MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018627	GAAAA	2	10	3353	3362	80 %	0 %	20 %	0 %	406594534
2	NC_018627	AGGAG	2	10	4410	4419	40 %	0 %	60 %	0 %	406594534
3	NC_018627	TGTTT	2	10	6758	6767	0 %	80 %	20 %	0 %	406594141
4	NC_018627	AACAT	2	10	7322	7331	60 %	20 %	0 %	20 %	406594370
5	NC_018627	AAGAA	2	10	9568	9577	80 %	0 %	20 %	0 %	406594531
6	NC_018627	ATAAA	2	10	13043	13052	80 %	20 %	0 %	0 %	406594948
7	NC_018627	AACTC	2	10	13487	13496	40 %	20 %	0 %	40 %	406594856
8	NC_018627	GTTTT	2	10	13558	13567	0 %	80 %	20 %	0 %	406594856
9	NC_018627	GAAAC	2	10	14326	14335	60 %	0 %	20 %	20 %	406594874
10	NC_018627	AACAA	2	10	15355	15364	80 %	0 %	0 %	20 %	406594874
11	NC_018627	AATAG	2	10	17067	17076	60 %	20 %	20 %	0 %	406594379
12	NC_018627	GCCGT	2	10	18925	18934	0 %	20 %	40 %	40 %	406594049
13	NC_018627	GCCTA	2	10	19903	19912	20 %	20 %	20 %	40 %	406594049
14	NC_018627	AGTGT	2	10	21117	21126	20 %	40 %	40 %	0 %	406594747
15	NC_018627	GCCAC	2	10	29446	29455	20 %	0 %	20 %	60 %	406594893
16	NC_018627	AAGGA	2	10	38572	38581	60 %	0 %	40 %	0 %	406594065
17	NC_018627	CCATA	2	10	38779	38788	40 %	20 %	0 %	40 %	406594065
18	NC_018627	CTTTA	2	10	38945	38954	20 %	60 %	0 %	20 %	406594065
19	NC_018627	CTTTC	2	10	43208	43217	0 %	60 %	0 %	40 %	406594998
20	NC_018627	ACAAA	2	10	43870	43879	80 %	0 %	0 %	20 %	406594572
21	NC_018627	TATGG	2	10	44280	44289	20 %	40 %	40 %	0 %	406594316
22	NC_018627	TCTTT	2	10	46088	46097	0 %	80 %	0 %	20 %	406594575
23	NC_018627	AGCCC	2	10	47085	47094	20 %	0 %	20 %	60 %	406594853
24	NC_018627	TCAAA	2	10	47440	47449	60 %	20 %	0 %	20 %	406594853
25	NC_018627	TCTAT	2	10	49559	49568	20 %	60 %	0 %	20 %	406594792
26	NC_018627	TTTGG	2	10	51473	51482	0 %	60 %	40 %	0 %	406594792
27	NC_018627	TTTTC	2	10	55342	55351	0 %	80 %	0 %	20 %	406594381
28	NC_018627	GTAAG	2	10	57390	57399	40 %	20 %	40 %	0 %	406594447
29	NC_018627	AAAAT	2	10	60212	60221	80 %	20 %	0 %	0 %	406594291
30	NC_018627	TAGTT	2	10	62814	62823	20 %	60 %	20 %	0 %	406594291
31	NC_018627	GAATG	2	10	62830	62839	40 %	20 %	40 %	0 %	406594291
32	NC_018627	TCCTA	2	10	64879	64888	20 %	40 %	0 %	40 %	406594863
33	NC_018627	AGAAA	2	10	70135	70144	80 %	0 %	20 %	0 %	406594491
34	NC_018627	GGATA	2	10	70943	70952	40 %	20 %	40 %	0 %	406594962
35	NC_018627	ATAGC	2	10	74382	74391	40 %	20 %	20 %	20 %	406594765
36	NC_018627	GCACA	2	10	77215	77224	40 %	0 %	20 %	40 %	406594859
37	NC_018627	AAAGA	2	10	78168	78177	80 %	0 %	20 %	0 %	406594136
38	NC_018627	AGTTC	2	10	79173	79182	20 %	40 %	20 %	20 %	406594136
39	NC_018627	CGTAT	2	10	81545	81554	20 %	40 %	20 %	20 %	406594800
40	NC_018627	GAAAA	2	10	82755	82764	80 %	0 %	20 %	0 %	406594076
41	NC_018627	CTTTT	2	10	85643	85652	0 %	80 %	0 %	20 %	406594416
42	NC_018627	CAAAG	2	10	87114	87123	60 %	0 %	20 %	20 %	406594217
43	NC_018627	AACAA	2	10	87281	87290	80 %	0 %	0 %	20 %	406594217
44	NC_018627	AAAGA	2	10	89187	89196	80 %	0 %	20 %	0 %	406594160
45	NC_018627	TTTTC	2	10	90202	90211	0 %	80 %	0 %	20 %	406594160
46	NC_018627	AGGAT	2	10	90725	90734	40 %	20 %	40 %	0 %	406594160
47	NC_018627	ATAAC	2	10	90811	90820	60 %	20 %	0 %	20 %	406594160
48	NC_018627	TGGCA	2	10	93296	93305	20 %	20 %	40 %	20 %	406594166
49	NC_018627	TGTTT	2	10	95021	95030	0 %	80 %	20 %	0 %	406594075
50	NC_018627	TCACC	2	10	96595	96604	20 %	20 %	0 %	60 %	406594495
51	NC_018627	AAAAT	2	10	96730	96739	80 %	20 %	0 %	0 %	406594495
52	NC_018627	TTAAT	2	10	97774	97783	40 %	60 %	0 %	0 %	406594334
53	NC_018627	ATTAC	2	10	102906	102915	40 %	40 %	0 %	20 %	406594743
54	NC_018627	CTACA	2	10	103280	103289	40 %	20 %	0 %	40 %	406594743
55	NC_018627	AATTA	2	10	104827	104836	60 %	40 %	0 %	0 %	406594650
56	NC_018627	CTATA	2	10	105817	105826	40 %	40 %	0 %	20 %	406594607
57	NC_018627	GTTTG	2	10	108777	108786	0 %	60 %	40 %	0 %	406594311
58	NC_018627	AGTTA	2	10	115582	115591	40 %	40 %	20 %	0 %	406594651
59	NC_018627	AGTTT	2	10	116072	116081	20 %	60 %	20 %	0 %	406594204
60	NC_018627	TTTAC	2	10	119184	119193	20 %	60 %	0 %	20 %	406594691
61	NC_018627	AATTA	2	10	122077	122086	60 %	40 %	0 %	0 %	406594633
62	NC_018627	AGATG	2	10	123430	123439	40 %	20 %	40 %	0 %	406594791
63	NC_018627	GTCAA	2	10	124748	124757	40 %	20 %	20 %	20 %	406594319
64	NC_018627	TAGGG	2	10	127220	127229	20 %	20 %	60 %	0 %	406594549
65	NC_018627	AACTT	2	10	128152	128161	40 %	40 %	0 %	20 %	406594549
66	NC_018627	TGTCA	2	10	132037	132046	20 %	40 %	20 %	20 %	406594808
67	NC_018627	AAAAG	2	10	135443	135452	80 %	0 %	20 %	0 %	406594555
68	NC_018627	TAAAA	2	10	135724	135733	80 %	20 %	0 %	0 %	406594555
69	NC_018627	GATTT	2	10	137983	137992	20 %	60 %	20 %	0 %	406594024
70	NC_018627	TTGTT	2	10	138325	138334	0 %	80 %	20 %	0 %	406594024
71	NC_018627	AAGAA	2	10	138806	138815	80 %	0 %	20 %	0 %	406594024
72	NC_018627	TTCTT	2	10	139399	139408	0 %	80 %	0 %	20 %	406594113
73	NC_018627	CTTTG	2	10	141303	141312	0 %	60 %	20 %	20 %	406594773
74	NC_018627	AGAAA	2	10	143340	143349	80 %	0 %	20 %	0 %	406594403
75	NC_018627	AAAGA	2	10	146005	146014	80 %	0 %	20 %	0 %	406594802
76	NC_018627	TACTC	2	10	149636	149645	20 %	40 %	0 %	40 %	406594905
77	NC_018627	CGTTT	2	10	149683	149692	0 %	60 %	20 %	20 %	406594905
78	NC_018627	ATTTT	2	10	149823	149832	20 %	80 %	0 %	0 %	406594905
79	NC_018627	ACCAT	2	10	151854	151863	40 %	20 %	0 %	40 %	406594273
80	NC_018627	CAGAA	2	10	152819	152828	60 %	0 %	20 %	20 %	406594280
81	NC_018627	TTCAT	2	10	153389	153398	20 %	60 %	0 %	20 %	406594280
82	NC_018627	AAAGG	2	10	154219	154228	60 %	0 %	40 %	0 %	406594317
83	NC_018627	ATAGG	2	10	155911	155920	40 %	20 %	40 %	0 %	406594522
84	NC_018627	TTTGA	2	10	155997	156006	20 %	60 %	20 %	0 %	406594522
85	NC_018627	AAGGT	2	10	160938	160947	40 %	20 %	40 %	0 %	406594027
86	NC_018627	TTTTG	2	10	161877	161886	0 %	80 %	20 %	0 %	406594412
87	NC_018627	GGGGC	2	10	162024	162033	0 %	0 %	80 %	20 %	406594412
88	NC_018627	AAATG	2	10	166431	166440	60 %	20 %	20 %	0 %	406593973
89	NC_018627	GGGGA	2	10	168206	168215	20 %	0 %	80 %	0 %	406594247
90	NC_018627	CTGTT	2	10	169732	169741	0 %	60 %	20 %	20 %	406594437
91	NC_018627	AATGA	2	10	169767	169776	60 %	20 %	20 %	0 %	406594437
92	NC_018627	ATTTT	2	10	173226	173235	20 %	80 %	0 %	0 %	406594712
93	NC_018627	GAGAG	2	10	173243	173252	40 %	0 %	60 %	0 %	406594712
94	NC_018627	CTAAG	2	10	181190	181199	40 %	20 %	20 %	20 %	406594513
95	NC_018627	TTTTC	2	10	181790	181799	0 %	80 %	0 %	20 %	406594513
96	NC_018627	GGTAC	2	10	183785	183794	20 %	20 %	40 %	20 %	406594587
97	NC_018627	AGGGA	2	10	186972	186981	40 %	0 %	60 %	0 %	406594400
98	NC_018627	AGGAA	2	10	187995	188004	60 %	0 %	40 %	0 %	406594112
99	NC_018627	TTCTT	2	10	188374	188383	0 %	80 %	0 %	20 %	406594112
100	NC_018627	GATAA	2	10	191017	191026	60 %	20 %	20 %	0 %	406594112
101	NC_018627	CCCTT	2	10	193221	193230	0 %	40 %	0 %	60 %	406594476
102	NC_018627	AGTTA	2	10	194212	194221	40 %	40 %	20 %	0 %	406594178
103	NC_018627	TTATT	2	10	194232	194241	20 %	80 %	0 %	0 %	406594178
104	NC_018627	AGGGT	2	10	197156	197165	20 %	20 %	60 %	0 %	406594240
105	NC_018627	TGGAT	2	10	197597	197606	20 %	40 %	40 %	0 %	406594240
106	NC_018627	CTAAA	2	10	197654	197663	60 %	20 %	0 %	20 %	406594240
107	NC_018627	CTTTA	2	10	197957	197966	20 %	60 %	0 %	20 %	406594240
108	NC_018627	AAAAT	2	10	198134	198143	80 %	20 %	0 %	0 %	406594240
109	NC_018627	TTGGT	2	10	201436	201445	0 %	60 %	40 %	0 %	406594232
110	NC_018627	AGCAA	2	10	203913	203922	60 %	0 %	20 %	20 %	406594063
111	NC_018627	ATGTG	2	10	204299	204308	20 %	40 %	40 %	0 %	406594870
112	NC_018627	TAATG	2	10	205028	205037	40 %	40 %	20 %	0 %	406594870
113	NC_018627	AAAAT	2	10	206974	206983	80 %	20 %	0 %	0 %	406594438
114	NC_018627	TGGTT	2	10	207893	207902	0 %	60 %	40 %	0 %	406594438
115	NC_018627	TCTCT	2	10	208671	208680	0 %	60 %	0 %	40 %	406594031
116	NC_018627	GAAAA	2	10	214204	214213	80 %	0 %	20 %	0 %	406594093
117	NC_018627	TAGCA	2	10	214570	214579	40 %	20 %	20 %	20 %	406594573
118	NC_018627	AAGAA	2	10	215268	215277	80 %	0 %	20 %	0 %	406594573
119	NC_018627	GTTAG	2	10	218554	218563	20 %	40 %	40 %	0 %	406594971
120	NC_018627	TGGAT	2	10	218706	218715	20 %	40 %	40 %	0 %	406594971
121	NC_018627	TTGTA	2	10	221370	221379	20 %	60 %	20 %	0 %	406594971
122	NC_018627	GCTTA	2	10	222501	222510	20 %	40 %	20 %	20 %	406594971
123	NC_018627	GCTGA	2	10	227379	227388	20 %	20 %	40 %	20 %	406594632
124	NC_018627	GATTG	2	10	230399	230408	20 %	40 %	40 %	0 %	406594935
125	NC_018627	AGGAG	2	10	230690	230699	40 %	0 %	60 %	0 %	406593984
126	NC_018627	TGCCC	2	10	230993	231002	0 %	20 %	20 %	60 %	406593984
127	NC_018627	TACCT	2	10	231859	231868	20 %	40 %	0 %	40 %	406594815
128	NC_018627	CTAGT	2	10	232150	232159	20 %	40 %	20 %	20 %	406594815
129	NC_018627	TGCGT	2	10	234316	234325	0 %	40 %	40 %	20 %	406594609
130	NC_018627	GTTTT	2	10	234361	234370	0 %	80 %	20 %	0 %	406594609
131	NC_018627	TAAAA	2	10	240124	240133	80 %	20 %	0 %	0 %	406594257
132	NC_018627	TTCAG	2	10	241352	241361	20 %	40 %	20 %	20 %	406594056
133	NC_018627	TTTAG	2	10	242642	242651	20 %	60 %	20 %	0 %	406594056
134	NC_018627	GTTGT	2	10	243447	243456	0 %	60 %	40 %	0 %	406594169
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