MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018656	CTT	2	6	195282	195287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464103
4002	NC_018656	ATCCAA	2	12	195308	195319	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407464103
4003	NC_018656	GAT	2	6	195369	195374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464103
4004	NC_018656	CT	3	6	195401	195406	0 %	50 %	0 %	50 %	407464103
4005	NC_018656	CTT	2	6	195493	195498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464103
4006	NC_018656	AAT	2	6	195506	195511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464103
4007	NC_018656	TCC	2	6	195527	195532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464103
4008	NC_018656	AAAAT	2	10	195698	195707	80 %	20 %	0 %	0 %	407464103
4009	NC_018656	ATTTT	2	10	195732	195741	20 %	80 %	0 %	0 %	407464103
4010	NC_018656	T	8	8	195738	195745	0 %	100 %	0 %	0 %	407464103
4011	NC_018656	TCT	2	6	195818	195823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464103
4012	NC_018656	T	6	6	195864	195869	0 %	100 %	0 %	0 %	407464103
4013	NC_018656	CTT	2	6	196064	196069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464104
4014	NC_018656	ATT	2	6	196150	196155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464104
4015	NC_018656	ATG	2	6	196187	196192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464104
4016	NC_018656	T	7	7	196194	196200	0 %	100 %	0 %	0 %	407464104
4017	NC_018656	CAT	2	6	196211	196216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464104
4018	NC_018656	AT	3	6	196294	196299	50 %	50 %	0 %	0 %	407464104
4019	NC_018656	AAT	2	6	196328	196333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464104
4020	NC_018656	CTT	2	6	196381	196386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464104
4021	NC_018656	TGG	2	6	196392	196397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464104
4022	NC_018656	T	6	6	196404	196409	0 %	100 %	0 %	0 %	407464104
4023	NC_018656	TCA	2	6	196432	196437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464104
4024	NC_018656	TTGA	2	8	196444	196451	25 %	50 %	25 %	0 %	407464104
4025	NC_018656	TTTC	2	8	196476	196483	0 %	75 %	0 %	25 %	407464104
4026	NC_018656	AAC	2	6	196542	196547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464104
4027	NC_018656	T	7	7	196575	196581	0 %	100 %	0 %	0 %	407464104
4028	NC_018656	TAA	2	6	196589	196594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464104
4029	NC_018656	AGA	2	6	196827	196832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464105
4030	NC_018656	AATT	2	8	196861	196868	50 %	50 %	0 %	0 %	407464105
4031	NC_018656	TCA	2	6	197060	197065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464105
4032	NC_018656	TC	3	6	197094	197099	0 %	50 %	0 %	50 %	407464105
4033	NC_018656	TCC	2	6	197158	197163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464105
4034	NC_018656	ACAA	2	8	197170	197177	75 %	0 %	0 %	25 %	407464105
4035	NC_018656	TTC	2	6	197209	197214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464105
4036	NC_018656	CTT	2	6	197265	197270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464105
4037	NC_018656	TGA	2	6	197427	197432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464105
4038	NC_018656	TGA	2	6	197481	197486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464105
4039	NC_018656	TCT	2	6	197495	197500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464105
4040	NC_018656	TAA	2	6	197761	197766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464106
4041	NC_018656	T	6	6	197772	197777	0 %	100 %	0 %	0 %	407464106
4042	NC_018656	CATT	2	8	197804	197811	25 %	50 %	0 %	25 %	407464106
4043	NC_018656	T	6	6	197814	197819	0 %	100 %	0 %	0 %	407464106
4044	NC_018656	ATT	2	6	197996	198001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464106
4045	NC_018656	GCA	2	6	198071	198076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464106
4046	NC_018656	ATTA	2	8	198085	198092	50 %	50 %	0 %	0 %	407464106
4047	NC_018656	ATTTT	2	10	198104	198113	20 %	80 %	0 %	0 %	407464106
4048	NC_018656	ATC	4	12	198157	198168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464106
4049	NC_018656	ATT	2	6	198179	198184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464106
4050	NC_018656	T	6	6	198183	198188	0 %	100 %	0 %	0 %	407464106
4051	NC_018656	TCC	2	6	198212	198217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464106
4052	NC_018656	T	6	6	198237	198242	0 %	100 %	0 %	0 %	407464106
4053	NC_018656	TAC	2	6	198246	198251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464106
4054	NC_018656	TAA	2	6	198313	198318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464107
4055	NC_018656	CAA	2	6	198651	198656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464107
4056	NC_018656	TTTC	2	8	198739	198746	0 %	75 %	0 %	25 %	407464108
4057	NC_018656	TTG	2	6	198860	198865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464108
4058	NC_018656	ATA	2	6	198904	198909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464108
4059	NC_018656	AGA	2	6	198936	198941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464108
4060	NC_018656	T	7	7	199007	199013	0 %	100 %	0 %	0 %	407464108
4061	NC_018656	CATCT	2	10	199014	199023	20 %	40 %	0 %	40 %	407464108
4062	NC_018656	CAA	2	6	199040	199045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464108
4063	NC_018656	TCT	2	6	199064	199069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464108
4064	NC_018656	GCGT	2	8	199116	199123	0 %	25 %	50 %	25 %	407464108
4065	NC_018656	CAA	2	6	199133	199138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464108
4066	NC_018656	AGC	2	6	199170	199175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464108
4067	NC_018656	TTC	2	6	199194	199199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464108
4068	NC_018656	ACA	2	6	199207	199212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464108
4069	NC_018656	CTG	2	6	199280	199285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464108
4070	NC_018656	CAA	2	6	199346	199351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464108
4071	NC_018656	TTC	2	6	199379	199384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464108
4072	NC_018656	CAG	2	6	199403	199408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464108
4073	NC_018656	CAT	2	6	199517	199522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464108
4074	NC_018656	T	7	7	199545	199551	0 %	100 %	0 %	0 %	407464108
4075	NC_018656	TTC	2	6	199573	199578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464108
4076	NC_018656	TCAT	2	8	199585	199592	25 %	50 %	0 %	25 %	407464108
4077	NC_018656	ATT	2	6	199647	199652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464109
4078	NC_018656	TCT	2	6	199674	199679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464109
4079	NC_018656	T	7	7	199699	199705	0 %	100 %	0 %	0 %	407464109
4080	NC_018656	TTGT	2	8	199723	199730	0 %	75 %	25 %	0 %	407464109
4081	NC_018656	T	7	7	199732	199738	0 %	100 %	0 %	0 %	407464109
4082	NC_018656	GTCA	2	8	199747	199754	25 %	25 %	25 %	25 %	407464109
4083	NC_018656	TCT	2	6	199797	199802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464109
4084	NC_018656	GTT	2	6	199860	199865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464109
4085	NC_018656	CAT	2	6	199893	199898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464109
4086	NC_018656	T	7	7	199915	199921	0 %	100 %	0 %	0 %	407464109
4087	NC_018656	TTC	2	6	199948	199953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464109
4088	NC_018656	ATT	2	6	200048	200053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464109
4089	NC_018656	T	7	7	200073	200079	0 %	100 %	0 %	0 %	407464109
4090	NC_018656	AAT	2	6	200081	200086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464109
4091	NC_018656	TAAAA	2	10	200089	200098	80 %	20 %	0 %	0 %	407464109
4092	NC_018656	ATC	2	6	200153	200158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464109
4093	NC_018656	ATT	2	6	200280	200285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464110
4094	NC_018656	GCT	2	6	200313	200318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464110
4095	NC_018656	TGC	2	6	200321	200326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464110
4096	NC_018656	A	6	6	200331	200336	100 %	0 %	0 %	0 %	407464110
4097	NC_018656	GCA	2	6	200415	200420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464110
4098	NC_018656	TCA	2	6	200543	200548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464110
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4101	NC_018656	ATT	2	6	200742	200747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464110
4102	NC_018656	ATG	2	6	200749	200754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464110
4103	NC_018656	TGG	2	6	200840	200845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464110
4104	NC_018656	TTC	2	6	200882	200887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464110
4105	NC_018656	TGGAT	2	10	200897	200906	20 %	40 %	40 %	0 %	407464110
4106	NC_018656	TGGCA	2	10	200921	200930	20 %	20 %	40 %	20 %	407464110
4107	NC_018656	TCT	2	6	201023	201028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464110
4108	NC_018656	GA	3	6	201042	201047	50 %	0 %	50 %	0 %	407464110
4109	NC_018656	TGC	2	6	201062	201067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464110
4110	NC_018656	AAG	2	6	201127	201132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464110
4111	NC_018656	A	6	6	201199	201204	100 %	0 %	0 %	0 %	407464110
4112	NC_018656	ATG	2	6	201303	201308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464110
4113	NC_018656	GGA	2	6	201309	201314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464110
4114	NC_018656	GAAT	2	8	201482	201489	50 %	25 %	25 %	0 %	407464110
4115	NC_018656	CAT	2	6	201507	201512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464110
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4117	NC_018656	GAAGA	2	10	201525	201534	60 %	0 %	40 %	0 %	407464110
4118	NC_018656	ATG	2	6	201541	201546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464110
4119	NC_018656	ACA	2	6	201590	201595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464110
4120	NC_018656	AATG	2	8	201608	201615	50 %	25 %	25 %	0 %	407464110
4121	NC_018656	TTG	2	6	201649	201654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464110
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4123	NC_018656	A	6	6	201680	201685	100 %	0 %	0 %	0 %	407464110
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4490	NC_018656	TGATCC	2	12	218285	218296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407464131
4491	NC_018656	GAA	2	6	218316	218321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464131
4492	NC_018656	A	6	6	218320	218325	100 %	0 %	0 %	0 %	407464131
4493	NC_018656	AT	3	6	218395	218400	50 %	50 %	0 %	0 %	407464131
4494	NC_018656	AGA	2	6	218423	218428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464131
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