MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 66428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_018664	AAGG	2	8	25895	25902	50 %	0 %	50 %	0 %	407472552
503	NC_018664	GGA	2	6	25948	25953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407472552
504	NC_018664	AT	3	6	25963	25968	50 %	50 %	0 %	0 %	407472552
505	NC_018664	TGC	2	6	26103	26108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472552
506	NC_018664	GCA	2	6	26140	26145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472552
507	NC_018664	A	6	6	26274	26279	100 %	0 %	0 %	0 %	407472552
508	NC_018664	TAA	2	6	26303	26308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472552
509	NC_018664	GTA	2	6	26338	26343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472552
510	NC_018664	GGAA	2	8	26352	26359	50 %	0 %	50 %	0 %	407472552
511	NC_018664	ATG	2	6	26414	26419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472552
512	NC_018664	TAC	2	6	26453	26458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472552
513	NC_018664	AAT	2	6	26475	26480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472552
514	NC_018664	A	7	7	26508	26514	100 %	0 %	0 %	0 %	407472552
515	NC_018664	GGAT	2	8	26515	26522	25 %	25 %	50 %	0 %	407472552
516	NC_018664	TTC	2	6	26603	26608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472553
517	NC_018664	T	6	6	26614	26619	0 %	100 %	0 %	0 %	407472553
518	NC_018664	TTAA	2	8	26647	26654	50 %	50 %	0 %	0 %	407472553
519	NC_018664	TAT	3	9	26723	26731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472553
520	NC_018664	ATAA	2	8	26733	26740	75 %	25 %	0 %	0 %	407472553
521	NC_018664	T	6	6	26789	26794	0 %	100 %	0 %	0 %	407472553
522	NC_018664	CCA	2	6	26833	26838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407472553
523	NC_018664	CAATC	2	10	26846	26855	40 %	20 %	0 %	40 %	407472553
524	NC_018664	A	7	7	26949	26955	100 %	0 %	0 %	0 %	407472553
525	NC_018664	TAA	3	9	26966	26974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472553
526	NC_018664	AAT	2	6	27006	27011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472553
527	NC_018664	TAT	2	6	27044	27049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472553
528	NC_018664	GTC	2	6	27129	27134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472553
529	NC_018664	TGTT	2	8	27152	27159	0 %	75 %	25 %	0 %	407472553
530	NC_018664	AAT	2	6	27169	27174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472553
531	NC_018664	GTTT	2	8	27262	27269	0 %	75 %	25 %	0 %	407472553
532	NC_018664	ATTTT	2	10	27307	27316	20 %	80 %	0 %	0 %	407472553
533	NC_018664	T	7	7	27313	27319	0 %	100 %	0 %	0 %	407472553
534	NC_018664	AT	3	6	27323	27328	50 %	50 %	0 %	0 %	407472553
535	NC_018664	T	7	7	27381	27387	0 %	100 %	0 %	0 %	407472553
536	NC_018664	CAA	2	6	27398	27403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472553
537	NC_018664	TCA	2	6	27466	27471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472553
538	NC_018664	TTATT	2	10	27801	27810	20 %	80 %	0 %	0 %	407472554
539	NC_018664	GAA	2	6	27962	27967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472554
540	NC_018664	CTT	2	6	28257	28262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472555
541	NC_018664	GCA	2	6	28286	28291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472555
542	NC_018664	TA	4	8	28348	28355	50 %	50 %	0 %	0 %	407472555
543	NC_018664	TAAA	2	8	28380	28387	75 %	25 %	0 %	0 %	407472555
544	NC_018664	GAA	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472555
545	NC_018664	ACTA	2	8	28415	28422	50 %	25 %	0 %	25 %	407472555
546	NC_018664	TA	3	6	28421	28426	50 %	50 %	0 %	0 %	407472555
547	NC_018664	ATA	2	6	28439	28444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472555
548	NC_018664	T	6	6	28462	28467	0 %	100 %	0 %	0 %	407472555
549	NC_018664	AGAAA	2	10	28475	28484	80 %	0 %	20 %	0 %	407472555
550	NC_018664	GATAA	2	10	28486	28495	60 %	20 %	20 %	0 %	407472555
551	NC_018664	ATTT	2	8	28553	28560	25 %	75 %	0 %	0 %	407472556
552	NC_018664	TTTTA	2	10	28580	28589	20 %	80 %	0 %	0 %	407472556
553	NC_018664	ATCT	2	8	28603	28610	25 %	50 %	0 %	25 %	407472556
554	NC_018664	ATC	2	6	28622	28627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472556
555	NC_018664	TA	4	8	28631	28638	50 %	50 %	0 %	0 %	407472556
556	NC_018664	CGTT	2	8	28668	28675	0 %	50 %	25 %	25 %	407472556
557	NC_018664	TAAT	2	8	28702	28709	50 %	50 %	0 %	0 %	407472556
558	NC_018664	CTT	2	6	28726	28731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472556
559	NC_018664	TACCT	2	10	28742	28751	20 %	40 %	0 %	40 %	407472556
560	NC_018664	AAG	2	6	28752	28757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472556
561	NC_018664	TA	3	6	28778	28783	50 %	50 %	0 %	0 %	407472556
562	NC_018664	CTT	2	6	28816	28821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472556
563	NC_018664	TGT	2	6	28859	28864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472556
564	NC_018664	ACC	2	6	28892	28897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407472556
565	NC_018664	AT	3	6	28900	28905	50 %	50 %	0 %	0 %	407472556
566	NC_018664	TCA	3	9	29034	29042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472556
567	NC_018664	CAT	2	6	29098	29103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472556
568	NC_018664	AAT	2	6	29113	29118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472556
569	NC_018664	TTA	2	6	29266	29271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472556
570	NC_018664	TTC	2	6	29315	29320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472556
571	NC_018664	TCAA	2	8	29349	29356	50 %	25 %	0 %	25 %	407472556
572	NC_018664	TTTAC	2	10	29382	29391	20 %	60 %	0 %	20 %	407472556
573	NC_018664	CAA	2	6	29392	29397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407472556
574	NC_018664	TAAA	2	8	29419	29426	75 %	25 %	0 %	0 %	407472556
575	NC_018664	TAG	2	6	29440	29445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472556
576	NC_018664	TAC	2	6	29468	29473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472556
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578	NC_018664	TTC	2	6	29558	29563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472556
579	NC_018664	CAAGAC	2	12	29605	29616	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407472556
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581	NC_018664	ATC	2	6	29711	29716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472556
582	NC_018664	CTA	2	6	29755	29760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472556
583	NC_018664	ATA	2	6	29811	29816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472556
584	NC_018664	AATA	2	8	29928	29935	75 %	25 %	0 %	0 %	407472557
585	NC_018664	AT	3	6	29945	29950	50 %	50 %	0 %	0 %	407472557
586	NC_018664	CTATA	2	10	30035	30044	40 %	40 %	0 %	20 %	407472557
587	NC_018664	GCT	2	6	30166	30171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407472557
588	NC_018664	A	7	7	30214	30220	100 %	0 %	0 %	0 %	407472557
589	NC_018664	TCC	2	6	30255	30260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407472557
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591	NC_018664	TAC	2	6	30329	30334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472557
592	NC_018664	AT	4	8	30347	30354	50 %	50 %	0 %	0 %	407472557
593	NC_018664	TAA	2	6	30390	30395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472557
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598	NC_018664	CT	3	6	30837	30842	0 %	50 %	0 %	50 %	407472557
599	NC_018664	CAG	2	6	30890	30895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407472557
600	NC_018664	TAT	2	6	30996	31001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472557
601	NC_018664	GCTGTA	2	12	31036	31047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407472557
602	NC_018664	AGT	2	6	31131	31136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472557
603	NC_018664	GTCT	2	8	31193	31200	0 %	50 %	25 %	25 %	407472557
604	NC_018664	A	6	6	32017	32022	100 %	0 %	0 %	0 %	407472558
605	NC_018664	GGTAT	2	10	32025	32034	20 %	40 %	40 %	0 %	407472558
606	NC_018664	TTG	2	6	32040	32045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407472558
607	NC_018664	CTT	2	6	32066	32071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407472558
608	NC_018664	A	6	6	32081	32086	100 %	0 %	0 %	0 %	407472558
609	NC_018664	ATTA	2	8	32165	32172	50 %	50 %	0 %	0 %	407472558
610	NC_018664	TGA	2	6	32218	32223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472558
611	NC_018664	CTC	2	6	32277	32282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407472558
612	NC_018664	AATT	2	8	32299	32306	50 %	50 %	0 %	0 %	407472558
613	NC_018664	CTA	2	6	32331	32336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407472558
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615	NC_018664	TGA	2	6	32877	32882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472559
616	NC_018664	TATTGA	2	12	32883	32894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472559
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621	NC_018664	AGA	2	6	33697	33702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472560
622	NC_018664	AATAT	2	10	33735	33744	60 %	40 %	0 %	0 %	407472560
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625	NC_018664	GTAGAA	2	12	33788	33799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472560
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