MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 1581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	AGGTAA	2	12	2969	2980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472535
2	NC_018664	ATAGAG	2	12	3326	3337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472536
3	NC_018664	AGATAT	2	12	3598	3609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472536
4	NC_018664	GAAAAT	2	12	3811	3822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472536
5	NC_018664	GGTATA	2	12	4846	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
6	NC_018664	AAACTA	2	12	5624	5635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407472538
7	NC_018664	TGATGG	2	12	6897	6908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407472539
8	NC_018664	ACATTT	2	12	16695	16706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407472543
9	NC_018664	ATTGGA	2	12	18904	18915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472545
10	NC_018664	TAGAAG	2	12	24661	24672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472550
11	NC_018664	CAAGAC	2	12	29605	29616	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407472556
12	NC_018664	GCTGTA	2	12	31036	31047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407472557
13	NC_018664	TATTGA	2	12	32883	32894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472559
14	NC_018664	GTAGAA	2	12	33788	33799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472560
15	NC_018664	TTTAGG	2	12	35991	36002	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407472562
16	NC_018664	TTTTGC	2	12	40701	40712	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407472570
17	NC_018664	TTTTGC	2	12	42576	42587	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407472572
18	NC_018664	TTAAAA	2	12	42910	42921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472572
19	NC_018664	CCATAC	2	12	44165	44176	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407472573
20	NC_018664	TTTTGC	2	12	44812	44823	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407472574
21	NC_018664	TTAAAA	2	12	45146	45157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472574
22	NC_018664	TAGTTT	2	12	46011	46022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407472575
23	NC_018664	CCTTCA	2	12	47119	47130	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407472575
24	NC_018664	ATCAGA	2	12	47879	47890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472576
25	NC_018664	ATTAAA	2	12	48828	48839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472577
26	NC_018664	TAAATT	2	12	50052	50063	50 %	50 %	0 %	0 %	407472577
27	NC_018664	GAAGTA	2	12	50296	50307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472577
28	NC_018664	AGCTAT	2	12	52206	52217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472580
29	NC_018664	AAGTGA	2	12	53922	53933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472581
30	NC_018664	GAAAAT	2	12	53971	53982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472581
31	NC_018664	TGTAGT	2	12	57110	57121	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407472583
32	NC_018664	TATAAA	2	12	60502	60513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472586
33	NC_018664	ATATTA	2	12	60539	60550	50 %	50 %	0 %	0 %	407472586
34	NC_018664	GGATAT	2	12	61961	61972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472587
35	NC_018664	ACTTTA	2	12	64428	64439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407472589
36	NC_018664	TACAGT	2	12	64787	64798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472589
37	NC_018664	GAAAAA	2	12	64921	64932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472589
38	NC_018664	TATGCT	2	12	65324	65335	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407472589
39	NC_018664	GTATTT	2	12	69563	69574	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407472593
40	NC_018664	AGGACT	2	12	78752	78763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407472602
41	NC_018664	GAAATC	2	12	78825	78836	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472602
42	NC_018664	CAAAAA	2	12	79488	79499	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407472602
43	NC_018664	ATAAGA	2	12	83666	83677	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472606
44	NC_018664	AAGAAA	2	12	84308	84319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472607
45	NC_018664	TTTAGA	2	12	85108	85119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472608
46	NC_018664	ATTTAG	2	12	85155	85166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472608
47	NC_018664	AGATGG	2	12	85279	85290	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407472608
48	NC_018664	GGATAT	2	12	86933	86944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472609
49	NC_018664	TATATT	2	12	87485	87496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472610
50	NC_018664	ATATTT	2	12	89836	89847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472612
51	NC_018664	TGAAAA	2	12	92983	92994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472615
52	NC_018664	TTAAAG	2	12	94075	94086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472617
53	NC_018664	CCATAA	2	12	94657	94668	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407472618
54	NC_018664	GGATTT	2	12	95830	95841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407472619
55	NC_018664	ATAACT	2	12	96285	96296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407472620
56	NC_018664	GGATAT	2	12	97188	97199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472620
57	NC_018664	ACAAGT	2	12	100180	100191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472624
58	NC_018664	AAAGAA	2	12	100250	100261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472624
59	NC_018664	AAGAAA	2	12	103053	103064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472626
60	NC_018664	ATTTGC	2	12	105080	105091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407472630
61	NC_018664	AGAAGT	2	12	107956	107967	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472634
62	NC_018664	AAAGTA	2	12	108150	108161	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472635
63	NC_018664	AGAGAA	2	12	112191	112202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472639
64	NC_018664	AGGAAC	2	12	115284	115295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407472644
65	NC_018664	TCAAAA	2	12	120153	120164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407472649
66	NC_018664	GAAGTA	2	12	122875	122886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472651
67	NC_018664	TAAAAG	2	12	123413	123424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472652
68	NC_018664	ACAGCA	2	12	123985	123996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407472652
69	NC_018664	TAAAGT	2	12	125627	125638	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472654
70	NC_018664	AGATGA	2	12	126077	126088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472655
71	NC_018664	TGAAGA	2	12	126725	126736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472655
72	NC_018664	AATTTA	2	12	131845	131856	50 %	50 %	0 %	0 %	407472663
73	NC_018664	ATTTAA	2	12	133445	133456	50 %	50 %	0 %	0 %	407472664
74	NC_018664	ATATAG	2	12	134083	134094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472664
75	NC_018664	AGGCGA	2	12	135164	135175	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407472666
76	NC_018664	TTTGAT	2	12	137676	137687	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407472668
77	NC_018664	ATAGAG	2	12	143048	143059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472672
78	NC_018664	AGAACA	2	12	148515	148526	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407472677
79	NC_018664	ATAGAT	2	12	151549	151560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472680
80	NC_018664	CTATAG	2	12	153575	153586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472682
81	NC_018664	TATAGC	2	12	156389	156400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472684
82	NC_018664	TAAAGT	2	12	158352	158363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472685
83	NC_018664	GTAGCA	2	12	158994	159005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407472686
84	NC_018664	TAGATG	2	12	162217	162228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472689
85	NC_018664	CTAGTA	2	12	163961	163972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472691
86	NC_018664	TCTGAC	2	12	164170	164181	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407472691
87	NC_018664	TTTTAA	2	12	165172	165183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472692
88	NC_018664	ATAGCA	2	12	165492	165503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472693
89	NC_018664	AGAAGT	2	12	167033	167044	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472693
90	NC_018664	ATAGTA	2	12	167355	167366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472693
91	NC_018664	ATAGAC	2	12	168810	168821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472693
92	NC_018664	TTATGA	2	12	170411	170422	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472693
93	NC_018664	CAAATA	2	12	170935	170946	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407472693
94	NC_018664	AAGGAC	2	12	171424	171435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407472694
95	NC_018664	GAAAGA	2	12	171735	171746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472694
96	NC_018664	AGATGT	2	12	172358	172369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472694
97	NC_018664	CAATAT	2	12	173551	173562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407472694
98	NC_018664	AGTGCA	2	12	176190	176201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407472696
99	NC_018664	ACTAGT	2	12	176828	176839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472697
100	NC_018664	TTTGCA	2	12	176868	176879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407472697
101	NC_018664	AGATAA	2	12	177521	177532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472697
102	NC_018664	AACTTT	2	12	177609	177620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407472697
103	NC_018664	GAATTA	2	12	177849	177860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472697
104	NC_018664	AAATAG	2	12	183175	183186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472700
105	NC_018664	ACGATA	2	12	184739	184750	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472701
106	NC_018664	TCATGT	2	12	187515	187526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407472704
107	NC_018664	TATAAA	2	12	187614	187625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472704
108	NC_018664	TGAATT	2	12	188006	188017	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472704
109	NC_018664	AGGTGA	2	12	189961	189972	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407472707
110	NC_018664	TTTAAT	2	12	191036	191047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472708
111	NC_018664	ATAAAG	2	12	191050	191061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472708
112	NC_018664	AGGGGA	2	12	193646	193657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472711
113	NC_018664	TAAAGA	2	12	193943	193954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472711
114	NC_018664	TAGCTA	2	12	194832	194843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472712
115	NC_018664	ATTAAA	2	12	194953	194964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472712
116	NC_018664	TGTAAT	2	12	195028	195039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472712
117	NC_018664	CCTATA	2	12	197193	197204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472715
118	NC_018664	TAGAAA	2	12	200268	200279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472720
119	NC_018664	TTATAG	2	12	200490	200501	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472720
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