MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 39343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	ATA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
2	NC_018664	AAG	2	6	303	308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472533
3	NC_018664	AAT	2	6	359	364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
4	NC_018664	TGC	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472533
5	NC_018664	GGA	2	6	539	544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472533
6	NC_018664	GTA	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472533
7	NC_018664	ATC	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472533
8	NC_018664	GAT	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472533
9	NC_018664	AAG	2	6	765	770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472533
10	NC_018664	ATT	2	6	815	820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472533
11	NC_018664	ATG	2	6	981	986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472533
12	NC_018664	TAA	2	6	1044	1049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
13	NC_018664	TAG	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472533
14	NC_018664	TTC	2	6	1063	1068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472533
15	NC_018664	AGA	2	6	1102	1107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472533
16	NC_018664	ATC	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472533
17	NC_018664	GGA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472533
18	NC_018664	TGG	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472533
19	NC_018664	TAC	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472533
20	NC_018664	ATA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
21	NC_018664	AAT	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
22	NC_018664	ATC	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472534
23	NC_018664	AGA	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472534
24	NC_018664	GTA	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472534
25	NC_018664	ATA	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
26	NC_018664	TTA	2	6	2079	2084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472534
27	NC_018664	TAA	2	6	2285	2290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
28	NC_018664	AGA	2	6	2297	2302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472534
29	NC_018664	TGA	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472534
30	NC_018664	ATA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
31	NC_018664	ATT	2	6	2343	2348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472534
32	NC_018664	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
33	NC_018664	ATA	2	6	2415	2420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
34	NC_018664	TAA	2	6	2518	2523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
35	NC_018664	ATT	2	6	2550	2555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472534
36	NC_018664	GAA	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472534
37	NC_018664	GAA	2	6	2676	2681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472534
38	NC_018664	TAA	2	6	2719	2724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
39	NC_018664	ATA	2	6	2777	2782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
40	NC_018664	ATG	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472535
41	NC_018664	GTG	2	6	2933	2938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472535
42	NC_018664	TAA	2	6	2954	2959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472535
43	NC_018664	AAG	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472535
44	NC_018664	GAA	2	6	3006	3011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472535
45	NC_018664	AAG	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472535
46	NC_018664	TAG	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472535
47	NC_018664	TAA	2	6	3059	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472535
48	NC_018664	AGT	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472536
49	NC_018664	TGT	2	6	3501	3506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472536
50	NC_018664	AGA	2	6	3519	3524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472536
51	NC_018664	TAA	2	6	3533	3538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
52	NC_018664	GGT	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472536
53	NC_018664	ATA	2	6	3623	3628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
54	NC_018664	ATT	2	6	3633	3638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472536
55	NC_018664	TAA	2	6	3645	3650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
56	NC_018664	CAA	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472536
57	NC_018664	ATA	2	6	3736	3741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
58	NC_018664	GAA	2	6	3859	3864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472536
59	NC_018664	AGA	2	6	3876	3881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472536
60	NC_018664	TTA	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472536
61	NC_018664	TAC	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472536
62	NC_018664	TAA	2	6	3983	3988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
63	NC_018664	CAA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472536
64	NC_018664	CTG	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472536
65	NC_018664	GAT	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472536
66	NC_018664	TAC	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472536
67	NC_018664	TAA	2	6	4184	4189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
68	NC_018664	GAT	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472536
69	NC_018664	GAT	2	6	4213	4218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472536
70	NC_018664	TGT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472537
71	NC_018664	AGA	2	6	4402	4407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472537
72	NC_018664	CAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472538
73	NC_018664	CAT	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472538
74	NC_018664	AGT	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
75	NC_018664	GGT	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472538
76	NC_018664	AGG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472538
77	NC_018664	TGT	2	6	4986	4991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472538
78	NC_018664	GTA	2	6	5017	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
79	NC_018664	TGA	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
80	NC_018664	TAC	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472538
81	NC_018664	TGA	2	6	5151	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
82	NC_018664	AAT	2	6	5226	5231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472538
83	NC_018664	AGA	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
84	NC_018664	TGT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472538
85	NC_018664	ACT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472538
86	NC_018664	TAA	2	6	5430	5435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472538
87	NC_018664	AGG	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472538
88	NC_018664	TAA	2	6	5495	5500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472538
89	NC_018664	TTA	2	6	5524	5529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472538
90	NC_018664	GAT	2	6	5557	5562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
91	NC_018664	TAT	2	6	5585	5590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472538
92	NC_018664	GTA	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
93	NC_018664	AGA	2	6	5703	5708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
94	NC_018664	AAG	2	6	5717	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
95	NC_018664	GGC	2	6	5751	5756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407472538
96	NC_018664	AGA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
97	NC_018664	CAG	2	6	5900	5905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472538
98	NC_018664	CAA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472538
99	NC_018664	TAA	2	6	6098	6103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472538
100	NC_018664	TTC	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472538
101	NC_018664	ATG	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
102	NC_018664	GAA	2	6	6296	6301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
103	NC_018664	AAC	2	6	6350	6355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472538
104	NC_018664	TAC	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472538
105	NC_018664	AGA	2	6	6408	6413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
106	NC_018664	GCA	4	12	6415	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472538
107	NC_018664	GAT	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
108	NC_018664	AAG	2	6	6468	6473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
109	NC_018664	GAT	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472539
110	NC_018664	AGA	2	6	6603	6608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472539
111	NC_018664	AGA	2	6	6697	6702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472539
112	NC_018664	ATG	2	6	6818	6823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472539
113	NC_018664	GCT	2	6	6913	6918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472539
114	NC_018664	TAG	2	6	7041	7046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472539
115	NC_018664	ATC	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472539
116	NC_018664	TAG	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472539
117	NC_018664	AGA	2	6	7176	7181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472539
118	NC_018664	ATC	2	6	7326	7331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472539
119	NC_018664	ATA	2	6	7333	7338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472539
120	NC_018664	TAT	2	6	7551	7556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472539
121	NC_018664	GAT	2	6	7605	7610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472539
122	NC_018664	ATC	2	6	7625	7630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472539
123	NC_018664	AAG	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472539
124	NC_018664	GAA	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472539
125	NC_018664	TAA	2	6	7745	7750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472539
126	NC_018664	TCA	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472539
127	NC_018664	ACT	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472539
128	NC_018664	TGA	2	6	7787	7792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472539
129	NC_018664	AGA	3	9	7878	7886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472539
130	NC_018664	TGA	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472539
131	NC_018664	AAG	2	6	8004	8009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472539
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