MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018656	GCT	2	6	50924	50929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463922
1002	NC_018656	TCT	2	6	50954	50959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463922
1003	NC_018656	TCC	2	6	50981	50986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463922
1004	NC_018656	TCT	2	6	51034	51039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463922
1005	NC_018656	CTGA	2	8	51259	51266	25 %	25 %	25 %	25 %	407463923
1006	NC_018656	AAG	2	6	51291	51296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463923
1007	NC_018656	A	6	6	51325	51330	100 %	0 %	0 %	0 %	407463923
1008	NC_018656	AGGA	2	8	51353	51360	50 %	0 %	50 %	0 %	407463923
1009	NC_018656	ATGCA	2	10	51374	51383	40 %	20 %	20 %	20 %	407463923
1010	NC_018656	TAATGA	2	12	51405	51416	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407463923
1011	NC_018656	TAC	2	6	51425	51430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463923
1012	NC_018656	CTC	2	6	51461	51466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463923
1013	NC_018656	GAA	2	6	51598	51603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463923
1014	NC_018656	ATT	2	6	51655	51660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463923
1015	NC_018656	AAT	2	6	51665	51670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463923
1016	NC_018656	ATTC	2	8	51705	51712	25 %	50 %	0 %	25 %	407463924
1017	NC_018656	T	7	7	51797	51803	0 %	100 %	0 %	0 %	407463924
1018	NC_018656	ACA	2	6	51896	51901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463925
1019	NC_018656	TCA	2	6	52017	52022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463925
1020	NC_018656	CTA	2	6	52065	52070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463925
1021	NC_018656	CAT	2	6	52076	52081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463925
1022	NC_018656	TTCT	2	8	52093	52100	0 %	75 %	0 %	25 %	407463925
1023	NC_018656	AAC	2	6	52175	52180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463925
1024	NC_018656	TCCTC	2	10	52230	52239	0 %	40 %	0 %	60 %	407463925
1025	NC_018656	TTCTGC	2	12	52283	52294	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407463925
1026	NC_018656	AAT	2	6	52305	52310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463925
1027	NC_018656	TTC	2	6	52322	52327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463925
1028	NC_018656	CTT	2	6	52338	52343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463926
1029	NC_018656	TAA	2	6	52353	52358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463926
1030	NC_018656	CAA	2	6	52415	52420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463926
1031	NC_018656	GAA	2	6	52426	52431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463926
1032	NC_018656	CTC	2	6	52436	52441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463926
1033	NC_018656	CCT	2	6	52492	52497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463926
1034	NC_018656	CTT	2	6	52509	52514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463926
1035	NC_018656	T	6	6	52838	52843	0 %	100 %	0 %	0 %	407463926
1036	NC_018656	TTG	2	6	52889	52894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463926
1037	NC_018656	TTC	2	6	52926	52931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463926
1038	NC_018656	A	6	6	53422	53427	100 %	0 %	0 %	0 %	407463927
1039	NC_018656	TGGA	2	8	53440	53447	25 %	25 %	50 %	0 %	407463927
1040	NC_018656	AAC	2	6	53500	53505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463927
1041	NC_018656	AAAG	2	8	53604	53611	75 %	0 %	25 %	0 %	407463927
1042	NC_018656	ATG	2	6	53662	53667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463927
1043	NC_018656	GA	3	6	53683	53688	50 %	0 %	50 %	0 %	407463927
1044	NC_018656	TGG	2	6	53718	53723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463927
1045	NC_018656	AGA	2	6	53739	53744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463927
1046	NC_018656	AGA	2	6	53772	53777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463927
1047	NC_018656	AAC	2	6	53866	53871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463927
1048	NC_018656	TAC	2	6	53964	53969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463927
1049	NC_018656	AGT	2	6	53970	53975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463927
1050	NC_018656	AATCA	2	10	53991	54000	60 %	20 %	0 %	20 %	407463927
1051	NC_018656	GAA	2	6	54095	54100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463927
1052	NC_018656	GAA	2	6	54160	54165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463927
1053	NC_018656	ACTA	2	8	54222	54229	50 %	25 %	0 %	25 %	407463927
1054	NC_018656	ACAT	2	8	54298	54305	50 %	25 %	0 %	25 %	407463927
1055	NC_018656	AAG	2	6	54325	54330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463927
1056	NC_018656	ATT	2	6	54375	54380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463927
1057	NC_018656	AGA	2	6	54393	54398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463927
1058	NC_018656	TTG	2	6	54461	54466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463927
1059	NC_018656	AAC	2	6	54476	54481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463927
1060	NC_018656	ATG	2	6	54580	54585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463927
1061	NC_018656	GAA	2	6	54751	54756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463927
1062	NC_018656	TGA	2	6	54816	54821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463927
1063	NC_018656	TGC	2	6	54825	54830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463927
1064	NC_018656	ATG	2	6	54857	54862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463927
1065	NC_018656	CAA	2	6	54872	54877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463927
1066	NC_018656	ATT	2	6	54945	54950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463928
1067	NC_018656	TGG	2	6	54962	54967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463928
1068	NC_018656	AGG	2	6	54968	54973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463928
1069	NC_018656	A	6	6	54982	54987	100 %	0 %	0 %	0 %	407463928
1070	NC_018656	CTT	2	6	55006	55011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463928
1071	NC_018656	CAAAAC	2	12	55051	55062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463928
1072	NC_018656	ATC	2	6	55064	55069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463928
1073	NC_018656	TCA	2	6	55110	55115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463928
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1075	NC_018656	TGG	2	6	55193	55198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463928
1076	NC_018656	CAA	2	6	55214	55219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463928
1077	NC_018656	A	6	6	55225	55230	100 %	0 %	0 %	0 %	407463928
1078	NC_018656	ATTAT	2	10	55316	55325	40 %	60 %	0 %	0 %	407463928
1079	NC_018656	A	6	6	55326	55331	100 %	0 %	0 %	0 %	407463928
1080	NC_018656	A	7	7	55333	55339	100 %	0 %	0 %	0 %	407463928
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1083	NC_018656	GCT	2	6	55778	55783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463929
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1086	NC_018656	ATG	2	6	55869	55874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463929
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1088	NC_018656	A	7	7	55945	55951	100 %	0 %	0 %	0 %	407463929
1089	NC_018656	GAA	2	6	55958	55963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463929
1090	NC_018656	TCA	2	6	55969	55974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463929
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1092	NC_018656	T	6	6	56026	56031	0 %	100 %	0 %	0 %	407463930
1093	NC_018656	T	7	7	56035	56041	0 %	100 %	0 %	0 %	407463930
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1097	NC_018656	AAT	2	6	56167	56172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463930
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1108	NC_018656	TG	3	6	56566	56571	0 %	50 %	50 %	0 %	407463930
1109	NC_018656	T	6	6	56586	56591	0 %	100 %	0 %	0 %	407463930
1110	NC_018656	GAA	2	6	56599	56604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463930
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1126	NC_018656	T	6	6	57263	57268	0 %	100 %	0 %	0 %	407463931
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