MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018656	AACAG	2	10	169940	169949	60 %	0 %	20 %	20 %	407464072
3502	NC_018656	TTTC	2	8	169988	169995	0 %	75 %	0 %	25 %	407464072
3503	NC_018656	ATA	2	6	170028	170033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464072
3504	NC_018656	TGA	2	6	170038	170043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464072
3505	NC_018656	TTG	2	6	170055	170060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464072
3506	NC_018656	GCT	2	6	170069	170074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464072
3507	NC_018656	AAAC	2	8	170212	170219	75 %	0 %	0 %	25 %	407464072
3508	NC_018656	TAAAA	2	10	170245	170254	80 %	20 %	0 %	0 %	407464072
3509	NC_018656	TGA	2	6	170272	170277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464072
3510	NC_018656	GTA	2	6	170294	170299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464072
3511	NC_018656	CTTGA	2	10	170399	170408	20 %	40 %	20 %	20 %	407464072
3512	NC_018656	AAT	2	6	170416	170421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464072
3513	NC_018656	A	7	7	170563	170569	100 %	0 %	0 %	0 %	407464072
3514	NC_018656	TCT	2	6	170698	170703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464073
3515	NC_018656	AGC	2	6	170755	170760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464073
3516	NC_018656	CAG	2	6	170831	170836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464073
3517	NC_018656	GAT	2	6	170863	170868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464073
3518	NC_018656	CTAT	2	8	170907	170914	25 %	50 %	0 %	25 %	407464073
3519	NC_018656	GTT	2	6	170939	170944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464073
3520	NC_018656	A	6	6	170981	170986	100 %	0 %	0 %	0 %	407464073
3521	NC_018656	GAA	2	6	171042	171047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464073
3522	NC_018656	TGA	2	6	171057	171062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464073
3523	NC_018656	TAT	2	6	171117	171122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464073
3524	NC_018656	ATT	2	6	171174	171179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464073
3525	NC_018656	T	8	8	171352	171359	0 %	100 %	0 %	0 %	407464074
3526	NC_018656	AATT	2	8	171367	171374	50 %	50 %	0 %	0 %	407464074
3527	NC_018656	T	6	6	171474	171479	0 %	100 %	0 %	0 %	407464074
3528	NC_018656	T	7	7	171484	171490	0 %	100 %	0 %	0 %	407464074
3529	NC_018656	T	6	6	171518	171523	0 %	100 %	0 %	0 %	407464074
3530	NC_018656	CAAT	2	8	171564	171571	50 %	25 %	0 %	25 %	407464074
3531	NC_018656	TCT	2	6	171674	171679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464074
3532	NC_018656	CTTC	2	8	171698	171705	0 %	50 %	0 %	50 %	407464074
3533	NC_018656	ATG	2	6	171780	171785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464074
3534	NC_018656	A	6	6	171849	171854	100 %	0 %	0 %	0 %	407464074
3535	NC_018656	TG	3	6	171887	171892	0 %	50 %	50 %	0 %	407464074
3536	NC_018656	CCT	2	6	171949	171954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464074
3537	NC_018656	AAT	2	6	172020	172025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464074
3538	NC_018656	ATGGT	2	10	172118	172127	20 %	40 %	40 %	0 %	407464074
3539	NC_018656	GTTTT	2	10	172385	172394	0 %	80 %	20 %	0 %	407464075
3540	NC_018656	GATG	2	8	172395	172402	25 %	25 %	50 %	0 %	407464075
3541	NC_018656	ATG	2	6	172405	172410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464075
3542	NC_018656	AAT	2	6	172437	172442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464075
3543	NC_018656	CAT	2	6	172492	172497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464075
3544	NC_018656	T	6	6	172533	172538	0 %	100 %	0 %	0 %	407464075
3545	NC_018656	TTTCCT	2	12	172543	172554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464075
3546	NC_018656	TCTCT	2	10	172582	172591	0 %	60 %	0 %	40 %	407464075
3547	NC_018656	GTTT	2	8	172597	172604	0 %	75 %	25 %	0 %	407464075
3548	NC_018656	CTG	2	6	172624	172629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464075
3549	NC_018656	TGA	2	6	172733	172738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464075
3550	NC_018656	CTGTT	2	10	172759	172768	0 %	60 %	20 %	20 %	407464075
3551	NC_018656	CCA	2	6	172770	172775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464075
3552	NC_018656	GCT	2	6	172779	172784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464075
3553	NC_018656	CAA	2	6	172795	172800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464075
3554	NC_018656	ATA	2	6	172847	172852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464075
3555	NC_018656	T	6	6	172881	172886	0 %	100 %	0 %	0 %	407464075
3556	NC_018656	T	7	7	172939	172945	0 %	100 %	0 %	0 %	407464075
3557	NC_018656	TCC	2	6	173052	173057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464076
3558	NC_018656	TTGCA	2	10	173061	173070	20 %	40 %	20 %	20 %	407464076
3559	NC_018656	TTTG	2	8	173074	173081	0 %	75 %	25 %	0 %	407464076
3560	NC_018656	ATG	2	6	173454	173459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464077
3561	NC_018656	TAA	2	6	173483	173488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464077
3562	NC_018656	ATT	2	6	173516	173521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464077
3563	NC_018656	AGTATT	2	12	173531	173542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407464077
3564	NC_018656	GGTAT	2	10	173544	173553	20 %	40 %	40 %	0 %	407464077
3565	NC_018656	TGA	2	6	173582	173587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464077
3566	NC_018656	CAT	2	6	173602	173607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464077
3567	NC_018656	ATG	2	6	173632	173637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464077
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3569	NC_018656	GAA	3	9	173658	173666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464077
3570	NC_018656	ATTGAA	2	12	173667	173678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407464077
3571	NC_018656	AGA	2	6	173687	173692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464077
3572	NC_018656	ATG	2	6	173722	173727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464077
3573	NC_018656	TGA	2	6	173756	173761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464077
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3575	NC_018656	TGA	2	6	173774	173779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464077
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3579	NC_018656	ACGAG	2	10	173918	173927	40 %	0 %	40 %	20 %	407464077
3580	NC_018656	ACGAG	2	10	173951	173960	40 %	0 %	40 %	20 %	407464077
3581	NC_018656	CAAA	2	8	174040	174047	75 %	0 %	0 %	25 %	407464077
3582	NC_018656	A	6	6	174067	174072	100 %	0 %	0 %	0 %	407464077
3583	NC_018656	A	6	6	174076	174081	100 %	0 %	0 %	0 %	407464077
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3587	NC_018656	GGT	2	6	174297	174302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464077
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3589	NC_018656	ATCTGG	2	12	174365	174376	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407464077
3590	NC_018656	GAA	2	6	174462	174467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464077
3591	NC_018656	GAA	2	6	174576	174581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464077
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3594	NC_018656	TGA	2	6	174650	174655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464077
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3596	NC_018656	ACA	2	6	174669	174674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464077
3597	NC_018656	TGA	2	6	174713	174718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464077
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3602	NC_018656	CA	3	6	175059	175064	50 %	0 %	0 %	50 %	407464078
3603	NC_018656	GTT	2	6	175075	175080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464078
3604	NC_018656	T	6	6	175079	175084	0 %	100 %	0 %	0 %	407464078
3605	NC_018656	CTG	2	6	175109	175114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464078
3606	NC_018656	GAT	2	6	175138	175143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464078
3607	NC_018656	AAT	2	6	175185	175190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464078
3608	NC_018656	TGA	2	6	175218	175223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464078
3609	NC_018656	ATG	2	6	175241	175246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464078
3610	NC_018656	TGA	2	6	175266	175271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464078
3611	NC_018656	ATGA	2	8	175294	175301	50 %	25 %	25 %	0 %	407464078
3612	NC_018656	GAA	2	6	175303	175308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464078
3613	NC_018656	ATT	2	6	175317	175322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464078
3614	NC_018656	AGA	2	6	175395	175400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464078
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3617	NC_018656	ATG	2	6	175487	175492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464078
3618	NC_018656	ATC	2	6	175517	175522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464078
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3620	NC_018656	ACT	2	6	175556	175561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464078
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3991	NC_018656	TTC	2	6	194912	194917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464102
3992	NC_018656	T	6	6	194983	194988	0 %	100 %	0 %	0 %	407464102
3993	NC_018656	CTA	2	6	195010	195015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464102
3994	NC_018656	AAT	2	6	195077	195082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464102
3995	NC_018656	TCA	2	6	195120	195125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464103
3996	NC_018656	CAT	2	6	195158	195163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464103
3997	NC_018656	T	6	6	195165	195170	0 %	100 %	0 %	0 %	407464103
3998	NC_018656	ATG	2	6	195219	195224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464103
3999	NC_018656	CTG	3	9	195235	195243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464103
4000	NC_018656	TTC	2	6	195260	195265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464103

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