MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 32676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018655	TCT	2	6	242662	242667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461816
5002	NC_018655	TGT	2	6	242744	242749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461816
5003	NC_018655	AAT	2	6	242777	242782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461816
5004	NC_018655	ATA	2	6	242800	242805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461816
5005	NC_018655	TG	3	6	242847	242852	0 %	50 %	50 %	0 %	407461816
5006	NC_018655	TCA	2	6	242874	242879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461816
5007	NC_018655	CACTG	2	10	242927	242936	20 %	20 %	20 %	40 %	407461816
5008	NC_018655	GCATT	2	10	242944	242953	20 %	40 %	20 %	20 %	407461816
5009	NC_018655	AT	3	6	242994	242999	50 %	50 %	0 %	0 %	407461816
5010	NC_018655	AAT	2	6	243023	243028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461816
5011	NC_018655	GCA	2	6	243039	243044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461816
5012	NC_018655	T	7	7	243053	243059	0 %	100 %	0 %	0 %	407461816
5013	NC_018655	T	7	7	243108	243114	0 %	100 %	0 %	0 %	407461816
5014	NC_018655	ATA	2	6	243221	243226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461817
5015	NC_018655	TTTC	2	8	243380	243387	0 %	75 %	0 %	25 %	407461817
5016	NC_018655	TAT	2	6	243405	243410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461817
5017	NC_018655	CAAT	2	8	243413	243420	50 %	25 %	0 %	25 %	407461817
5018	NC_018655	AAT	2	6	243485	243490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461817
5019	NC_018655	TTC	2	6	243513	243518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461817
5020	NC_018655	TTC	2	6	243524	243529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461817
5021	NC_018655	TGA	2	6	243537	243542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461817
5022	NC_018655	CTT	2	6	243622	243627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461817
5023	NC_018655	TCA	2	6	243649	243654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461817
5024	NC_018655	AAC	2	6	243655	243660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461817
5025	NC_018655	TCT	2	6	243715	243720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461817
5026	NC_018655	TCA	2	6	243742	243747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461817
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5029	NC_018655	AAC	2	6	243786	243791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461818
5030	NC_018655	A	6	6	243854	243859	100 %	0 %	0 %	0 %	407461818
5031	NC_018655	CTT	2	6	243892	243897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461818
5032	NC_018655	CCA	2	6	243915	243920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407461818
5033	NC_018655	ATTTT	2	10	243930	243939	20 %	80 %	0 %	0 %	407461818
5034	NC_018655	GATG	2	8	243948	243955	25 %	25 %	50 %	0 %	407461818
5035	NC_018655	AATT	2	8	243974	243981	50 %	50 %	0 %	0 %	407461818
5036	NC_018655	T	6	6	243980	243985	0 %	100 %	0 %	0 %	407461818
5037	NC_018655	ATT	2	6	244068	244073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461818
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5039	NC_018655	CCATA	2	10	244107	244116	40 %	20 %	0 %	40 %	407461818
5040	NC_018655	T	6	6	244159	244164	0 %	100 %	0 %	0 %	407461818
5041	NC_018655	T	6	6	244179	244184	0 %	100 %	0 %	0 %	407461818
5042	NC_018655	TGG	2	6	244217	244222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461818
5043	NC_018655	ATTTA	2	10	244235	244244	40 %	60 %	0 %	0 %	407461818
5044	NC_018655	T	6	6	244245	244250	0 %	100 %	0 %	0 %	407461818
5045	NC_018655	ATT	2	6	244266	244271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461818
5046	NC_018655	T	6	6	244293	244298	0 %	100 %	0 %	0 %	407461818
5047	NC_018655	TCTT	2	8	244328	244335	0 %	75 %	0 %	25 %	407461818
5048	NC_018655	ATATT	2	10	244344	244353	40 %	60 %	0 %	0 %	407461818
5049	NC_018655	AAT	2	6	244363	244368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461818
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5051	NC_018655	T	6	6	244416	244421	0 %	100 %	0 %	0 %	407461818
5052	NC_018655	TCT	2	6	244451	244456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461818
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5055	NC_018655	CCT	2	6	244664	244669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407461819
5056	NC_018655	ATT	2	6	244775	244780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461819
5057	NC_018655	T	6	6	244779	244784	0 %	100 %	0 %	0 %	407461819
5058	NC_018655	TGT	2	6	244800	244805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461819
5059	NC_018655	TTCT	2	8	244870	244877	0 %	75 %	0 %	25 %	407461819
5060	NC_018655	CTTT	2	8	244883	244890	0 %	75 %	0 %	25 %	407461819
5061	NC_018655	TACT	2	8	244896	244903	25 %	50 %	0 %	25 %	407461819
5062	NC_018655	AAC	2	6	244909	244914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461819
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5070	NC_018655	GTTT	2	8	245298	245305	0 %	75 %	25 %	0 %	407461819
5071	NC_018655	TCTT	2	8	245346	245353	0 %	75 %	0 %	25 %	407461819
5072	NC_018655	ACA	2	6	245423	245428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461819
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5083	NC_018655	TGA	2	6	245948	245953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461820
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5094	NC_018655	ATC	2	6	246457	246462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461821
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5098	NC_018655	AAT	2	6	246565	246570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461821
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5104	NC_018655	AGTT	2	8	246855	246862	25 %	50 %	25 %	0 %	407461821
5105	NC_018655	CTT	2	6	246870	246875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461821
5106	NC_018655	CAC	2	6	246945	246950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407461821
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5108	NC_018655	GTT	2	6	247020	247025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461821
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5110	NC_018655	GAT	2	6	247151	247156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461821
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5112	NC_018655	AACT	2	8	247227	247234	50 %	25 %	0 %	25 %	407461821
5113	NC_018655	TGT	2	6	247335	247340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461821
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5119	NC_018655	TC	3	6	247490	247495	0 %	50 %	0 %	50 %	407461822
5120	NC_018655	ATTTT	2	10	247542	247551	20 %	80 %	0 %	0 %	407461822
5121	NC_018655	ATT	2	6	247766	247771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461823
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5123	NC_018655	CAT	2	6	247838	247843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461823
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5366	NC_018655	AGC	2	6	260263	260268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461834
5367	NC_018655	CTC	2	6	260281	260286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407461834
5368	NC_018655	A	7	7	260340	260346	100 %	0 %	0 %	0 %	407461834
5369	NC_018655	GTGAC	2	10	260433	260442	20 %	20 %	40 %	20 %	407461834
5370	NC_018655	ATG	2	6	260475	260480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461834
5371	NC_018655	CTG	2	6	260535	260540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461834
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5373	NC_018655	T	7	7	260591	260597	0 %	100 %	0 %	0 %	407461834
5374	NC_018655	A	6	6	260608	260613	100 %	0 %	0 %	0 %	407461834
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5378	NC_018655	TGA	2	6	260800	260805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461834
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5380	NC_018655	ACT	2	6	260906	260911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461834
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5382	NC_018655	AT	3	6	260993	260998	50 %	50 %	0 %	0 %	407461834
5383	NC_018655	TGG	2	6	261121	261126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461834
5384	NC_018655	TGG	2	6	261247	261252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461834
5385	NC_018655	TTA	2	6	261268	261273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461834
5386	NC_018655	CGA	2	6	261283	261288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461834
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5395	NC_018655	ATG	2	6	261588	261593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461834
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5397	NC_018655	TGG	2	6	261668	261673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461834
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5402	NC_018655	A	6	6	261872	261877	100 %	0 %	0 %	0 %	407461834
5403	NC_018655	AAAATG	2	12	261948	261959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407461835
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5472	NC_018655	T	7	7	264460	264466	0 %	100 %	0 %	0 %	407461837
5473	NC_018655	TTG	2	6	264505	264510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461837
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5476	NC_018655	AATA	2	8	264605	264612	75 %	25 %	0 %	0 %	407461837
5477	NC_018655	TCT	2	6	264615	264620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461837
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5480	NC_018655	TTC	2	6	264655	264660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461837
5481	NC_018655	ACA	2	6	264834	264839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461837
5482	NC_018655	GCCA	2	8	264845	264852	25 %	0 %	25 %	50 %	407461837
5483	NC_018655	T	7	7	264932	264938	0 %	100 %	0 %	0 %	407461838
5484	NC_018655	TGC	2	6	264962	264967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461838
5485	NC_018655	CCA	2	6	264972	264977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407461838
5486	NC_018655	TAC	2	6	265001	265006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461838
5487	NC_018655	AAC	2	6	265021	265026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461838
5488	NC_018655	GGC	2	6	265046	265051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407461838
5489	NC_018655	TGTC	2	8	265108	265115	0 %	50 %	25 %	25 %	407461838
5490	NC_018655	TTCCA	2	10	265145	265154	20 %	40 %	0 %	40 %	407461838
5491	NC_018655	AAT	2	6	265163	265168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461838
5492	NC_018655	T	8	8	265192	265199	0 %	100 %	0 %	0 %	407461838
5493	NC_018655	CAT	2	6	265237	265242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461838
5494	NC_018655	TTC	2	6	265289	265294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461838
5495	NC_018655	CCA	2	6	265341	265346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407461838
5496	NC_018655	T	6	6	265361	265366	0 %	100 %	0 %	0 %	407461838
5497	NC_018655	ATA	3	9	265369	265377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461838
5498	NC_018655	GAT	2	6	265383	265388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461838
5499	NC_018655	T	6	6	265388	265393	0 %	100 %	0 %	0 %	407461838
5500	NC_018655	T	7	7	265510	265516	0 %	100 %	0 %	0 %	407461838

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