MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018656	TGG	2	6	243281	243286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464161
5002	NC_018656	TGC	2	6	243329	243334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464161
5003	NC_018656	CAT	2	6	243368	243373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464161
5004	NC_018656	TGA	2	6	243389	243394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464161
5005	NC_018656	CAA	2	6	243477	243482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464161
5006	NC_018656	TGA	2	6	243512	243517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464161
5007	NC_018656	ATA	2	6	243532	243537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464161
5008	NC_018656	TTGG	2	8	243595	243602	0 %	50 %	50 %	0 %	407464161
5009	NC_018656	AATTGA	2	12	243608	243619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407464161
5010	NC_018656	GCA	2	6	243645	243650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464161
5011	NC_018656	AAT	3	9	243686	243694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464161
5012	NC_018656	TGT	2	6	243773	243778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464161
5013	NC_018656	ATT	2	6	243828	243833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464161
5014	NC_018656	TG	3	6	243873	243878	0 %	50 %	50 %	0 %	407464161
5015	NC_018656	ATGG	2	8	243912	243919	25 %	25 %	50 %	0 %	407464161
5016	NC_018656	TGA	2	6	244003	244008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464161
5017	NC_018656	TGA	2	6	244085	244090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464161
5018	NC_018656	GTA	2	6	244227	244232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464161
5019	NC_018656	GGT	2	6	244401	244406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464161
5020	NC_018656	TAT	2	6	244409	244414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464161
5021	NC_018656	ACA	2	6	244418	244423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464161
5022	NC_018656	AGA	2	6	244473	244478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464161
5023	NC_018656	A	7	7	244575	244581	100 %	0 %	0 %	0 %	407464161
5024	NC_018656	AGG	2	6	244588	244593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464161
5025	NC_018656	TGAA	2	8	244605	244612	50 %	25 %	25 %	0 %	407464161
5026	NC_018656	GAAAA	2	10	244665	244674	80 %	0 %	20 %	0 %	407464162
5027	NC_018656	TTG	2	6	244683	244688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464162
5028	NC_018656	GA	3	6	244748	244753	50 %	0 %	50 %	0 %	407464162
5029	NC_018656	ATA	2	6	244884	244889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464162
5030	NC_018656	CAC	2	6	244902	244907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464162
5031	NC_018656	A	7	7	244912	244918	100 %	0 %	0 %	0 %	407464162
5032	NC_018656	TGG	2	6	244948	244953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464162
5033	NC_018656	TGG	2	6	244972	244977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464162
5034	NC_018656	TCA	2	6	244981	244986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464162
5035	NC_018656	AAT	2	6	245005	245010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464162
5036	NC_018656	CTG	2	6	245043	245048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464162
5037	NC_018656	TTG	2	6	245208	245213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464162
5038	NC_018656	GCT	2	6	245246	245251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464162
5039	NC_018656	AAG	2	6	245265	245270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464162
5040	NC_018656	CAAT	2	8	245317	245324	50 %	25 %	0 %	25 %	407464162
5041	NC_018656	GCT	2	6	245336	245341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464162
5042	NC_018656	ATA	2	6	245376	245381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464162
5043	NC_018656	CTG	2	6	245400	245405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464162
5044	NC_018656	A	6	6	245567	245572	100 %	0 %	0 %	0 %	407464162
5045	NC_018656	AGG	2	6	245679	245684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464163
5046	NC_018656	ATC	2	6	245719	245724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464163
5047	NC_018656	AGA	2	6	245775	245780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464163
5048	NC_018656	TGT	2	6	245811	245816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464163
5049	NC_018656	GCA	2	6	245926	245931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464163
5050	NC_018656	GAT	2	6	245974	245979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464163
5051	NC_018656	TTG	2	6	246062	246067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464163
5052	NC_018656	TGC	2	6	246099	246104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464163
5053	NC_018656	GTT	2	6	246121	246126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464163
5054	NC_018656	CCT	2	6	246133	246138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464163
5055	NC_018656	ACA	2	6	246159	246164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464163
5056	NC_018656	TAC	2	6	246295	246300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464164
5057	NC_018656	TTC	2	6	246440	246445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464164
5058	NC_018656	CTG	2	6	246446	246451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464164
5059	NC_018656	T	6	6	246456	246461	0 %	100 %	0 %	0 %	407464164
5060	NC_018656	CTT	2	6	246467	246472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464164
5061	NC_018656	TCA	2	6	246514	246519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464164
5062	NC_018656	ACT	2	6	246632	246637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5063	NC_018656	ATCC	2	8	246639	246646	25 %	25 %	0 %	50 %	407464165
5064	NC_018656	CAT	2	6	246668	246673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5065	NC_018656	AAT	2	6	246695	246700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464165
5066	NC_018656	AAT	2	6	246704	246709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464165
5067	NC_018656	TGT	2	6	246713	246718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464165
5068	NC_018656	TCC	2	6	246752	246757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407464165
5069	NC_018656	CATT	2	8	246769	246776	25 %	50 %	0 %	25 %	407464165
5070	NC_018656	ATT	2	6	246822	246827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464165
5071	NC_018656	TTTG	2	8	246845	246852	0 %	75 %	25 %	0 %	407464165
5072	NC_018656	T	6	6	246853	246858	0 %	100 %	0 %	0 %	407464165
5073	NC_018656	TTC	2	6	246911	246916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464165
5074	NC_018656	ATA	2	6	246959	246964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464165
5075	NC_018656	TCA	3	9	246975	246983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5076	NC_018656	T	6	6	247008	247013	0 %	100 %	0 %	0 %	407464165
5077	NC_018656	TTC	2	6	247051	247056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464165
5078	NC_018656	CTT	2	6	247092	247097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464165
5079	NC_018656	TCA	2	6	247113	247118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5080	NC_018656	TCA	2	6	247137	247142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5081	NC_018656	AAT	2	6	247151	247156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464165
5082	NC_018656	ATGT	2	8	247165	247172	25 %	50 %	25 %	0 %	407464165
5083	NC_018656	ATC	2	6	247178	247183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5084	NC_018656	TTCT	2	8	247242	247249	0 %	75 %	0 %	25 %	407464165
5085	NC_018656	TTG	2	6	247250	247255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464165
5086	NC_018656	CTA	2	6	247279	247284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5087	NC_018656	CTA	2	6	247288	247293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5088	NC_018656	TGA	2	6	247311	247316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464165
5089	NC_018656	T	6	6	247362	247367	0 %	100 %	0 %	0 %	407464165
5090	NC_018656	T	6	6	247378	247383	0 %	100 %	0 %	0 %	407464165
5091	NC_018656	GTG	2	6	247390	247395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464165
5092	NC_018656	AAG	2	6	247413	247418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464165
5093	NC_018656	TCA	2	6	247422	247427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5094	NC_018656	CAT	2	6	247516	247521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464165
5095	NC_018656	TGA	2	6	247633	247638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464165
5096	NC_018656	A	6	6	248015	248020	100 %	0 %	0 %	0 %	407464166
5097	NC_018656	ACTT	2	8	248027	248034	25 %	50 %	0 %	25 %	407464166
5098	NC_018656	TCT	2	6	248044	248049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464166
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5100	NC_018656	CAT	2	6	248157	248162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464166
5101	NC_018656	A	6	6	248205	248210	100 %	0 %	0 %	0 %	407464166
5102	NC_018656	CCAA	2	8	248214	248221	50 %	0 %	0 %	50 %	407464166
5103	NC_018656	ATC	2	6	248250	248255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464166
5104	NC_018656	TCT	2	6	248272	248277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464166
5105	NC_018656	TGA	2	6	248290	248295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464166
5106	NC_018656	TAA	2	6	248410	248415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464167
5107	NC_018656	ATGT	2	8	248456	248463	25 %	50 %	25 %	0 %	407464167
5108	NC_018656	CA	3	6	248490	248495	50 %	0 %	0 %	50 %	407464167
5109	NC_018656	CAA	2	6	248653	248658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464167
5110	NC_018656	T	6	6	248680	248685	0 %	100 %	0 %	0 %	407464167
5111	NC_018656	AT	3	6	248705	248710	50 %	50 %	0 %	0 %	407464167
5112	NC_018656	ATT	2	6	248762	248767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464167
5113	NC_018656	ATTA	2	8	248809	248816	50 %	50 %	0 %	0 %	407464167
5114	NC_018656	TCA	2	6	248822	248827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464167
5115	NC_018656	AAAAT	2	10	248835	248844	80 %	20 %	0 %	0 %	407464167
5116	NC_018656	TTC	2	6	248869	248874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464167
5117	NC_018656	AATT	2	8	248887	248894	50 %	50 %	0 %	0 %	407464167
5118	NC_018656	T	7	7	248904	248910	0 %	100 %	0 %	0 %	407464167
5119	NC_018656	T	6	6	248940	248945	0 %	100 %	0 %	0 %	407464167
5120	NC_018656	TTC	2	6	248972	248977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464167
5121	NC_018656	ATC	2	6	249043	249048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464167
5122	NC_018656	TTC	2	6	249148	249153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464167
5123	NC_018656	CAT	2	6	249271	249276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464168
5124	NC_018656	TGC	2	6	249296	249301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464168
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5128	NC_018656	TTGC	2	8	249384	249391	0 %	50 %	25 %	25 %	407464168
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5240	NC_018656	T	7	7	255252	255258	0 %	100 %	0 %	0 %	407464175
5241	NC_018656	TGG	2	6	255292	255297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464175
5242	NC_018656	ATTTA	2	10	255310	255319	40 %	60 %	0 %	0 %	407464175
5243	NC_018656	T	6	6	255320	255325	0 %	100 %	0 %	0 %	407464175
5244	NC_018656	TTTA	2	8	255346	255353	25 %	75 %	0 %	0 %	407464175
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5246	NC_018656	T	8	8	255400	255407	0 %	100 %	0 %	0 %	407464175
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5478	NC_018656	T	6	6	265532	265537	0 %	100 %	0 %	0 %	407464188
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5482	NC_018656	TAAT	2	8	265696	265703	50 %	50 %	0 %	0 %	407464188
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5488	NC_018656	AAT	2	6	265989	265994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464188
5489	NC_018656	TAAT	2	8	266008	266015	50 %	50 %	0 %	0 %	407464188
5490	NC_018656	TCG	2	6	266173	266178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464189
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5492	NC_018656	TAC	2	6	266416	266421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464189
5493	NC_018656	ATT	2	6	266438	266443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464189
5494	NC_018656	ATG	2	6	266448	266453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464189
5495	NC_018656	AAT	2	6	266458	266463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464189
5496	NC_018656	TCA	2	6	266565	266570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464189
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5498	NC_018656	ATGG	2	8	266624	266631	25 %	25 %	50 %	0 %	407464189
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