MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 33938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018656	ACT	2	6	218704	218709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464131
4502	NC_018656	TGC	2	6	218732	218737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464131
4503	NC_018656	ACT	2	6	218820	218825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464131
4504	NC_018656	GTG	2	6	218845	218850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464131
4505	NC_018656	ATG	2	6	218890	218895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464131
4506	NC_018656	TGA	2	6	218917	218922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464131
4507	NC_018656	AAG	2	6	218923	218928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464131
4508	NC_018656	ATG	2	6	218967	218972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464131
4509	NC_018656	A	6	6	219004	219009	100 %	0 %	0 %	0 %	407464131
4510	NC_018656	TAAAAC	2	12	219034	219045	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407464131
4511	NC_018656	TCT	2	6	219200	219205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464131
4512	NC_018656	ATT	2	6	219253	219258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464131
4513	NC_018656	GTCA	2	8	219284	219291	25 %	25 %	25 %	25 %	407464132
4514	NC_018656	CTA	2	6	219357	219362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464132
4515	NC_018656	ACT	2	6	219434	219439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464132
4516	NC_018656	ATT	2	6	219492	219497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464132
4517	NC_018656	TGGATT	2	12	219542	219553	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407464132
4518	NC_018656	GCA	2	6	219555	219560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464132
4519	NC_018656	AGC	2	6	219566	219571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464132
4520	NC_018656	GAAA	2	8	219588	219595	75 %	0 %	25 %	0 %	407464132
4521	NC_018656	ATT	3	9	219699	219707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464132
4522	NC_018656	TGCAGC	2	12	219758	219769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407464132
4523	NC_018656	CATT	2	8	219781	219788	25 %	50 %	0 %	25 %	407464132
4524	NC_018656	TTC	2	6	219858	219863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464132
4525	NC_018656	TC	3	6	219878	219883	0 %	50 %	0 %	50 %	407464132
4526	NC_018656	CATT	2	8	219910	219917	25 %	50 %	0 %	25 %	407464132
4527	NC_018656	GGT	2	6	219918	219923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464132
4528	NC_018656	ATT	2	6	219932	219937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464132
4529	NC_018656	GTC	2	6	219984	219989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464132
4530	NC_018656	TGC	2	6	220022	220027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464132
4531	NC_018656	AGAA	2	8	220106	220113	75 %	0 %	25 %	0 %	407464132
4532	NC_018656	TTG	2	6	220147	220152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464132
4533	NC_018656	TGGT	2	8	220154	220161	0 %	50 %	50 %	0 %	407464132
4534	NC_018656	ATG	2	6	220179	220184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464132
4535	NC_018656	GCA	2	6	220230	220235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464132
4536	NC_018656	TTGT	2	8	220236	220243	0 %	75 %	25 %	0 %	407464132
4537	NC_018656	TGGA	2	8	220259	220266	25 %	25 %	50 %	0 %	407464132
4538	NC_018656	ACC	2	6	220283	220288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407464132
4539	NC_018656	CAG	2	6	220294	220299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464132
4540	NC_018656	ATT	2	6	220358	220363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464132
4541	NC_018656	TTG	2	6	220431	220436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464132
4542	NC_018656	TGC	2	6	220471	220476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464132
4543	NC_018656	TGGA	2	8	220484	220491	25 %	25 %	50 %	0 %	407464132
4544	NC_018656	AATT	2	8	220495	220502	50 %	50 %	0 %	0 %	407464132
4545	NC_018656	GCTT	2	8	220537	220544	0 %	50 %	25 %	25 %	407464132
4546	NC_018656	AGG	2	6	220565	220570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407464132
4547	NC_018656	AAT	2	6	220576	220581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464132
4548	NC_018656	TAT	2	6	220597	220602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464133
4549	NC_018656	CAA	2	6	220635	220640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464133
4550	NC_018656	GAC	2	6	220740	220745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464133
4551	NC_018656	AGA	2	6	220837	220842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464133
4552	NC_018656	ACAAAA	2	12	220843	220854	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407464133
4553	NC_018656	A	6	6	220856	220861	100 %	0 %	0 %	0 %	407464133
4554	NC_018656	AAG	2	6	220977	220982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464133
4555	NC_018656	TGC	2	6	221078	221083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464134
4556	NC_018656	TGC	2	6	221123	221128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464134
4557	NC_018656	GGT	2	6	221181	221186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464134
4558	NC_018656	ATT	2	6	221228	221233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464134
4559	NC_018656	A	7	7	221313	221319	100 %	0 %	0 %	0 %	407464134
4560	NC_018656	AGA	2	6	221331	221336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464134
4561	NC_018656	ACT	2	6	221418	221423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464134
4562	NC_018656	ATT	2	6	221473	221478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464134
4563	NC_018656	ATT	2	6	221501	221506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464134
4564	NC_018656	ATT	2	6	221677	221682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464135
4565	NC_018656	TGC	2	6	221685	221690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464135
4566	NC_018656	TTG	2	6	221702	221707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464135
4567	NC_018656	GGT	2	6	221734	221739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464135
4568	NC_018656	ATT	2	6	221751	221756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464135
4569	NC_018656	CAATTG	2	12	221759	221770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407464135
4570	NC_018656	CAG	3	9	221771	221779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464135
4571	NC_018656	GTAT	2	8	221819	221826	25 %	50 %	25 %	0 %	407464135
4572	NC_018656	TAT	2	6	221908	221913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464136
4573	NC_018656	ATT	2	6	221928	221933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464136
4574	NC_018656	GAA	2	6	221935	221940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464136
4575	NC_018656	TAC	2	6	221990	221995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464136
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4577	NC_018656	GCA	2	6	222012	222017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464136
4578	NC_018656	AAT	2	6	222107	222112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464136
4579	NC_018656	GAA	2	6	222189	222194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464136
4580	NC_018656	TCT	3	9	222240	222248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464136
4581	NC_018656	ACTTT	2	10	222278	222287	20 %	60 %	0 %	20 %	407464136
4582	NC_018656	TCT	2	6	222358	222363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464136
4583	NC_018656	AGA	2	6	222420	222425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464136
4584	NC_018656	AGT	2	6	222467	222472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464136
4585	NC_018656	TGA	2	6	222490	222495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464136
4586	NC_018656	CTG	2	6	222571	222576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464136
4587	NC_018656	CACCAA	2	12	222655	222666	50 %	0 %	0 %	50 %	407464136
4588	NC_018656	TTG	2	6	222727	222732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464136
4589	NC_018656	TGG	2	6	222803	222808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464136
4590	NC_018656	GAT	2	6	222828	222833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464136
4591	NC_018656	GAT	2	6	222929	222934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464136
4592	NC_018656	AC	3	6	222942	222947	50 %	0 %	0 %	50 %	407464136
4593	NC_018656	ATG	2	6	222972	222977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464136
4594	NC_018656	ATT	3	9	222984	222992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464136
4595	NC_018656	CAA	2	6	223102	223107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464136
4596	NC_018656	GAA	2	6	223161	223166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464136
4597	NC_018656	ATG	2	6	223323	223328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464136
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4599	NC_018656	ATT	2	6	223512	223517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464137
4600	NC_018656	GTTGCA	2	12	223557	223568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407464137
4601	NC_018656	GCA	2	6	223593	223598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464137
4602	NC_018656	CAT	2	6	223635	223640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464137
4603	NC_018656	ATT	2	6	223701	223706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464137
4604	NC_018656	GAT	2	6	223802	223807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464137
4605	NC_018656	AATT	2	8	223828	223835	50 %	50 %	0 %	0 %	407464137
4606	NC_018656	TAT	2	6	223837	223842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464137
4607	NC_018656	ACTT	2	8	223849	223856	25 %	50 %	0 %	25 %	407464137
4608	NC_018656	TCT	2	6	223861	223866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407464137
4609	NC_018656	CAT	2	6	223891	223896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464137
4610	NC_018656	AAAG	2	8	223928	223935	75 %	0 %	25 %	0 %	407464137
4611	NC_018656	ATT	2	6	223978	223983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407464137
4612	NC_018656	TCA	2	6	224014	224019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407464137
4613	NC_018656	ATG	2	6	224040	224045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464137
4614	NC_018656	TTTG	2	8	224069	224076	0 %	75 %	25 %	0 %	407464137
4615	NC_018656	GCT	2	6	224133	224138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464137
4616	NC_018656	TGG	2	6	224174	224179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464137
4617	NC_018656	GCA	2	6	224268	224273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407464137
4618	NC_018656	TGG	2	6	224299	224304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407464137
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4620	NC_018656	TTG	2	6	224371	224376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464137
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4987	NC_018656	TC	3	6	242426	242431	0 %	50 %	0 %	50 %	407464160
4988	NC_018656	T	6	6	242459	242464	0 %	100 %	0 %	0 %	407464160
4989	NC_018656	AAG	2	6	242509	242514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464160
4990	NC_018656	AAT	2	6	242541	242546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407464160
4991	NC_018656	GAA	2	6	242565	242570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407464160
4992	NC_018656	TGAAA	2	10	242636	242645	60 %	20 %	20 %	0 %	407464160
4993	NC_018656	ATG	2	6	242673	242678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464160
4994	NC_018656	ATG	2	6	242715	242720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407464160
4995	NC_018656	A	6	6	242733	242738	100 %	0 %	0 %	0 %	407464160
4996	NC_018656	GGAAT	2	10	242777	242786	40 %	20 %	40 %	0 %	407464160
4997	NC_018656	A	7	7	242801	242807	100 %	0 %	0 %	0 %	407464160
4998	NC_018656	GTT	2	6	243064	243069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407464161
4999	NC_018656	CAA	2	6	243074	243079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407464161
5000	NC_018656	TGC	2	6	243149	243154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407464161

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