MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 66428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	AATG	2	8	96	103	50 %	25 %	25 %	0 %	407472533
2	NC_018664	ATA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
3	NC_018664	ATGA	2	8	209	216	50 %	25 %	25 %	0 %	407472533
4	NC_018664	AAG	2	6	303	308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472533
5	NC_018664	AAT	2	6	359	364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
6	NC_018664	TA	3	6	431	436	50 %	50 %	0 %	0 %	407472533
7	NC_018664	TGC	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472533
8	NC_018664	GGA	2	6	539	544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472533
9	NC_018664	ATGC	2	8	569	576	25 %	25 %	25 %	25 %	407472533
10	NC_018664	GTA	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472533
11	NC_018664	ATC	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472533
12	NC_018664	AAGT	2	8	694	701	50 %	25 %	25 %	0 %	407472533
13	NC_018664	GAT	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472533
14	NC_018664	GAAC	2	8	755	762	50 %	0 %	25 %	25 %	407472533
15	NC_018664	AAG	2	6	765	770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472533
16	NC_018664	T	6	6	773	778	0 %	100 %	0 %	0 %	407472533
17	NC_018664	ATT	2	6	815	820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472533
18	NC_018664	A	6	6	946	951	100 %	0 %	0 %	0 %	407472533
19	NC_018664	ATG	2	6	981	986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472533
20	NC_018664	AT	4	8	992	999	50 %	50 %	0 %	0 %	407472533
21	NC_018664	TAA	2	6	1044	1049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
22	NC_018664	TAG	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472533
23	NC_018664	TTC	2	6	1063	1068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472533
24	NC_018664	AGA	2	6	1102	1107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472533
25	NC_018664	ATC	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472533
26	NC_018664	GGA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472533
27	NC_018664	A	7	7	1217	1223	100 %	0 %	0 %	0 %	407472533
28	NC_018664	AG	3	6	1271	1276	50 %	0 %	50 %	0 %	407472533
29	NC_018664	TC	3	6	1289	1294	0 %	50 %	0 %	50 %	407472533
30	NC_018664	TGG	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472533
31	NC_018664	TAC	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472533
32	NC_018664	A	7	7	1393	1399	100 %	0 %	0 %	0 %	407472533
33	NC_018664	ATA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
34	NC_018664	AAT	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472533
35	NC_018664	AATA	2	8	1721	1728	75 %	25 %	0 %	0 %	407472534
36	NC_018664	ATC	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472534
37	NC_018664	GTAAT	2	10	1858	1867	40 %	40 %	20 %	0 %	407472534
38	NC_018664	AGA	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472534
39	NC_018664	GTA	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472534
40	NC_018664	ATA	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
41	NC_018664	A	6	6	2038	2043	100 %	0 %	0 %	0 %	407472534
42	NC_018664	TTA	2	6	2079	2084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472534
43	NC_018664	TAA	2	6	2285	2290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
44	NC_018664	AGA	2	6	2297	2302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472534
45	NC_018664	TGA	2	6	2303	2308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472534
46	NC_018664	ATA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
47	NC_018664	ATT	2	6	2343	2348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472534
48	NC_018664	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
49	NC_018664	ATA	2	6	2415	2420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
50	NC_018664	TAA	2	6	2518	2523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
51	NC_018664	AT	3	6	2530	2535	50 %	50 %	0 %	0 %	407472534
52	NC_018664	ATT	2	6	2550	2555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472534
53	NC_018664	GAA	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472534
54	NC_018664	AT	3	6	2642	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	407472534
55	NC_018664	GAA	2	6	2676	2681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472534
56	NC_018664	TAA	2	6	2719	2724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
57	NC_018664	TACT	2	8	2747	2754	25 %	50 %	0 %	25 %	407472534
58	NC_018664	ATA	2	6	2777	2782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472534
59	NC_018664	ATG	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472535
60	NC_018664	GTG	2	6	2933	2938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472535
61	NC_018664	TAA	2	6	2954	2959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472535
62	NC_018664	AAG	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472535
63	NC_018664	AGGTAA	2	12	2969	2980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472535
64	NC_018664	GA	3	6	2998	3003	50 %	0 %	50 %	0 %	407472535
65	NC_018664	GAA	2	6	3006	3011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472535
66	NC_018664	AAG	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472535
67	NC_018664	TAG	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472535
68	NC_018664	TAA	2	6	3059	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472535
69	NC_018664	AG	3	6	3171	3176	50 %	0 %	50 %	0 %	407472536
70	NC_018664	ATTA	2	8	3183	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	407472536
71	NC_018664	A	6	6	3205	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	407472536
72	NC_018664	TAAA	2	8	3224	3231	75 %	25 %	0 %	0 %	407472536
73	NC_018664	AAAC	2	8	3269	3276	75 %	0 %	0 %	25 %	407472536
74	NC_018664	AT	4	8	3289	3296	50 %	50 %	0 %	0 %	407472536
75	NC_018664	ATAGAG	2	12	3326	3337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472536
76	NC_018664	AT	3	6	3366	3371	50 %	50 %	0 %	0 %	407472536
77	NC_018664	AGT	2	6	3381	3386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472536
78	NC_018664	AT	3	6	3405	3410	50 %	50 %	0 %	0 %	407472536
79	NC_018664	AAATT	2	10	3413	3422	60 %	40 %	0 %	0 %	407472536
80	NC_018664	A	6	6	3425	3430	100 %	0 %	0 %	0 %	407472536
81	NC_018664	AATA	2	8	3450	3457	75 %	25 %	0 %	0 %	407472536
82	NC_018664	TGT	2	6	3501	3506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472536
83	NC_018664	AGA	2	6	3519	3524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472536
84	NC_018664	TAA	2	6	3533	3538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
85	NC_018664	GGT	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472536
86	NC_018664	AG	3	6	3552	3557	50 %	0 %	50 %	0 %	407472536
87	NC_018664	AGATAT	2	12	3598	3609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472536
88	NC_018664	ATA	2	6	3623	3628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
89	NC_018664	ATT	2	6	3633	3638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472536
90	NC_018664	TAA	2	6	3645	3650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
91	NC_018664	A	6	6	3657	3662	100 %	0 %	0 %	0 %	407472536
92	NC_018664	CAA	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472536
93	NC_018664	ATA	2	6	3736	3741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
94	NC_018664	A	6	6	3796	3801	100 %	0 %	0 %	0 %	407472536
95	NC_018664	GAAAAT	2	12	3811	3822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472536
96	NC_018664	GAA	2	6	3859	3864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472536
97	NC_018664	AGA	2	6	3876	3881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472536
98	NC_018664	TTA	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472536
99	NC_018664	TAC	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472536
100	NC_018664	TAA	2	6	3983	3988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
101	NC_018664	CAA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472536
102	NC_018664	CTG	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472536
103	NC_018664	GAT	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472536
104	NC_018664	TAC	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472536
105	NC_018664	TAA	2	6	4184	4189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472536
106	NC_018664	GAT	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472536
107	NC_018664	GAT	2	6	4213	4218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472536
108	NC_018664	TAAT	2	8	4247	4254	50 %	50 %	0 %	0 %	407472536
109	NC_018664	TA	3	6	4268	4273	50 %	50 %	0 %	0 %	407472536
110	NC_018664	TGT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472537
111	NC_018664	AGA	2	6	4402	4407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472537
112	NC_018664	TA	3	6	4448	4453	50 %	50 %	0 %	0 %	407472537
113	NC_018664	A	6	6	4478	4483	100 %	0 %	0 %	0 %	407472537
114	NC_018664	AT	3	6	4511	4516	50 %	50 %	0 %	0 %	407472537
115	NC_018664	AT	3	6	4524	4529	50 %	50 %	0 %	0 %	407472537
116	NC_018664	AT	3	6	4569	4574	50 %	50 %	0 %	0 %	407472537
117	NC_018664	CAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472538
118	NC_018664	CAT	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472538
119	NC_018664	AGT	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
120	NC_018664	GGTATA	2	12	4846	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
121	NC_018664	GGT	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407472538
122	NC_018664	AGG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472538
123	NC_018664	TGT	2	6	4986	4991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472538
124	NC_018664	GTA	2	6	5017	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
125	NC_018664	TGA	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
126	NC_018664	TAC	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472538
127	NC_018664	TGA	2	6	5151	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
128	NC_018664	TAAA	2	8	5210	5217	75 %	25 %	0 %	0 %	407472538
129	NC_018664	AAT	2	6	5226	5231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472538
130	NC_018664	AGA	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
131	NC_018664	TGT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472538
132	NC_018664	ACT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472538
133	NC_018664	TAA	2	6	5430	5435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472538
134	NC_018664	AGG	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472538
135	NC_018664	TAA	2	6	5495	5500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472538
136	NC_018664	TTA	2	6	5524	5529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472538
137	NC_018664	GAT	2	6	5557	5562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
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141	NC_018664	AGA	2	6	5703	5708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
142	NC_018664	AAG	2	6	5717	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
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145	NC_018664	AGA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472538
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149	NC_018664	TAGAT	2	10	5988	5997	40 %	40 %	20 %	0 %	407472538
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167	NC_018664	A	6	6	6504	6509	100 %	0 %	0 %	0 %	407472538
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269	NC_018664	TA	4	8	10047	10054	50 %	50 %	0 %	0 %	407472542
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