358
108	NC_018676	TAA	2	6	7211	7216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
109	NC_018676	CAA	2	6	7231	7236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681359
110	NC_018676	TAT	2	6	7321	7326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
111	NC_018676	TTA	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
112	NC_018676	AAC	2	6	7457	7462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681359
113	NC_018676	TAA	2	6	7479	7484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
114	NC_018676	AGC	2	6	7508	7513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681359
115	NC_018676	ATT	2	6	7536	7541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
116	NC_018676	GAA	2	6	7542	7547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681359
117	NC_018676	ACA	2	6	7556	7561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681359
118	NC_018676	TAT	2	6	7576	7581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
119	NC_018676	TTA	2	6	7612	7617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
120	NC_018676	TAA	2	6	7643	7648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
121	NC_018676	TTA	2	6	7698	7703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
122	NC_018676	TAA	2	6	7711	7716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
123	NC_018676	TTA	2	6	7719	7724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
124	NC_018676	CTA	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681359
125	NC_018676	TTG	2	6	7809	7814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681359
126	NC_018676	TAA	2	6	7870	7875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
127	NC_018676	ACC	2	6	7898	7903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407681359
128	NC_018676	ATA	2	6	7919	7924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
129	NC_018676	ATT	2	6	8001	8006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681359
130	NC_018676	ATC	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681359
131	NC_018676	TAA	3	9	8183	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681359
132	NC_018676	TGC	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681359
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